SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaMG_comp26205_c1_seq1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_RNA-directed_DNA_polymerase_from_mobile_element_jockey-like_isoform_X1_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0003964 F RNA-directed DNA polymerase activity
GO:0006278 P RNA-dependent DNA biosynthetic process
GO:0008152 P metabolic process
GO:0016740 F transferase activity
GO:0016779 F nucleotidyltransferase activity
Transcript
Level		FPKM:5.49 TPM:4.62
ORF EntryO_TrvaMG11857_internal:A_TrvaMG_comp26205_c1_seq1
Sequence
(Nucleotide)
TAAACTTCCTTTGTGGGATGCAGGTAGGACACTCCAAGCATAACTTTAATTATAATGCGT
TGAGATCTTTCCAATTCAATAATATAAGACTTAGCAGCCCCCCCCCAAGCACAAATACAA
TACGTTAGTATACTTTCACATAAAGATTTGTAGGTTTGAATTAAGATTTTGAATTTAACT
ACTTTACGTATATTTTTGAAAATGCGTGTAAGTACTCTCAGTCTAGCTGACATTGCATTA
ATATGACATCTCCAATTAAGCTTGTTGTCAATAATAATACCTAAATATCGAACATTACTA
ACTTGTGTCAGTTCAGAACAGGCACAGTGCACTTCAGTTGATCTATTGCAAGGATAGGTA
TGTATCTTTATTTTAAGATTAGAGGGAGGTTTGGATGCATCAGTCATTCGAAAGCAAATA
CACTTTGTTTTTTCAATATTTAGAGACAGAAGGCTGTTTTCTAACCACGCCATAATATTT
GATAAGCCTTTCTCTGTTGTTGTTTTAACACAATCCCACGTTTTTCCATGGAACAAAATT
GCAGTATCATCTGCAAACATAAATAGGTCTGCCCCTTGAATGTTAAGTTTACTCAATTCA
TTAACATAAATGAGGAAAAGAGTGGGCCCAAGTGTCGAACCTTGAGGAACACCGTATGTA
CATGTACTTGTATCACTTAAACAACCATTAATCTTAACCACTTGTTGTCTGCATTTAAGA
TAATCTTCGAACCACGAGAGGGCCAAACCTCTGATTCCTATATTTTGTAGCCGTGCAATC
AAAATAGGCAGCGATACTGTATCAAACGCTTTTTGGAGATCTAGGAATATACCTATACAT
TTCTCACCCTGGTCCAAGAATGAATTTAATTGGGACGTGAATCGCAGGATGGCGTCATTT
GTTGAGCGTTTTGTTCTGAAACCATATTGATTTGCAGCTAATAAATTTTGTTTTTCAAGA
TATGTAATTAAGCGTTTATTAATTAGTTTTTCTAATATTTTAGATAGTGTAGATAAAAGT
GAAATAGGCCTATAATTACTAAGTTTTTTTTTGTCACCAGATTTATGGATTGGTATTACA
ACTGATTTTTTAAAGCATTTCGGAAACACCCCACTTTGCATACTGAGATTACATAGGTAG
GTTATAGGTTCAACAATTAGTTCCATGTGTTTTTTTAGTACAGATGTAGTAATATTGTCC
CACCCTGGAGCACTGTGAGTTTTCAAGCTCAATATAATTCCCTTTATTTCCTGAGTGTTA
GTAGGGATCAATGAAAATGAATTGCAAGGTCCATTTAGTGACAGTGCAGAGTTTGATAGG
TAAGTATCAGTTGTGTTTAATTTTGTTAAAATTTTATTAGCTAAAGTGCTGCCCACAGAA
GTAAAATACTGGTTAATTTCATTTAATGATTCCTTGTCGTTTTTACAAATATTTAGAAGT
TCTTTCGAGGTGTCATATTCAGTCACTTGTTTAAAATTACAGATTTCTTTTATTAATTTC
CAAGTTTGTTTACTATTGCCATGATTTTTTTTAAATTGCTTTTTGTAATACTCTCTTTTT
AAATGCTTTATAATTTTGTTGCAAATATTACGATATTTTTGATAATATTTTTTCAGCTCT
TCATTATCCAGATTTGCTCGTTTTTTAATTCTTCGGTGTAAATTATCTCTCCTTCTCAAT
GATTTTAATACGTTTGGTGTAATCCATGGTTTTAGTGGTTTTTTACTTCTATTGATTTTA
TTTACCGTTGTATTATTATCAATCACTGTTTGCAAATTAGATATCAGAATATCAGCCGCC
GTGTTAACATCATTTATTTTAAAATATTCGTTCCAATTTAAAAGTTCTAAATCGGTTCCT
ATTTGTTTTATATTACTTCGAATGTAGTTGTACTCGCTTAAGTTATTGTTATTTACATTT
TTTTTCAAACAAAGTAATATAGGACAATGATCAGTGATTGGTTCAAAAACAAAGGAACGT
GCTTGATGGGCGGATTTAACCATGAAGTGGTCTATACATGTACTAATTCTCGTCGGGCAG
TTTATTTCCGGACGTAAACCGTTAGAAGCCAGCAAATTAAGATATTTAAGGGCAACTTTA
TTCAGATTATCTGGCATAATATCAATATTAAT
(2132 bp)

- SilkBase 1999-2023 -