SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_TrvaMG_comp27194_c0_seq3
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_zinc_finger_protein_2_homolog_isoform_X7_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003676 F nucleic acid binding
GO:0003677 F DNA binding
GO:0003700 F DNA-binding transcription factor activity
GO:0005622 C intracellular anatomical structure
GO:0005634 C nucleus
GO:0006351 P transcription, DNA-templated
GO:0006355 P regulation of transcription, DNA-templated
GO:0046872 F metal ion binding
Transcript
Level
FPKM:6.01 TPM:5.06
ORF EntryO_TrvaMG17183_complete:A_TrvaMG_comp27194_c0_seq3
Sequence
(Nucleotide)
GTCGAATGCAATGATTGTTTTAGAAATAAGTTATTCATCTTGTTACTCGTGAAACATAAT
GTAGCTTTTTCAAAGCTGAATATTTAGGACGGCACGCTCAAAAACTATTCACAAACTTTT
AAAAACTAAAGCATGCGTACGTTGTGAGGTTTTCGTTAAGTAGTAGGACAAATGTTTGAT
GGACAAATAAACGTATCAAATTCCCTCATGGTAGTAAATAATGTAAACTCAATTGGTATG
CGGTTGTGACGACGTCATGTAGAATTATTTGTCCATCGTGGTTTTGTTTTGTTTCTCTGT
CCCCTCGTGTCCGTGCGTTCGTTGGCGGCGCAGGGGAGCGGCCGTTCCAGTGCACCGTCT
GCCTCAAGTCCTTCACGCAGAAGTGCGCGCTCAATTTGCACGAAAAAATACATACGGTCC
AGGGCAGACCGTTCCAGTGCCTGTCGTGTCCCGCCGCCTTCACCTGCAAGCAATACCTGG
AGATACACACGCGCACTCATACCGGCGAGCGACCCTATCAGTGCGACATCTGCCTGAAAC
GCTTCACACAGAAATCGAGTCTCAACATTCACAAGCGGACACACTCAGTGCAGGGCCGGC
CCTTCCAGTGTCTGCAGTGCCCGGCCGCCTTCACCTGCAAGCAGTACCTCGAAATCCACA
ACCGCACGCACACCGGAGAGCGTCCCTACCAGTGTGATGTCTGCCTCAAGAGATTCGCCC
AAAAATCAACACTGAACATACACAAACGAACGCACACCGGCGAACGTCCATACGCATGTG
ACATTTGCCAGAAGCGTTTCGCTGTGAAGAGTTATGTAACGGCCCACCGATGGTCCCACG
TGGCGGACAAGCCTCTCAACTGCGACCGTTGCTCGATGACGTTCACATCCAAGTCCCAGT
TCGCGTTACACATCCGCACGCACACCGCCGGCTCCTGCTACGAGTGCAGCGTGTGCGGAC
GGAGCTTCGTGAGGGACAGCTATCTCATACGTCATCACAATCGTGTGCACCGTGATAACC
ACAGCAACATGTCCGCCAACAGCATCGGCATCAACAGCGTCGCCGCAAACACCAATAATT
CAAACAACTCCAACTATGATTCGCCTGGTGTTTGTGATCTCAGCTTTGTGCCAATGGTGA
ACCGTTATATGACGTCACAAGGGACGCAAGTGACCTTGCAAGACACACAAAGTAAAATGT
CTGCCATGTCCCCACAATCCATCGCTTCTATATCGTCTCCCCCACCGTCGCACACCCCGA
CGCCGCAGCCGATGTCGGGACAGATGCATCGCACAGACTGATCCACTTCACAGCTGTGGG
TTGAAGAGCAGGCAGCCAGAGTGCAATATATGAATTGGGCAGCCTTCAACAGCAGCTACC
ACACATGGAGCCAGCAGCTCACAGGTCGTCGGCATGGACTCATGCAATGATTTCATTATT
ATTATTTATGTCCAGTTATTTATTTGTTGTTCGAGAGTGCGGATATCGTTAGTGCACGGG
ACGTGCGAGTTCAATCGAGTCGGTTTCGTTACGCTTGTGGAATCCCTCGATAACATCAAG
TGGACATCACAGTTTGAGAGGACGTAGTAATTAGAGACAGTGGCGTGACTGTAGTAGTGA
TGATGGATACAGGAGTCTACCGTGGGGCTCTTGACCTTCTAGTCAAGATTATATCGCCAG
GGTGATTGAACGATCTGAATCGCGGGGTTCAACCCATAGTAACTTCATGTTGTTTTATTA
ATTTTAGCGAAGCGAACAAACGCTTAGATTTGGCGATTGCATCTTCACTAGAAAGGCTGA
AAGGAAATGACGTCGTGGTTTTTTCGTGGTTTTGTTACGCCGCTGGTTAGGAAGTAGCGG
TACCGCCTATGATAACGGAGCATCGTGAATGATGCCCACAACTGTGATTTGTCTTGTCAC
TCGAAACTTTTTGTTTCGGTGAATTTTATAAATCGATACTTAAAACTCTCATTGTTTAGA
TGTAGGCCTAAAATTTTTTGATCTCATATTCTAATTTGCTTAGCGGTAATTGTTTTTTTT
TTGAAAACCTGAAGTTAAATCTTCAAATGTGAAATTCTAAATTTTAATGTTGTCATACGC
TTAATCACCCTCATCAACATTTTCATTAGGCGTAGTGAAATGTAACGATATCTTATTGCG
ATGCTTTAACTTAGAACGTGTCAGTGTATATGGAAGTTCAGTATTTTATAAAACTATTAC
TATCGAAATTATATATTTTGAGAAGACAGGACTCTTCTATTCTGCAATACTACAAATTAA
ATATGTATCATGATATAATTCCATATATTTAATTCCAAATAAGATATAATATTGATAAGT
ACAAATAATTCGAAACAGAGTCCTTAGCAATACAAAAAAAAATCACAAACTTATGATAAT
ATTATTGGAGAAATCCAGAGAAGTGCCTGTATGCAACATAAATTGGCAATATTTTATTAA
TGTATTACGTTCAATAATATTTACTTTTATTCGATGTGTGGCCCTGAATTCGATTCGAGG
AACCTGTGGCAATAATGAATGTGCAACTATTTAATGTTGATAGAAGTTTCTCTTTTCGCC
CATTATGTAGATGGAGCGTATAATTTGTGAAGCTTCTTACTAACTTTGTGTGCCTTCTAG
CGGATAGATACATTAGGGCAACATCACATCGTTTTAAAGTCATTCTCTTCTAGTTTTCCA
ATATATTCGTATTAGAGTTAGTATCGTAAGAACGTAGTACATTATTTTGATTACGTATGT
GTTGCCATGTATATGAACGCATAACGGCGACAGTGGAGTTGCAATTGTACTTTTAGATAA
AATTATATTAAAATATCCAGACACTAAAATATAAATAAATACTAGTAAATATTGCACACA
CAGAATTGTACAACGTTGTGTGTGCAGAAATATTGTTAGGTTCCTAATAGTCTCGTAGCT
GCGATATTACGCCTTTAATCGGTACCTGATTAAAATTAATATTTACAAAATGTCCACTGT
CGTCTTATTTTGTAGGTGATTTTTCCATAACTATTTTTCGAATAATAGTGATTACGATTA
GTGTATAGAGCAGTAGTCTTCCAATACGTTACAGTTGTCAGGCGCGTCGAGGTGCAGCCG
AGTGTCCGCTGCGGGGGTTCCTTATGGTTTGCCATTATTAATATCAAAGATAGATTGGTG
CCATTTCTATGTAAATGAAGCGGTAGTGTAAGTTTAGTTAAGTCTGCAGGTCAGGGTAGA
ACTGGGAATAAAAAATATAAAAGAAATTATATCCCCATAGTGTATTCACTGGAATGTATA
CCTACCTATATTGTTTTTTTATGACGTTATTTTATTCAAAATTATTTACAAATGTATGTG
TCCATGTGCTGAGTCAGAGATTGTAAATAAACCGTAGTATTTATTTATTCGAATTTTAAA
ATTTATGAAAAGAGTAATGTTTTCGTAGAATTGTTCCCCTTATACAACGGTTATTGAACT
GGTTTCCAAATTATTACGAGGAAATAGTACATATTGGAATTACAAAAAAATCTTAGATGT
ATAGAGAGTATACATAATATAGCTATATCGTTTTATAGTCCTCGATATTTTTTTATATTT
TGATAGGTCTGTATTTGCAAAGAAAACATAAAAAATAGGCCAATATCTTTCATTATCTAT
CCTTTTAACTATATTTGTATACAGTATTGTTAAGGTAATGATGTAACAAAACGGATGCAT
TTAGTTGCCCTGAATCGTAAGTGTAATGTATCATGTCTTCAACTTTTTAAATGTTGTAGT
AAGTTTCTAACCAAGCCATTGATAACAGTATTATTTAGACAAACTAGAACTTGGTTAAAA
TGTAGTTTAAAATTTACAGATACCATAACGGAAAATACCGTTGAAGAAACATAGTTATCA
ATAGTTTGTATTTAACAATAAAAGGTACAATACAAGGCTAGTACTTGAAAACCGTAGGTC
AAACTACTCATGAAGTAGTTTGAATTAAATACGAATATAAAAGGGAAGTAATATTAAAGA
TCTCAAGAGAAATCTTTAAATGATGGCGGTTTATGATTAAACTTTAATAATTTGGGTACC
GAAATCCATGTAAACATTGAAGTCGGTCTATGCGTTTTAAGTATGTGAATAGCGTCTCCT
GGCATCGTGTTTCTTATAGTACTAGCCTAGTGTTGTGCCCATTAGACACACTCGTATATT
TTAGTGTCGATTATCGTATAATATATTATTATATCCATAGATAATATTATAAATGGAAAT
AGAAACACCAACATAGTGAATTAGGTATATTTATAAGTCTTCTAACTTTCAAAAACTCGC
CGGTATTGATTGTTCCTCTATTTACTCTTAATATATTTTTGTTATATTATGTTCTTTCTA
TTATATTGTTTCATTCTATTGATGTGTTGTTTTATCGGCGAGTTAACGAAAGTTGAGACT
CGTAGTGGCCCTACTTATTTACGAATTAATTCGAATTTACTGTGCGTGTATACCTGATTT
ATTAATCTTTGTAGGTAAAAAAGTAGGGCTATTGATGTACAATATTAAATCAGTGAAGTA
ACACAAAATAAATGAGTACTAGAGCCATACAAAATGGCCAAGCGTGTCTTCACTGCTATA
TTTTACATACTGATAGTAATCTATATTTATAGAATAAATATGAAACATTATATTTTATGT
TATATCAGTTACATTGATTTATTTTTTTTCTACTTAATTTTGAACCGTAGAAAAGACTGA
GGAATTCACAAGTTAAAAAGAATACTCACGATATATTTTGGCGGTATTTAAAGATGTATT
TGTTATTGATTGAAATGTTTTGACATCAGATTGGTTGTGGTGACGGACCAACCTGCTTTT
TTTGAACCGTTATATTTCGTTAATAGAAATCGTACATATCTGTGTTGGATAAGAACGGCT
AGTCCAGGCTCTCGCGGGCTCGTTACTTGATTGTGGTAGTTATACAGTGAGCCTTGTGTA
ATCATAATCGTCTAAGGTACATAATTATTTAGTTGTATTGTATCGTTAGATTTATGCGTA
CTTCCGCTTTGCCAACTTATTTGCGTTGCTTTTGTTATATAATCAAATGAGTACAGCCTA
AGGATTTTAACTTTTTTTGATATACTGAGAGCTATTTCTAAGTCGCTGATTTTGTATTAA
AAACTATTTATAAATGATACTAAATTTAACGGCTTTAAGCCAAACATACCAAGTTTTGGA
GTGATTTACATCCTTTTAATTGCAATTTTACTTAAAAATCTATGAACAAACATCATGGCA
TGATGATTTAATTATAAGTGCGGTCATTTAGTTATAGCTCTTCAGAGTTTTGATGACCAA
TATTTTACTTAAACGTTTATTTTTTTCGTTAAAATTTTTAGGCTAGTTTATATTATTCTG
TATAAGTTAGATTCGTTAACTATGGTGTATTGGATTGCACGTAAATATTATAGCTCTCAC
AGCCTCCTTTACTGCTACATGTAGTTGATTTTATAGTCTGATGTATTGTGATAGTTATTG
GTTTGTTTACCCTAAACTAAAAGTCTTTCTTGTTTATTGTTAATAGTAAGTATGTGTGTC
GGTAGCGGCGTAGAGAGGGCTGTCAGAGCAAGCAGTAGTCAGCATTATGTATATGCTTTA
ATGTGATTTTACATGTACTCTTTATATAATTAGCCTCTCATAAATCAATGTTATAATAAT
TAGCGGACTAACTAACAAATTTATTTTATTATTTCTGTTTTAGTGAGATCAGAATAAAAA
TTAAAGAGTTTATATTTTAATTTTACGAAAAAGTTTACAATTTAAAAGGTTTATTATTTA
GTTCTTGATTAAGAGCTCTATTTAAATGTATAATTGAATGCAAAATAACAAGTCAAGATT
CTTTTAGAAGCCATGTAGTGGAGAAAATAAACGTGCCATGATATTTGTGGCTGAAAAAAA
AAAAAA
(5946 bp)

- SilkBase 1999-2023 -