SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_TrvaFAMAMG_TR3872c0_g1_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_uncharacterized_protein_LOC101745326_isoform_X1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003677 F DNA binding
GO:0003682 F chromatin binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0005654 C nucleoplasm
GO:0005694 C chromosome
GO:0005730 C nucleolus
GO:0010369 C chromocenter
Transcript
Level
FPKM:0.13 TPM:0.12
ORF EntryO_TrvaFAMAMG2882_3prime_partial:A_TrvaFAMAMG_TR3872c0_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
AAAAGCACTAAGAAAGTTGACTTACCGTCGCCAGAACTGAAATTATGCCTATCAATTAAC
TTCTGAAGTCCTGACCCTGCGTCCGAACCAGACGCCTGATAGTGCCTGTAACTTCTGTCC
TGAGTGTTGACACTTATCGCGTTATAGTCCATGTCCTTTGAAAGTCCATGACCAACGCTG
TAACCGTTTGTCCTCATTATTTTATCAGACCTGTACGATGATCCGTCTCCGAAGTCATTT
TTCCTTTTGTATGAATGTATTCGTTCGTAATAGGTGGACGTCATGGGTAAAACATTTTGG
CAGTTCATTGAAGAGGAGCTCATGTTCTGAGAGTAGTGCACGTCAGTGGACTCCACAGAG
TTGTGTGTGTGACTCTGCCGCATCATAGACACGTTTGACAACATACATTGCGTATCCGTT
TCTGATGAGAAATCGTTTGGCGTCGGCCACACTTGATCACGAGTTTCCGTTATATCTTGT
TCACTACTCGACACACACTGTACCATGGCCGAGGAGGTGTTGTCGTGGTGCGGCGCTGGC
TCGGGCGACTCGGTGGTGGTGTCGGGCTGCGCGGCGCCGAGCGGGCTGAGCGTGGTGGTG
TCGGGCGGGCTGCTGCCGGCCGGACTGGCGCCTGACTTCCGCGCCGCGTTCAGCAACGTC
TGCGTCGACACCGAGTGCCGCACGTGCCGCAGCGACAGCTCGCTCTCAGCGCTCTCGCAC
GTCGCCTCCTCCTTGTGCTCCTCGACTGCTTGATTGGCCTGCATGGCGTTCCGAGCCTTG
TGCTTTTTGGTCAACAACATATTGGGATCTATGCTCAGCCGGGCGTTGGATGCCGGTACG
GACGCCACGTGCACGTTCGAAGAATTCGACACTAGCGTCGTCTGCTGTTGTACGATAGTG
GTGTTCTGTACGAAAGTCGAAGAAGCGCGATTGGGAGTGCTCGATATCGATATTTGCTTA
GGGGACATCGGGATCATTAGCGTCTGCCCGGTTTGATTTGTTTGGACAAATTCTTGTGAT
TGAACCGTACCCTGCCGTAGCTGAGGGCTCGTGCCAAAAGTAACGTTTGTTGGGCTCAAA
TTGGCGAGCATTGGACTTAATTGTCCATTAAAGTTAGGGCTGTTCATCATAACTTGACCA
TTCGGTGACAAGAACTGAGCGCCGGGGCTATGTTGCGATTGGATAATTTTCCCTTGTTGG
TTTTGAGCTCGTATCACCATACTGCCTCCCGATCCAGCCGTAAATACTCCAGAGTTTTGT
ACTGGGGTAAGAACGTTTTGTCCATTTACCGCCTGTAGCTGAAGTTGCATAGGCACACCC
GCCGAGTTATCTTGGATAAGGGCTGCACCGTCAGCTGTCATTACCATTCCACCAAGATTC
GGAACAATAAATTGTTGAAAAGCAGGGAAATTAGGCATTACGCCACCAGCGTTATTTATT
AAATTAACAGGCTGTAATAAATTTATCTGCTGAGATGGAGATGTATTTGCCAGTATTTGT
TGGGATCCATAATTATTTGAATTATTTTGACCATTCATTACTATATGAGCTGGAGTCCCA
GATTTACCAGGGACTATTGTTAGAGCTTGCAACATTGGCGACGGAGATATATTGTTATTA
GGCGACAGTTGGAAGCTTCGGGGAGAAAACTGTGGACTAGAATTGTGTTGTGGTGACGAG
TGATGTACCATCAAATTATTAGAATTTTGTTGCGGCGCTGCAATTTGCAACATGTTTGTA
ATGTTTGCATTCTGATTTTTCTTTTTCTTACTTCTCTTTTTAACGCTTTCTGGTGATACC
ATAGTGACGCCTTGTACAAAGTTCATTTGGTTTTTCACGTCAACATTCCTTGCATTTTCA
TGAGATGCTTGTGAGACTATTCCCCCAGTTACAATTTGTGGCATCACGGCATTTTGTTGA
ACAACCTGGCCATCAACAGCCATCATTGATGGTTGAATAACAAAAGGCGCTGGAAGAGTA
TTTACTACAACGGCAGACTGATTGACAAGTGGCTGTACACCGCCAACGGCCGGTATCACT
TGAGTCACAGAAGCACTCACGTTAGTACTCGACGTATGTAATGACGATGTCGTTATTTTG
GGAGGAGGCGGAGGCATAGGACTACTAGATACTATTATTTGTCCAGTTGATGATATAAGT
ATTTGACCTGGTGTTGTCGGACTCGTTCTTCTTATTTGTGATAACGAGGAGGGTTGAGAG
TTACTTGATTCCGGTTTAGGTGTTAAACTTCCAATTACGTTTTGTACCATTTCTAATGGC
GATTTGGATATCATATTCTGAGCCGTTGTCCCGGCAATGTGTAAGGGGTAGCTTGTTGGC
AAGTTCACAGAATTAATAAATGGATCTGGTTGATTGTTTGGAATAGCATACGACGTCGCT
AAATTAACACTTGGTGGTGGTGGAGGTCTTACAAAATTAGCCTGCGAAGCGTTAATCGAA
GTTGTGGCAGTTTTAGCCCTTCCAGCTAATACTGACGTGACGGTATCCCTTGTCACAGAA
AAACCACTGGCCATTGTTGTCACATAAGTTTGTATGTAGCAAGTTTGAATCAAAGAATGT
GCGGGACCTCCACCAAGATGTGGCGGTGGGCAATAGCCTGGCATAGCATTCTCTGTCACA
TATCTATGTTCCATTTTATAAATCTCTTGAGGATTTCTAACACCTGTTTTTACACCCACC
ATTGTTGATATATTGTCTACTTCCATTAAATTTTTATTAACATTATGATTAGATATGAAA
TGTAGCATTTGTGTTCCAGTAATCGTCTGAGTAGTGTTAGGTGGTCCTGGAGAATTATAA
GGATACATGCTTCCCGGCGTTGATGGATTGCTGCTGAAACTATCTTTTCCTGAGCCATTG
TTGGAGTAGGCTGGGCTGGGTAACGTATACATAGAATTAGATAAAGCTTGGTTATTACAA
ATGCTACTGTGCGGCGTGTCCGTATTACGAGAGCTATTAGATAGCGTGGGTGATGGTTCA
GGAAGTTGCAATGTTTCCGTTATGGAACTAGTACTAACTGTAGCTGCCTGTATCGGGCCA
TTATTATCGCCCATAGAACATCGTTCTACAAAAGTCGACGTAATAGGGTTATCGTCGAAA
TTATTTTTCGGACTAGACATCGTATGGTCACGGTCCTCTTTAAATATGTTATGTTTGTTA
TATTTAAACCTCATATTATCACTGCATTCGAAAGCTGTAGGACGTCTCGAGACATTATTG
CATCCTTTACAACATTGGGAGTTATCTGACAACACGCTGCTGTCGGGCATATTTGTGGGT
GATAATGATTGATTTGCTATATTATTATGACTTCTTAACAAGGTAGATGACTCGACTGGT
TTTGATAACAGCTTCTTGTCCAAAATGTTTTGTGCCGCAATACTGTTCGAAATCGTTATA
TTTTCATACTGAGATTTTTCATAGGAAGTACTGCCTACTTGCCTAGATATGGTGTTGTTC
AATAAAGCAGTTTGTTGGGCTAGGTATCCATTGGGATCCTCCATAAATGAAGGAACAGTA
TTGTTTGGCATTTCATTTGTACTACCTTTTGAATCGTGTGCAATTCGAACTACGGTATTA
CTGTAGGACAACAGTTTATTATCGTTCGTATTATTTTTCTTTTTACTACCTTTACTATTT
TTAGTACGTTTCTTCGTCGTGTCAATGGCGGGAGGCCAGTGTTGTCCAAGCATGGAGTAG
TGCTGTGGTAACGGAGGTACACGCGAACAAACAGCGTGATTTACTGATTGCTCACTTGAA
TATGAACTGTAGGAACCTGAAGAATCTTCTGACATGTTTGTATTTACTTCTTCATTATCT
AAACTGTCAGGTTTACCCATTCTTGGCCCTGGACTTGTCATTGAACTCACAGAATCATTT
CTCTTAACTTGCCACGGAGGAGTCTTCGCGGGGTTTGTTTTAACAACGCTACCATTTTGT
ATGACTAACTGCGCTTGATTGTATTGATTTTGACTCTGTTGTTTATTTTGGTTACCATTA
TCCGTTAGCTGAGACCGAAAACCTTTCATGGCCATTTCTATTTGTTTCTGATTTTGTTGA
ATAAAAATGTGTTGTTGTTCGTTTATTTTTTGCATTACTTCTGGCGTTAAAGCCTGATTA
AGCCCAGAAAAAGTTTGAGATTCGTCTTCTTTACAGGTATGCTTTTGATGTTGTTGTATA
TTTATATCTTTTTTGTCATCTTTCGACTCCTGGGATGATTGAATAGGTTGAGTGGCCGTT
TGGTTATTGTTCTTGTAACTCGAATATTTACTTAACCCTGTATTAACTCCGATTATTTGT
CCATTAGAACCCAACACTGGCGTGCCATTTAATGGCTGCTGAACATTCGTCATCGTCGTT
TGACTAGATGTCTGTCCATTGTCAGATTTTTCCGGATGTTGTGAAATCCAACCACTGTTG
ACAGTAAGGTAGTGGGAACTCCTCGGAAGGTGAGCATCATGCCTTACTTCGTTACTCTGA
GATGATGCACAGGGTGCGTTTTGATGCGATTGCCCAAAAACTGATGATGATGATGATAGA
CATGACTGGTTGTTGACAACACGTTGAGATGTTTGAACTATTTCCCTATTGTGTTCGGAG
TCTTGGAACTTTATATCATGTAAAGACAACTCTCTTTGAACCATGACCTTTGACATGGTT
ACATTGGTTGGAAGCCCGCCTCTTCTCTTAGTTTTCTTCTTAACAACTATCTCCGTACTC
ATAACTCTCTTTTTTTCGATGTTTTGTGGCGGTGGCGTGGCCGGTGAATGCGACCTCGAC
TGCAGTGTGGCTAACAATTTCCGCTTATGGTTGCACAATTTCGTCGATTCAGCCTCGGAA
GTTGCTTGATAAGGTTTACTGACCACTTTTGGATCGAAACTAAAGGCTGTTTCCGGCCTA
AGCGGACAAGGCAAGCCACACTTGCAGGTGCCGGCAGTCTGCAGATATTCTCGCAATTGA
GGCAAAGTACTCAACGCAGTCCCGCTCGGGCTTATATATAACACTGATGCACCGTTGATT
ATTCTTCTCCACCCTAAGGGCACTGTTACACAATGTGATTGTTCACTTTGTTGTTTTCTC
AAGTTGTTTGGTAGAGAATCCAAAGAGGGTACAACAGGTGAAGGAATCACTGCTAATACA
ACACCGTCCGCAGTCCGCACCAGCTGTGGACTGCCACTACCATCCCCTTCATTAGCCACA
CTGTTATTTACACCAACTTGCTGGTTTAGTATACTTATACTCTGATTCACTATTGATTGA
TGAGACACACTTTGTTCTAAAAACTGATAGTTCACATAACTTTTCCCAACTATCTCTTGG
TCACTACAGTTAGCAACTTCACCACTTTGAACTGTCACACTTTCACAAAACTGATTTTGG
CCATGGTGAATGGCCATTTGCTGCACATGGGGCATAGTACCATTGGGACCTCCCGGAATA
ACACATTTTAGATGTGAAGTTGTATCTACTGTTACTCCAGGTAACTGACCACTGAAGGTT
TCTACACACCCTGAGTCTGCACTAACTGTACCGCTACACTCCTGTCTAATGCCAACTACA
CTAGACCCTTCAGCTTTTGTATCTTCTAGTTTAACACAGGAATCTTTGACATATTGCTGA
GACACAGGATACAAGTCTGACAAATGGTTTATACTTTCTACAGATCCAAAGCTATCAATC
TTGTCATTACTTTCGTGCTTGTAGAACAACTGAGTGTGGTGTGTTGTTTGGTCTGTTTCT
TCTGTTTGTGTACGATAGAAGGAGGAGCGCAAGTGGGGCTGCAAATGGTCAGGCAAGTAC
AGGGAGTCCAGTGAGGTGTCGAGGTCTGGCGGCGCGGTGGCGGGCTCTAGCTGGCGCTGC
TCCGCCACGTACAGCAGCACGCGCGGCGCTCCCGCCACGCCCGCTCGCGACGCGCCCACA
TTCGCGGGCTTGCCCGACATCGCGAACATACATTACACGACGCCACACTTTGGTACTCAT
TAGCTGAGTGCACCACAACGTGCTCCTCCAGCTGCCCGAATACAACTGTAAGCACCATAG
CTCTCCGTACCTCGATCATATCTCGACAGCCTCCTATCACTTTGAGGCCGATTCACCATC
GTCAACTGACACCTTTTTTTGCACCGATGTCATGAATTGAATTTTATGGTTTTATGACGG
ACGAATGACCCACTGATAGTTTTATGGCGGAGCCCTTTTCAACCCCATTGTTTGTTTATG
ATGTTTTAGTACCAGTAGCAGTCACTTTTTATAGTTTACAACTTTTGAGATAATTCAACT
TATTACGTACTGAGCTAGGGTATTGATACACTTTCTGTATAAAAGGTCACTGAATGAGAT
GTCAGCTTCACCAACAAATCATTTTCAAACTCACTACACTTGGTTATTCGTATTTTTGCA
TTTACGTTTACAAGTCAAGATTCAATAATAGTATGAGTTTTCGTAGAATCAAAGATTCTG
GAAATATTTACGCGATTTACGACAGATTACCAATAAAACATAACGACCGAATGAAGCGAT
TTGTAAATTTTAATCGCCAGCAAAGTTGTTCA
(6572 bp)

- SilkBase 1999-2023 -