SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR9945c1_g1_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_uncharacterized_protein_LOC101746298_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000785 C chromatin
GO:0000976 F transcription cis-regulatory region binding
GO:0003682 F chromatin binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0005654 C nucleoplasm
GO:0005677 C chromatin silencing complex
GO:0005694 C chromosome
GO:0006342 P heterochromatin assembly
GO:0006351 P transcription, DNA-templated
GO:0006355 P regulation of transcription, DNA-templated
GO:0016568 P chromatin organization
GO:0031507 P heterochromatin assembly
GO:0045892 P negative regulation of transcription, DNA-templated
Transcript
Level		FPKM:5.95 TPM:5.83
ORF EntryO_TrvaFAMAMG10993_complete:A_TrvaFAMAMG_TR9945c1_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
CAACTTCGGAGGTGTGCGGTCGCCTCGCTCGTGCCCACTACGCGAAAACGCCGCGCCAAC
TGTAAACACGACGCACTATCTACGCGCTGCTTCCGTTCGCGACTTAACCTGGATCCGGCG
TTAAATTTCGCGCCTAGTGTCGTGTTGTGCCAAATTGTGGATGAATTAGTGCTTAAATCG
AGGAACGCAACTACTTCCAACACTTACATAACCGCCGCCGAACACTGCTGTGATAACTTC
TGTGATGTGCGAGACAGCCCACAAATATTTTTATATGTGATTTACTAGTGCCCAGTACAA
ACCGAGTACAGAAAAAAACGGATATTATTTATATTATATAGATTAGTGTAAACAAAACTA
TGAAGGAGGATTGCAAGTTGTGTAGTGTGAATGGTTGGTGTGGTCCAGGGCACACGACTA
CTGACTTCTCCATATCTTCACTGATGAGGCCGGCGGTCCATCACCCAGGACACGTGGACC
CGAGGCAGGACGCCGTGCTCCTGTCAGCGTACCTGTTCAAACTAGGATATTACCAGCCGG
CTGGACCCCTGATCAAAGAGTCGAGCGCAGACGCAGAGCGAGCGCTCGCCAGATACCACC
CACAACCACATTATCACGCGCCGCATCCATCGATGCTGCAACAATACGGTCCCCCGTACT
ACCCGGATCTGTGCTATGGACGATATTACCGACCCCCGGGACCTTACCACATGCCGCCAC
CACAACCAGATGCACAGATGGTCGGTGTGGGCAGCGAGCCATATCCTCCATCACAATATT
ACGGCACGCCACCATGTTATCAACACTCACCACAAAGGATACCGTATGTTGAATACCGAT
GCCCGTGCCCACTGAACGCGTGTCCAAAAAACGTCCTTATTGGGCCCGTTACTGGTAAAG
CCCCCACTGGTAGCGGCCCGGCAGACTTACCCTCAGCCCTCGTGCAGCCCGGGGGCGCCT
TCCGACCGAAGGTGCGGGCCTGTGCGCCAGACACTGCCACAGACACTCACGGCAGTGGAA
AGGATCCTCCACTAGAACCAGAACCACCAGCTGCAGCTGGTGCTCCACATCCATGTCCCC
TCCCAGCCATAGGTGGTGCATCACCAAAACGAGAACTCTATGATATTCGGGAAAAGTTAA
GGATCGCCGGGCCACCTGAAGCATTAGGACCACCATCACCAGCTAGAGGATCAGCTGGTG
TTTGTGCTCCACAACCTCCGCCTGTTGCTCCTAGACGAGCCAGACTCGGTAAAGACATGG
CCAGAAAGTCACTTGCGAGAGACGACACAGGTCTACTTTTATCAGCACCGCGACAACTCC
ATACCAACACTACACCAACGCCAAGCGATGCCGATGATGATGTTCTCGCTATCTCACCAC
CGGTGTGTGGACCTATTGATTTATCATCATCAGATGAACGAACAACTCCACTAGTAGATG
TCAAAAAAGAAAACGAAGGACCCACTTACGCATCAGCTCGCAACCCTGAAGCACAAGCTC
TAAAAGAGCATAACAACTGCGTAATAATTAGTGACCCCACGGTGATTTCTGATGGAGCAA
AGGCCGTAAAACGGAGGTATTCCAGACCAAAGCTTGAAATTGATATGAAAGACTCGCAAC
TAGAAGATGTATGTTTAACGAATGGTATTGGAGAACACGTTAAATTACAAAAAAAGACGA
AAAGTGTCAAGTGATCACAGTGATAACAATATGGCCAGGACAGAAACTATTACAAAGGAA
CCCAAAAAGAGAACTCCCAAAAAATTGTCAAAGACACCTACCGATAAAAAGAGCATAAAA
CGGAAGAGGGTAAAGTCAACTACCAGTTCGAGTGTCAAGAAGATACTTCTAGAATCGAAG
TTAGATGATGACTTACGATCTAATCACATCTCTGCTATTGATGAAAGCCAGGTCGCGAAA
CCAAAAACAAAAAGCGCTCAATTGCTGGATAACTTATTAAGGAAGAACAGCATCGAAAGG
CTAGATGCCAAAAAATATACGTCGGATGGAGAATTGGATCCAGCAGAATTGTTTTTATCT
CCAAACGAAAATGTAGGTCAAAACAAAAAAGAAAATGATGATAAAAAGACCAACATCAAT
AACAACGTGCTAGAAAATACGGTTAATGGAGTTCGACCAAATACAATCGCAGCTGTAACT
CAACTTATAGAAAAGAAGCTAGCCTTAAAGAATGCCTGTAAACTAGAGAAAGTAGATTCC
AAAGTAACTCACAGTATAAAATCAGTATTAGAAGCACCAATTGTAAAATCTGAAATTAAA
GCACAGATCAAGCCTGAAATTGAAGATAAGTTTTTGATTTGTATGGAAAAAGACATTTCA
AAATCTATTGAAAGTACAGATAAAGTGGAAAACAAAAATGAAGAATGCTGTTCAGCTAAT
AATATAATTATCAGCGACATTCCAAGTATACCCACAGTTACAGAACTTTCTACACCAAAG
ACTCCAAATGAAAATGAATTAAATATTTCAAGTGAAGAAATTAAAGATGAATCTCAGAAA
ACGGAAACGAAATGTGAAGACACCGAACAGAAAAATGATTCGGAGTTAATACGGCAAGAT
AGGTCATCGTTGAAACGATGTAAACTAACTAAAGGCAAAATGAAGAGGAAGAACACAGCT
AAATTGTTAATATCTAAGCGACCAGCGATAAAAACTGACGAAGCCACGCAAGTGATTGAA
GAAGCTTGCGCATCACCAACACCTAGTGTGATGTTCAGGGGGAAGACGAGACGAAGAGGG
TGCGGTGGATCGCGGAGGGGCAGACGACCACGGTCTCCGCTCACGTTATTAGATTTCGGA
CCCAAAGCGCCTCCCCGGTGGAGCAATGGCTGGAGATGGGATGGAAGGAGCTATGTTTCA
AGAGTTTACGTCAATAATAGTTCCCGTCACATTCGTACGGCTCGGTGCTGGCCGCGCATG
ACGCACGAGAGCGGGGACAGCGTGTCGCGCGGTGACTGCGTCCTGCTGCGGGCGTCTGTC
GCTAAAGCACAACCTTTCGTCGCGAAGGTTGCCAGTCTATGGGAGAATCCTGATGACGGT
GAAATGATGGTTTCCCTTGTATGGTATTACCGTCCAGAGCACACGCAAGCCGGTCGGCAG
CCCGAGGACGCGCCCGATGAGGTGTTCGCGTCGAGACACCGAGACTCAAACTCGGTAGCT
TGCATCGAAGACAAATGCTATGTACTCAATTTAAAGGAATATTCACGGTACAGGAAAAGG
CTAAAAGCCATAGAGGCAGAAGTACCGACGCGGCCCTCCATAGTCCCGCCGGCTCCCCCC
GCCGAGCTGGTGCCGGGCTGCGAGCCAGCCGACGTGCGCCTGCCGCCTTCCGTCTCGCCC
GAACTGGTACTGTTCTGCCGCAAGATATACGACTTCCGGTCCAAGAGAATACACGTATCC
AACAAGTGAACTCATCTGGACGTTTAAGGACAAACACCAAAGTTAACATTATTAAACGGG
GGCTACCAAAAGTGCTAATTTCCTTCACAAACGACAGAATTTAAGACGCCCCCGTGGAAG
CGTTATTGTGCTTCGAATGGAGGTGCGGAGGAGAGATAGTTATTTCTTGAATCGTAGTGC
CCTATCCTTGATTAGTACAAATACTTTCCCTGGTGCAAACGTTAGTGTGAACTATTGCTA
TTTGTGTGAAGTAGATGTCGCTTGTGTCGTGATTCGTGGTAGATCGTTTTGTTTTTAATT
ATCGCAGTGATTTGCTGTATTGATTTCGTATTGTATCAAAAGATGCCTTTTGTAATGTGT
AAGTATGTAGATGTAAGTGATCGCGTTGAGACAATTACGTATAGCAATATATTTTCCTTT
TGCTTCGAAGTGATATGAGCGAGTTTATTGTGCTTACAAGTAGAGACTGTGAAAGAGTGC
TAAGTTTTACTAAATACTGTTTGTGGTTGAAACAATTATGTTCACCGTTCTATTTGGCTA
CGTGAAATAGATGAAGCATTTATAATTAATTTTAAATAATTGTTACATTGTTGTCAAAGT
AGAGTCTATATTAAATTATTCTTTTAATTAATGTAGTTAAGATGACAGTCATGGGACAGC
GATTATGGGATGAACAAAACCGTGTTATTTAAATGATTTCCTTATTATGTCGCCGATCAG
GAAACAACTGTGAAGTCGCAGTTCTCGTAGTTTTAAGTATATTTGTTTGGAAGCATTTTG
AATAGTGTCCATGATTCTTGTAAAGAATTAAATATCACAATATTCCTGTCTTCACATCGA
CATCAAGTGTTAAACTACACTCAATTGTTCCGGTACAAAAATGCCCGCCTGCAAGCTAAA
GGTTTTGGAAAGTTTTATTGTGACTATTTTCACCATTTCTGTATACATTTCGATTTAAAA
GTTCAACTCTTGCCTTCAAAGGAATTGATTTATCTGATTACTTTCAGCATTTTAACTTCT
GGACAGTTTTGCTTTTCTTTCTACTCAACTGTCTATAATTTCAGAAAGACTGATTTTTCA
GAATCATATAATTTGTTTGTGTTTGCTTTTTTCTTGTTGATAATGAATCAGTTACATACA
TTAAAATATCTGAACTTAAAATGACATGTCATCCAACATTTTACGATTTAAAAAACAAGT
GGGAACATGTAACATATTTTAAAAAGTAATACTAGAACATAGATGTAAAACAAACACTTG
AGTGTTAAATAAAAAGAGATATATTGTAAGACTTAAATAGTGAAATCTCTTATCATTAGA
TATATAATTTTAAGTAGTGTGAAATAAACGGAGAATCTATATTGACGTTATATTTTCCCT
GAGGTAGATATATTTTAAAAGGGCATTTATATAATTGCAGTCTTGTCTTCACTATTTCCT
ACAATGTATCTCTATGTTGGCTACTACTGGGTATAAAGTGTTGATTTTCGTTGTAAATAA
TATTTTTTTAGTTTATTTAAATTTAAGCCTATTTCATTTTAATGTTGTTCTTTCGTTTCT
GTTGAATTCTAACTTTGTCACGAATTTTTGGGGGTAAAAGGTACATGCAATTTTCAATAG
ATGAACAAAATAATGTTTAAATTAAGTAGTGATTTGTGAAGAAGCGATACATAGAAATTT
GGGCTTTATTATTATTAAAGTAAATGTCAGTGTTCCCTAAATTAGAAACTATCTAATTTT
TTAATAATCTTATTTGATGTAATAGATGTGTTTAATTCCATTGAATGTGTTAAAAATCTG
TGTTGTACTTATGTGTTAAAAGAAGTGAGATAAGTAAATTATATATTTTCAACTAGTAAA
TGTAACTCCCTCGTACAAAAATTAGTAAAAATTAAATGTGTGTAGATCAATTCAATATAA
ATATATTTAAGTCGCAAATGTTGTTTGAATGAACAACGGTATGAGTTTGATTCCAGAAAT
AGCTCTTCAACTATTACATTTTCTATAATTCTTGTGTAATAAATGCACACCTATGTTGTT
GTTTTTGATTATTGTTATTATGTATACTTACTACATAATTAATTGTCATTTCAGTTTAAT
AACAGTAACATTGTTTAATAGTTCATAGCAAAAATGTGACCTATTTTACGAAAAGAAACA
TTTTACCCTGGGTTATTTTTGGATATTGGGCCGTTGTTTATAGAAAATTAAATTAAAATA
TACCTATAATTACTTGTCTATTCCAAAGCTATTTCCTTTACCCCTTGTATTGCTTTATGC
CAAAAATTTAGCTGCAAAAATGGTTATAATATCTTAAACCAATTCTTTCTATTTAGGTTA
CGTGGATAGTGGAAAAATCGATGCTAAATGTTGCTATCAACTTTAGCTCTTGTTTTTAAT
TATTCCATTTTTTTTAGAATTAACTTAATCTCCATATTATACTTCATCATATTATACTAT
GAAGTATAATATGGATATTAAGTTGATTATTCCTCCTTCATACCTACTTACTTGTCAAAA
GATCAATGAAAAATTATTTCAACAGAAGTACGATTATTACAAAAAAAAAGGATTAAAAAA
AATTCAACAGAATAAGTTAATGTTGATAATTGATGGTATAAAATACTATAGTATTTAGAA
TACATATAGATTAAATATTAATAGCAACAACAGAAACATTACCTATCTTCATTTTCAGAA
CATTTATTTTCAAAATAACTACAGAATACCGATTATTTCACTATCCATACTCATTATTTA
CTATTAGTTAATTGTAGAATTAATGAGTAAATTCCATAATAACTATAAAAACTATGTTAA
CTATAAGTGAGTTTCCTTGCTTGTAGGTGGATTGTTTTAAAGATGTTACCTTACTCCACA
ATCGCAAATCCTTATAGTCAATGATTTTTAGATTTAGATATTACTAATAAGGAATAAAGT
ACTTTGTTTTATTATTTATTTTGTTTCAATGAAAATTATATAGGTATATTTTTATTATTG
TAACCTTACATAATTATGTTGGCTGTAATTTAATATTGATGTAATTAATATATGTATTTT
TATTTCAAAAAAA
(6493 bp)

- SilkBase 1999-2023 -