SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR532c0_g1_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_eukaryotic_translation_initiation_factor_4_gamma_3-like_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0001934 P positive regulation of protein phosphorylation
GO:0003723 F RNA binding
GO:0003743 F translation initiation factor activity
GO:0005515 F protein binding
GO:0005575 C cellular_component
GO:0006412 P translation
GO:0006413 P translational initiation
GO:0006417 P regulation of translation
GO:0007283 P spermatogenesis
GO:0044822 F RNA binding
GO:0045727 P positive regulation of translation
GO:0060903 P positive regulation of meiosis I
Transcript
Level		FPKM:4.50 TPM:4.41
ORF EntryO_TrvaFAMAMG250_complete:A_TrvaFAMAMG_TR532c0_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
TTTTTTTTTTTTTTTTTTCAACCCACCTAGAGATTTATTTGTATTTTTTTATAAAATTTC
AATAATAAATAACGTTTCAGCTATAGTCCTCGTGGAATATATAATAATTTGTTGTAATGT
GATATAAAAGCTCTGGCGTGATAACTATGTTCTTACAATGTAATATACAAATTTGCTATG
GTTGACATCTGTGTATATTTCGAAATATACAATCAGATATCATCAACAGGATTAATTTAA
TATATTTACGTAACAAATATATAAATATAACTGACAAGATTAGCTAAGTATACAAATATA
ACAATAGAACACGAAAGGTATATAAAACAAGGCTCATTAACTACTGGCTTCGCAATTATA
TGAAAAATATATCTATAAACCAGTACTTTTGTGCCTTTTCTTAATATATATCGAGGATAT
GAAACGTTTATTTAACTAATGGGGACATTATCAAATAGTTAAAACTAAAAAATTAAAAGT
CTACCAAATTAAAATTGTAAAAACAAAATTCTCATGTTATTTGGAGAATGGATTTGGTAT
AATTAAAATAGAATTGAATATGAACAATTTCATCAAATAAGAAGCCGTAGTCTTTTCACA
TTATTCATAATAGTACAGTACAATGTATTTTTTTTTACTTTTTTGTATTTTTATTATTTT
TTTCTAATAAATTTTTCTACAGAATGCAAATGAATGCATGTACATAAATGACGATAACAT
AATTATATATCATCTCGAACACGAATACTACTCATCGAACTCTTAAATTTAGATTACATT
AATATATTTTATATTATAAAAATTGTGATCGTTACCCTACCGCTATATCGTTCTCTTTTA
ACACTATCGCGCATACGTTGGCGAAAATAATGAAACATAATAAAAAGTCTTCATTCACTA
ATATTCATCCATTTATTTAATTATATAATATTATTCAATTATCATGGAGACAGTATCGAT
AATAATAGCAGTATAATAGTAATTATTAAATAAATACATCATAATAAACCTTTTTGGAAA
TAGCGAACGCTGTACGCATTTATGTTGATTTACATTGTCAACAAGATTATAGTAACAATT
ATATAAAGCATGATAATATTAATATTGTATACAAATAATTATTGCTTGTTTCAATTCAGA
TTCATAATTTAGAATCCATTCAATTATTTTATTATTTTTCTAATAAAATATTTTAACTAG
CAAACAATTATATTATTATTTATTTAATTAAATATGTCATATTTAAAAAATGTTATCTTT
ATAATAAAATAAGCTATCTAAATAGACTATAATAATATAACAGATATGTTTATTGCTCTA
AAGTGTGTAGATAACTGCAAAATCACTAGCAACATTTATATATTTTAGTTAAATCTAGTA
ACTTGCATTAACAACGAGTACAACAAGACATTATAATAATTTATTAATTAATTAGGTTGT
GATTATTACTTCCGTTCACTTCGTATTATTATAGATTATTACAACGCAACAGACAGAATT
ATTATGATGCAGATTATTGCTGTCAGTTCAAATTGAGGAACTTACGTTTTGTAATACCCA
TTATAAAATCTCTTTATTATGTTTCAATCCAATGTAATGCAAATCAACGAAACGCGCTAT
CCAAAAAGAGCTATATTCATTAAAACTGAAGATAAAGAAACTATGTTGTAAAGCAAAACG
TGAAAATTGACAATTATCTATATAAAGCGTTCAAAAATATAATACAACTTTACTATCTAG
CTTGTTATATAAAGCAATTTAACAATAATATAATCCAACCATTTTCTAGAAGGATGATTT
AGTATAATATAAAGCAGTATATATCGTATGCGGATGAGAGCGCGGGCGGCGTTGGTAACA
CGACCGCCTGCGAGAACACTCGTCAGTCCTCGCTGCAGGAGTCCTCATTCTCCACCTCGG
CGTTTATACTCGTGAAGAACGACGTCAGGGCCTTCGACATTACACCTTTGCCTTCTGGCT
CTTTGTCAGATTCCCACCAAGCCAAGAACCCTTCTAAAGATATGATGTATTGATCATGAA
GGTATTGGAAAATTTCTAATGATAAACCCTGCGGATGTTCTAATCTTTGAATGAGTTGTT
GTATACCAAATAGACAGATGGCCTCTCTACTTTGTTTGGTCTCACCAAAGTCTTGAATGA
GGCCAGCATATTTATTCATGCGGTCTTGGTTAAAATGTGGCACATCTCGTCTCTCAGGTC
CAAATAAGGCATGTTCGCATATTGCTTGTATTAAACACCGCATAAACCATTCTTCATTAC
ACGACTTTCCAAATTTATCCTGTGCCCATCCCTTTATACACTCACAACTTTCATCTGCAT
TCATAAGTTGTAACAATTTAGATTGGGTCTCTGCTGGTGTTAAGATTTTCTTGTTTTCTT
CATCAGTGGGCTTGACTTCTCCTTCGAGGAATTCAAATTTGCTATCCTCAATCCACTTTG
GAACCTGGTCCTCGCTCATCCATTGTTCCAATTTTAGGTTTGATTCTTGCCACTTACTTT
TAACAAATTTAGGTCCCATACTTTCCTTTAATTCTCTAATTATTGCTTTCAGTAACAAAT
GACCATGATTCGACGATATAATTGTGTTACACAGTTTAAATAACTGCACAAATGTGATAT
GCTTTTTCTCAATATGAGGCACTACAAATTTTCCTAAATAATCATAAAGCCTAGGAATAT
CAATGTGCAGGTCTGGTGCACAATCAAATGTTTCCTTCATGCCTTCTAATAAATTATCTG
CAGAAACAGTATTTGTTGATACTAACAACTGGACAATATTCACAATCATATCAATTTCTT
TTGAAGACTTATCAAACGTAATATTAAATATTTCACTAATAACAGCAGCGTGATGTTCGG
GTTTGAATATTTCTTTAAATTCTACAAGCATTTCATCATAATAAGAGTGAATGAGGCACA
GATCGACCATAGATTTGACTGAGCTCCTCTTGCTATCGGGCAGTGGTTCCTGTGGTACAG
TGGTGGCCTGTGCGGGTTGGACGGTCTCGGCGGGAGCGGGCGCGGGAGGCGGCGCGGCAC
TCGTGCTGCGACTACCGGAGCTGGAGCGACCCAGACCCATTGAATCAGACCTATTTGTTG
CTGTCGTACCAAATTCAGGTCTAGAATTAAATGTCGATCGCTCAATAGATGCACCCTTTG
AATGGTACGTAGGTGTCATATCATGTGTACCTCTAAGTGATGTCGGTTCGGTGGATACAT
TTTCTAAAATGCTGTACATGTTCTTGGTTAAACTTATCATTGAATTACTGCTGCCGGCAG
TTTGGGCAGTGTTCTTGGTGCCTGAACCATGATTCCATCCAGAATTATGCGGTGCCAATT
TGATTGGCATCTTTTGAGAAACAGCTTTGAGTTTCGAAGTGTCCACGGCAAAATTGGTTC
TAGTCGTTTTCCAACTGTTATCCATGTAGGAGTTAGTGTTAGGTCTTCGGTTGTCGCCGC
CACGTTTGCCGCGTCCATCATCGCGTCGGAAGCCTCCCATGGGGTTCGCATTCATCAGCT
CAATATGACGTTGTTGCTGTTCTGCTTCTTTCTGTATTTGGTCCATCATTTTAGGTTGAG
TGTCTATAACACTCTTGGTGACCCATTTTCTTTTCCTTAATTCTATAACATCTTGTATCA
TGAATCTAACACGACTGCTAATTTTGTTAGATCTGCGATCGACAATATCCTGCATTTTCT
TGAATATGGGATCTAAATGATCTTGTGGCTCGTTTTCTATCTGTTCTCCAATAGTTGTCA
ATAATTTGCAAAGACATTCCAATTTCTCTTCTTCCAATATTTCTATCAAGTAATTCATAC
AATATTCCATAATTTTTACAGTTAACATCTTTAGTTTGTATAATTCACCAATAAATCTAA
CATTTCCTACAGATCTCATTCTTATACGTCTGTGCTCTTCTTCTATCATTGCTTGTAATT
CCTTCTTTTTGGCAGGATCAGAACTTTCTGCTATTTCCTTTTCTAGTTTCATCACTTGCT
CATTACTTTTATCTGTTTGAAATTGATTTTGGCACTTGTTAATAATTAGAGCTCTGAAAT
TGACGCATTGATCTGGTTTTGCAGGGTTGTCAGCAGGAACCTTCAGTTTCGAGAGCTTAT
GACACATAGCAGCATAAGCTTTAGAAAAGTTGGGCTCTTCAATAGCTTTTTCAAATACTA
AATCAATAACACCTTCAAGTCGTTTCTGGTTGTTGATGTCAAGAGCTTTCACTTTATCCA
GTAAAGTGTCGAATTTCTGGGGTGTTAACTTATTCAAAATGCCTCTGAATTTCTTGTAAA
GTTCCTGTGTTTTCAGTTCTTCCTCATCAACATTTTCTGGTTTAACAAATCTAGTGGGTC
GCCAAGCCGAATCAGATTCATTCAATTTCACATCATCATTCAAACAAACATGAATAACAG
GTTTGTGAGAACTGCCACTACTTGATGAAGTAGGCATTTTCATACTTCCCCGTGCACTAG
GCGTCAGGTTTCTACCGTCTCTCTTTATATCACGAGGCGTATTGCTTCTCGATCCCGTAC
CAGAACTCTTGCCGAATGGGAAGAACATGTCACCGGATGGTCTTGAAATGTTAGCAAAAG
GCAGAGGCTCCAACATTGGTGTAGTCCTTATGACATTCCAAGCTTCCAACAATGGGGCCT
CTGGTTTATTTTTCGAAAGTGGATCATCCTTTATTTGTTTTAGTAAATCAATGTCATAAG
TTTTCTTGCCAGCCTTATTGAAAGGAGACCACTGATCCTCACTATACTTGTATTTAGGTA
TAAATACAGGTTGTGCAGAAGAAGCTTCCACTTTCTCACTTGAAGGATTAGTTTCGGTTT
CATCTTTCAAATTTTCATCTATATCAACTACTTTATCAGTCTCATCTTTACCATTTTCAT
AGGCTTCTGATTCCTTATTGTTATTGGCCATTTTCTTTGATTTCTTGTTAATATTCTTTT
GATTTTTCAAAGCCTTATCATTTTTATTAATGTCCTCTTTAACAGTTTCACTTACAGTTT
CAGAATTGTTTCCATTGGTAGTGTCAGGATCTGTGGTTTTGTTAGTGTCTTTCATTTTAG
AGTCAGTTTGTTGAGCCCGTAGAACACTTGATATACTTTGTGTCAGCTTTGTCTGAGCAT
CAAAAGCGCTAGAAGTTTCCTTATTATCTGGTTCAAAGGTTGGTAATCTAATACTATTCT
CAAAACTCGATGGTATATACTCTTGAGTTACTTTATGATTAGAACTATCGATTTGAGTCT
TTTCTTTTTGTATCACCTCAGTTTTAGGTTCAACAAGTATGCCTTCAGTTTCTTGATTTG
TAACGTTTTTAATAATTTCAATGTTTTTCGTTGATTCTTCACTTGTAAATTTATTGTTCT
GACTAGTTGGAGGGTTGATAGCATTTGATAAACTATCAACTGAACTAATCACTATTCTAT
AAATAGAGACGTGAGGTATTTCCACGTGGGAGTTCTTGCACTGTACCTGAATATCAGACT
TCGCTATGTGGCACTGACGGTTAAATTATATCACAGCTCCTAGATACTTAAAGCATTTAC
TAAAACTTCACTCAACTTAGATACGAAACGATAACGTAGCAATATGGTAAATGAAAGTAT
TCAAAAGGTCACTCAAGGATCTAGAATGTCTGACTTTAACACTCTTTACACTTCAAGTAA
AATGATTATTTTTAGTATGTAGGATTTTAAATATTATTCAAAATGTTTTATAAACCCGAA
TAAGTTGCCCGAAGGTTGATTTACTTATGTTTTAAAATTTATAAAAGGCAGCCATACTCA
ACGTGACTGTGAAGTAAAGCCGCCA
(5845 bp)

- SilkBase 1999-2023 -