SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_TrvaFAMAMG_TR9877c3_g1_i9
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_ADAMTS-like_protein_1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005515 F protein binding
GO:0005576 C extracellular region
GO:0005578 C extracellular matrix
GO:0006508 P proteolysis
GO:0008233 F peptidase activity
GO:0008237 F metallopeptidase activity
GO:0008270 F zinc ion binding
Transcript
Level
FPKM:1.80 TPM:1.76
ORF EntryO_TrvaFAMAMG10578_5prime_partial:A_TrvaFAMAMG_TR9877c3_g1_i9
Sequence
(Nucleotide)
GAATTCAGACAAGAGAAGTAACTTGCATCCACGAGGTAACCCGTGGTGGTACAAATACAG
TGGTAGTACCAAACAGTATGTGTCCGCAACCACCACCTCCCGACAGACAATACTGCAACG
TTCTGGACTGTCCAGTCAGGTGGCATACTGGAGAGTGGACTAAATGCTCCAAAACTTGCG
GCGGAGGAGTAAAACAAAGAGAGGTGGAATGTAAGCAAATAATGGCGCAGTCCCATGTGG
TGGAGCGTCCAGCATCGCTCTGTAGTTCTCCGAGACCGGCTGCTACTAAATCTTGTAATA
GTCGACCGTGTTTATTGGATACGTCATCGCCAGAGATATCTTTGGCTAATTCATCTTATA
TACAACATGATCCGAAGAAGAAAAAGGTAACGGTAAAAGTTGGTGGTTCGGCAACTATTT
TTTTCGGGACCCAAGTTAAGATAAAATGTCCGGTCAAAGGCTACAACCGGACGAGGATAC
AGTGGGCCAAGGATAACCAGATTATAACGAAATCTAAGAAGTACAAGATATCTAGGAAGG
GAGCTCTCCGGATCACGACTCTATCGTTCAGAGATCATGGAGTATACACCTGTGTGGCTG
GTAGATCCAGTGCTAATCTGACTCTGCTGGTGAAACCAAGACCTGGAGAATTCCCTTCCA
GTGAAGAAATTGAACGGCATAAAGCTTTGGATGAACCATCGTCACCTTTGTCCGATAGCC
GAGCTGATGGTAGATACAGAGCTATGATCGGAGGAGCATCCGATGATCAATCACATGAAC
AGAGACCGGGAGATCAGAGGAAGAATTACAAGAGTCGACAGAAAGGAAAAATAGATAAAG
TTAGAGAGTCAGTTTACGGGCAAACAGCTACAACCAGCACCAAAGCAACTCCCAGCTTCA
ATTCTCAAGCCAGAGATATTTATGATGAAAACGAGGAGAGTGCCGTATCATCACGGATGC
TTCCGCCCAAACGTAGCAGTGCCACCAGGCTACTCCCTTGTCTCCATTACATTGTCATGC
AGCTTCAGATGCTTTGGAACTTCCAGAGCGTAGGGAATTCGAGAGGGCAGCGTACTGTCG
ATTCGATGTTGATGTACCAAAATTACGGTGCCCGAACAAATAGAATATTAAACTTTGAAG
ATAAACAAATAGTTTTTCCTGAGGATGACGATTCTGACTTTATTATTGTCAACGAAGATT
ACAGTAAACAACATAATGAAGATTTGGGTGTTAAAGAGGATTTTATTGAAGCTGAACATA
CAACTGAAGCAAGAGTAACATCAGCGGATATAAGTGAATTCGCTTGGAAGACCACAGATT
GGTCTCCTTGCAACGCTCCATGCGGCCAGATCGGGCATCAAGTCAGAGGAGCCGTTTGTC
AGCACAACACGGTGAACTCAACGACTACCGTTGAGACTGAAGAATGCCTCTCTCGTGGGC
TGACGCCTCCTAAAGTACTGTTGGAATGTGGTGGGGATAACTGCGCCAATTGGAGGACTT
CGCAGTGGTCGACTCTTAGATGTCTTAGGAGTGGGACTGCCATATCCCGTCGTCGTGTGG
AATGTACTTCTGACAATGGAACGATCCTACCTGATGCCTCGTGTGACGTCATAACGAAAC
CTGAGAAAATAAGAAAAGAAGGGCAATCGTGTATAGCAGCGTGGGATGTGGGACCTTGGA
CTAAGTGTAAAGGCGAATGCGGTGGTCCCGGTCGCCAGCACCGCACATTACGGTGCGTGT
GGCGCGCTGGGAGGGGCGTAGGGGGCCGACGCGGGGCCAGGGGGGCCGGTGCAGCTTGCA
GGGAGCTGCGACGCCCCACAGTTATAAGGGACTGTGCTCTACATTGTGTTAATGATGGAG
CATGCTTCGACACATCGCGTTTCTGCGAAAACGTACGAGCAATGAACATGTGTGCACTCA
AACGATATAAGGAACAATGCTGCAAGACTTGTTCGGACTGAACCCTTTGCCTGAGTGTTT
AAAAAGAAAAGTGACAGTGACGTTTGAGTAAAAACGGCGGGAATTTCGTGATGTTTTTGT
GGCTCAGTTTTTTTTTTGATGTGAGACATCTAGAAAGAAAAATTTAAACATTGTTACATA
GTAAAATATACTATTTGTGCATGATGGTCATACTTTTTTCCTATAAAATAATATGCATAT
AATAAAGAGCGACAAGTGTAACTTGGCGTGCATGGCGTCTTTGTATTCTTGTACTAGAGT
AACAGTTGTTAATTTAATAATTTTAAAACTTGATTTGAATTCAAAACATTGTAATAATTT
TTTATTTCAAATTGTTACCGCCATGTTATGATTGTCGTATAATAATCCATTTTTACGATC
TGGCCAATTTGGGCGACTTTTTAGTGACAAATAATTTAATTACATGTGCCATATCACGTT
ATAAAACTATGCTTTAGATCTGATTATTTGTGATAATAATGAAATTTTCCGTTGTATTCC
TAATTTAATAAAATATTTTAGTTCAAATATTAAGAGGTATTTTTACAATTGAATTAACAG
AGGATTTGAGATTAGAACACGTCTGCTCCTATCGACGGTTTGTGAGTAAATGACTAAAAG
CAAGATGGTTTGAGCTAAGGTAATCTTGTGATCCCCACTCTAACTAAAAATTAATTTGTA
GTGCAAAGTCAAATTGGTTAATACGTTCAGAAAAATAATATTAGTCTGTTAATTTAAAAA
CGTGCATATAATTGAAAATATTTTAGACAGTATCAATACTTGATAATGTAAAATATGTAT
TATCAATACTATTCTTTTTATTCAACTATATTTTGAGGATAATTTTAAAATAATTTTATG
TCTTTTAACAATTTTAAACTTATGATAATTTCTAGTGGTCGATCGACTTTCTGCCTCCTA
GTTTATATAAAGCGGGTAAAAAAGACTTAACAAATATTTTTCTGAACACGTTAACCAAAC
AAAATATTACTAGAATTAAAAAAAATAGGTAAAATATATTACTGTCTAAATTAAGCACAA
ATGATTATAGTATCTAGTCGTAATGCACTAAATGAGGACTTTTAATAAAATAAATCATAT
TAATATTCAAATAAAAAGAATATTGATAGAAAGCTATGAAAAAGCTATGAATAAACAAAA
CTAAAAAAGGCGAATCAAAAATAAGTCCTCAAAATGACTAACTAGAATAAATTTTGTACT
ATAATTAAAAATATATGTAAATAAAAAAATATATTAAAAATTCAGCACTGTGCTACGCTT
AGCTCATATAAATTTAAATATAATGCACAAAATGTAATTTAGAGCCAAATGCACGTTAAA
CTAGAAAGACGTCCGCACAGCTCGGCGGTCGAGACGCGAATGACAGTTATCAACGTTGTA
CTAGCCTTACGTAAGTTCACGCCCCTCCACTTTCTTTAATGTGTATTTGACTCTAATATT
TTTATCAAATATATTGTATAGAAATTATAAAGTAGTTAAAATGCCAAATGCGTTAAATAA
TCGTGTTAAAAAAGCTGTCAATTCTGTTCGTCACGACTGTTTTTTAGATAGTTAAAAATA
TGTATATTTGGACAAAAAAAATAGATATAAAATATATTCTATATAGGATAGTTTCGAAAG
CAATACGAGTCGCTTATTTGTATATAAATCGTTATACATTATTATATAAAAGTTAATTAT
TTATGTAAATTGAGACACATAATGATTACATGTTTTGATTATTTTACTGAAAAATATCAA
ATTTAATGTTATACTATTAAAAAATGTTATGTGTCACGATTTATATAATACACTATTCAT
GGAATAGAAACTTAGTTAATTAATTATTATTGTGATCGTCAATTTTTATTGTTATATTTT
TTTTATTTTTTTGTAGGCAGACGAGATAACGGGCCACCTGATCGTAAGCGTAAGCTGATG
TATTATTTGATTGTCTGATGTGTTTTAAAGTTGTATGATATCTCTTGATAATCTATTTGT
TATCAAGTCTAAGTTTAAAGTCAGCTAACTTTTTAAGTGGATTGTCAGTGAACCGATTTA
ATTGTTAATTTTCTTCGACAACTAGGATTTCTTAAGAACTCTCAAACTTTGATGAATACA
GTCTAAAATTATCGTAAAAATATTAACCGACTTTCAAAAGGCGGAGATTTTCTAGTTTAT
ACTATTGAAATATGTTTTTTTTTTCAATTATTTTTATCATTAACAATGCCTGAAGTAACA
ATAAAATTTGACAATCACAAATAAATTAAAATTTAGGTGAAATACAGTATTATGTAAGAG
AATGTAAACTTAGTTATCTGTCAATTGTAATGATCCAAAGTATGTGGCATTATTTGGATG
TTCTATCGGCGAAAAAACTATTAAAGGCGGTCTTGATGTGAGCTCTTGCAGACAACCCCT
TTCTTTGTGACAGGAGGAAATCGCGCGGACTTCCACCAGCCCCGCGAGTGGGGTATGTGG
GAGTCGAACCGCACCAAAACCTCCTGCCGCTCACGCTCAGCGTCCGAATCCCGGCCGAGG
ACAGAACCCCGCACGAGACTGGGCGAGGTGACGGGACGCATTCGCGATCAACGCTCACGT
CTCGCCCCGTCACCCCCGGACGCCGAACCGGCAGTCGTCGGCGAAACGACCACCGGCTCT
CTCGGTTGGCGGCCTAACAAAAATAATAAATAATAGTAAAAAAAAACTTGAGATGTGACA
TGGGACACCCGAATTTCGATTAAACGATATCTCTTTTTTTTCCTAACGTAACGCGCGATA
AGGAACGTGTTTTAAAAGATTTT
(4763 bp)

- SilkBase 1999-2023 -