SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaMG_comp26891_c0_seq2
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_endophilin-A_isoform_X2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0002102 C podosome
GO:0005515 F protein binding
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005768 C endosome
GO:0006897 P endocytosis
GO:0008289 F lipid binding
GO:0016020 C membrane
GO:0019902 F phosphatase binding
GO:0030054 C cell junction
GO:0031901 C early endosome membrane
GO:0042802 F identical protein binding
GO:0042995 C cell projection
GO:0051020 F GTPase binding
Transcript
Level		FPKM:0.77 TPM:0.65
ORF EntryO_TrvaMG14729_complete:A_TrvaMG_comp26891_c0_seq2
Sequence
(Nucleotide)
CTTTTTGCTTATTTTTACTGTAATTCTTATTTATTTAATTTCAATTTGTTTTAAGTTATT
TTGTTTGATTTATCACAGGCCCTGGTAGGGCCAGCCCTTATATGAGTCCAAGCCATGGTA
CAGCAAGACATGGTATGTTAAATACCTAAACTTTACACGCTAGAAGCTATACACTAGAAC
GCAACACAAACACTTATTTCTGTAGATTTAAGATTTGCTTGTTTCTTTCATGTTTTTGTT
CCCGCCTTGGCACCGTGCTCCTTGCGATTTGCAATCATCTCTTCATTTATAACCGGGTAT
TTACGCCGTTTGGTCTGTATTGGTTTCTTTTGTTTATTTTTTTGTTTTTGTTACTCTGCT
TCTGTTTGGATCATCTTGTGCTCGTTCATTGACTGGATTTATTGAAGCACATTTACATCA
GGCTCTCACATTCCAGACGACGAGATTAGACAGGCGGAAGAGAAGTTCGCTGAATCTTTG
CAACTTGCCCAAGTCGGGATGTTCAATCTTCTTGACAACGATGAGGAGCAAGTGGCACAA
CTTGCGTTCTTTGCGGAAGGTCTGTTGGAATACCATCAACAATGCACGGAGATCCTGAAA
GGGCTTGCTTCTACACTCTTGGAGAAGAAAGAAGAAGCGATCAACCGTCCCAAGATGGAG
TTCGTTCCGAAGACGCTGGCCGATCTGAACATCGAGGGCATACACGAGTTGAACCACGGT
AGGCGGTACGGTTCTAGTCAGAGCCTCTCCCGTCCCCGCCAGCCCCTCCCCCCGTCCCCG
TCGGTCGGCGACCTGCGTGACCCCCGCGACCCCCTGCGCGCCTGGGACCAACACCCCCGC
CCCTCCCTGAGGCCGCACCCCGCCCCCCGCGCGCCGCACAATGGACGGGACCCTTGGACA
GCTTCGCCACTCCCGTCGCCCGTTAAATCTCCAGCGCGAACCCCGATGGTGCCCAAGGCT
CCATGCTGTACTGCTCTGTACGATTTCGACCCGGAGAACCCAGGAGAGTTGGGCTTCAAG
GAAAACGACGTGATCACGCTGATCAACAAGGTGGACGAGAACTGGTTCGAGGGCAGCGTG
AACGGCAAGACCGGGTACTTCCCCATCAGCTACGTGCAGGTGACCGTGCCGCTGCCCAAC
ATGTAACTAAGGCGCCGCGGCCGCACTGACACGGTTCGTTTGATTCCATTCGATGCATTC
TTAATACACGTCTTACACGAATTTTGTTTTACAGATCTGTAGTATACGATACTTTATGTA
TGAATTTTTATTTGATCATGTCAATGAAATATGAGATTTTTTTGTAAGTACAGAAATAAG
AGTAGGAATTAACTGTCCAATGTGCGTTTCTGTCATTCAATAAACTGCAACTTTTCATAA
AGCATTTTAATTATAAAATGGTGTCGTTGACTCTTATTTCTTAACATTGCAATAATAAAA
CTGATCGTTGAAATCCTAATTACTTATAAAAAGTATGAATAATCCTACTCTTATTTGACT
AGTACCGGATTTTGCAGTATTATGTAGATGATCTACCTAGCTATTTTTGAATTATACGTA
AATTCAATCGTGTCAAAAGCTCAACCCCTCATTACATTACGTATATGGATGTAACATAAT
TTCTATTGGTTAGGAAGTCTTCCCGATATTCCAATTTGTTTTGTAGTTGTTTTCGCTCAA
AAAATATTTTGAGTATCAAAACAATTGTATGAAAACCCCTGTATACAACACGCCAAAGAA
TACCTTAATAATTAAAATGATAAATTAATTATTAGTGTAGTTTTTTTTTTTCATTTCTAG
ACGAATGGGAACTGTATTGAAATTATTTTTTTTTAACTTTACAAACGATCTATTAGTTTA
TTATACTGTAATATTAATTTTAAAATCGTGTTGCCATTTTATTTGTGACTATTATTATAG
GTTTTGCGGGACTGAGTTGGTTCTTGAAGCTCAAAACGGAGTAAAATATCTAACACAATA
GCATTTATGGATTCTAACTAATTCTTTAACGAACTTATCTGAAGTATACCTTCTGTCGAA
TCTAACTTAAGTGATCGTTAAATACATGGTACCTACTGCCTAAAATGTATCATGCTTTGT
ATATAAAAACAAAGAAATAATAATAGCAATGATGTCAGTTTTAATGCTGCAGATAAAAAA
ACAAGTCTATGATTGATTGGTATAAACTCGGGAAATGCATATTTTGATAAGAAAAGCTGA
TAACGTGATGATAATATTGTTGATAAATTCAGTTTCAGACCAACTCAGTCCGAACATTTC
CAAAAAAGTATTTTTACCGGGCTTTTTTATTTTGAACAAAGTTCTGTTTAGATAGATCCT
TGATTAGTTGTATTTTATGATTATTTAGATATTCAAGTGAATTAGTTTTATTAATAATAG
TTATATACTTTAAGATTATTGTTGATAGGATTGCAGGACTGGAAAACTTTGAGCTTGTCC
AAATTAATAATTTATTAGGGCAGTCAATAAATCATCGTCTCAAATCTATAGCAACTAACT
CTAACTGCCACGTAGGCTGCCGGTGTCTCTCTTAGCGATTTGTTCTTATTCTTCGATAAA
GTTGGATTACACAGGAAAGGAAAATATTATTTAGGTTGAGCTCGAAGTTTTAGTATGGCA
GCATTTTAAAGTCAGGGCTGTCAAGGTTTATATAATCGCAGGTACGCTTAGTTACCTCAC
CAATTTTATTTTGAATACAGACGAAATGCACATAATATGCTCGACATAGTTGATAAAATT
TTCAGCCTCAAAATATTCCCTCTTCACAGAGGAAATATTACAGTTTTAAATAATAGAATA
ATAAGATCTCATTGGCAGCTCTGATAGATTCCGGACAGGTGGTATTAAATAATTTAATTA
TATTTACTGTAATATTCTACAAAAAATAGTGCATAATAATATATTTTGCTAATGCAACTT
TTTATTTTTAGATCCCTTTCATGTGTATTTGTCTGATCATGTTTAATCAATTATGTTCAA
ATTTGGCACTATTTATTAGCTAGAAAAATAGTTTACATTATGTAGTCGAATGTTTGAGAT
TAGATTTTGTAGTTAAATATTTGTGCGGGTAATTTTTATGTTAAAATTTAAGCGATTATT
ATGAAGTTAGTCATCGTGAGACATTCGAAAATTGGTGGATGTTAAAATTTATCTTGCCAG
CAAACATGATAACAAGAGAAAAATTCTCATTATTGTGATAAGAAATCTTCATATTCGATG
TATTTTAGTAAGTGTTAATTATGAATTACGATAATATGATATTCATTCATTTAATATATT
CAAATCTAATCGCAACTAAAAGCAAATAATAAATTTAACTAATTTGTCGTTGTGGTATTT
GCATAATACCGGTTGGATAAAAATTTTTGGCGCGTATTTCTGTTCCATGAATTATTCTAC
TGAACAAAATATATCCCAGTGCAAAATGTAACCTTCATCATTATAATAAAATATAAAATT
TATTAATGTTTAATACATGCATAACCTTAACATTTTAAAATAATTATTATAAATTTAAAT
GTTGTTGATGTTGCAATAATGTTTGAAAATGAATTAAAATTCATCGTATCATTCGCGTAG
TAATCGAAACCCATTAGATCACGTATCTGGCATACAAAAGACAATACCTAGATCTAATGT
TAGTCGTATGTAAGTTCATAAATGAATTGTTCTATCTTCAAGTGTCTCTTAATATAAGTA
TATTATGGAGTATAATAAATTAATATTATCTTCAATGTTACAAAAATCTATATTTTAAAT
GTTAATAAAAATCGCAATGCGGTATGATAATTGCATGTCGTTTTGTCTTCAAATTTTTAG
GTACCTACTCACCTCTTCGTTTCAATATCTCGAAGATTAATGTTTGTCATTGTATAAAAT
CTTATCTTATGGCTTGCTAAACGATTGTTGAGAAGATGAGGTTCGTTAGGTATGTTGTTG
CTTCGCACCATGAGTGTTGTAAGTTTTATTAAGACAAATCTGTGTTTCTGTAAAACAACT
GAAGGTGAGGTTGCTAGTAATGTCATGATGTTAATGTCTTTGCTTGATATCACAACATTA
TTTTTAGTAAACTAAAAATCTTGTCCTAATAATTATATTTCTCAAGTCGAAATTCACCTG
TGTGAAGTTATAACGTACTTTGCGTACATTCTCCCCTTTTATTTTAATAAACTGTAGGTA
TCTTTGACTTTATAACAAAATTGTAAGTCTGGTTTACTAGAAATAATTTTGTGTAGTCTT
GAATTATAATATGTAAGCCTGTCTAGTTAACAGTGGATGTTGTCTGTTATTATGTACTTC
TTGTTCATGTTACTATAATCTTGAATATTGTGCAATTTATAAATGTATCTTCATCTTGAC
GATTTGTGAATTGTAATGCAATAAATTGGTTTGTATTTGAAGATATTCAAAACGCTCTTT
TTCGCCTATTAATAAAATGTTAACAATTAAAAAAAA
(4476 bp)

- SilkBase 1999-2023 -