SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaMG_comp26955_c0_seq15
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_probable_queuine_tRNA-ribosyltransferase_isoform_X2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0006400 P tRNA modification
GO:0008033 P tRNA processing
GO:0008479 F queuine tRNA-ribosyltransferase activity
GO:0008616 P queuosine biosynthetic process
GO:0016740 F transferase activity
GO:0016757 F glycosyltransferase activity
GO:0046872 F metal ion binding
Transcript
Level		FPKM:0.84 TPM:0.71
ORF EntryO_TrvaMG15184_complete:A_TrvaMG_comp26955_c0_seq15
Sequence
(Nucleotide)
AAAAAATATTAAATAGTGTCGTTCATGTAAATTTGTAATTTTAAATAACTAATAATATTT
TTCTTAAAGACATTATACTTATAAATTGTTATTTAATTTTATAAACTCCTGCTTGTGTAA
AACGAAATTTCAGATTTTCGCTCGACGAAACTTATAGCATGGTGTTTTACTTCACGAGTA
ATGTTGTCGCTCCTTCAGTGACATTATTTATGGGAGCCGACAAGAACGAAAATGAAGATT
TAATAAAATGGGGTTGGCCAGAAGATGTGTGGTTCCATGTAGATAAAGTGTCTTCTGCAC
ATGTGTATTTGCGGCTTGGTCCTGGTCAAACCATTGATGACATACCAAATTCAGTACTGG
ATGATGCTTGCCAGCTTGTTAAAGCTAATTCCATATTAGGAAATAAAATGAATGACATTG
ACATAGTTTATACAATGTGGTCAAACCTAAAGAAGACAGCTGGAATGGAGGTAGGACAAG
TGGCTTTCCATAAAGATAAAGAAGTGAGGAAAGTAAGGGTTGCTAAAAGAATCAATGAAA
TCGTTAACAGATTGAATAAAACAAAGGTAGAATCTTTTCCTGATCTGAGACAAGAAAGAG
AAAACAGAGACAGGCTAGAAAGAGAAGATAAAAAGAAAGCTTTGAGAGAGAAAAAAGAGA
AAGAAAAAGAAGAAGAAAAGCGAAAAAAGGAGGAAGCAGAACTCCGAAGTTATTCCACAT
TGATGAAACCGGAAAACATGTCTACCAACCAGGATGGCAACGACTCAGATGATTTCATGT
GACAAATATTTAAATACAAAGTCATTTTTTAATTTAATGTCACAGAGCATTTAATTTTGA
TATCTTTTGCAACACTTGGCTGATATGCATAATGTAAAATAATTATTTGGTGGAATGATT
TTGAGTAACTCTTCAGCCATATTGTGCATTTTGGAGAATGGATGATGAATTCATTCAACA
TGAATTTGTTAAAGCTGGCCTGATGAGAAGCTTAGGTATTGATAATGTTAATTTATAAAC
TCATAGCTTTGTTTATTGTGGAGATCTGTATTATTCTGTATCTATAGTGGATTTTGATAA
GATTTTAAAAATGTTATTCTTATTGGATGGTAACAGATCAATTGGACTGTGTTGTAGAAT
CTAATGATTACTATTGTTTATGGATTGCAATCAGAAATAGATTCAGTAAAATAAAACTGT
TGATGATGCCCAACAAGTCTGCAATTGTACCAATTTGTGCATGAAGCTGAACAAATAAAA
ATAAATAAATCCAGTAGTAGACTTTTGATCTCATTTTGAGTTATCAATAGCATCTAAAAG
TAATAGAAATGGAAACAAAGGTTAATATTTTAAATAATTTATTAATACTAAACTTAATAT
AAAAATGTTATAAACAGTCCAGAATTTGAATACATGTTGTTTTTAGAAAATATTTTATAA
AGCTTTTGTATTGTGCTAAAATGAATCTAAAATAAATGTATACCAACAGAGCCCAGGGAA
TTTACAACCCAAGCTGGGTATTGGCTATTAGGATACAGTTGATCCACAAAACATTTTACA
AAATTTGGGAATGTGCCATTTTCAATATTATCTCTTATTGTCTGCATAAGACGCATCTGA
AAATAGGAAATAGTAAATTAAAGTCTTAACAAAAAAAAGAGAATTTCACATTAATAACTT
GTAGATTAACATTACTGTATGATATTTGTTAATACCTGATATGCAATGTTGTGTACAGAC
AGCAGATGACAAGCAACGGTTTCAACAGTTACAATATTATGTAGATAAGCCCTTGTGTAA
TTCAGACATGTAGAACAAGTACAATCTTTGTCAATTGGATTTAAATCGGTTTCATATTTT
TTTTGCTTCAAATTCAACTGCCCTATATTGACTAGTGCACATCCAAATCTCTGAAATTAT
GCAAATATTGTACAACACAGCTTGGTTAATGATATAACTGATGAATAAAATAACTTACTG
CTGTGCGAGTTGGATAGACACAATCAAACATATCTACTCCAAGAGCTACACATATTACAA
TATCTATGGCAACTCCAACACCCATCAGATATCTCGGTCTATTTTTGTCTAGTATTCCTG
TACTTAGACTGACCATTGGCCAGAAATCATCTTTTGCTTCACCTCCACTTAAACCCCCAA
TGGCAAATCCATTAACATCTTTGGTCATATGCTCAGTAGCACTTTGTTCTCTTAACTTAG
TGTTCAACAAACCTTGCACAATTGGGAATATGCTTTGTTCAGAAGGTCTTCTATGTGCTC
TGAGACATCTGTCAAGCCAACGACTTGTCCTTTCAGTGGCCTCTTGATTTCTTTCATGAT
TCTGGTTTGTGGTTTGTACTACATCATCTAGTTGCATTATTATATCAGCACCTATTGTAT
TCTGGATTTCAATAGATTTTTCTGGAGTTAGCATTGTTTCTGATCCATCGTAAGGTGATT
TAAATTTCACTCCTTCTTCGGTAATGTCTGCTAACTGAAGAAGTGATACCATTTGAAATC
CACCAGAATCAGTAAGAAGTGCTCTATCCCAGCCCATGAATTTATGTAAACCCCCAGCTT
TTTGTAAAACATCTGTTCCTGGTCGATTTCCTAGATGATATGTATTTCCTAATATTATTT
CACAATCCAAATTTTGTAACTGTTGGGGCAAAAGACCTTTCATTGTTCCCTGAAATTAAA
CTTAATAAAACGCTAATTCAAA
(2722 bp)

- SilkBase 1999-2023 -