SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_TrvaFAMAMG_TR23468c4_g1_i2
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
putative_zinc_finger_CCCH-type_containing_10_[Operophtera_brumata]
Ontology
GO:0005515 F protein binding
GO:0044822 F RNA binding
GO:0046872 F metal ion binding
Transcript
Level
FPKM:6.99 TPM:6.84
ORF EntryO_TrvaFAMAMG27944_complete:A_TrvaFAMAMG_TR23468c4_g1_i2
Sequence
(Nucleotide)
AAAAAAACATTACACAACTTCAATCGCTTTCGCTGTCGCATCTGTACTTTCTGATCTGTG
CAGTAAACTCGGGTAACCTAGTAGCTTGGCGACTGACACGACGCGTCGCGCGCGATTAGT
TGCCAATGCGTTAGTAACTGGTTAGTGACTAGTAGCGTCGTGTGCGAAGCTGTATGACAA
TGTATGGGCGGTGACGCTAGAGAAACTCGTTAGTAATTTGAGTTTGTAATTAGTCACTTT
TGAGTAGCTCCGTGTGCGGAGGGCCTAACAATTATTTGTTGTAATTTTGTACAAAATGAA
CACCACCCCTGTATAACGACTTCCCAAATCAATGAAGCAACAACAAAAATACTAGAAATT
CGATAAATTGTAATAAATACGTTTCATACCAATGTAATGAATAAAAATGTATTAAAGATT
ACAAAATAAATGCAATGTATAAAAAATGTTCACTATCATTTAAATACGGAACATTAAAGA
AAAAATGATATCAGTGCTACTTATGTTAAAATTTATAAACTTCCAAATGACTTAATATTT
AGTTACAAAAGTTTCTGATGTTTTAATTCGTTTACTGAAAAGGTTCGTTTAACATCAATA
TAAAAATATTATTATTTGAGACATTAATAGAATATTAAGAATTTTTCTAGGCTATCGCTT
ATACAAGGTGGATGTCTGATAATTTTTTTGTGAACTCTCTTTGGAAAACTCAAATTTAAG
TGGAATAAATATTTTTAGGTATTTGGTACAATCAATTATTGTGCAATATGTTTGTTTCAT
CTTTTACATTTAACCCTGTATTAAATGCCAGCAAAAGAATATTTGCAGTACAGAATATCT
TGAAATTTCGTTTTATTACATATGTATTTTCAAATTTCAATTCTTCGAACGAACTTCAGT
TTATAATAGTATTTAAAAAACTATTTTAAATAACATATTCAATTTAATATAATTCAAAAT
GATTGTTGGTACACAGTACACACCCCTCGATTACACGGTTATCTCGGTTAGTTTTGAAAT
AATTTGAAAGTATAGATTTATTTTATATTGTACTAGTTGAAGTTATGACTCCGTATAATA
TATTACATAGAGTATTTACGTTGTTAGCAATACAAACTTTTTATGGATATTGGATACTTT
TATATACCAACGGATTTTGAAAAAAACCATGGTAACGCACATTTGTATAAACAGAGTCAG
CAAGTCGAGATCTCAATCTAGTGACGTCACAGCTTTCATCATTTTAATTAACTATTCAAA
CACACACAATTAAAATGAATGTATGGATCAAATAATAAATAAACTATTGAACAAAATGTT
ATAGGAATTAAGTCTAATTATCTATTAGACACAAAAAATATTGTGTGTTCCTTCTTTCCG
TAAAAAAATTTTTTTGGTACTTTTGGATTTGTTTTTTAATTTTGTATAAAAAGTGTCATC
GACATTGTATGTCTTGTCTTACAATATACTTAGAAAAACGAGCTAAATCTAGCAATATTC
GCGGAATTTTAAACTAGAGAAATTATTGTCAAAGTCAGTGGTTCTCAAATGAAGCTGCGA
TAGCTAGTTGACGAGATTCATTTAATCATATTTCTAGACTATACTAGGTATTAAGTGTAC
CAGATCACGTGATCGTCAACCAACTACTAACTTCGCTCCATTTGAGAACCTCTGACTGAA
GCAACATTGTTGCATAGCACAACCTGTATGCATTATGATATAATGTTTGTATTAACTTAA
TACATAACTGATAAAGACCAGCTCAGACAATAATATTTACAAAAGAGAATATTATAATAA
AAATATATTCATCTTATAAACATTTTATAATGTTTGTTTTACAATAAAATAGTAGGAAAC
CTACCTACATGATGTTTTTGTGCAATAAATAAATAAAAAAAAATTGCGGAGCCTGCTGGT
CAATGTCGCGTGTTGTAGAATGTTGTCTTAAAGCGCGCGCACAATAAGATGAGCCGGGCC
GCAGTACATAACACGTCTGGATCCGCTTTAGTACATTTTGTACAAAACGACATACTTGAA
CGGGGCGCCATCTGACGGATTTCCTTTGCAAAAAGAAAAGAGCAACAGCACGCGTTGTGC
CCCGGCCTCCGGCAAATTGTAGTAATATTAATAAATTCATGATATAATCTAATCGTTTAA
TCTGTAGGGGTCGTCAGGCGAGCGACCGGACTCGGCGCGCTCGGCCGCCATCACATCTCT
CATAACTTGCGCAGCGCTACTCCCATAACTCTTCTTACTGTCGGGCAGGCTAGAGTCACA
ATGTTCAGTCACAGCATCAATAAGTAGAATGAGTACTTCATTCAATTTACTGTTTTTCTT
TGTGATTTGTCCCACACGCATGTCCAAATCCTCTGTGTCTTCGATCATCTTTTTCACTTT
GTTTTTATTGTGCTGCAATCTGAGTTCGTTGACGTCACAATTCCTACATTTCTTAGGTCC
GGTGGTATCGCCGTAATCCACGTCCTCCTCCGCCGGTGCTGGCTCTTGTACTGGTTCTTC
CATTTCCGTCCACTGTCGTTTGTTGGGCGAGGCGGCGGGCGCGTATACGTCGTGCATCAT
GTCGACGTTAGCAGGCGGCGGTGGTGGGGGCGCGCTCCCGTATACGCCGCTCATACCGCC
CACGCTGCCCATACCACTCACGTTGCCCATACCGCTAACGCTGCCCATACTACCAACGTT
GCCCATATTGCCCATACCGCTCATACCGCCCATTGGATGAGGATATCCCGGAACGGCCTC
GGGATAATGTGCCGACATATCGACTGTGGACGGATCTTCCATTCCTGTCCATTGAGTGGC
GTATGGATTTTGCATCATATTTTGCTGATTTAAATACATCGGCGTTGTATTATGTGAGTA
TGTAGTGCCTGTGTACTGCGCTGACATCTCGGACGGTTGCTCTGGAAAATAGTCAACATG
AGTTTCCATCCCTTGCCACTGTCTGGTAGGAGAGATCATGCCTGTGTATGGATTCTGCAT
CATATTCACATTCGTTGGTACCGTGTAGTTTTGAATTGGATTCATGCTCATGGGATATTG
CTGAGTGGGGTAACGTGCTTGTTCTGGTGCTGCTTCTGGCTCTTTGGCTGGTTCAGGCTG
AATAGGAACTTTCTTAATATGACTAAGAGCGTGCGGAGGTATGTGTCCAGTTCTGAAGAA
ATGTTCTTTCTCGGGTAAACTGGCGTGGACATATTTACAATCTGGTCGTTTACAAATATT
ATTCTCAAAATCTATACAAAACTTGTATACTCCTTTGAGTTGTGAAATAATAATTTTATG
AGCGTATATACACATCGCACCACGGTTGCATGTATTCCTAACAAAATTACGGCACATAGT
TTCTTCCGGCTTGTCGGGTTCGTCTGGTTTTGCTGCCAATTTCTCTATCTCCGAAGGATC
TGTTTTGATCTTGAGAAGCAATGCAGTGGTGTCGATATAGTCGTCATTAACGACTTCTTT
TTTGAAATTCGCCAGGAGCGGTTCCGGAGGCGGTAGCGGTGGTTGATTGGGAAGCGGTGG
ATTAATTTCCCCCGGATTATCATTTTTATTTTTTTTGTCTCTATTTGAAGGATCATACTG
TGAGGAGTAGCTCGTCTCCCCGAGCTTGTCTTTCAAGTACTTTTTCATATGTCTGAAGTT
CGGCGATGGCCGAAAATTAATTGAATCTTCATCCCCTGTACTCTGTAGGTTGAAGTTACC
TGAGTCTGAGCTTTGCATTTATTTAAATTAACCAAAAGATCACTAGGACATTCATCTAAT
AAATGATGAAAAACAATACATTTAGTACTTCTTCCATGCCCAAGCCAAAAAAATACTAGG
ATTGATATAGTTCCATAGAATTATTACAGCACATGTATGTATAGTTCTTGATACAGCATT
ACATCCCAGGCTCATTGCATATCATTTGAGATTTGATAATATTCATAGCTGAGTCTCTTA
TTTCTTTACAATCACTTCATCAATCACTTTACCACAGTTTAAACCACAGGTTTAGAAAAA
TATGAATAGCACTATTTAAAAAAATCCACGCCAAATAG
(4058 bp)

- SilkBase 1999-2023 -