SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_TrvaFAMAMG_TR9946c0_g1_i13
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_queuine_tRNA-ribosyltransferase_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0006400 P tRNA modification
GO:0008033 P tRNA processing
GO:0008479 F queuine tRNA-ribosyltransferase activity
GO:0008616 P queuosine biosynthetic process
GO:0016740 F transferase activity
GO:0016757 F glycosyltransferase activity
GO:0046872 F metal ion binding
Transcript
Level
FPKM:0.18 TPM:0.18
ORF EntryO_TrvaFAMAMG11026_complete:A_TrvaFAMAMG_TR9946c0_g1_i13
Sequence
(Nucleotide)
GCTAATGCATCAAAAATAGTACGTTGTGATTATATTACAAAAATTGCATAATCTATACCA
CATTTTTTATTTTTTAGGTTCTGAATTCAACCCTGTCGTTAAAAGAATACGTCAAAATTA
CTAATCTGTGACGTTAAATGTCAAATTAATGCTAGTCTTCCCTTCCGAAACTCAGACTTC
CGAAACACACACGAACAGAATTTGTATTGTTAATTGTTATTAGGATTTCGCAATTTTTAA
ACAAAATATCCATGCTTGCAACAGAGAGTAAAGCCGCAACCCCGAACACTTAAAGTGGAG
AATAGAGCATAAATATAATTTTTAAAACAATATGAAGACAAAACCAACCGCATTAACTTT
TGATATAAAAAGTGAATGTAAAACAACTAGAGCACGCTCTGGAGTTATGCATTTACCTCA
TTACGATGTGAAAACCCCGGTATTTATGCCCGTAGGAACACAGGGAACAATGAAAGGTCT
TTTGCCCCAACAGTTACAAAATTTGGATTGTGAAATAATATTAGGAAATACATATCATCT
AGGAAATCGACCAGGAACAGATGTTTTACAAAAAGCTGGGGGTTTACATAAATTCATGGG
CTGGGATAGAGCACTTCTTACTGATTCTGGTGGATTTCAAATGGTATCACTTCTTCAGTT
AGCAGACATTACCGAAGAAGGAGTGAAATTTAAATCACCTTACGATGGATCAGAAACAAT
GCTAACTCCAGAAAAATCTATTGAAATCCAGAATACAATAGGTGCTGATATAATAATGCA
ACTAGATGATGTAGTACAAACCACAAACCAGAATCATGAAAGAAATCAAGAGGCCACTGA
AAGGACAAGTCGTTGGCTTGACAGATGTCTCAGAGCACATAGAAGACCTTCTGAACAAAG
CATATTCCCAATTGTGCAAGGTTTGTTGAACACTAAGTTAAGAGAACAAAGTGCTACTGA
GCATATGACCAAAGATGTTAATGGATTTGCCATTGGGGGTTTAAGTGGAGGTGAAGCAAA
AGATGATTTCTGGCCAATGGTCAGTCTAAGTACAGGAATACTAGACAAAAATAGACCGAG
ATATCTGATGGGTGTTGGAGTTGCCATAGATATTGTAATATGTGTAGCTCTTGGAGTAGA
TATGTTTGATTGTGTCTATCCAACTCGCACAGCAGTAAGTTATTTTATTCATCAGTTATA
TCATTAACCAAGCTGTGTTGTACAATATTTGCATAATTTCAGAGATTTGGATGTGCACTA
GTCAATATAGGGCAGTTGAATTTGAAGCAAAAAAAATATGAAACCGATTTAAATCCAATT
GACAAAGATTGTACTTGTTCTACATGTCTGAATTACACAAGGGCTTATCTACATAATATT
GTAACTGTTGAAACCGTTGCTTGTCATCTGCTGTCTGTACACAACATTGCATATCAGGTA
TTAACAAATATCATACAGTAATGTTAATCTACAAGTTATTAATGTGAAATTCTCTTTTTT
TTGTTAAGACTTTAATTTACTATTTCCTATTTTCAGATGCGTCTTATGCAGACAATAAGA
GATAATATTGAAAATGGCACATTCCCAAATTTTGTAAAATGTTTTGTGGATCAACTGTAT
CCTAATAGCCAATACCCAGCTTGGGTTGTAAATTCCCTGGGCTCTGTTGGTATACATTTA
TTTTAGATTCATTTTAGCACAATACAAAAGCTTTATAAAATATTTTCTAAAAACAACATG
TATTCAAATTCTGGACTGTTTATAACATTTTTATATTAAGTTTAGTATTAATAAATTATT
TAAAATATTAACCTTTGTTTCCATTTCTATTACTTTTAGATGCTATTGATAACTCAAAAT
GAGATCAAAAGTCTACTACTGGATTTATTTATTTTTATTTGTTCAGCTTCATGCACAAAT
TGGTACAATTGCAGACTTGTTGGGCATCATCAACAGTTTTATTTTACTGAATCTATTTCT
GATTGCAATCCATAAACAATAGTAATCATTAGATTCTACAACACAGTCCAATTGATCTGT
TACCATCCAATAAGAATAACATTTTTAAAATCTTATCAAAATCCACTATAGATACAGAAT
AATACAGATCTCCACAATAAACAAAGCTATGAGTTTATAAATTAACATTATCAATACCTA
AGCTTCTCATCAGGCCAGCTTTAACAAATTCATGTTGAATGAATTCATCATCCATTCTCC
AAAATGCACAATATGGCTGAAGAGTTACTCAAAATCATTCCACCAAATAATTATTTTACA
TTATGCATATCAGCCAAGTGTTGCAAAAGATATCAAAATTAAATGCTCTGTGACATTAAA
TTAAAAAATGACTTTGTATTTAAATATTTGTCACATGAAATCATCTGAGTCGTTGCCATC
CTGGTTGGTAGACATGTTTTCCGGTTTCATCAATGTGGAATAACTTCGGAGTTCTGCTTC
CTCCTTTTTTCGCTTTTCTTCTTCTTTTTCTTTCTCTTTTTTCTCTCTCAAAGCTTTCTT
TTTATCTTCTCTTTCTAGCCTGTCTCTGTTTTCTCTTTCTTGTCTCAGATCAGGAAAAGA
TTCTACCTTTGTTTTATTCAATCTGTTAACGATTTCATTGATTCTTTTAGCAACCCTTAC
TTTCCTCACTTCTTTATCTTTATGGAAAGCCACTTGTCCTACCTCCATTCCAGCTGTCTT
CTTTAGGTTTGACCACATTGTATAAACTATGTCAATGTCATTCATTTTATTTCCTAATAT
GGAATTAGCTTTAACAAGCTGGCAAGCATCATCCAGTACTGAATTTGGTATGTCATCAAT
GGTTTGACCAGGACCAAGCCGCAAATACACATGTGCAGAAGACACTTTATCTACATGGAA
CCACACATCTTCTGGCCAACCCCATTTTATTAAATCTTCATTTTCGTTCTTGTCGGCTCC
CATAAATAATGTCACTGAAGGAGCGACAACATTACTCGTGAAGTAAAACACCATGCTATA
AGTTTCGTCGAGCGAAAATCTGAAATTTCGTTTTACACAAGCAGGAGTTTATAAAATTAA
ATAACAATTTATAAGTATAATGTCTTTAAGAAAAATATTATTAGTTATTTAAAATTACAA
ATTTACATGAACGACACTATTTAATATTTTTTTAGGTTATTTTTTTTAAGTAGCCGAAGA
CTAG
(3184 bp)

- SilkBase 1999-2023 -