SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR23500c0_g1_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_hemicentin-1-like_isoform_X1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005509 F calcium ion binding
GO:0005576 C extracellular region
GO:0005578 C extracellular matrix
GO:0005604 C basement membrane
GO:0005938 C cell cortex
GO:0007601 P visual perception
GO:0030054 C cell junction
GO:0031012 C extracellular matrix
GO:0050896 P response to stimulus
GO:0070062 C extracellular exosome
Transcript
Level		FPKM:1.16 TPM:1.14
ORF EntryO_TrvaFAMAMG28522_5prime_partial:A_TrvaFAMAMG_TR23500c0_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
TGCTTTTGAATTGTGGTGTTAATGCTAAACCTATAGCTAAGGTAAAATGGTTGTATAATT
CTAAAGCAAGTCATCTTCTTTTATAACCTCAACATTTTCATCTACCGTCATTAAGAACGC
TGGCGGCCATTGCACGTCGAGCGCTACGTACGCAAGGGCACTACCCGCAGTATTAGTTGC
AACGCACGCAAGCACGGACGTATTGTCGCGTGAGATATTTTTAATGACAAGGTTACCAGA
TGAGACTAATTTTGCATCCTTGTACCATTTAATGGAATTGATGTTTGATCCTCGGACAGG
ACATAAGATATTGACGTCGCTCCCTTCGACCACACCCACTTTGATGAGAGTTTCATCTGA
CTGAATCTGTTTGGGCACAGAATATATTAAGACTTCAAAAGTTTTATTGCCATTTCCGTA
ATTATTCCAGGCGACACATGTGTAATTGCCACTGAGTTCCTCTTTGGGTGCAATTATTTC
GAATCTTCCATTCACATCTATATTGTACCTTGGGTCGTGATTTAAATAAAACCCATCCTT
ATACCACAAGACATAAGGTTTAGGTTTACCAGTTGCTGCACAATACAATGATAAAGATCG
ATCCATTTCGGTTGCCACATACGGACCAGTATAGTTATCGTCTAATATCTTTGGTGGTTC
ATTAACAACAATAAAAGTTGTCTTAATGGCAACACCGGCAATGTTGCTGGCAACACAACC
ATAGGCTCCCTCGCTTGCTAAAGTAATGTTCGTCAAATATAAATTACCGTATTCGTTGTA
ACTTAACGTAGTTGTGTTTTCAGATATAACATTTCCTCCATATTCCCAAGTAACGTCGGG
AATGGGGAAACCAACAACATCGCATTGTACAGTTACATTATCACCGGAAAAAACTTGTTT
CGTTAATCGTAAAGGCGGATCTATGCTTGGAGCCACCCAAACCAAAACAGAATAGGTTAT
AGAATCATTTCCATATTCATTGCTGGCAACACATGAATAATTACCAAAATCTGTTATGTT
TGCCACGAATCTTATTCCATTTTCATCGATCTGTCTTCTATCATCGTGTATTGCCTCGTC
GTTATGTTTCCATAAAACTTCAGGAATAGGTACTCCTTTTGATCTACATGGCAACTCAAC
CAGTTGACCTTCTAAGAATTGCTGAACAGGTTGTAACGACGATGGAAGTATTTTAGGAGT
TGCATAACTTTTAAGTGTAAAGTTCCTGTGAATTGATCCTAACGCATTCGAAACATTGCA
CGAGTAAAGTCCAGCGTTATGTTCCGTGACATTGTCTATGACCAGAATTTCTGGTTCAAT
CAAGTACACATTTTTGGAGAAAGCAACGGGTAGACCATTTTTAGTCCAGACTACAATCGG
TGTTGGGGAACCGGTAGTATTACATGAAAATGTAACTTTTTTACCAATTTCTATGGAACT
TGTCACATTTTCTATCCATTCTGAAGGTACAATTGACTGAGGAGCATATTGAACTACTAG
TTGTGTATCATGCGTGTCGCTGCCTATTACATTTTCTACTTTACACCGATATGTTCCAGA
TTGTTCTAAAGAAATTTCAGATAGGACAATTTTGTTTTGATCGGTGTAATCTACAAGGAA
GGTGCTAAAATCTTTTGCAGATACATTTTTGAACATCCACGAGACAGTCGGCTCTGGGTT
TCCTTTAAAGATCCTACATGTAATATTTGTTGTATCTCCTTTACGAACGACCACATTTTT
TGTTTCTTTAGATAATTGCGGTAATTCCAATCCCGTAACAGTAACAGTTGCATTATACGA
CATTGTTTCGTAACCATTTTCGGCAACACAAGTATATCGACCAAAGTTGGAAAAATCCAT
TTTCTTGACAAGTAAAACAGAACTATCTTTAGACAAATCGATGTTTTCGTTCTTCTGCAG
TTCTGTTCCGTTGTGATACCATTTCAAAGTCGGTGGAGGGTAAGAATCGACATCACACTG
AAGTTTTATTTGCGAGTATAACTGTGTTGTAATGTCGTTAAAATCATGAAGTAGAAACAT
TTTTCGTCTAATTTGAACCGTAACGCTGTCTTCTGAAATGCCTTCCGAATTCTCCCCTAT
GCAGAAATACGTGTCTTGTACTTGTTCTTTGCTACTGTCTAATTTCAGCACACTTTTATA
TAAATTGTGTCCTACCGAAGTCGTAACACAATCCAGGAATTCTTCAGTTTCTCTATGCCA
TATTACTCGAGGTATAGGTTTCGCTAGTATTTCACAATTGATTTCGTAGATAGATCCATT
CAGTATAGTAATACTTTTAGATCCAATAATTTTGACACTTGGTTTTATTTTTATGTTTAT
TTGAACGGAATCTGACACATTAAGTTTCCCGCGACGAGCTAAACACGTCCATGTACCATC
TTCACTAACATTCCTTACATTGAGAACAAAGTCGGAACTAAGCTTTACTGTTTGATTCAC
CACTACACTCCCGTTAGGAGCTATCCATTGCATCGACTCTGCTCTGTCTACATGACACAC
AAGTTGTACATCAGAATGTATTTCACTAGATATTGTGTGTGGACCAAGAATTTGTGTATT
AGGTTTTGCGTTAACCTTTATCATGATAGTTTTATTTGATTCTCCGGCTTCATTGGAAGC
TGAACAAGAATAGTTTCCAGCGTATTTTTCTGATATATTGCGTATAATAACACTGAAAGA
ATATTTTCCTTCTGTATTCAACTCCGGACTTACTTCAGAGGAATTCTCAAAATTGTTTCC
TTTGAAGTTGAGTCGATATTTAAGCAGAAGTGATTCACTGAAGGCAGTACATGTAATGTT
CAGTTCATTTCCTTCATCCAACGTTTTATTACCAGGTTCAATATAAATCTCTGGTGGATT
GACTAGTTTGGTTACAGTTGTGTTTATCACAATTTTATCGTATCCATCGTCGGCCATACA
TGAATATTGTCCAAAGTCTGAGGTGTTCATACTCTTGATTTTTAAAATAGTGTTGCCAGC
GAATATGTGCGTATTTTCGTTGTTTTCCAGTTTTATACCATTATGGTACCACTTTATAAT
CGGTGGCGGATGTGAATCAACATTACAGTGCAGATTTAGTTGTGAATATAATTTGGTCCT
TGTATCATTCATTCCATGTAACAGAATCAGTTTAGTCCTAACTTGTACTGTAACGCTGTC
TTGCGAGATGCCTTCAGCATTCTCTCCGATGCAAAAATACGTGCCTTGGACTAGCTCTTT
GCTGCTATCTAATTGTAGCACGCTTCTATATAAATTAGATCCTAGTGAAGTTGTAACACA
ATCCAGAAATTGTTCAGTTTCCTTGTGCCATATCACTCTAGGTAAAGGCTTGGCTAATAT
TTCACAGTGAATTTCATATATCGTTCCATTCAAAATGGTAACATTTTTAGGTCCAATAAT
TGCTACTCTTGGTTTTATTTGCACATTAATCTGAACGGAATCTGAAGCATTGACTTTCCC
GTTTTGTGCTACACATGTCCACCTTCCATCGTCACAAACATTTTTTAGATTAAGAACAAA
ATCAGAGCTGGCTTCGGTTTTTTGATTCATTACTATACTACCGTTAGGAGCCAACCATTG
CATCGACTCTGCCTTTTCTACATGACATACAAGTTGTACATCAGAATGAAGTGGACTAGA
TATCGTGTGTGGACCTAGTATTTGAGAATTGGGTTTCGAATTGACCTTTATGACTATTGT
TTTGTTCATTTCCCCGCCTTCATTGGTAGCTGAACACGAATAATTTCCAGAAAAATTCTC
AGATACATTGCGTATTATGACGCTAAAAGCATATTTTCCATCAGCATTTAATTCTGGTTG
TACATCAGAGGATTTTTCAAATTTA
(3865 bp)

- SilkBase 1999-2023 -