SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_TrvaFAMAMG_TR9877c3_g1_i2
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_ADAMTS-like_protein_1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005515 F protein binding
GO:0005576 C extracellular region
GO:0005578 C extracellular matrix
GO:0006508 P proteolysis
GO:0008233 F peptidase activity
GO:0008237 F metallopeptidase activity
GO:0008270 F zinc ion binding
Transcript
Level
FPKM:0.39 TPM:0.38
ORF EntryO_TrvaFAMAMG10566_5prime_partial:A_TrvaFAMAMG_TR9877c3_g1_i2
Sequence
(Nucleotide)
GAATTCAGACAAGAGAAGTAACTTGCATCCACGAGGTAACCCGTGGTGGTACAAATACAG
TGGTAGTACCAAACAGTATGTGTCCGCAACCACCACCTCCCGACAGACAATACTGCAACG
TTCTGGACTGTCCAGTCAGGTGGCATACTGGAGAGTGGACTAAATGCTCCAAAACTTGCG
GCGGAGGAGTAAAACAAAGAGAGGTGGAATGTAAGCAAATAATGGCGCAGTCCCATGTGG
TGGAGCGTCCAGCATCGCTCTGTAGTTCTCCGAGACCGGCTGCTACTAAATCTTGTAATA
GTCGACCGTGTTTATTGGATACGTCATCGCCAGAGATATCTTTGGCTAATTCATCTTATA
TACAACATGATCCGAAGAAGAAAAAGGTAACGGTAAAAGTTGGTGGTTCGGCAACTATTT
TTTTCGGGACCCAAGTTAAGATAAAATGTCCGGTCAAAGGCTACAACCGGACGAGGATAC
AGTGGGCCAAGGATAACCAGATTATAACGAAATCTAAGAAGTACAAGATATCTAGGAAGG
GAGCTCTCCGGATCACGACTCTATCGTTCAGAGATCATGGAGTATACACCTGTGTGGCTG
GTAGATCCAGTGCTAATCTGACTCTGCTGGTGAAACCAAGACCTGGAGAATTCCCTTCCA
GTGAAGAAATTGAACGGCATAAAGCTTTGGATGAACCATCGTCACCTTTGTCCGATAGCC
GAGCTGATGGTAGATACAGAGCTATGATCGGAGGAGCATCCGATGATCAATCACATGAAC
AGAGACCGGGAGATCAGAGGAAGAATTACAAGAGTCGACAGAAAGGAAAAATAGATAAAG
TTAGAGAGTCAGTTTACGGGCAAACAGCTACAACCAGCACCAAAGCAACTCCCAGCTTCA
ATTCTCAAGCCAGAGATATTTATGATGAAAACGAGGAGAGTGCCGTATCATCACGGATGC
TTCCGCCCAAACGTAGCAGTGCCACCAGGCTACTCCCTTGTCTCCATTACATTGTCATGC
AGCTTCAGATGCTTTGGAACTTCCAGAGCGTAGGGAATTCGAGAGGGCAGCGTACTGTCG
ATTCGATGTTGATGTACCAAAATTACGGTGCCCGAACAAATAGAATATTAAACTTTGAAG
ATAAACAAATAGTTTTTCCTGAGGATGACGATTCTGACTTTATTATTGTCAACGAAGATT
ACAGTAAACAACATAATGAAGATTTGGGTGTTAAAGAGGATTTTATTGAAGCTGAACATA
CAACTGAAGCAAGAGTAACATCAGCGGATATAAGTGAATTCGCTTGGAAGACCACAGATT
GGTCTCCTTGCAACGCTCCATGCGGCCAGATCGGGCATCAAGTCAGAGGAGCCGTTTGTC
AGCACAACACGGTGAACTCAACGACTACCGTTGAGACTGAAGAATGCCTCTCTCGTGGGC
TGACGCCTCCTAAAGTACTGTTGGAATGTGGTGGGGATAACTGCGCCAATTGGAGGACTT
CGCAGTGGTCGACTCTTAGATGTCTTAGGAGTGGGACTGCCATATCCCGTCGTCGTGTGG
AATGTACTTCTGACAATGGAACGATCCTACCTGATGCCTCGTGTGACGTCATAACGAAAC
CTGAGAAAATAAGAAAAGAAGGGCAATCGTGTATAGCAGCGTGGGATGTGGGACCTTGGA
CTAAGTGTAAAGGCGAATGCGGTGGTCCCGGTCGCCAGCACCGCACATTACGGTGCGTGT
GGCGCGCTGGGAGGGGCGTAGGGGGCCGACGCGGGGCCAGGGGGGCCGGTGCAGCTTGCA
GGGAGCTGCGACGCCCCACAGTTATAAGGGACTGTGCTCTACATTGTGTTAATGATGGAG
CATGCTTCGACACATCGCGTTTCTGCGAAAACGTACGAGCAATGAACATGTGTGCACTCA
AACGATATAAGGAACAATGCTGCAAGACTTGTTCGGACTGAACCCTTTGCCTGAGTGTTT
AAAAAGAAAAGTGACAGTGACGTTTGAGTAAAAACGGCGGGAATTTCGTGATGTTTTTGT
GGCTCAGTTTTTTTTTTTGATGTGAGACATCTAGAAAGAAAAATTTAAACATTGTTACAT
AGTAAAATATACTATTTGTGCATGATGGTCATACTTTTTTCCTATAAAATAATATGCATA
TAATAAAGAGCGACAAGTGTAACTTGGCGTGCATGGCGTCTTTGTATTCTTGTACTAGAG
TAACAGTTGTTAATTTAATAATTTTAAAACTTGATTTGAATTCAAAACATTGTAATAATT
TTTTATTTCAAATTGTTACCGCCATGTTATGATTGTCGTATAATAATCCATTTTTACGAT
CTGGCCAATTTGGGCGACTTTTTAGTGACAAATAATTTAATTACATGTGCCATATCACGT
TATAAAACTATGCTTTAGATCTGATTATTTGTGATAATAATGAAATTTTCCGTTGTATTC
CTAATTTAATAAAATATTTTAGTTCAAATATTAAGAGGTATTTTTACAATTGAATTAACA
GAGGATTTGAGATTAGAACACGTCTGCTCCTATCGACGGTTTGTGAGTAAATGACTAAAA
GCAAGATGGTTTGAGCTAAGGTAATCTTGTGATCCCCACTCTAACTAAAAATTAATTTGT
AGTGCAAAGTCAAATTGGTTAATACGTTCAGAAAAATAATATTAGTCTGTTAATTTAAAA
ACGTGCATATAATTGAAAATATTTTAGACAGTATCAATACTTGATAATGTAAAATATGTA
TTATCAATACTATTCTTTTTATTCAACTATATTTTGAGGATAATTTTAAAATAATTTTAT
GTCTTTTAACAATTTTAAACTTATGATAATTTCTAGTGGTCGATCGACTTTCTGCCTCCT
AGTTTATATAAAGCGGGTAAAAAAGACTTAACAAATATTTTTCTGAACACGTTAACCAAA
CAAAATATTACTAGAATTAAAAAAAATAGGTAAAATATATTACTGTCTAAATTAAGCACA
AATGATTATAGTATCTAGTCGTAATGCACTAAATGAGGACTTTTAATAAAATAAATCATA
TTAATATTCAAATAAAAAGAATATTGATAGAAAGCTATGAAAAAGCTATGAATAAACAAA
ACTAAAAAAGGCGAATCAAAAATAAGTCCTCAAAATGACTAACTAGAATAAATTTTGTAC
TATAATTAAAAATATATGTAAATAAAAAAATATATTAAAAATTCAGCACTGTGCTACGCT
TAGCTCATATAAATTTAAATATAATGCACAAAATGTAATTTAGAGCCAAATGCACGTTAA
ACTAGAAAGACGTCCGCACAGCTCGGCGGTCGAGACGCGAATGACAGTTATCAACGTTGT
ACTAGCCTTACGTAAGTTCACGCCCCTCCACTTTCTTTAATGTGTATTTGACTCTAATAT
TTTTATCAAATATATTGTATAGAAATTATAAAGTAGTTAAAATGCCAAATGCGTTAAATA
ATCGTGTTAAAAAAGCTGTCAATTCTGTTCGTCACGACTGTTTTTTAGATAGTTAAAAAT
ATGTATATTTGGACAAAAAAAATAGATATAAAATATATTCTATATAGGATAGTTTCGAAA
GCAATACGAGTCGCTTATTTGTATATAAATCGTTATACATTATTATATAAAAGTTAATTA
TTTATGTAAATTGAGACACATAATGATTACATGTTTTGATTATTTTACTGAAAAATATCA
AATTTAATGTTATACTATTAAAAAATGTTATGTGTCACGATTTATATAATACACTATTCA
TGGAATAGAAACTTAGTTAATTAATTATTATTGTGATCGTCAATTTTTATTGTTATATTT
TTTTTATTTTTTTGTAGGCAGACGAGATAACGGGCCACCTGATCGTAAGCGTAAGCTGAT
GTATTATTTGATTGTCTGATGTGTTTTAAAGTTGTATGATATCTCTTGATAATCTATTTG
TTATCAAGTCTAAGTTTAAAGTCAGCTAACTTTTTAAGTGGATTGTCAGTGAACCGATTT
AATTGTTAATTTTCTTCGACAACTAGGATTTCTTAAGAACTCTCAAACTTTGATGAATAC
AGTCTAAAATTATCGTAAAAATATTAACCGACTTTCAAAAGGCGGAGATTTTCTAGTTTA
TACTATTGAAATATGTTTTTTTTTTCAATTATTTTTATCATTAACAATGCCTGAAGTAAC
AATAAAATTTGACAATCACAAATAAATTAAAATTTAGGTGAAATACAGTATTATGTAAGA
GAATGTAAACTTAGTTATCTGTCAATTGTAATGATCCAAAGTATGTGGCATTATTTGGAT
GTTCTATCGGCGAAAAAACTATTAAAGGCGGTCTTGATGTGAGCTCTTGCAGACAACCCC
TTTCTTTGTGACAGGAGGAAATCGCGCGGACTTCCACCAGCCCCGCGAGTGGGGTATGTG
GGAGTCGAACCGCACCAAAACCTCCTGCCGCTCACGCTCAGCGTCCGAATCCCGGCCGAG
GACAGAACCCCGCACGAGACTGGGCGAGGTGACGGGACGCGTTCGCGATCAACGCTCACG
TCTGGCCCCGTCACCCTCGGACGCTTAACCGGCAGTCGTCGGCGAAGCGACCACCGGCTC
TCTCGGTCGGCGGGCCGACACTATTTCTTAAACCTAGTATAGATTTTTAAAATTTCAAAA
GTAATCAAACGTTACACAGTGAATATTTCACATAATTATATTTATACATTTAAACTGATC
GACAATGTTGATATAATCATTATATTCATAATGATTAAAATGTTACCCTGGTGAACTAAA
GGTTTCGGAATAATATATTTAAAATAAATGTAAAAAAAATGAACAAAAGCAAATACAATA
TTGAATATAAGTTTAATACGCATAACAAATTACACAACCCTCATTACCCAACCATCTCAA
ACCTTGATGTGGAATATGTCTTTAATCTTTATTTAATATCTACTTTGTTTGAAAATAATA
TTCCAAATATTAAAGAATTAATCGTGCTACAATCATTACTAAATGCAGCAATGAAGCTAC
TTTGTATAAATTATTTTTGAATTTTCAATAATAAGATAATAGATAATAGTCGTGCGTTTA
AAATTAAGATGTTAAAAAGTGTTATACTGTAAATAATTTTTTTTTTTTTGTATTTTCTAT
TAAATTTTAATTACAACACGCATTCCGACCCTGTCAATAAAGGCTAATAATATAGAAATG
AGCTGTTTCAGGCAAAATAACTATAAACACAAATTACAACTAACTAAGCATGTATTCCGT
TCACAACACACTGTAACAAGATTTGAATCTGGTCAATGAGCACACAACACTAAATAAGTG
TTTAATTTTGTTTCTTATAAAATTTACTATAATGAATCTTTATTAATACTCTTATATGGC
ACCGTCAGGGGCCATCCATAATGACTTTTTTCCCCTACCCCCTTGTCACATTTCTGAGAC
GCCCACTCCCTAGTGTGACGTCACACATTTTGTTAATATTATACATTTGAATTTTTATCC
ATTTTATATTAATTAACAAAAAATATTGACTATTTTTTTTCGTAAAGTCTTTACATAGTT
AAAATTTCATTTTTTAACACTTACATTATAGTAGATTTTGAAATGTAACGTCGCCAAATT
GAGAACCCCACCCCCTTGTCACACAATGTTGTCCTTCGTCGACCCCCCTTGAGGTGTGAC
GTAATATATGGACGGCCCCTTATAAATATTAATCTCATTAAAACAATTGATAAGTTGCCT
AAGTTCGACTGACGTTTTAAACCTCGAGACTTCGTCAATATTCAGATCCACATAAGGTTT
ACACATAACGTTGCTACCTAATAGTTATTATGCGCATATTATTACGATTTTCAACAAATA
AACTAATATTACTCGAAGCCTAGCTTACATCAACATTCAGATAATTGAGCAAATCAAAAT
AACATTAACAATGATATTGAATCATAATTATTATTATAAACATGAGTAAAATAGATTAAC
TGCCTTTTTTCTTAAAAATAATTGAACATATCGTATTGACAGAAAAAAGTATCTATATTT
ATAAACTACAATATCAGTGTTGCATAAAATTTACATTATTTACGATTACTATTAGATATT
GTGTTTATTGTAACACACACTGTAGACCAAAACATTTCCAGGAAATAACATTAATTGTCT
CGAGTACACTTCTCTTTATAAAAAAAACTCTTATTGAAAACATCGTAGTTAGCATTACTT
TGTAGAATAAAATGAAAGAAAGAATCGTATCAACCACCGTTGTTTAGTCGATTATGTTTT
GGTCACCAGTTACATGACAATTACTTTAGAATTGTGATCTGCGTTATGTTTTATAATACA
TTAACTGTATTATGAACCATTGTCAGGTTTCGACAGTGCAGCCTGACGCGGCTTTATGCA
CAAAAGTGCTTCAAATTCTTACACCTAAGAAATCTCTCATTAAACATGTATTTCTCATAT
TAAAATCGCCTATTCAACTACACGTTTACACTATTCACCTGTGTGGTACTTACAATACGA
AGCTCTATACACTGTCTTAATTGCAATTAATTACCATTTAATTGATTTTATCAAAATAAT
TATTGCTAATTTATTTGAAGCGTTACCACACAAATCATTTTCTAAAATTTTAACAACAAC
GAAAATAAATATAAAATTAATAATTTAAAATCCAATAAGATGAGATAAAATTTTG
(6715 bp)

- SilkBase 1999-2023 -