SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR2961c0_g1_i2
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_metallophosphoesterase_1_homolog_isoform_X2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003674 F molecular_function
GO:0005575 C cellular_component
GO:0008150 P biological_process
GO:0008152 P metabolic process
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0016787 F hydrolase activity
GO:0046872 F metal ion binding
Transcript
Level		FPKM:2.81 TPM:2.75
ORF EntryO_TrvaFAMAMG1781_complete:A_TrvaFAMAMG_TR2961c0_g1_i2
Sequence
(Nucleotide)
ATAATATTTACTCAAAAAATATGAACTGTTTGGAAAAGGAAAATAAGTTATTTAAAAATC
TTAAAATTACTTCCAGAGTTTAACAGGATAATATACTAGAGTTTACTAGAATAAAAAAGT
TTTGCAGGTTGTTATCAGCATTGAACAATAATGATAACACCATTCGTCTTTTATGTGGTT
CTATAAAATATATATTATACCGTAGAATTCTATTGAAGAGGCTCCAGTGAAGACAAATTT
TAATACTCGTTTGTTTTAGGAACTGGTCACTCCACTGGTTCCAGTTAAAAATTGTTATTT
TCATACTACGAAATGGTACGATGCGTAGAGTTACAAAAAACCTTATTATTTTTATTAGTG
GGATGCTTTGTATTTGGTTTTTTTGTGAATACATCATCTATTTTATAGTTATAACTCAGT
GTGGCTGGCCTGTAATAAATTATTCCGAAAAAGAAATACAGCCTTTAAAGGCCTTAATGA
TATCAGACACTCATTTGCTTGGACCTCGGAGAGGACACTGGCTGGATAAAATGAGACGTG
AGTGGCAAATGCATCAAGCTTTTCAAACTATTATGTGGTTACACAATCCAGAAGTAGTGT
TTGTTTTAGGAGATCTATTTGATGAAGGAGAATGGACAACTAATAAAGAATTTGAGGATT
ATGTGGAACGCTTCTACAGATTATTTGCAGTACCAGAATATGTGAAGATGTATGTGGTGG
CAGGAAATCATGATATTGGATTTCACAATTATATAAGAAGAGGAAGTGTCCAAAGGTTTT
ACAAACATCTCAACACATCATCAGTTCAACTTGTAACATTGAAAAATAATCATTTTGTGC
TTTTGAATTCAATGGCAATGGAAGGAGATTCCTGCCAATTATGTACTGGAGCAAGAAATG
AAATATCACAAATATCAGCAAGGCTAAAATGCTCTGAAAATCCTGAAACTTGCACAGAAA
AAAAAATCAAAGCACTAAACTACAGTCAACCTATTCTTCTACAGCACTTTCCTTTATACA
GAAAATCAGACTCAATGTGCACGGAACCTGATGCACCACCGCTACCAGAACGAGAAAAAC
CGTTTCGACTTAAAATCGACGCTCTATCTAAAGAAGCCACAGATTTCTTAATTAGAAGTA
TTAAACCCAGAGTTGTTTTTGGAGGGCACACGCATCATGGGTGCCTTTTGGATCACAAAT
ACGAGAACTTGGGTCAACTGCAGTTTAAAGAATATTCAATTCCATCATTTTCATGGAGAA
ATAGACTAGATCCTAAATATATGTTGGTCACTATAACACCAAATGAATATAAGGCACATA
AATGTGCTCTACCACAAGAATCTACGATGATTGTATCTGCAATATTATTACTTCTAACAC
TAGCCTGCTATATTGTGAGGAGGAAACATATTGGAAGGTGACAAAAACAACATAGATTTA
GTCTCATGAGTATATTCGATAATAAATATCATTGACAAGATCGAGCACTTTGTACATTTA
TACACCATTCAAAATAGATTGTACTTTCGAAAAGACATACAATATAAAATGGATATATCA
CATAAACCGCCCCTAAGCTAAACAAATAAATTTACAAATCAAAATAAGTTACAATCAAGA
GAGTAAAATTAGAGGTAGATACAGAGATTCTTAATTAATAATAAGAGTTATAAACGCAAT
ACTGACACAGGTAATTTGTACCCTCATAATTTATAACTGAGAAAATAATTAAGTTAAATT
TGACAGTTCTTATAGTCATAAAGTTTATCAAAATTCAACGAAAATCAACTAGCAAAATTG
TGTCATGTAACGATTTATAAACTATCTTACTTGGAGCACCTAACACTTAAATCTAAGATC
AGTCTATAAACTCTTAAGTGAGTTCTTCCAAATTGTACATAATGTACTGAGCATTTAACT
AAATCACTATAATAATATGTGTTCGATATGTGAACAAATACCCCGACGAAATGCTTGTAC
TTATGAATAAATAGTTAAGTAATATTATATTGTTTTTAAATACTTAACGCCTTTAAAAAT
ACTGCATTAATACTTAATTTCTAGTATTAGATATATCTTTGATTTAATTTAGTAAATTAT
CCTATGCGATACCGCGATTTAAGTACTGGGATACATTGAACAAACCAAGTGAATGGTGGC
GCCACATTAAGACAACAAGGTCAGTTTTTGTAACATTAAAATAACACCATCCGTCTATGA
AACTGGCACGAAAGCGTAAGCTCATTTTATTTAATTCTGGATGGCTAGTGTAATTTATAT
TTTATTTATTTATTCCCAGTAAAATAACCCCTAGAAATTGTACGGTCTTTAACATGATAA
TCGATCAGCGATTTCCTTTTAAATATCACTTGGTAACTGGAAATTGTTTTATCTGACCCA
TTAATAGACAAGGACAAAGTCGCCGTATTCGACGATGCCCTTATTTGTATCTTATAAGAA
AATAATTTGCAATACCCTTGGATAGTTTGGAGATTGTTGTGGATGTTCATTGGACTTAGA
ACGCGGTTGATGCGGGACTCTAGTCGGTCTAGGCGCCTGCTGTTTATGATGGTACCCAGT
ATGAGCATGTTTTGCTGAAGAACAGATCACGGCGTGCAAGTAGCGATCGTATCTGCACAA
GTGAGAGTCCCCGCCGCTAGCCAAATCCAAATAACCGTTGCCAGTTGATTCAGTTGTTGG
TTTTGGAAATGCATTCGTTGGTTTCTCACTGACGGTATAGGATCTTTTTCTTAACTTTTG
ATATTTGTTGTTGTAGTCGTCATCATTGGCAACAGAGTCGCAGGGCTTTCTTGAAGCTTG
AAAGCTCAGATGGTTCTTCTCCATGTTAGCTTGAATGATTTCGAGTAGTTCCCGTCTTTG
TAAGCTTCCAGAACGCTTTTTAGTGTGCTTGCGTTCACGATGTTCCCTGCGTGGAGGATG
ACGGTGTGGTCGGGGACGTATTATCGCTGTTGGTTTACGATCAGAGAGAGGTACCCTTCG
ATCTTCTGAACAAGAAGACTTGGAAGATAAATCGTCATCTGGCGAAAGTCTGTCTCGATG
CTCGTCATCGCTATGTGGTGCACAATCTGGTTTCGTAATGTGTACCGATACTGGATCCTC
TTTCCGGCGTCGCCTTTGTACTTCTCTTCGTTCCCGTTGATTGCGCGGTGTACCGTTTTC
GGGTACAACAGTTAACCGTACTTGTATGGTTTTGGATCCATAATGAGGAACTGTAACGGA
CTTGCCTATCGACTCATATATTGTTGATACAATTCCAGCTATGTCATCTTTAGTCATTCT
TCCATGCCCATCCAGGTCATACAAGGTAAACGAAAATTGCAAAGGTTGTTGTTTTGAGGA
TTCAGGATGTTGCAATTCTACATCACAGGTGAGTTCCTCAAATCTCATTCTTGGATTTTT
GTCCTCTTGGTTCTCTGGAGCGGAATAAGTAGGTGGTTTGTGTGAGGGTTCATTAGAAGG
CTTCAATAAGCGAGGTGGTGGCGGTGGTGCTGCTGGTTGTAATAGAGCTCTCGCCTCACT
CGGTAATAGATCTGGAGGAGCTGAGTTTTGAGATGCAGCTCTGCCGACAAGTTCTTCGGT
ATCGGTTCGATCGCCGTCCATACCGAGACTGAATTTCTTGTATCCATTTCTAAACTTATT
GCGCCACCACTTGACGAAGTGGTGCGCCATGGGGGCGTCCTCTGCGGGTGCCGGAGCTCT
CAACGTTTCGTAGCAAGTCATGCGCTGCGCTCACGCACGCATCCCGTACACTTCAAAAGA
GCCGCTAAACTGTTAATCCACCGAATCTTAATTTAAAATCACTTTCACTATAAACGCTAC
GAACACCAATTCGATTAAAACACGTTTGTTATTGTAAGCAGAAAATGTATGACCTAGTTG
CCCGCGTGAATGTCAGTAAGTGACGGAAGCGAACGACCGTTCCG
(3944 bp)

- SilkBase 1999-2023 -