SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR3321c0_g1_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		hypothetical_protein_KGM_18572_[Danaus_plexippus]
Ontology
GO:0000086 P G2/M transition of mitotic cell cycle
GO:0005515 F protein binding
GO:0005654 C nucleoplasm
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005829 C cytosol
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0006937 P regulation of muscle contraction
GO:0007165 P signal transduction
GO:0008047 F enzyme activator activity
GO:0015629 C actin cytoskeleton
GO:0019208 F phosphatase regulator activity
GO:0019901 F protein kinase binding
GO:0030018 C Z disc
GO:0031672 C A band
GO:0043085 P positive regulation of catalytic activity
GO:0050790 P regulation of catalytic activity
Transcript
Level		FPKM:0.05 TPM:0.05
ORF EntryO_TrvaFAMAMG2270_complete:A_TrvaFAMAMG_TR3321c0_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
TCGGGGAAACGTTGAGTCTGTTTTCGCCAGCCGCGGCGGCCGGTCGCGCATTCCCGCCCC
ATTTTACGCTGAAATGTGATCGAGGATGAGTCGAAAACAGGATAGATATACGACGCGGCC
GCGCAGCCTGACCTCTCACTATGGCTCCTCGCCTAGTATGCTGGGCTCAGTACTGACCGG
TCAGTACAGCCCGTACGCGAATAATTATTCCAACTATGCTCCAAGTACTTACCGTAACTA
CAACCCCTATAGTGTGGGGTTGGGACGGCCTGCTTCAAATCTTAGCATTTACGGCGGGAC
AAGTTCGGGTTACGGGGGTGTATATTTAAGTGGTGCCACTTTGGGATCACTTAATTTAAT
GACACCAGTGCTGAAAAAGTTAGACAAGAAGCTGCTGGCGAGCCAGAAGAATTTCAAGCC
GAAACCAGTGCCACTGGCTAAGCCCCCAGAAGTTGCACCCGAAGAGCCCGCTCCAGAAGA
GCCGCCACCGGTTCGTCCTGAACGCAAGCCTCGCGCCAACAAACTTACAACTGCACTTGA
TAAAGAAAAATCACGATCTCTCGGTTCCTTGGACACCTTCGGCGGCATAGGATCGCGATC
GCTCAGTCTCAACTCTTTAGCATCAGATGGATATTGCTCTGGAAGCGAACGTACTGAGGA
AGTGAAGAATCGCGACTACAAGGAACTTTACGAGTCGTCCGTGGATGAGGTTCAGCGTCT
ACGAGCCTTGCTCAAAACATCCGAGCAACAGCTGCGCGAGGCACGGGCCACCATCGGGAG
GCTCACGCAAGTGAATTCAAACCCGTTGTCTGAGATCGAGAAGCGGGAGAAAAGAGCAAT
GGAACGGAAACTATCCGAAATGGAAGAAGAGTTGAAGCAATTGCAAAAGCTAAAAGCCGA
GAACGAAAGGCTGAGGGCAGAGAACCGTGCACTGACGCGGGTCGTCACCAAACTGACCAA
CTCTGCCGCCAAATAGTACCAACAAGCTCTGCAGGCCGAAAACCAACGATTAAAGGACGA
GAACGGAGCTTTGATCAGAGTCATCAGTAAATTGTCGAAATGAATTTCGGACGCGCTGTC
TCCCTGTTCACGAACAAAATGACTCCTCTCAAACATCGATAGATATACAGTTGAAATTAT
ATAATTCGAACTAAATGTCATACATAAGAAACTAGTGCGTGAACTACTTCAGTAATAATG
AGTGACATCGATACATTTCCAAATGTTTTCGGCGTTTGTTAATAGTCCCGGGGACGTTGC
TGCGCCTCGAGTTTTGTTATTCTAAAATCGTTTATCGTATTTAATAATTTATACTACATT
AGCATCGCATGTTGAAAAGTTGCAGTTTATTTATCACGATGGAATACTTCCATACGTGTT
TTGTTTTACTAATCTTAATATGTGCCTAAAACATAGTTCCTGTTGTTAGAAACGTTTTGA
AGGTAATTCTTTGAACAAGCCCCTTTATTGAGTGTGGATTTATCGACTATAATTTTCTTT
ATTGAGTACGCATAATGAGTTCGAATTTTTTTTTATAATATAATTTATTGATATAATCTA
TAAATTTATAATTATTAAATATGTGCGTAATATTCACTTAAGTTTATGGTTATTAAAGTA
GATTTACTAATGACTTCAGAGGTGTGCGAAATGATTAACCGCTTTTATTGTTTGTATACA
AAATTTTATTTCATGGTTTGAATATTTCTATGAAATAAGTGGACATTAAAATTTTTATTT
ATTACTTTGATTGTCGATTCATTTATTTTCATTTTGATGCGCCTATAACATTATTTTTAC
CAAGTGTTAGTATGTACTTATTTAGATTTCGTTGAGTTGATTTTCACGTCAAATACACGT
ACGATGAACAAAAGCATATTGTTATTGGCCGTTAAATCGATTTAATTTTATAAGTAGTTA
ATAATTGACGTTTATGAATAAAGTAGTTTAAAAAAATAATAAAATGAAGTCTAGAAATAT
CCCATTGTGTCAATAATGTATTCCTAAATTGACGTAAGTGTATAGATTAGTTTTATATTT
AAACTGTAGTGGGCCATTCAAGGTTACATACACACAGTCGTTATAGAAGATTTTAGGTAG
AGTATTAGATTATAAAATCGTCCTAATGCTGTATACAAATGTTTGTAACCTCTGTGTGTG
CGTGACTCGCCATTGTGTATTGTAGTTGTGTGCGTTGCAGGGATTTTGTCTATCACACAT
TGTTATGACATTAAAAATCTATTTCAATATTAATTTATGTTTGTACAGAAATTCAAATTA
TTATATTATTATAATGTATTTTGAAGGAAAGGGCGCTTTTTAATAGGTAACGTTACTGGA
CACTTAATTTGAATTAAACGACATTGACGCGGAGTGTATAGTCTATCAAAAAATGTCTGG
TTTAAAAAAAACTACCTCAAACAAGCAATAGACGACAATCCAAATGAATTACGATAATTA
GTTTAATATATAATTTATATTAAATTTAGCTAATCTAAAGAAAAAAATCATTAAATATTA
CAATATATTTGCACAAAACCGGTCACTGTGTGACTTATTTCAATTACTTTTATTAAAGTG
TGACATAACAAAATTCCTGCGATAAATTATATCTCAAATTATTCACGTACACTGCCGGTC
AAAAAAATATAGCAAAGTTAAATAGAGCAGTAGTTTTTAATATGTAAAGTAAAATCAAGA
AAAATATTTATAAAGGAAACTGTCTGACACATTTCTGTAAGATTTTGTCAAAAATATTCT
TCATTGTAAAAATAAACTTCAGACCGGCACTGTACGTGTTAAAGATATTGTATAATGTAG
AACGTTTATAAGGATCAGTTGTCGAGAATTGGATTGTGATAGCGGTATTGTGCGCCACTC
ATGACTTATCGGTTTTTAAGGTTTTTTCGCCCGACATTTCGACTTCTGAACTATTCGTAT
GATAATGTATTGTATGTGCTTGGATTGCAACTAGTCTGTAATTAGCTGTAGACTGTAGAT
GGTTTGTCCACCGATTGAAGTCTCCGCCATAATGTCAGTGGACCCGAGTAGTTTTTAATT
TATCGCAATTTTTGATCATTGGAAATCGTAAGCGATCATCGTGGTTGACAATTAACACTT
TTGCTACAATAGTGTCATAACTCAAATTAATATTGGTACATTTTTGATCATGTTTGTCAA
CTTTAGGTCCTAGATGGCCATAATGTCGTAATTATAATAAAATAATGTTAAATTTCTAAG
AACTTTCTCCTGGGACATTGGTATTTTGACTTATGACACTATTCACGCAAAAGTGCTGAA
TAAATTATGTAAGTTTGGTTTATAAACTTATTTTTGTAGAGTGACACTAATAATCGGACT
TAAATATAAAATGTAATGGGAATTATCAAAATGTAATGACACATTTGGAAATGAGATGGT
TTTTAGTTCATTACAAATGGTTTTTTCGGCAAATCACTTTTACTTTTGTATGATCTTTAT
AATTTATTTGACATTGAATTGAATCTAATTGACATGATGAATTTATTCTTTAATTATTTT
GTGTTATTGTTTTCAAAATAAATTTAGTGTCACTACAGTTATTAATTTCATTATTGGTTG
TAATTTTATAATCTCGAAAATAAAAATTTAAAATAAATTTAAAATGTAATGTAGTTAAGT
GTTGAAAACTGTATTGAAAAAAGGTGATAGGAATCTACTGAAGAACGTATGTAATGTAAT
TTATAGAATTTTTATCCTTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTAATGAAGAAATGTGTTTTA
TTTAACTCTTATCTCTGGAAATAAATAAAAAC
(3812 bp)

- SilkBase 1999-2023 -