SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_TrvaFAMAMG_TR23460c3_g2_i4
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_RNA-directed_DNA_polymerase_from_mobile_element_jockey-like_isoform_X1_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0003964 F RNA-directed DNA polymerase activity
GO:0006278 P RNA-dependent DNA biosynthetic process
GO:0008152 P metabolic process
GO:0016740 F transferase activity
GO:0016779 F nucleotidyltransferase activity
Transcript
Level
FPKM:4.09 TPM:4.01
ORF EntryO_TrvaFAMAMG27862_complete:A_TrvaFAMAMG_TR23460c3_g2_i4
Sequence
(Nucleotide)
TATTCACGGCTGATATAGGCATGAGATTCGGACTGGATAAGTGTAAGACCTTAGACATAA
CAGCAGGACATCGAAGCAGAGCGACAGGGCAGGGACACGTACTACTAACAGGTGAGGAAT
TTGAACAATTAGGTACAAATGACAGTTACAAATATTTAGGAATTAATGAATCAGGTAAAA
TAGAACACAATATAGTTAGGGATCAGATTAGTAAGGAATATTTTAAACGTATTAAAAAAC
TACTCAACACACATCTTAACTCTAGAAATATCATTAAGGGTATAAACACATTTGCAGTAC
CAGTACTACTATACTCATTTGGTATAATAAATTACAAACCATTTACCATTTATTTCATAA
AACAAAACACTTAGCCTACTACAATAATTTGTTTTAACAATAAACAAGAATAAGGGTATA
TAAAGATTACAATATTGGTATGGCTAGTTGTATAGATAGGGTAGTGCGACATGGAACAAA
AGTATAAAACTGAGCTGTTCACGTCGGCTTCGTTTGTGATAGTTGTACATAGTTGCCGTG
ATGCGGTCACAAAATTAAGCATGTAGTGCCTTATTAAATCTTATAACTAAGTGCTGAGAG
ATTGTTATCCTAATGGCTATATAAGAAAGTGCATGCATGATAAATGTGTGTGTGTATATG
TGTGTGTGCGTGTGTGTGTTTGTGTGAGTGTTAGTGTGTGTGAGCGTTTGTATGAGTGTG
TCTGTATGTGGGTGTGTGCGAGTGTGTATGTTTGAATATGTGTGTACCTGCTTGTACGAT
AAATGATTAATTCGAAATTCCTTGCATTATCATGGTAATAATAATTTTTCTGTATCATTG
TATGAAAAACCGAAAATCCAATCCTTTACAATTCTTTTACATTTCTGTTTATTTATGTTA
TTTATTTTCAATATGTGGTGAGCTTTGTTGTATAGGAGAGGGCCCAGATAACACATGTAT
CTATGACTGAATTTAGTATTGAATGAGTGTATAGTGGCTGGTCGCTCGATGCGTTTCTTA
GCTATAGTAGTAGATATAGGTGTGTTGACATGCTGGGTGATAATTGCCTGCACAATAAAT
AGTTGCCGAACTGTTAGTACCTCACAATCTTTATATAGTTGCTGCGATGAGAATAGTCTA
GGTTTAAAATATGCTACTTTTAAAAGTGCTCTTTGAGCCCTTTCTAATGGTAATAAACTA
GTTTTAGGTACTCCACCCCAGGTTGTTATACAGTATGTTATTATTGATTCTCCAAGAGTT
TTATAGATCATTTTGATAATGGACTTGTTTGCTATTTTTCTTAATATTTTCATAACATAA
ATCAGTTTACGTATTCTGTTTGTTAATACATTAATATGCGCTTTAAAATTTAGTTGAGAA
TCAATTATAACTCCTAAGTATTTAGTTTCTTGTGTTTTGATTAGGCTTATGCAAGTGCAT
GTTGCTACTGGATTGTTTACCTGCGTGCAGTCGTATGAGTGCGCGACCAATTTAAATATT
TTGTTTTCATGTTGACGCGTATTACGGATATTAAATGTCATATATTTAGTTTTTTTTGTG
TTCAGTGAGAGTAGATTTTGATTTAACCATTGTGTTACTATATTGAGGCTATTTTGCGCA
TCCCGATATACTTCGGCCCAAGTTTTACCAGTTATCAGTATAGTTGTATCATCTGCATAT
GAGAGAAGCGAGGCGTTCGGAAGATTTAGTCTGCAAAGGTCATTTATATAGATTAGAAAT
AGTGTCGCGCTTAAACTACTGCCTTGCGGTATACCACATGTAACAGGTAATTCAGAGCTA
GTATAATTGTCTAACTTAACACATTGTACCCTGTCATTTAAGTAACTATTGAATAATTTT
AACTGAGTACCCCGAATACCTAAAGCTTCCATCTTTTTTAATAGCAGAGGTATTGAAACC
GTGTCAAATGCTTTTTGTAAGTCTAGATATATAGCTAAACATTTTTTTCTTCTATCTAAA
CTTCGTGCTATAGTGTTTGTAAAATGTTGTATAATCTGATCAGTTGATCGATTCGGACGA
AAACCATATTGGTTGTTTGAAAGCAAGTTTTTATTTTCTATGTATCTTGAAAGTTGTGAG
TTAATGATTTTTTCCAATAATTTTGTAAATACTGTTAGGATGGAAATGGGTCTATAGTTA
TTCACTAGTTTACTATCTCCGTCTTTATAAATGGGGTATATGAGTGCTTTTTTAAAGCAT
GATGGATATATTCCTTTTTCAATAACCTGATTGTAAATGTGTGTTAGGTAAGGAGCTAGT
TGAAATTTGATTTTTTTTATAATTTTGCATGTGATACCGTCCCATCCACCCGCGCAATCA
TCCTTTAGATTTGTTATGTGGCTCAGTACTTCGGATTCTGTCGTTTTTAGTAGAACAAAA
GATTGGTGGTTAGAGGCAGTATAAGGTAAAAACTTATGCTGTGGCTTTTTTAATTGCTGA
CGAATGTTGTTTGTAATATGCGTTCCTACACTCGAAAAATATTCATTAATTTTGTTAACA
TCGTGTTGTGGGTTATTATGTGATTGGATAAGGTCATTGGCTGATTTTTTACTTACATTG
AAATTTGCAATTTCTTTAGTAGACTTCCATAGTTGTTTATTGTTTGATGTCGCTTTAATC
AATTGATTTTGATCATATTTTCTTTTTATGCTTTTTAATAAATTGTTACAGAAATTTTTA
TATCTTTTAAAAGTAATTTTCAATGTGTCATTATTTGGTGACTTTTTTAATTTTTTATAC
ATGTTATCTCTGTTTCGGATGCACCTAAGGAGACCATGTGTCATCCACGGTTTTAATAAT
TTACGTTTGTGGGATATTTTTTTTGTTTGTGTGTTTTTTGTTATTACATCAGACAACAGT
GATACTAGAGTGTTTGCTTGTATGTTGATGTTGTCACTGTTAAATATTTGTGAAAAATTC
AGTTGCATGACGTCATTTTCTAATTGTTTAAAGTTTATAATTTTATGTGTGTTGTTTTTT
GTTCTCTTAAGGGGTTTATAAATAGCTAACAGTGTAGTATAGTGGTCAGTTATTGTTGAC
TGTATAATTAGTGTTTTCGCTGTATATGTCGACTTCATGAAAAAATGGTCAAGACAGGTG
TGCGTGTGCGTTGATTGCGTGTGAGTTGGGAGAAGTCCATGATATGCGAGTAAGTTGAGA
TATTGTTGTGAATGAGGATCAGTGTTGTTATTAGATATGTCAATGTTTATATCTCCAGTT
AAGATTATATTGGGAGTTGATGTATGTTGTGATAAAGTTCTGTCTAAGAAGTTAAAAAAA
TTGTCTGGATTTTTTATAGCATTGGGGCGATATATTGCAAGTATAACTGAGTCTATTCCA
ATTTTTATCATGATGCAACTGCAATCACCTCCTGAAAGTTGCGTAGCAGAGCTACAGTGA
ATGTCGTCCCTTAAATATATCACCACGCCATCATTTTGATTATATGGGTCCCTAGAAGAG
ATGTGAGAGAAACCATTTAAATTTGGAACATTCGGATTGCTTAAAATCCAACATTCCGTA
AGAACTATTATGTCAAAGTCGATTTTTATTTCAGCGAGTAAGATATTAAATTCAGTGAAA
TTCGCTCCTATACTTCTTATATTTTGTGAGATTATAGTCAATGATTGATTATGTTTTTTT
ATTATTTTATTACACTCATTAACGTTGCATATGAATGTTTTTGAAATTGACGAATTGTCA
ATTTCTTCTGAAATTTCAAATGACATCTAATAATTATTTTAATTTAATTGATTTAA
(3776 bp)

- SilkBase 1999-2023 -