SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR2339c1_g1_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		putative_growth_hormone_regulated_TBC_protein_1_[Danaus_plexippus]
Ontology
GO:0005096 F GTPase activator activity
GO:0005622 C intracellular anatomical structure
GO:0006886 P intracellular protein transport
GO:0012505 C endomembrane system
GO:0017137 F small GTPase binding
GO:0031338 P regulation of vesicle fusion
GO:0090630 P activation of GTPase activity
Transcript
Level		FPKM:5.36 TPM:5.25
ORF EntryO_TrvaFAMAMG1588_complete:A_TrvaFAMAMG_TR2339c1_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
CTCTCAATGCAAATCCGTCATGTGGATGTGGGGCAGTTCGGGGCCCAACATAGTGCATTT
CGGGGCGTAAACTAAATTAAATTCGTAATAGTAGTATTGATTATTATGTTGTATTAATAA
AAGTTCAAAAAGTGCAGTTTCAGAATGGCACAGTCAACATTCAGCGCCGTAGACGAATAC
GGCTTTGAGCGGCACGACGACTTTGACTACGATAGTTATGAAGACTTTATGTCAAATTAT
TTGAAAGTTCTCGCTACTCGTGCTCAAAAATGGGCCAGTCTTCTGGGCGAAGGAAAGTCG
GTCAAACGGACCAACACCGTCAAACGATACGTGCGCAAAGGAATACCCAGTGAACATCGT
CCTTCGGTATGGATGGCCATTTCTGAAGCTGAAAAAAATGAAAGAACAATATCCTGATTT
GTACCAAAAAATACTGGACAGTCCATTTGAGAAGGAACTTGTTGATTTGGTCAAAACGGA
CTTACCAAGGACATTTCCGGATAACATATACTTCACAAAGGAGGCCAACCATCAAACTCA
CTTGTTCAACATACTTATTGCCTATGCACACAACAACAGAGCCGTTGGGTATTGTCAGGG
CCTCAACTACATTGCCGGCCTCTTACTGCTCGCAACAAAAAGTGAAGAAACATCATTCTG
GCTACTGAAAGTGTTAGTAGAAAAGATTCTACCGGATTACTACACTAAAACGATGGATGG
TCTCATTGTGGACATTGAAGTGCTCTCGGAATTAGTCAAAGCCAAAGTACCGGATGTACA
TCAACATGTCATCAATCTAGGGCTACCGTGGGCTGTTATAACAACAAAATGGTTTGTCTG
TCTGTTTGCTGAAGTTCTACCCATCGAAACAGTTTTACGAATTTGGGACTGTCTTTTCTA
CGAAGGCTCAAAAATTCTGTTTAGAGTTTGCCTGACCCTTATCAAGGCTAATAAAGCCGC
AATCATGGAATGCAATGATTTTACGACATTGGCAGAATGCTTCAAAGCTATCGTCAAAAA
TGCGAGTGCATTGCACTGCCATGAGTTTATGCAGTCAATATTCAAAGTGCCCGGTACATT
ATCTAACGCGACTATAATTAAATTACGTGCACGCTTCGCTAAACAACGCCGCGAACAACA
ACAGAAGGAGCCTCCTCGATGAACGTACAACAGCATAATGGGAAATGATGATCTCATAGA
ATTATATACCAAATTCAAATAATTTTACCTAATATTTTGAATAAAAAAACTCTATATCTT
GTTCCTTGACTAGCTGATCTATCCATGAAATTTATACATGACAAATTATGATATCCTTTC
CTATGTGCAAGCTATAATTATAATTACTTTGTATCACAATCAAGTTTTAAATATTAATAT
ATGTTTAACGACACAACTTGGCAATAGTAGATGCGCAGAACCCATTTTTGAGTCTGTGAA
GTTCTCACTTGACAGTTCGTTGCAGCCTCGTGATTGGTTGCTCAATAAACCCTTGCTTCT
CTCTATTTCAAAAGTGTACAAACCGCCAAAATTTTAGATCCTTACTTTGAATATTAATAT
ACCTAAACAATTTCACATGATCCAGTTCTCTTAAATGTTTATTTTATACTATTGTGGGTC
CATTCATTCAGATGTGACTAGTCCTAGCCGCTTTATTTATATTAATTCAATCATGATATC
AATATCAGTCACACATGACATGTGAAGCTTATGATTATCAATGTGGTGTATTTGTTGTTT
AAGTTAGTTGTAAGTTGCAATCTTTATTTTGCATATCATTAAAGTATTTTTTAATATTGT
TATTATTTATTTGTTAAATTGTACAAAAAACAATTGTACCTGTATTGGTTTTCAAATGTT
GTACATTATTTACGTTAAAATGGGTAATAATGAAACATACAAAAGGAAAAATTGTTATGT
TACAATGATAATTTTAAATGGTGCATTGTGTTGCATTTAAGAAATACTTTTTATAAACTA
CATATTATTACTAAATACTTATATTATTATTATTTAGTACATAATGTGCATGAGACATTT
TTTTGTGCGTGTTTTGCGAAATATCACAAAGTGATAACATTAGTTGTTTTACAGTTAAGT
AAAAACCGAAATAAACTTTGAGACAAAAAACTTGAGAGGTGTCAAGGGACACCCAAATGG
AACAAAATTCTTAATCCTTCGTAAATACAACAGCGTATTATAACACGCAGGGCTTGCTAC
ACACATACGTTCTGATATTATGATATCAAACATATGTATAATATCGTTAAAGAAGATCTT
AAACTTTTGAAACAGAAAACGTGCGCACGCCGCATAGCCTACATGGCTCTTCAGTAGATA
CTATATCAGAAAGTGTCGTTACCACTTTTCGTAAGATTTTTTTGTCGTGTAGCCCCCTTT
GGCCTTTCGTAACGCGCGTTGATTTAAGGAACTTCGTTCCAATAAAATATATTTTATGCA
TGACAATAAATTTCGCATATCTCTCAATTTGAACAAATATTATGAAGAATATTATGAATA
TTCTTTAAATGGAGCAGCATACCTTACTGCAGTAACATGAATCATGACTTAAATTCAATT
AAGGTAAATTGTCTTAGTTTGTAATTTAGTAGTTTTATGAAGCATGATGTCATCAGAGCA
GCTGAGATGACTCGGCTACTGTGGAATCGGGCTAAAATTTAATTTTAAATTGCTCAATGT
ATATTTGCTTGAATTTATTTATAAGCTATTGCTGTTAGTCATTTCTAGAAATGTACAAAT
TGTACAATTTTTCAAATTTAACATCTTTTTAAATATTAAAATGTAATTTGTGAATTTTTT
AGCATCTAGTTATTGTCAAAATATTAAATACTTAATATTTAGCGTTCTCTTGATATTTTT
GTATTAATATTTTTTTTACTTGTCTGTGTGTAAATGTACTGTGATTGATGGTTTAGTGTG
CAGGTTGCTTGTTAAAAGTATTGCCATAATAAATGTCTAGATTTTTGATTGAATAGACTA
TTGAGATGTTGAAAAAAAAAAAAA
(3024 bp)

- SilkBase 1999-2023 -