SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_TrvaMG_comp26208_c0_seq3
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_RNA-binding_protein_Musashi_homolog_Rbp6_isoform_X1_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0003676 F nucleic acid binding
GO:0003723 F RNA binding
GO:0003727 F single-stranded RNA binding
GO:0003729 F mRNA binding
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005844 C polysome
GO:0008266 F poly(U) RNA binding
GO:0048864 P stem cell development
Transcript
Level
FPKM:19.82 TPM:16.69
ORF EntryO_TrvaMG11865_5prime_partial:A_TrvaMG_comp26208_c0_seq3
Sequence
(Nucleotide)
GAGGGCGCGAGCGGGCGGCGGAGGCGCGCGGCGGGGGCAGAGGGGGCGGCGGTGCTCTGC
GTGGAGGGGTGCGCCGCGCCGCGCCAGTCTCGTGCCGGTAGTCGGTAGTGCAACCGAGCG
ACTCCGGGAGCCGTGCGCCGCTTCTCGCTCGAACGTAGTCGTAGTGCCGACTGGCTCGCA
TCGCGTGCCCATCTCCGCGAGCCCCATGGACACCCAGAACCAGGATGTGACCCGAAGCCC
CGCGGACCTGCCCAACGACCCGGGGAAGATGTTCGTCGGAGGACTCAGCTGGCAGACTAG
TCCAGAAAGCCTTCGAGACTACTTCAATAAATTCGGAGAAATCACAGAAGTTATGGTTAT
GAAAGACCCAACTACGAGGCGGTCGAGGGGTTTCGGTTTCATCACATTCGGCGATCCAGC
TAGTGTAGACAAAGTATTAGCTCAAGGAACACACGAATTAGACGGCAAAAAGATTGACCC
AAAAGTGGCGTTTCCCAGAAGAGCACATCCAAAGATGGTTACCAGGACGAAGAAAATTTT
CGTGGGAGGGCTATCAGCACCTACAACGCTCGAAGATGTCAAGAATTACTTCGAGCAATT
TGGACCGATCGAGGACGCCATGCTAATGTTTGACAAACAAACCAACAGGCACAGAGGTTT
TGGCTTCGTCACATTTCAAAGCGAAGACATAGTAGATAAGGTGTGCGAAATACACTTCCA
CGAAATCAACAACAAAATGGTGGAATGTAAAAAAGCTCAGCCCAAAGAAGTAATGCTCCC
AGCAAATCTGGCGAAGACGAGAGCTGCAGGCCGCGGCGCGTACGATTTCATGTGGTCATT
GGGTGCTCTTCCTGACGGTTTTCCCGCAGCATACGCCGCCTACGCGGCCGGACGTAGCTA
TTCGGGCTATCCTAGCTTCGGGCTGCCCTACCCAGCAGTTGACCTGACCAACGGCCAACT
CACACCGAACAACAACACACCGCTGCTCGCGCAGGCGCTCTCAGTGATGAACAACTACCA
GGCTGCGGCGGCTGGGTTTGGTCCGCCGGCATCCCCTCACGCCGCTGGAGGCCGCGCCGG
GTTTCCCGCCGCCAGCTCCCCTGGCCCGGCCCTCGACGTCTACGGCTCTGCAGCAGACAG
CGTTGGCTACGTCCAGGCAGCTAGCCCCCAGCCCTCTGGATTCCCCGCGATTGCTGTCAG
CCGCGCTCCCCTCAATTACACCCCAGGACCCCTGATTCCGGCGGCTTTCACCAACGGATA
TCATTGAAAGTGTTATAGCACAAATATTTTACGTGGCGAGCGGTGTGGTGGCGCATAGCG
TCCCTTTGAAGTGCCGCCCTCCCCCGCGCCGTCCGCCGCCGCCAGCGCCTCTCCTCCAGC
CAGCGCGACGACTCCAACGATCCTCGCCCCTGCGCGGCCGCAACACAACCCCATCCCTAT
CCCACCCCACACCCGGTCGAAATGACCCCGTCTATTGTAAATAACTTTTTGTCGTGTGAA
CGAATCATAGTACTTATATCAATTAAACAGGTATTTTTTCAATTTTTCTCGCTTTCGTCT
GTACCGTAGATGTGTTTACGATTTAAACTTACAAAAAAAATACATTTCATAATTATAATG
TGCATGTAGACGTTTGCAGGGAGGTATGTCTTAATATTTTATAATTCATAGTTAATTACA
GTTAAAGTAATCGGTCCCTTGCGCGGGACTTTAGATAAGTCAATCTGTTAAGAATGTTCT
GACGTCCAGTGCGTCTGCATGGTAGGGTTTTCAATAGTTCGCTTTGATAAAATGTTGTAT
GAAGTCCGGCGTTAGGAGGCATCGAGATCGTATCGTATCGTAAGCAGCTTGTCCCTGTCC
CATTCCGTGTGTTCCGCGAGCTGGTGGGCAGCAGACCGCCGCGACTGCCACGCGACAGTG
ACGCGACAGCGACGCGGCTGCGATGCGACCGCAACGCGACGGCTGGACACCGGAGACAGT
AACGCGGTGCGACACTAGCGCCTTCTCGCTCGTCCACCGACACATATTTTATTCTATCTA
TTTTTAATATTAATGTCAAAATATTAACGTAATTATAGTAATATGTACTATCGCATATTT
TATCTATTAATGTAATTATTTTTCTTCTTATTCGAATTGTATGATATCACTACTTTGAAC
GGCTGTTCTTTTTCTGTAGCGAGTTTCTCGATTACTTCCTTAAGACTATGTTAGTAACGC
ATATATACAACTTCTTATTATTATATATTATTATGATATAAATTTTTATCCTAAGGATAT
TGATTCATGTTAACGTTTGGAGTACTAAGTCGAAATTTCTGAATATCTCTCATGACGTAT
TAAGAAGATTCAATTCAATCTTGTACCTTTGAACGTAGGTATTGTAATTATAATTAATGA
CAGTTTTTATGTATTACGTAATAAGTATTTCATTGTTTCTTACTATTGTATTAACCGTAT
ATTTAAGACCACTGTTAAAAATCAGACTCCTATTGTATCACGGAGTCGCACTGTACTTAG
TCGTATTCAAATTTTAATCAAAATAAACTTTCGAATTTCGTACATTCACAATAGACACAC
GACACGTCACTTTGAATATTCCAAAGACAGGGATATCAAAAATTCAGCCAAAGGCGCAGG
TTTGAGGTAATAGAATAAAATATGAAGTCAATTCATTAATCATATTCGTTAGGTACTGGA
TTTATCGATCACATAATTTAGTGTGCGTCACGGAATAGTCGGTGCAGAGTCTGCGTCGGC
TCTGCACCGCGTCGGCAGCGGCTGACTGCCAAACGTCCAACCGCGAATCGCTCGCCGCTC
GCCGCTCGCTACAATACTTGCACTCGGTTGCATTCATTCATTTTTTACTATTATAACTCA
TTATCTACATCAATTAAACATTAATATTATTAAACTAGTTATTAAATTTTAGGTATAAAT
AATAAACAATCTTTTAAATGCTATTATTAAATACGTTATTAATATAAATGTTCCCTGTTT
AATAAAAAAACATTGAAAACGGTACGAAAGGAATCAATATAGTTTTGAATGGATATTCAT
TACGTTGTCTCGTCTCGTGCGTAGTTAATTAAATAATGGAGTGTAAGAGGGAGTGCGGCG
CGCGCTCGCGTCTACATTTCGTTTGTGCCGAGTCGTGGCCGACCCACCGCACTACGCGAC
CGCGATTATGTTGTTATGAACCTTAGCTAGGAAATTGATAATGAAATCGAAAGGTGTGAG
TCTATAGGACGGTCGGAATATCGATATCATACCTAACAAAATAACGTAATTATTTGTTTT
ATATTTACGGTGTTATAGGTATTTAAGACTTTTTTTCTTAGAATATTTAATTATTACGAT
GAGACATAACGTTTAGTGATGGCGGCGGTGGGAGCCTACTCTCGCCGTCGTCGGTCGTCT
CGTTCTCTTTTACATCCTCACTATAATTATATTTTCTTACCGACCTTTTTAATGTAGGAG
AAGCGCACACGGTTGCTTGTTCCCGTGCGAGTACTACAAACAAACATTCATATAGTGAGA
GAGGTTTGTATCGCCGTTCGTGAGAAGCCATCGGTTCGCCGCGATCACATCGAGATGAGA
TATGATGACAAATTGTATATAAATAGTTAGCCGCATGTGTAAAAAGACGTTAGGTTAGCG
CCACACCTCGGTGGGTATTGTGCGAGACCGAATTCGCCGCGAGCGTAATTTACGGCTGTA
AGATTCAAAGCGCCGAATCAAGAACACATCTCGACGGCGTACGTACACTATGTTTAACGA
CCAATCGAAAGCAATAATAGCTTATTTTAACATATCTTCGACGTAAACAATAATTATTCA
AATTAATAATAATGATATGATTAGTGCAAGAGTCAGTGTTCGAAATTTAATTGTTGATTT
TATGTGTGTTTGTAATTAGGGACGTTAAAAATAGTGTACAGTGAACAATCGCAACGCTTA
GTAACTCATACCATCTGGTCGATATTAGAATCATGGAGCTGCAATCAGGATTAGCTTGAC
GGATCTTTAGTTTCATTGTCGTTGTTATAGTTTTGTGGAACGTTTGTGAGTTTGTTTTTA
ATCACCTTGAGAGACTCTTAATACGGTTCATGTCAGACGCCATTTTGTGAAATGCGATAG
AAGAATTGATAGACAAAATTGTATTCGTATTTCGGAACATCATGAATAGTACCTATAATT
GGAATAAAGCATAGATAAATTCGTGGCACTGATATGGACCGCAGTTTCGAAGCCAGACCA
GACCACCGTCAGTATCGCGGTAATATGGTTGCCAACAACCACTCGATGGCCGCGTCTCAA
CTACTACTCTCGCTTGTTCCTAAACACGTTAGTTTACTTCTATCATTTTAGTTGTCTTCT
CTATCACAATAAAGACTACGTAATAATAAGCGAGATCTCAAATTTTATTTAAAAATTCGT
TATGTGATCCTAGTATTGCGACTTATCGTATGTATTGTAAATTAAAAAGATAATTTTATT
ATATTTTGTACGATGACATTCTACATTATTTTACACATGATCTACTATTATTGATATTAA
AGATAATAATTAATTTTAATCTAATAACGTGACAGACTGGTAAAGTTGGTAGATTCGCCG
CAGCGGCCATAGATCAGTAGCTTTGCATATACGGCGATGGCCAAGTGAACATAACAAGGA
CCAAAGGTATAGATATTCGCGTAGAACCGGACGCGCATTGGCTCCGCACGAACAGACCGG
CCGATCGGTAGTCACTAGTCAGCATGGTGCCTGCACTTTGAGAATCACTGGCGTCAGTGG
CGTTTACGACATCACTGACGTCACCGGCGTCACCGGCACCATCGGCACCAGCATCCCGCC
CCGCGTAACGCGTCACGCCGCTCGCTTACTTCACTTTTCGCGGTTACTTCTCGATTGCGT
GCTTCGCGTGCTGACTGATTTTCTATAGCAATAAAAATTTTCAATTACCTAAGATTTTAC
ATTAAAAGTAAATTTGGATTTATATACGTTCGAATTTGGTGTCATGTACATTTAAGTGTT
AGAGAATGATGTTAATGTTAGGCGAACGAGCCGCGTCGTGTCTTCGCGGCGTCGACGCGA
TGTTTTCGTCATTTCTTCGTGTATAATATGTTACATGAATCTGTATACAATATGGATATA
AATCGTAATAATGAATAAAATTAGTTTTTACGGCATCTCTTTATTAAATAATGATAATAT
CAAAACGTTTTGTAAAAAGCGGTGGGTACGTCCGCCGCCCCGATTTCGTGCACCAATGCA
CTTCTTATTGGAATATTACATTATATAACGTACATAATACTATGATATATAATCATACAG
CCTCTCGGGGCGCGCGTGTATGGCGATGTATGTATACCTACACATTGTGCAATGTACATA
TACCTATTATAATAAAATGATTTAAGACAAGGTTCACATCGTGCCGTGTGTATGTGGTAA
TAAATATAATATGGACATTGTTC
(5483 bp)

- SilkBase 1999-2023 -