SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR23494c0_g2_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_lysine-specific_demethylase_6A_isoform_X2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000978 F RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001701 P in utero embryonic development
GO:0001843 P neural tube closure
GO:0003007 P heart morphogenesis
GO:0003016 P respiratory system process
GO:0005515 F protein binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0005654 C nucleoplasm
GO:0007507 P heart development
GO:0010468 P regulation of gene expression
GO:0010628 P positive regulation of gene expression
GO:0016491 F oxidoreductase activity
GO:0016568 P chromatin organization
GO:0021915 P neural tube development
GO:0031490 F chromatin DNA binding
GO:0032525 P somite rostral/caudal axis specification
GO:0035097 C histone methyltransferase complex
GO:0035264 P multicellular organism growth
GO:0042802 F identical protein binding
GO:0044666 C MLL3/4 complex
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0048333 P mesodermal cell differentiation
GO:0048568 P embryonic organ development
GO:0048570 P notochord morphogenesis
GO:0051213 F dioxygenase activity
GO:0055114 P obsolete oxidation-reduction process
GO:0060070 P canonical Wnt signaling pathway
GO:0071557 P histone H3-K27 demethylation
GO:0071558 F histone H3-tri/di-methyl-lysine-27 demethylase activity
GO:0072358 P circulatory system development
Transcript
Level		FPKM:2.53 TPM:2.48
ORF EntryO_TrvaFAMAMG28438_complete:A_TrvaFAMAMG_TR23494c0_g2_i1
Sequence
(Nucleotide)
CACGTCGATGTTAATCCACTGTAGGTAATTCATTGATTAATTTGTTACGTATTACTTCTT
TCTGTTTCTATAAAATGTATAATCATTTAGCACAATGGATTGAGTGATTTTTTCTATGTT
GCGACAGGATGTGGCACATTGATAAAACACTCTATTAGGGTAAATTAAACGATTTTTATG
GGTATTTATTTTATTAGCAGAAAACTATTATATGTCGCGCCTGGTTAAATTATTACAATT
TAAAATTTACGATCTAAATCAAATTGAGTAGTTGATTTACTGGCGTACTGCTGTAATATA
CGTGTTTTACAGTATAACTCCATGTTTGTTTTGAAGTCCCCTACGATACACATTACGTTT
CGATACGTTTCGAAGCTTGCGTCACAATAGTCAAGTTATTTCTCACAATGAGCCGGTCTA
GCGGAGTGAGAAATGCCGCGTAGCAACAATATAGAATAGCGGGGAAACCGGAATTTATTT
ATGCTTCACGTGTATAGTAATGTTACAAGACGTAAAAATGAATTGAAACATTGACCGAAG
GTACGAAGTTTAAAGTTCCCTAGTTTGCAAATATTCAAGACACTTTCAACTTCGATTTTT
GGATTGAGACTTTTCACATACGAATAGAAAATCGTAGGTTCATCTAAATAAAATATGGCA
AAGATAGGGCGTAACCTCTTTACCCTTCGTCCCGCAGTATGCGCCACATCACGTACGCAC
GGGCCCTTTCACGCACAGGGAGGGCCTCTGAGAGGGCCCGCGCGCGCAGCGTCTATCGAA
TTGACTAAGGGCGTACTGTGCATTATTTTGTCTCTCCCTACACCCGTCCAGGCCCCGGTT
ACACCCGACGCCCTGTGCAGACGTTCCCGGGTCGAGGTACCCACACCCTTGCCGGGACGC
TTTTATTAAATCATAGCTTGTGACCTATTACGTAACTGACACATTTTTAATGTCAAATCT
AGGTCAGGGCTTGTAGAGCTCAGTAGCAGGGTTACAGGGGAGATGAGACGCGGTCGTCGA
CACTAACGGATCGCTATTTATACCTGGCTCGTAGTGCACCGGAACTCGCTCGCTGCACTC
GATGCATCCGCGCTACCCGCCTCCGCCCTGTCAATGACCTCTTCATCACTTTGCCGTACC
AGAAACGTTTCCTATTTCGACAAATGTCGCAACTAAATGCTCGTTCGTATTATTATAAAC
TTGAGCCTAATCAGAATTTACTATTTCTAATGTTCGTTGCTCACCGGCGACTCATAAGGC
AAATGTTGCGAAAGTCTGGCTGGCTATGTAGTAAGCGGACGCCCTTCGGCTTTGTTTGAG
TTACGTAAAACAAACCCGCCCACGTCTATAGGGCAGCCACCCACGCAGGGCATGAACTGT
GTCAAGCAGCCTGTCCTAGTTTTTAGATCAAGGGTTCTGAAGTAGGGATACGTGCATTTT
CCGCGTATCAAAAGAAAATTGGTACCGGAAGTAGAAAACAACGGTTGGCGACATTTAAAT
TATGCTTACATTTAGCGCGTTGAAGTGGGTATTTTTTTAAAGAATTGGTGGCAGTGGTTT
TACCGTGCACAAAAACTTTGTTCTAATTATAATATCGAATAACTAATTATCCACTTGGGA
GTATACGTGTTTGGCAAACATCGTGCGATGTCCGCGCTGGAATTTCCGCGAAAAAAATCA
TACGTCACCACACGTCACGGCGGTGGGGCGGAGCGTCGTACGTCACGCTTGCAAGGCCGC
CAGTGAGTAAGCGATGAGATGCTTTTTGTTTACACCAATCCTACTTGCGCTTTGTAGGAG
CGTGTTACATAATCAGTAAAAAATATCGGATATATGTAACAGTTTTCAAGTAATGGAAAG
AAAAAATATGCACGTGTGTGCATATTAATCGTAAAAACTATTTACGAATGACCCAGATAC
CAGATACTCGTTTAATTTTTTTTTTTCAAGGCATATGTAAGATGAAGATGAGCAGTTCTT
CTTTCTTAAATAAATCGATTTTTTTTGTAACATCGTTATGTTCCAATATCTCTAATACCT
ATAACTTTTAATGTTTTGTAACTTTTGTTAGAATGAAGTTTTATTACACTCGCAAATATT
AAAAGCTTTCAAATCTTTCACATGGTACTGAGAATGTCTCTGTGTCTAAAGTCTCACACA
TTTAGTATGTTCTGCATGACATGGTATTCGTTGTATCTAATCTGTGAGCTATAAAATACA
TAATTTATATGTTCCGAGTAAATTTAAATTAATTTAAAATTACACTTCAAAGTACAGCCA
AGAATTTTAATCGTAACGGAACTTCTCGGAAAACCACATCGCTGTGTATTTTCCTAGAAT
ACCCCTAATTGTCGCTTTGTACGACAATCACGTATGTTGGAGTTGTTATCACTGTGCGAG
TTACGTAAACTAGGTGGTACGTTATTCCCATAATATACGAATTGAAAATATTACTTGATT
ATCATAATGCATATTTCTCAGTAATATGAGTGAAATCGCATTCTGATGTTAGATAAAGAC
AATATTTTACAATTTAATGGAATGTTAGTCTAGTATCTAGCGCGTTCATACGAGCATACG
TAATTAGTGAGCAGCGGAGCGGTTCTCACGGATGTCGAACTGTACTTACGATCTTACCGT
CGCTTTGAACGCACAATGGGCATTAGAAAGCGACCGGTGACCGCAAAAAGGGAGCTTTGG
AAAGGGCCTGACTCTTGCAAGATGCTGTTACGTCACTATCGAACTATAAACCCGTCCCCC
TTTGTCCCGTCTCTTCGTAAATACACTACGCGTAAACGTACTGCATAGTGTGCTCGCTAT
TGTCCGACGTATGCGATAAACTTAAAAATTCGATCGGAAAGGGTTGAACCCTTCTTCAGT
TGTTATAATGGGGATGGGGCAGAGTTTTTAATTCTGCTGCATGTAAATAAGTATTGGACT
TGTCAAACACTTGTGAGCCGTGAATCGTATGGGGTTGTTATCAAGGGCACTCCGACGTTT
GTAATGTAATAATAGCGCAAAATGTCGTCTTTTTTACGTAGGGGGAAGTTCACTCTGCAT
AATTTTATGAGCGTTAGTTTCGTGCGTAATAAATGTGATGCGATGATTCTGTCTGTGTTT
ATTTGAAGCGTTATTTCTAGATTTTAGATGTCTCGATGTGTTTCTTTGAGTAAACAAGTA
TTATGATTGTTGTAGAAATCATTTTACAGATTGTACGCGTGTAATGATGCGTAATGACCG
CTCATAGTCAGAGTAATGTAATGGACTTAGCTTGCGAGTTGCGTTTGCATTATTATAATA
ATAACGTTGCAAGTACTTGTTAGTGCAACGTAATGTGCTTTGCAGAATAAATTGCAAGTG
CAGCTGTCATCATCCGGCTGTTTCCGCGTTTGTAATGACTTTGGTCTTTGTGGCAGCGTT
CGAAGCTCTGTTTATTATAAATCGTCTTTTGAATCCAGAGTTTTATTATAAATGGCGTTG
AGTTGACTATTAATAAGCAGGTAAATGAATTGTGTAAATGTTCATTTGCTGCGGTTTGTA
GCATGATATTTTATTACGGAATGCGAAAATTTAATTAAATATAAAGAGTACAAAATTTAA
TTTAGTTATTTTGTAAAATGATTTAAAGGATTGAATATTTGTACGTGCAATACGTTAAGT
TACTAAGTGGAGTGTTATAGATGGCCAATAAAACAGTCGTAAAGGTAAAACAGCTTATTC
TACTGATAACAAGTCACCTTGACTACAGTTTTATCGATTTCTATGGGTATTCTTGATTTT
ATTGTTGACGTGCCAACAGCAACGAAAATGTACATTTTAAATGTTACAAAATACTTTGTA
TATTTGAGGCTATGGGGAAGTTTCCAAATGCTTCACACATTCGTTCTTCTTCAGTACTAG
AAAACATTAATCTCCTCTGTCTTCCTCGTTTTGAAAATACATCTAACGAAATAACTACTA
GACGTATTCCAACTTTAAAAATCTCATACAATTGAAGTAGTATTCAAACCTTCCGGCCTT
GGTTAGTTCATGCATCATTCAAAGGCTGTATGTGTCATGTTCTCTATTCACAGTAAAACA
GAAATAACAAATTAATTGAAAGCGTTATGATGATTAATTTGTGTGTACCGAGTTACCGAC
CATAATGTCGGGTCATATTATTGACACACCGTTTATTTAAGCAAATTAATTAATAATCAT
CGAAAACGATTTGGTTCATTTGCATGTTTAACCCGGTAATTGCCGGGAGGCGACGTACAT
CTGGATCATTATTTTGGATACGTTCGATGTTATTTTAGTTGGATTCGCTTTAATTTCAAA
TTTGGTTTCAAGTGTATATGTATATGAAATTGGTAAAATTCTTGATTTCTTCCTACAAAA
TTTGCTTATCCAAGTTATTCGACAGCACAGGAAGCTATTATAGTCTAAAGATGTTACTCA
ACCATTCTATAAATATTATGTAATGTTTGTTTATTGGCATCGTGAGTGCTCTCGCTAAAT
GAGTTAGCAATGATGATTAAATTTTCCTGAAAATCTCAGTTGCTAACGAAACTTTAGCAC
AGTTTAGACTAGATTATTTATTCGAAAAAGTTAAGTTGTAATGCCAAGAGAAAGCTTCCA
ACTCGTTAGTCTAATAACGTCTGTAACTAAGTGCACGTTTCACATGTAAAGGAAATTGTG
TTCTGTCGTCTACAAGCAACTTTGCGTGTGGCTCTCCATTAGAACTCAGTCGATCCTTTC
ATTGGCGACCCAAATACCTTTGGAGGCCCTTGAACGACACAGCATTGAAATGAATTGCTT
ATAGTTTATGATCACATTATTCTAAACAGCATTAGACTGAAAATATTCAACGCATATCAT
AAATATTGCGTTCATGAGATCATTCGTGTGTAGGTTACTCTATAAGTGGTATCGACTATA
ACGAAAGTAGGTCAACTAGTATGACGTGAGCGATAAAACAGCACTCGTTCATTATCAATA
TTGAAGTACTTAGCTTTTGTTCCTGCTGGTGTTAGATTGCTAATTTGTGACGTGAATCAC
AATAACCAAACAGTGCGGTAGTAGCTTCATCTTACATTGTTCTTCATTCGTTAGATCAAT
TCTCGAAAGTTTTGTAAGGAATAATAGAAAAATATGATGGGAAAGACATACAACATAATA
TGAGTAGTCAGTTTCTATGATAAATCTGAATACCGTTGTTAAAGAGATAATAATCAAAAG
ATTAAAATTGCTCATTAAAAATTTAATAATAATATATTTTACAAGCGCTACTAGTTTTTA
ATTAAAGAGATTGGATGAGATCTTTGAATTATACAAATTTATATAATTGAGTAAAACACG
ATAAACGTTAATAAACAATCAATTAGTTCTAATCTCACTACTCAGATTAGGTCAATCAGC
GACGCACTCGGTCAATTAGGTACAAATTATTACCTCGGTTACTAATACCAACATATTCTC
TTGGCAATAACAGTTATAAACAGCAATTAAAAAATATATATTAAACAGTGTTTAAATAGT
ACCTATTGCATATACTATAAGGTTATAAAAATACTTTTCATTGCCTTCATCACCACAATC
AGTATATTTAAATCTCACTGGATGTCTTCTAAAAGATTATGATCGGCGTTTGGTTCTGTT
CTTCCTGTATTAAACTTTACCTAAACCATCCCACATTACATTCGCCTTGCCAAACCAATC
GATTCTCTTATTCAAATCTATAATGTATCTACATAAAGTTCTCGCATTGATATTTATATT
ATTGTACAAGTATTAGCCTTCGATGCATACAGTTGCAGTTAGTTTGCACTCGGTTACGGA
GCTGCCAAGGCCATGATGCAATGTAGCCAGGTAGATTATAGGTTTCTGTCGCCTCGCATG
ATCGCATCACGCGATCACGAGTACAATTACTATTAGTACTTACATGTAAACTCAATATTT
CAACATGTATTTATTATTTGAAGAAGACAATATCAAAAGTGTTAAAAGATTTTTATACGG
TAGACTGACTGTGCCCCTGGCATTGCCGAACGTCATCAGATCGTTTACCTCTGACGGCAA
TAAAAAATACAAGTTATCACGACTTAACGTCCATTATGTTAAACTAAATCTTCTTTTCAA
ACAATTACGTTGCTTGATGTTAAATTTCATTTTATTTTGGTCTCTTTCTTTGTTAATTGA
ATAATTGTTTCCAAAACATTAATTTTTAAAGGAGAGTGTAGATGGCTACTTCCTTCAAAT
GCTTATAAAAGGAACTGGCTCTATCAATCGTGGATTTCTTTTTTACTCAGCCTTCATTCA
TTACAGAACAGATGACCTATAAAACACAGCTGTTGTAAATAGGTCGTATCCGTCTAAGAT
CTAGGAAAGAATATGTTGCGACTTTGACCCCATTCCGCGAGTCAACATTGCGTGCGAATT
TCTAATCCCACTTTTTATTCTTTTCAAAATGCTAATCAAAAACGTTTTATTATTAAAATG
ATTTAATTCGTTCCCCTTTGATCGTCAAATTCCGTGGGAAAGTTGCGTGTTTGTAGTGCG
AGAGTGTATAGATTCGCTCATATCACGTGCCGTTCAGCACTGAGTAACTAGTGACTAGAA
TTATTATTGGTTATGTAAAAATTATCGATTCCATTACGATCTGGAGTTATTTATAAATGG
AGGATCTGCTCTTGTCTTCCGTAGTGAGTTTGATACCACTTGATACAGATTTGAAGCAAA
TTCTTAAGACGGTATTTTTGGATCATCGCTTTTGTTAGCTATAATTAGCACTACCGAATG
TTTTCGAAAGGTTAAATGGTTTTGTGTAGGCAGTTAAAGCTAAAATAATTAAGTGTATTT
GGCGTTTTAGCAGATTACGTAACAATTAAATGGCAATTAAGAGTATATTAAAGTAATTAT
GTAGTATTCGTCAAATTTTAAACACGAAATGTGAACGATAAATCTTTCGTCTCATAATCT
CAAATAGCGTATCCGCATTTATTTTCGGCCTGGACAACAATTTTATTTCAACGTAGATTA
CCGCTCACAAAAACTGGTTTCCTGTCGACATCTGCCGAGTGCGTACACATTTCTAAAATT
TCATCCACTACAGTGCAGCTCGCGTTTGATGTTTGACAACCGGCCAGATGTTCCATCTTT
ACACTCGGATTTGAATAACCTCGAATATTCGTTTGTTCAAATAAAATAGGGATCCTTCTT
TATTCATGAAGCTCTTACCTGCATGATAATGCTCAAGGTTGGGTTGTGAAGCAGGTAGCA
AACCGGATTATAATTGATCCCGTCTCGATTTCTGGATATTTAGATTCTGCAATGTTTGCT
GAACGAGATCTAATTTCGCTCGGAGATTTAATAGCATCTTTTAGAATGACGTAAACGTTT
AAAATAATCATTATTACGTCAAGCTTATCTTTATTATGATTTTAATTATGCTAATATTCA
GGTCGTGGCAGTAAAGGATTTAATCATTACTTTTCCAACAGCTCCAGTGTTATTTATTTA
ACGTGATGCAAATTATAATGTTGAAATGTTGGTAAATAACCCTCAATTTTTGTGATGCCT
AATATTTTTATTGAAACGTAGTGCATGGCAGTTTATTTGGTGATTGGAATAATATTTATT
TTTTGTTATCGTTACATGTGGGTGTGAAGTTGTGAACCATAAAGCCAGTCGCTGATAACA
CATCACCCATTACGTTATCATTGGACATGGCACAACGCCCTACCCAGTTGCGATGTTAGA
ATATGTACATATCGCTTTGACCGCTATCGAGTCACTTTCAATATTGAGGACTTTCAGTAC
AATATCGCATTGTACCTAATATAGTTAAACGCAAAACAAACGTTTATGACGTGAATTGAC
TCGTACACGAGTAGCGTGACATGAGACAGTAGACTTGTTATAACAATGAATATTAATATA
GCTGAAGTAGGTACTTGCGATGGCGATGGCAAGGTGAAAGCTTTCTATCGTCCTATCACG
AAGATGCGAGTGTTTTCGCCGAGTAGTCGTTTAATTTTAGTTGTTGGTCGATGTATCGAG
TGCCGTCGGCTGGCACCTGTCTCATTCCTTTGTTTCGGCTTGCAAATGTCAGTGGAGGTC
ATCTAAATAAAGGCGTTGTATGTAGGCTTTGGTTTCGGCGTGCGATCGGTGTCTAGACGT
TGTGTTGCATCGTCCGATCGATTGCATGGACGAGCTTCAGACGGTCACCGACCCCGAGGA
GCATCGGTGACGTTACGCTCCGGTGATGCGCTCCTCAATAACCTTACTCACGTTATGGAT
CAATCTTTTGTAACTAAACCATTCACCTTGACGTCGCCGCATTGTCGGTGTTAATAACCT
GGACGACTTATTTTATTTCTTTACGAAGTAACATTTAAGTTGTTCGAACAGACAATCGAG
ACGAATTTTTAAAGTGAATATCCTCAATCGTTTAACAAAAAAAGGGACTGTTTCTTTCAA
TTTAGGAAATGCTCGAATACTTTTAAATTGCTAGTAAAAAAAATATGTAAAATGGAGCTA
TAGAAACTGAATGGGATGTTTTTGAACAAAAACATTTTACAAACATTACGTTTTGTTACA
AATGCACCAAAATATTCCCTTTTTTTGCGCAACATCTCTTTTGTTTCGCAGACAATGTTT
TTATTTGGGATGTACCAAGCAATTTTGTTGTAGTTGTCTTCGACTTTATTATTATTTACG
ATACCTTTGCCCTTGTTTGTAGAGAGTTCTACAGTTTTGTAAGATTGACATTGTTTCACT
TGAGGACTTTTAGAAAACTAGTGCATTAGGTCACAAGTAACAAGTTCATTGGTAAATAGA
GTAGGTCGTGAATAGAATGTGTACGTGGCGGATGCTCGGAGACGGTTTTTGCCAACAGGG
CGACCAAGGCGTTGCAGATGGCCCTGTACGTGTCGCCGGGGTTCTCTCGAGCGGCGGACG
CTCACCTGCGGCTGGCGCTCATGTTCAAGGCGCGCCGACACTGGACCGCAGCCGCCGCAC
ACTTCAGGAGGGCCCGCCTCGCTCCTCACCAAGATGCCACCTTCACCCGCCTTGAACTAA
GCTTCCACGCTGCTCATCTGCTCGAAGCAAGAGGTCTCAGAAAAGCCGCGAGGGACGCAT
ATGAACGACTCCTTGAAGAACCAAAACTTTCGTCCACGCTCAAAGCTGACGTATGCAGAC
AATTAGGTTGGTTGTACCACCGATGCATATCTCTGGGCGAGCCGGCGGCGAGGGCCCGCG
CCGCGATATGGTGCCTGCAGCGAGCCGTGGCGGCCGAGCCCGAGTCCGGAGCGGGACTCT
ACCTCTTGGGCCGGTGCTTCGCCGCTCAGGGCAAGGTGCACGACGCCTTCATAGCCTACA
GAAACTCCGTCGAGAAGTCTGAAGGAAACGCCGATACTTGGTGCTCGATCGGCGTGCTAT
ACCAGCAACAGAATCAGCCCATGGACGCGTTGCAAGCGTACATCTGCGCCGTACAACTGG
ACAAGGGTCACTCCGCGGCGTGGACCAACCTCGGCAGTCTGTACGAGAGTTGTCAGATGC
CGCGCGACGCCTTCGCCTGTTACACTAACGGCGGGAGCGCGGCCACCGCCAACAATGGCG
CCTTGAGACAGAGGCTCGCGTTTCTGAAGGCGCATTTGGCTCATGCACCTATGCCTTCTA
TTACTGGGAAACGTCGTCAGTTACCATCTATTGAAGAAGCTTGGAACCTGCCCATATCAG
CGGAGATGTCATCTCGCGCCCCTAAAGCCGCGCCGCCCCCCTACCCCGGCAAGCGGGACG
AGTTGTCGCAGCACCAGCTCCACACGCTGCACTACTTGCAGAAGAACTCGCACAACTTGA
CGCCGCAACAACAAGTACTTACGAGTCTTAGAATCACCCTTATATTTATTGAAAGAAAAG
TTTCTAGATTTTTTTTTAGAATCATCCTTTTTATACAAAATTACCTCAAATGGAATTTAA
TTAGAATCATATTCGCACTAATTTGTTCTTGCTGATGTACAAAGTCTCAAGGATAGATAG
TTGCTGTCTTTTAGAATCACCCTTATATTTACTGGTATAAAAATTGTTAGATTTTTTTTA
TAATCACCTTTTTTGATAGTTTTTTCTATTTA
(10112 bp)

- SilkBase 1999-2023 -