SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR3025c0_g1_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_zinc_finger_protein_98-like_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0002230 P positive regulation of defense response to virus by host
GO:0003676 F nucleic acid binding
GO:0003677 F DNA binding
GO:0003700 F DNA-binding transcription factor activity
GO:0005622 C intracellular anatomical structure
GO:0005634 C nucleus
GO:0006351 P transcription, DNA-templated
GO:0006355 P regulation of transcription, DNA-templated
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0098792 P xenophagy
Transcript
Level		FPKM:6.09 TPM:5.97
ORF EntryO_TrvaFAMAMG2010_complete:A_TrvaFAMAMG_TR3025c0_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
TTTTTTTTTATAACCAATACTTTAATAGAGTTAAATATGATACAAGTATTAAAAACAATT
ATCTGTCAATTATTCTCTATATCAGTATATTTTTATTACATTGGTTAGAGAACGATTTCA
CACGACATCGAATGTAAATATAAATTAAGTACCGAAAGATAACTTAATATACCAACACAA
ATCAATCATACTCCTTACAATAAACGTAATAATATTAAAGTTGTATGTTACACACTATTT
TACTAACTCGTACAATATATGTAAAGATCAGTGTAAATATATTTTGTTTGTTCAACGAAT
TTTAATGAAAAAGCTTTATTGATTACAATAATAACTTATTAAGAAAAAGTAAATAATTCT
CGTCATGTGAGATCGTTTCAAACATAAAATCATATTTATTAAAGCCTTTATTTACAAGTA
TTTAAGTGCGACATCGAGTATTTAGTACAAAAATAGGATTTACATTAAAAATCCTTACAG
TTAGAGCAATATTTAGCTAATGTTACGAGTAATTGTAAAATAATAATTTGAGTTGGTTTC
ATTTCTTTGAATGATGCACCACAACGTCCAATCTTATGAAAAATTTAGTAAAGGAAAATG
TTTGCGAACCGTTTCACATTATGAGTTTTTAATTTGATGTCATTTGAAATACTGCTCGTA
AGTTGATAACGTTTGAAGAAAAAAAAAACAATTCTTTAGGAGTCTAAATCAACAGATGCT
CATCCAAAGAAACCAAACCAATCAAGAATATACGTAAGTAAACTAATATTTACATAAACA
TAAGATTATTTTATACTTTTAACTATTCCTACCTACAACACCGAATTTTATACAGAATAT
ACGCTATATTATAATATTGCCTATTTGATATTCTGAGATATATGATAAAAATCAACATTC
ACTCCAATTCAATGTTAATCTGGAATAATTCTAATATAAACTTTAAAAGATATCAGATTC
ATTTTTAAAGTAAACTTAATATAGTTCTTATATGAGTATAATATTCATAGCTACCAGACT
ACCAGCTTCATGTGTTTGTAGTTCATATAAAACAGCAACCTTTAAAAGCGGTTTACTTTA
TCATTATTTCTTTTTTTCTAATGGAATAAGTAGATGATATACGACACCATTTCTCTTTGA
CAATTTCAATAAATTTCAATTTTACAGGATGTTCCAAGACTATTTGACATGACTGGGAAG
TACATTAAATATTAGAGATACGATGTTTTTCTTAAGGAAACATACTTTTATTTTTGGCTT
TATATACAGGGTGTTGATTTTGGCCACTTTTGTTACCTCAATTTTCAGTTAAGCAAACAA
TTAAAAAAAATTGTATGCAGTATTAATAATTATCAAAAATAAAATAATGTTTCCTTCTAG
CAAAACAACGTAACTCTAAGGTTTAAGGTACTTCCCGTTCTTGTCACATGGTCCTGGGAC
ACCCTGTATAGTTTAATACACAATATTTAACGAGTAAAATTAATATTTCAATGAACAGAT
TCAAAGTAGAGCGTTAAACATAATTTTAAAGTAGCGTGTACATAGCGTGTCACTTTTCTA
AATCTCAGTGACCTGATAATACATGACGTGTCAGTATTAGCACGAGGTGGCACTATTGCG
CCAACTCAGTCTACTGAGCTCAGTGTTTTTATAAACTAATAAATACATTTCCTAAATATA
ACTGGGTACAAACATCATATTGAAAAAAAAATAGAGATACAATTTATTGTGAACTCAAAA
TCAACAAAATTGTATTTTTATAATGAGTCGCGTCTAGTGCATTCTTAGTACATAACTAAA
TTGGTTATTTAATCTAACTTTAGTCTGAAATGATTTTAAATGTTGTTTCAAGTACCTATT
GAAATATTGTAACTTATTTTATTTGACAATTTTAACGTAGTTTTTATCTACTTTTTAAAT
GTTGAATGTTTGCGAAAAAGTATCGATATGTGGTTCTCATACATAATAATACCAGATAAG
TAAGGAATTTATAAAGTTATTGAGAATTCAGATAGTGTGTGTGGTCAGTGCGGGAAGTCT
GTCCGGATGCCGAACTCGGCGGCGTAGGCTCCCGACCACGACGTGGCCGCTATCAGGGAG
GTGGAGGACGAGAGCTGCGCGATCAGTTTGTGCGGCGTGACGGGCGTGGCGCCGCGCGAC
TCCGGACTGCGCTCTGACTTACTCTCGCACTCGTTGTCGACATGCGCGTCGGATCGCTTC
CCGAGCGCCTGCGCCTTCAGCATCTTGCTCATGGTGTTCCGCGGCGTCGGCGGCGGCCGC
TCCAGCGTGCGACCGTGCGCCGCCGGCATGTGCCGCTCCAACATGTACCGTCTCTCGTAC
CGCTCGGGGCAGTAGTGGCAGCGGAACAGGCGGCGTCGCTCCGGACGCGGCAGGTCGGCG
GCGCGCGCCCCGGACTCCGGCCCGTGGTGGGACTTCGCGTGCGCCATCAGGTTGTACCTC
TCTGAGAAGCGCTTCCCGCAGAGCGAGCACTCGTGTCGCTTCTCCCCGCTGTGCACGCGC
TTGTGTCGCTTGAGATGCGAGCGCGTCATGAGCGCGAGGCCGCAGACGTCGCAGGAGTGA
GGCTTGACGCCGGAGTGGGAGAGCTTGTGCATCTTGAACGACGACGTGTGGATGAACGAC
TTGCCGCACAGGTCGCACTGATAATTAAGTTTGCCAGTGTGAATGTTGTTATGCCTCTGA
AGAGCATTCTTAGAGGGAAACAGTTTATTGCACTCTTCACATTTCCAATCACTTATACCT
TTATGTAAAGCTATGTGTATATCGCAGGCTCGCTTGTGTTTGTAATGTGCTCCACATATC
TCACAGATGTAGGGCGGCTTTGATCCTTCGTGTTTGATCTGTTTGTGACGCTCCAAACGA
ACAAGTGAAGTATATCTATTAGTGCACTGGTCACACGGATGCATCACTTTAGTTTTAGTA
TCTTTCAACACTTTCTTTTTCTTTCTTGTTGTTTTAGTTTTTTTCTTTTTAACCTTTTCA
TCTTTATTAGCTTCCTCTAGAGTCCCGAGTGCTAGTAGTAGAGATTCCTTGAATGTGTAC
TTGAATGGACTTTGTGATCCATCAGCTGAGTCCTCAGTCTTAACATCATTAAATTCTCCA
TTATTATCTGCAGCTCCATCGGTTATAGTTAGTCTGTTTGAGTCGGCCGTGTCGTTACTG
GCATCAGGTTCTAGACACAGCTCAGCTTTCCAACTGTTCTCTATTTTATTAGTTTTCCGT
CTGACAGACTTTTTGTTTACTTGTACTTTTCTTCGTCTCTTTTTACACTTAACTAACGGC
TCATCCTCAGAATCCTCCTCCAAGTCATTGAAGTCAACAGATTCATCATCAACATCATCA
TTGTCATTGTACTCGTCCTTAACTGTCGCTAATTTTAAGGGTATAGGATGAGACGATACG
AATATAGGATTTTTACTTATTACTGCTTCAAATGTCTGTTTTATCTTATTATATTCTATT
TCGGCGTGATCGAACACATTGATTAGTTCTAGACAACTCTTGCATATCTGTTTCGATGTG
ACGGTACTGTCGATGTCTGTTTGTGTGTGTTTCGCGAGGAAAGTAAGCAGACTTATGTTC
GAAGCAGTAGTATTTGTTGTGTATATGTCGTAGCACTCGGGACTCCGAGCGACGCACACT
ATACACTCGCAGGGCTCCGGCTTCACGACAACCTCCTTCTTGATGGCCAAGTCTTCGGAC
GAGGAATTGAACTGCTCCACTTCCATTCCAGAGTTCATTGCACTTTTTCCAGCCATTGCA
ACGTTCCAACACAAACGTATTCACATTCCAATGACTACTGCGATGGCTTTCAACATTTCG
ATACATTTATTCGTAAGTTTAATTACTACAAAACACGAACATAAACATTATTTTGTGCTG
TTCGTCTACGTTGGGGATAAAAAT
(3924 bp)

- SilkBase 1999-2023 -