SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR3381c0_g2_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_survival_of_motor_neuron-related-splicing_factor_30_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0003723 F RNA binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0005681 C spliceosomal complex
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0006397 P mRNA processing
GO:0008380 P RNA splicing
GO:0015030 C Cajal body
GO:0016607 C nuclear speck
Transcript
Level		FPKM:6.71 TPM:6.58
ORF EntryO_TrvaFAMAMG2535_complete:A_TrvaFAMAMG_TR3381c0_g2_i1
Sequence
(Nucleotide)
AGAAAGTGCTGAGAACTAAAGCAATTTCATTACTGATAACTTGTGGTATTTTGTGTATTT
ATCAAAAAAACTTATTTATGAAGTGTTTATGAATTAGAAAATAGATACACTAATTACAAT
GGCTGATGATTTACGAAATTATACTTTGCAATTACAACAGGTTGAGGCAGCGTTGCTAAC
TGACCCGCAAAATGAAGAGCTCCTGAAGCTAAAGGCAGATTTAGAAGAAGTAATTGAGTT
GACAAAAGATTTAATTAAAACTCAAGATGGTGATTCAAAAATAACTAATATTCATGGTTC
TAGTAATAGTGATGATGTTACAGCATCCCTGTTGGCGGCAGAAGAACGAGATCCTACAGA
AAGACACTATCCTAAATGGGAAATAGGCGAAAAGTGTTTAGCTAAATGGAGAGCTGATGG
AATGTTCTATGAAGCTCTTATTGAGGAAGTGTCTGAAGATAATTTAAAAGTTAAATTTGA
TGGTTATACAACTCTAGAGGTAGTCTCGGTTAATGATGTTAAATCTTTAAATTCAGGAAT
TAAAAGATCACATAGCACAGAAGACAAACATGGCAAAGGATACAATAGAGAGTATTTAAA
GAAAAAGAAACAGAAAAAACAACAAAGATTCAAGCAAATTGAAGAAGAGAGAGAGTCTGA
AAAGAATAAATGGTTATCATTTCATTCTAAAGCCTCAAAAAAACCTGGTGTCAGAACAAA
GAGTATATTTGCATCTCCAGATAATTTGACGGGGAGAGTGGGTATTGGTACTTGTGGTAT
TTCAGGTAAACCAATGACTGAATATACACCTGGAGAAAAATGGAAGAAAGGAGGATAAAG
CATCCTAATTAATCAGTAATAGCATATTATAATTATTTTTATTAATAAACATTGAAAAGT
GGAAGGATCCCACTAATTAGATTATTGGTTTCTGTTAAATGAACTCAATTAACAAATTAT
TACATGTCAGAAAGATTATTTAAATACCATACCATGGTAAATATGAAATATCTATTTGAT
GAATCCTGTGAATACATCTGAATGTCACCTGATGAGTATTGTTACTTAACATATAAAATA
TCTTTAATAATTTTGATTTCATTTTCTTGCTTTACACACATTATATTATAATTAATTTAA
AAGCTTACAAATTACTTTATTTCATTTAAAAAATTGCAAAGAAAAAGGCAAACAATAGTA
TATCCTAATTAAAATATCTCTATAAACAATACAATCTGCATATTTTTCTACAAATGTGTA
TTTCAGTGTATCATGCAGATAAAACTAAATAAATCCTAGTATCTAACTTCTGAAACTCAA
ATTTTACAATTTAATGAATTTGCTTAAATAGCTTTAGCATGAGTCACTGGTAGTAATATA
ATCTGATAACACTAGTATGTACTTCTGCATTTCATTCAATTTCATTAAAGGAATTAAACT
TCAGGTATAGTGTTGCCAAACTCTAAATCTCACAATCATAGACTTTCTCTAAGTAATGAA
GAAACTAGATCTGGAGTTTATCTGGATCTATATGGGACACCATGACGCTATAATTGAGTC
TGGCTTCAGTATGTTGTTGCAAAAGTAAATAAATTAATTTTTCTTTTTGATCAATGCCAT
GAAAGTTGAAAATGAAGGTCTGTTGATAAGAAGTACACTGAATCTAAGAGTATTATTATT
ATTCAAAAGATAATATCAAGCTTATCCTGACTGAAGTCTAGGCTTGTTTAGCATCAGCCC
AAGTCCAACTCCAGAACCACTTTGACTGTTGTAATGGTACCTATTGTGGAAGAGAATAAT
GGTTTCATGGAACTTGTTTATACTATAAGAATTAATTATTTAAGAACTGTCATACAAACA
CTTAAAATCTCCATGCCTATGAAACAAAGACTGCTACTTTGTTGTTACCTCAGATAACAC
AGTAAAAAAACAATGCTCTGTCAACACTAAGATACTGTTCGTTGGATTTATGCAATATGT
ATGACATCTATTGTATATGATGTGACATCGTATATTTCATACTCAAGGATTTGTCGCAGT
TCCTATGTGATTTTTTTTTATGAATTCATTGATAGGAAGGAACTTATCTGCGCCCCTTTT
GCCTGTAAATAGCCTATTTTTTTAATATACCCAGATAGTAAAAATTAATTACATTTTATT
TCAGTCACTTAGGCTGTGTATGACAATTGGATGTGCTGTATGTCTGTGTACGTAGTCACC
TTTCTTAGCGTGTGTCCATCTAATATCTATGTAATATTATTTTATTAACGACCTATTTCA
CAATTTTATAAACATAAAATCTTAAAACTGATTTGTATTCTCATCTGTGATGCTTTACAT
CTGTGATAAATACATGGATGTATGGGGTATTGGGTATGAAAAATTTAATTGTATTTTATT
GTGAAATAGGCCTTAGCAATGAATAATGTGTTCAAATTAACTTTATCAGTCTTAAGTTTT
TGCATAGCTACAGTTATTAGTGTATTGTAAAAACTGAAATAAAGTTATACGTTTTTAAAA
AAA
(2523 bp)

- SilkBase 1999-2023 -