SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR23506c6_g9_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_vacuolar_membrane_protein_YPL162C-like_[Papilio_polytes]
Ontology
GO:0003674 F molecular_function
GO:0005246 F calcium channel regulator activity
GO:0005515 F protein binding
GO:0005575 C cellular_component
GO:0005783 C endoplasmic reticulum
GO:0005789 C endoplasmic reticulum membrane
GO:0008150 P biological_process
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0032237 P activation of store-operated calcium channel activity
GO:0032541 C cortical endoplasmic reticulum
GO:0035584 P calcium-mediated signaling using intracellular calcium source
GO:0051533 P positive regulation of calcineurin-NFAT signaling cascade
Transcript
Level		FPKM:6.95 TPM:6.81
ORF EntryO_TrvaFAMAMG28615_complete:A_TrvaFAMAMG_TR23506c6_g9_i1
Sequence
(Nucleotide)
AAAAAATGTAAACAAAACAAGTTTTAGAACTGTGCTCAATTTTGGCTTCTGCTACAGACT
TGGCAATAAACAAACCAATTATGTTGCCGATCCCAGTTGAGTAGATAAAACAGAATACCA
CCCGAAGAGCACATAAAGTACGTAGATACTAGCACATCACTAAATTTTGTCTACTTGTCA
GTTGTCATGGTTGTCATCACTTGTCACAAAATTTCGTGTTTTCGGCTCACTCCTGAAAGT
CGCAAATAAATTATTAAATAGAATTGTAATAATTTTTAATACTGTTGATTTTTAATTTTC
TTGAAGTAACAACTCCGTAACAAGTGTTTTTTAATAGTAGATTTTCTAACCCATTCTAGT
GACGACACATATGTGAGATTGAAAGTGCGAAATTTAAAGTGTTTTATTGACATTAAGAGA
ATGAGAAAATGAATAATAGTTCGGATTACATATACTGGTCTGAGCCGCATTGCTCCAAGG
ATGCTCTTACCGATACTTATGGATGGTTCATGCAGATTCTTTTGGCGGTGTTAGCCTTCA
CCTGTTTAATAGGTAAAAGATTCTGTGAACCTCGCTTTGCCAGAAGACCATGGTTGATAT
GGTTCTACGACACATCAAAACAAGGATTAGGAGCGGCCATTATTCATGCAGCTAATGTGT
GGCTCTCACCCCATCTCACAGGGAACCCATGTACATGGTATATTGTGAACTTCATGTTGG
ATTCAACATTAGGATTATTAATAATTTGGGCTGGAATCAGACTAGCCCAGTACTGTGCTA
GAATTTATGACATACCATTGATTAACTTTGGTGAATATGGTAAACCGCCCATGTGCTCCG
CGTGGATATGCCAGTGTATATTGTACGCGGCTCTAGCAACGTTCGCCAAGTCGATCCTGG
CTCTGGTTTTGCGTCTCCCGCCCGTCGTCGCAGTTCTATCCACGTTGAGACTGTCCCCGG
TGTCGGATCCGCGCTTAGAGCTTGCTGTAGTTATGCTTATAATACCTTTCTTTGTTAATA
TTTTAATATTCTGGGTGACGGACAACTTCCTTATGTATCACCCGAGAGGAGTCAGTTCTA
AAATTAAAACAAAGGTGAGATACCAATCAATAAAGAAAGAGAAGTCAGGTTCAGAAGAAG
ACGATCATTCGGCAGACGAGCGTCTCCTGGGAGCGAGCGTATGACCCAACAGGAAGCCCT
CAACGCAGCGGGCTTCGGTAACGTAATCTCTTCGAATATTTATATTATATCGATGTCGAC
TGTTAGCCAGGTAAGATTTATACATTCATATCCGTGATTGGAATTGTGTTTTGTTCTAAA
ACAATGGAGACGTTTCTTTGTTAGATACAGGGTGTGTTTTTGAAGTCGTGAGATGTAGGA
CTGATCTCGTTTTGGACATTTAAAATTTGCAGCTAGGATACGATCTCATTTTTTTTGTCA
CATTTTAAAACACTATATTGTTAATTCTTGAGAATGTTTTACAGCGTTTGCTTTTTCGTT
GTTCGACATAGTTTCCAAGACCCTTTAAATATCTACTCTGTGTACATAATGTACCTATAT
CTACAAATACGAATCTATTGTGGCTTTATTCCATCAAAATATTATTTTATTTCGCTCATT
ATCTGTTCAATGCGAAACTGCTTTTGATTTTTGAAAAAGCAATAATGCACAGAAATGTTA
CCATTGAGTTTAGAATAGACACTCTTCCAACATATTAGACCACCATGTTGTACTGAATAA
ATTTAATAGGCAATTTGATTGAAACGAAATGTAAAAATACGTTTTAAAAACACAAACATG
CTTATTGACGAGTCACTGTTTAGTGTCGATAATAAGAAAATTGTAAGTGTAATGAAATTT
TTAAATGTGTTCCAAAAATATATTTATTGTAAATGAATATTGTACATTACAAATAAATGT
ATATTTTTCATGCATGTTTAGTTACATTTTTTATTTGAAATTAAGTAACAAAAGAATTCG
AACCATTTAATTAGTCATATTTTGGAAAAACGTGGTAGTTTTGAAAAAAAAAGACAGTCA
AAAATTTTAAATTATTCTCGTAACTTTAGTTGAATCACTTTGTAAAAACACGTCCAATTT
TCAGAAAATTCAAAGTATTTTTGTATGTTTCATTTATGAAATGAAATGTTATGTGTAATG
TTCCTATAGTAAAATTATGTAAGTACTTAGATCGTTTGTTGAATAATAAAATCGCTTTTG
TATTGGTCACTCTCGCACCTACTGCTTGATAATAGGGGTGAGTGAAACATTAGAATATAC
CGGGTCGATCTGTGTCTTTGTACCAGCTGAAACGGGGTTTTGTCGAAATGCAACTTATAA
CTTACAAATATTTTTGGAATTCGTTTTTTTTTAATGTTGTTAAGTTTATTTGTGACTGTT
GTCGTGGACTTCAGGATTTAGACATAAAAAAAAAGTTAATCAATTCCAAAACTAAACGTG
GTTCTCAGCTGTAGTTCGATAAGTCATTCACCCCACTCCAGCTGGTATAAAGTTACAGAT
CCACCCTGTATATGTTCTGAGTACATTTATATTATAGTGCCATGTTTGAAAGTTATTGAA
AAATAAACAAAAGACATCGAATCAAGACTGAAATTCGATGCTCACTGTTATTTTTTTTTA
TATTTCGTCTTTTTATTGATTTTATTGATATTGGGTTGATAATTTCGAGATTTTTGTTGC
TTTTCAAAGAGATACAATTATGATTGCTGTGAAATTAAAAATTTAACATCATAAACTTAT
GAATATAAAAAGTATTGAAAAGTAATTTAGACATCCTTCCATATTGATGTAACAATTTTT
TTTAAATGCTAGTCTAGGAATGATGATTTTTCTCGATTACGTTTATGATCAGTTTTTTTA
TGGGAATATTAATTTTAAATGTTTTTTTACATCACAAATGGGCTAATTTTTGTATAATTT
TATGTATTTTATTTTTTTTATTTAAATTTTTAAACCTATAATTGATAATGGCATTAATTA
GTTGTAGATTTTTTTAAACAATATATCATTTTTTTTTAAAGCACACCTAAATTAGAATAT
TTCTTGATCTGATTATCTTTCCATCCATTACATGAATGATATCACAAATATTGCCATTTC
AAATGAAAATGTAAATAAATAAGGTGTTAGTAAAATAATTGAGAAACTCCAAAAAAAATA
TTTTGCCTATATATTTTATCTCCATAAATACTCAAGACATGTTAAGTAA
(3229 bp)

- SilkBase 1999-2023 -