SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_TrvaFAMAMG_TR9884c1_g1_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_RNA-directed_DNA_polymerase_from_mobile_element_jockey_isoform_X1_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0003964 F RNA-directed DNA polymerase activity
GO:0006278 P RNA-dependent DNA biosynthetic process
GO:0008152 P metabolic process
GO:0016740 F transferase activity
GO:0016779 F nucleotidyltransferase activity
Transcript
Level
FPKM:4.99 TPM:4.88
ORF EntryO_TrvaFAMAMG10635_complete:A_TrvaFAMAMG_TR9884c1_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
GTATCCATAGGTTGTCTTGATGCGGTCCTTCACATATTGTGGCCATAGGCTGAAATACAG
TATATCATTATTTTTTATAAACGGATGATGCAACACAAATGCAAATAACAAAAAACATTG
ATTTAAAAAAAAAACTTTCTAATATTATTACAGCAATATAATTCAGTCTTAAATAATAAT
AGAAAAATTTTAGATTTAATTTTATCTAATAGTACCGAGTTGATTGTTACGGAAAATAAA
AATCCCATCAGTAAAGTCGATACTCATCATCCACCTTTAGACATACAAATTAAAGCTAAA
GCAAATAAATTATTTACAGAAAAAAGTGGCGATCAAGTCAATTACTTCAAAGCAGATTAT
GACAAAATATTAAAAGAACTAAATGCTACACCTTGGTTAAAACTTTTAAGTCAGAATAAT
GTTAATGATATGCTTCAAGCATTTTACGATAAATTGAATGAAATAATATTAAGAAATGCA
CCTAAAAAGAAACTTAGAAATAAGAAATACCCCGTTTGGTTCACTAACAAACTTATTTTA
CTGTTAAAAAATAAAAATAAAATTAGATTACGCTTTAAAAAATATAAAAATCCCTTAGAT
TTGGTTAAATTTCAAAGTTTAAGGTCTCAGTGTGACACCATGATAAAAAGCTGCTACAAA
CGTTATATCCAATCTATTGAATCAAATATTGCGGGTAACCCTAAATATTTCTGGACACAT
CTAAAAAACATAAAGCAATCCTCTAATGCATACCCAGCTAAAATGACATTAAATAATTCC
TCAGCTTCAAACGAAACTGATATATGTAATTTGTTTGCTTCATTTTTTTCGTCGGTATAT
GAAAATGATGATGTCGATCCCACTTCGGAAAGTATGCTCCAGACTGTTATCGGCTCCTCA
TTATGCTTTGTACAGTTTACTCAGTTTGAAGTTTTTAATAAGTTGAGAAAGCTTGATTTG
AGTAAGGGTGCCGGTCCAGACAATCTTCCCGCTATATTTATATCTAGGTGTGCTCCATCT
TTATCTTACCCAGTCTGTATGATATATAATAGCTCGCTGAAGCTCGGTGTCTTCCCTGAA
ATCTGGAAAAAAGCGCGAATAGTTCCTATTTACAAAAAGGGAGGTCGTGACAATGTAGCC
AACTACAGACCTATATCAATAATATCAATATTATCAAAGGTGTTCGAGTCTCTCTTGCAT
CCGGTGCTTATGAGTCATGTGCGTCAGGGTTTGTCGGAGAGTCAGCACGGGTTCATGCGT
TTCAGATCAACAGCGACTAATCTTTCGAATTTTGTTAGTTTTGTTTCTGAGGCTATGGAT
TCCCGTATACAGATTGATACAATTTATACTGATTTTTCCAAAGCCTTTGACAAGGTCAAT
CACTTATTACTGTTAAATAAACTGTCAGCTTTCGGCGTTGGAGGGTCTCTTCTCGCATGG
TTCACCTCTTACTTACATAAAAGGCCATCAGCAGTTGTTATTGGGGGCTACACTTCTCAT
TCTTTCTGTGCTTCTTCAGGAGTTCCACAGGGATCCATACTGGGGCCACTTCTGTTTAAT
ATCTTCATAAATGACGTCACCAAATGCTTTTTAAATTCCAAGTGTTTTATGTTTGCGGAT
GATCTTAAAATCTCTAAGAGGATCTTTCATATCGATGACACCGTAGCTCTTCAGGACGAC
GTAAATAGGTTGTGCGACTGGTGTGGGCGTAATCGAATGATACTTAATGCCGAGAAGTGT
TCGTTTATTACATTCACACGTAGTCGCAAAAGTATCATATCGAGTGACATGTATAGAATC
AATGATTCTATATTACAGGAGTGTAATGTCGTTCGTGATCTGGGGGTTACTTTGGATGCA
AAGCTCAATTTTATAAATCATATCGATAATATATGCCAATCAGCTCGAAGGATGTTGGGA
TTTGTTTTCAGGAATGCGAAGGAGTTCGGGCTGAGTACAAGGAGGATGTTATTCACTAGT
TTGGTTCGAAGTAGACTTGAATATTGTTCAATTGTTTGGAATCCCCATTACCAATCACAC
AAGGATCGTATTGAGAGTGTACAGAGACGTTTCACAAAATATTATTTACATGGCTCACTT
CAGTATTCACCTTATAAAGAACGTCTCAAAACGTTTGATCTTATGAATTTAAGTGATAGG
CGCAAAATTAGTGACATAAATTTTTTTGTATAGATTAGTGAATAATTTAATCGACGACCC
TGAATTTTTGAGCCATGTATCGTTAAGGGTACCCGTACGTCTGCCACGCTATCCGGTTCC
TTTACTTACACATAACACATGCAGGACAAATTTGGGCCATTTCTCAATCTTACCTAGACT
CTGTAGACTGCTGGGCGAGTTCGTAGCCAAAGATAACACTATTGACATATTTTTTGATAA
GCCATCCACTTTCGAAGCAAAGGTTCTTAAAAGTATAAGTTCTTAAAATTATATGCTCGT
TATTTTTTTAATTTAATTTATCAATTTTTAATCTCATTATAAATTATTTGTTCTTAATTC
AATTTTATCTTTATAATTAATTGCCTTCTATTTATAAACTAGATGGTAAAAATTTTAATT
GTATGTTTTTTTTTTTTTTT
(2600 bp)

- SilkBase 1999-2023 -