SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_TrvaFAMAMG_TR23525c0_g1_i13
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_piezo-type_mechanosensitive_ion_channel_component_isoform_X2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0006810 P transport
GO:0006811 P ion transport
GO:0007638 P mechanosensory behavior
GO:0008381 F mechanosensitive ion channel activity
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0034220 P ion transmembrane transport
GO:0050896 P response to stimulus
GO:0071260 P cellular response to mechanical stimulus
Transcript
Level
FPKM:0.39 TPM:0.38
ORF EntryO_TrvaFAMAMG28927_complete:A_TrvaFAMAMG_TR23525c0_g1_i13
Sequence
(Nucleotide)
ATCTTTGATTAACAACAAGGAACAAGTTGTTAATATAGTATTATTATGTTAACAAAGAAA
TAACATTATCTAATATAAAATAAATATAAAGAAAAACTAGTAATATAAAAGTTTTTACAT
CCATTATTTATTTTAATTTCCAATAGTTTTTCTCATAACACACTTGTGTCCTGAACTTTT
ATTCTATATATGTGCAAGATGTTAATCTGATTGTTTTGTTCAAAGTACGTTTTTTTAATT
ATAGTTATAAAAATCTATAGCAAAGACGCTGCAAGCTATATACCTCTTAGTCCGTAATCT
GTTTATTATTATCTTGTAAAAATATATATGATTATATTATACTAAAAGGTATTAATTACA
ATAAAATTATCAGTTCTTTGCATTTTTTCTAAGAGAGCTTTATTTGGTTATTGTGACGAA
GTAATAAACGAAGAGATAATTAAATGCAAGAATAATTTAAGTACCTACCACCTAGTGTAA
CTAACATTTAGCCGTGCGAATCTAATCATAATCATTTTGTGCATGAATTAAATCGACAAG
ACATCTTATAACAAGTTGTAAATTGTGTCATTGGGGAGAAATGTTTTAAACTTAAATAAA
TACGTATAATAAAAGGTTATTTACTGTACAACTAATTCATGCGATTCGATCCTAATTCAT
CGTAAGTTATCGACAATAAATATAAAAAAATGGACGTGTTCTACCCACAATTAAGGCATA
TTTTGTATTCAAGTTGATGTTCGTAAATTTAATGCGATTCCCACTTAAACTAAACGGAAT
AAAATGCTTTATAAAATAAAATGAAAAGGTACGAAAAGTACCGGGTTTAGTACAGGTGGG
AATCATGTTAGTAATTCGTGAGATCCCGGTTCGCGCGTGACTCAGCTTCTGTCTGAAGGC
GGCAAGGCTCTCTGCTCGGGCTCGTCCTTGGGCCGACTCCACTTGATCATAGTCTCCGGT
GATCGGTACAGGAACACCAGTTTCGCGAATAAGTCTTCCTCTAGAGATAGCTCCAAGGCT
TCTCGGACGAGATAGATGTCGAGGCACAGTTGCAGCACGCGGTCGACGTTGGGCAGGTCG
TCGAACATGATCTTGGTGTATATGCCGGAGAAGAACCCGCGCAGGATGCGGGACGCGAGG
AACACGAACGTCGTGTACAAACCGAGGATACCGCTTCCAGAAATAAAGTTAAGTGTTTCC
GGGAACAGTTTGTCGTTGAAAGTGTACATCACGAGCATATCGCAGTTATTCATCGGAAGC
GCAGTCAACGGGTCTCCAGGCGGGCATCTCTCTCGTACGCGCCAGTACAAGTCGTCACCC
TGGCGTTCCAGGCGAAGCTGCACGTCTCTGTATTGTTGGGCGTACGGATCATCGCTGGGC
GGCATGAGTTGATACGCCGGTTTCGTTGTACCCTTATTGAAAACTTTAATGAACTTCGGG
AATAGAGTTGTCACGTTGAACCAGAGGTCGTGCGGCGCGGTCCCGTTGAGCATGTCAGTA
AGGAGCGCGCGGTCGGGGTTGACGCGGTCGCCGCTGTAGGCCGGCATGTCCACCTCGCGC
TTGTCCTCCAGCGTCGGTGGACTCGGCACCGCATTGGTGGGGTGAGTGATCACGTATGTG
AACTTAACTTGCAGCGATGCGTTAGAAGCAGCCTCCTCCTCAAGACGCCTGAGTTCGGGC
GGCGAGATGACCCAGTTCATGGTGGAGATGGGGTTGATCTTGACGACGGCGATGTCGTTG
TACATGTAGTTGGAGAGGAACGTGAGCGCGGCTCGGTTGCGGCTGTACATGTTGTTCAGC
AGCGTGTAGTCGGACTCCGTGAAACCTTCGATATTGTGCGACTGTGCTGACATCTGGTAG
ATGGGTAGATAAGGTCCGATACGTATTTTCACTGTGACGTCAGTCGGTGGGTTCGGTTGG
CCAACGGAATTTCCAAACGCGAAGAACACAAGCGGGAACCATATAATAGCAATGACGAAT
GCTAGTACGCATCCTCCCATCAGATATTTGGTAGTGCTTGATTTCTTAACGCCACGCGGT
TGTGGATATTCATCTTCAACGTAACGAGAGCACTTTAATAAGAAAACGCTCGCGAATATA
TCTTCCATCTTGAGCCAGTCTAATAAAGTCATAGAAGTGTCTGTCCATATCCAGTCCATC
AACGTACGTAACTCGAACACAAACGGAACAGCCATGAACCCTCTAAAGCATATCATGTTG
AGGAACCGGTACGACTTGCAGAGGAAGTTCCCGATGATGCGTCGCGGGTAGCCGCAGCGG
ATCTGGTAGGCAGACAGCAGCAGGTAGATACACTTCATCATGTACCACATCGGCGGGGGC
GGCAACGTGTTGAACGATCTTTCTGTAATAAAAGGCAGCACAAAGAACATCCATATATGT
ACTCCAATAATGAGAGCATATTGGAACAGTATCTTGCCGAGCATGTATTTCCGGAGGTAC
AGCGCTCGGTCGATGATGATGAGTATGAACTGTAGGATCAACATTATAAGGAACGGGATC
GGCACTTTGTTCTCTTCCAAGTACGCTTGTACGCCGCCGTCGCCTTGGTGAGTACCAAAG
GCAGCGAACCCGAATATAACGACGAGGAAGTTGAAGAAGTCGCAGAGGAACATGTACGCG
TACACGTCCGCCGTGACGCGCGCGCCCGGCGCCAACATGCGCTCGAAGAAACGCTGCGTC
GGACGGAGGTAACGCTTCACAGACAGGAGCATGACTTTAGGGTAATGCTTGTATGTGTCC
TCCATCGTTGTTGTTACTGCTATTATCGGTTCTTGATCATCGTTTACTTTGTAATGATCA
TCGTCGATGGGTTTCGAAGGACCAGCTTCATCGAAATCTCGCTCTTCTTGTGATCGAATA
TCTCGTCTGATACTTAAGTCCGATTCATCGTCTTCATTAACATCTTGAGGTCCGCTTCTA
TCGTGCAGCTGTACGAACTTCCTGGCGACTTCAGCAGCTCGCCCGTCCACCACCAGCTGC
GTGTCCTCCGGCGTCAGCGCGTACTCCATGTCGTCGCGCAACTCTACTTCAGGGGACGAC
TCCTTCCATAGACCCAGAGATTTTAACATGAACCTATGCAAGAATATAATCAGCAACAAT
AATAAATCATAGATGGCGTAACCGGGCTTTCTCTCAATTCCAATAACTCGCGCCGTACTG
AATGGTACGTTCGCTGGAACACTGTCTCGATTCCACGGTAATATTTCAAATTGGAACATG
CTTTTTATTAACACAATCACCTCGGTATAAGCAATAAGTGTAACCCAAAAAGTCTTTGTC
GGTCTCGGTATCGTCAGAGTACCCCATAGGAATACCATCAACGGTAGTGGTATGGATAAA
ATCGTAGCTGATTGTATCTGATTTATAAACACCATAATGTAGCAGACGATATCTGTGTGT
GCCAGCACTGCATACCACAAAGCGTAGGTCAAATGTAAGAATGGAGATCTGTCCTGTTTG
AACATCGAGTCATCCTGCTCCTCTAGGGTTGTCACATCCTTACCCATTTCAACATCAGGA
GCCAGTAGATTTTTATCAATATTTTCCACTTCGATACGCGGTTGATGCATTAATGCTTCG
GGCAGCGGTTCCCAAATCATTTGAGAGCCTTCTCTTAAGCCGATACCAAAACCTTCTTTT
TCCTTAAGTATTTTCTTTTCAACAGAAAGCGTTCTAGAAACATATCGATAATCTCGTGAG
TACTTCATCAGGTATCGTGTGATCGACACCAGCAAGCTCGATATGAACGCCCAGGCTGTT
TCCATGATGCGCTTTAACTTCTCAAATGTTGTTTCTTGTTCAGGTAACGGTGCGTAGTCG
TCCAGTTCAGAGCCAGGAGGTTCGCGTTCTCTTTCCGATATTGCGACATTTACATCGCCC
TCCTGTGCAATTTCAACTTGTGATTGTTTCCGACGAACCTTTCCGAATCCCATTTCTTTG
GGAGCGTCTTCATCTGAACTTGATTCGTCATCTTTCATGTGAATTTCCGTGTCATCAAAC
TCATCGAACATGTAGTAGTCGCCGGAGCGGATAGCTGTTTAAAAATATTGTATGTTTAAA
TCTGAATTTACAATAGTAACGTAACTAGAATCAAATAAAAAGTATTTTAATTTTATTGCC
TTCTATCGTGGTCGAAGCTCTAAAAATGGTTTCATTATTCAATCTACAATAGTCAATTAT
TTCAAACAACAGCAAATAATGCATAAAATATATTTATATTCTGCATCATAATTAAAAAAA
ATACTAAACAAGAATACTAAAAAGGATAATTCTTGATCTTAGAAATATTATCGAACTCCA
AATTGTCAAAAAGTTCTAGTTACGTTTTTGAATTCAATTAAGCATCGTGATTTGAGTGCT
TCTACAAAATACAAATAATGCTTTTGCTATTTGTGTAACATGCACTAATATTCCATTATT
GTGTAGTAAATATTGAATGATATTTAATTTACTATTTAATGATTTCAATTCTCAAAAAAT
CTAGTTTTCGATTTATACACTTCTTTAATGGTAGTGTTTTAAAACGAACATGCAAACATG
CACACTCAAAGCCAGTCAAACATGCGATCAAAGCACTTTAAGCGAAGAATTTTCCCATAA
CATTAAACTCCCAATTATTTCAGCGACAAATGTGTTCCCGCCACGATGTTACTTGCCTAA
ATACCAAAGCTGCAAAGGGTTAGAAACGCCGATACAAGAATAGAGCGAATTTCGACTGAA
CGTTACCCTTCTGATGAGTGGCTGGCGGCTTATACGGCGGCCTGTCTCGAGCTACAAGAG
AAAAGCACAACTCAACGGAAACTCACACCAAACAGCACCAGGACGAATATTTCAACAGAT
TCGGGGTTAAAACAGAGATCAGGTTATTAAGCGTAGATCGGAAGACAGGATGAGACATAC
GTCCCATTTGGAATTTATGTAATTGTGATTGCACACTTCTATTCGGAGAAATCAAAAATG
TTTAAAACCAATGTTACATTTTAAATGAATACCGTTAGTTAAAATGAATTGTATGTACAT
GAGAGCGTGACATCATTGAACCATGAGTTTTAAAATGTAACATTGTTGTACAAATGTGCA
ACGGCAAATCACAAATTAATAAAATGGTAAAAGAAAGTCCAGATGACGATATTAATAACA
TTAACCAACACCTGCATTCGATCGCATCACCTATGATTTACCTTCGTGTCTCTTTGAAAA
AACTTTCCTCTTAATCGCGGCCCCAGTTCCTATTTAGATAAAATTTTAAATTAAAACAAA
ATGTCAACATTGCTGTACATTGTTTACATTGCGGAACGTCGATTCGGTACATTCAGTGGT
ATCGAGAGGCCGAGTAATAATGTGAACATTTTTAGTTCTTTTCTATTTTTACAGCAAGTA
TTTTACAATGCTATCAAACAGTACGCATTACTCAGTCTCATCGTCTATATCGTAAGAGTG
CACATCGTACGATCGAGGTCCAATTACAGGTATGGTGGGAGTGCGGTTCGGCGCGGCTGG
AGTGCGACATGAGCGAGGTCCGGTGCGGCACGGTGGGGCTGGCGAGCGTGTGGCGGCGCC
GCACGGGGGGCG
(5592 bp)

- SilkBase 1999-2023 -