SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_TrvaFAMAMG_TR23036c0_g1_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_protein_sprint_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0005085 F guanyl-nucleotide exchange factor activity
GO:0005096 F GTPase activator activity
GO:0005938 C cell cortex
GO:0006897 P endocytosis
GO:0007165 P signal transduction
GO:0007275 P multicellular organism development
GO:0007298 P border follicle cell migration
GO:0017016 F small GTPase binding
GO:0017112 F guanyl-nucleotide exchange factor activity
GO:0019901 F protein kinase binding
GO:0030139 C endocytic vesicle
GO:0030971 F receptor tyrosine kinase binding
GO:0032483 P regulation of Rab protein signal transduction
GO:0043547 P positive regulation of GTPase activity
GO:0048675 P axon extension
Transcript
Level
FPKM:3.55 TPM:3.48
ORF EntryO_TrvaFAMAMG26347_complete:A_TrvaFAMAMG_TR23036c0_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGGTTGGTAAAAACTCGTTTACTTTTCCACAAATG
ACTGAAAATGTTATCGAACACAATATACGTGTTACATAACTATAGTTAATATAGGTAATG
CAATAAATACATAATGGTGAGCTTGCACCTGCTTGTACAGATTTCATGACGACATTTATT
CATTTGATATTTTATTATTATATCATTTCATTAGTTAACGCCTGCGCTGAGAATATTTTT
GTGTTATTAAATGAAAAACTTTAAAACTTCCTCAGTTATGAATTTAAGTTTCATTCAATC
TAAATGTAGAGATATTATTTTTTTTACATTAAGTTAAATATATGGGTTGAACAAACACGT
TCAACAGATACATTATTTACCCAAAGAACGGAATTTCAGGCTTGTAGGACAACAAAATAT
GTAAGGCAAATATTTGCTTTAAGACATCATTTTAAAATTGTAAGAAAAATGTCATGAAAT
CTGTACATTATAATATTATTGAGTAAATTAAAGCGTATTTTAAAATGTATTTTAATTAAC
GCTTTGTGATATTTAAAGACTTCTAACTAGTGACGTAGTTTTAAAATAATTGATGAAAAA
CTTAGTAATTATTTTCCTTTTTATAATATTTTCCTCATTTTTTATACTTCGATAATATAA
ACGTAACAGGTACATAATAAACTTATGGTAAAATGGATTTGTACCTTATTCATAGTATAC
ACTTAAAAAATATACAAAATTTTATTTGATTTATTATTCTCAAGCCAACTACGCCACAAT
GTACGTACATTTTTAATAATTTTCGCTCTAATTTACTCAAAAAAATTTAGCGTTAAATAC
CTTAAGATTACATTAAATAAATTATAATATTGAGAAACGATCCTACGAATATACAAAATC
AATAAAACATTCTTAAATTAGTACTAATACAAATTACATCACAGTTCATAAAAAAGTTAG
TAAAAGTTAAATTTACAGATACATACTTCAAAAGTAAAATATAAAATAATTTACAAGAAC
TAGAAATTGAAAAACTTAAACTTAAATAATATAATCGTTTTGGTGAGTTTGTTCAGTGTT
ATAAAACAAATTTAGGAACATATCCTCGCGAGTAAGCGACTACCTTTTCAAGGAAGCCGA
AATCGTGTGTAATTAAAACAAATAAAATAAGAATGGTTAGTATTATATTCATTCACAAGA
ATCGGGAAATCACACTTCATACAAATGTACAAAACTGGGCGATTCACCCTAAATACTCAG
TCAGGTTACATATAAAAAATCCACTAATTATTCCAAGATTTTTACATATACTACTTGACA
CATTGTACTGATTCACGCAAGTTAATTACTCATCTAGAAGTATATATAAAAGTCTATTTA
TTGAGTAAAAAAGCTACAATAAAAGTTAATATTTTGAATAGCATAGCTTAAGAATACTGC
TTATGTAAGTTACATGAGAGTAAGCATTAAAAAAGTTGCGTCTAGCTTATAGCAATTACT
ATAAAAGATATCACTTTGAATGACAAAAATATAGTTCAAACTTTAGTACTAGTCAGAACA
TAGTTTCATTTAGTAAAAATCAGAATATTATACGATTGTCATTCTGGCAGTGAAATACGT
TTGGCGTGATAGGAAATGGCATGACGCTCGTATATGGTATCACTGCACACACCATAACAT
CTCATAGCTTGTATGAGTTACATAATGCTCTGAATTTGTAATTTTTACACTGTCGTAATC
AATATTTTTCTATTCAGTTCTGTGGTATTTGTAATGACGTATAATGATAGTAAATAGATG
TAAATCAAAGTATTTTCGTAGTTTATCGTTATAGCAATTCAATTATTTGCACTAAAACCA
ATGAGTGATAGAATGACAGAATTATTCACTTCGGTTTACTTATTAGGGCGTGAAATTCAC
TGCCTCTGTAGAAATAACATGGAATATTTAAGCCAATATCAATAATATTGTAGCTCACAA
AACGCTCACACGATAAAACATAAATTCCAAAGATAAGTTAATTTATTTGAACTTCAAATA
TTTTACAAATGGTAATGACTATGGATAAGACATCAGTGCTTGTTGGGGCCAAGCGATTTT
CGCATCTATCCTTCTGTACGCAAGGGTGAAATTCTGTCCGGTTTTTTCTGACATCACTTC
TTGTGGGCAATCGTTCTCGTTCAACATTGTTTCATGTCCATCATGTAAAGCAAAGAGCGC
GTAGTCCTGCGGGTTAGTAATGGCGGCGGCGTGCGCGAGCGCTCGGCACAGATCCCTGGC
GCGCGCACCGGGCCGGCACGGAACCGGCACTCGTCTGATGGAGCCGCGACATTCGTCTGG
TAACACTACGCGGACCACTGCCACTGGACACTGGTCCCGGTTGTTGTCTATTGAGCCTCT
TCGCCACGGAGCAGTACTGTCCTGTCCAGTTTCAGGAGCTAATCTCTTAAGTACAGCCAC
AGCTGAGAACAGAGCAGTGAGATAATATCCTCCTTCGCCGGCCAACAGTGCAGGTGGAAG
CAACCCGGCCATTAGTTCAGCTTCCAGTTCGGCGCAGACTAGTCTACTGCGAGCTACTGT
CCACGCCAGTACTGGAAGCAAGTCGTCCGCTCCGAGACTGCGTTCACCGCGAATCGCGTT
GAACATAACGGATATAGCTGCTAGTAGATTCTCAAGTTTATCAAGTGGCGAGTCAGCTTC
TTGCATTTTGAGGAAATGCTTTGAGATCACAGCTAACACAGCCGCTGATGGAACTTTTGT
TGATTCCTTAATCCCTAGTTGTAGCGGTGTTGCATGCTGTGCGCGTTCAATGGCAGCGTG
CAGTCTCCTTACGTCGGGCGCGTGCCACGCCGCTAGGAGCGAGTAGAGACGCGCTCGAAG
AGGCCTTACTACTAGACGGTGCATCACTGCTTCCAATATAGCGTCCAGGTTCAAGAATTC
AGTCGGTTTTAGCTTCAGTCTTTCTTTTTCAACTTCCTTCTCAAATTCCCTTTCGCCGTG
TTTGACTAAGTAATTCTTCATTCCAGACATGAACTGTCTTATATTTCTCATCATCACCTG
CGGACAAGTTTCCTTCGAGTCCAAAGTGCAGGATATGAAGTTATCGATGTTCTGCGCGAA
TGTCGTGCTCTTGTCTTGTGCGAGGTGTAGTGCGTATGCTCGTAATGCCGCTCCTGCTCC
GCGTGTTGTACGACCACCTCGGAGAGCTCGAACACGACCAGCTGCCAGTAATGGATCTAG
ACGATCTCTAAAACTTTTAGTTCTCAGCGACATGGCGTTCCCTCTTCTTGGTACAGGCGA
TTCCCACTCCAATGGTTCCTCCGTATCGTATGGTTGTTGAACGTTAGAAGGTGGTATTAA
ACCATCCCACTGTGAACTGTCCCAGGGCTCAGAGAATACTGTCCCGTCATCACTTGCCTG
TTCTGATAAAGGCCTCAGGTCATGCACATTGTCGTAGCAAGAAGCGCGCGGTGGTGACTT
CACTTCTTCGGGTAATGCTGCTGGTTGGGAATTCAGTCTTAAATCTGGTAACCTCTGTGC
TACAACTTGGTGAACGGTTAAGTTTTGTGATTCGTCGTCAACTCCACTCAACCTGCATTC
CTGTTCGGCCAATGAAGGAAATGTTCCATTTTCACTGTTACCACTTTCATCATGTTTATC
TGAGGGCTTGGTGTTAACTCGCGGAGGCTGCACTGGCTTCACCTTCGGCTTGCTACGGAT
TGATACGAGGTTGTCCACTGATGATGATGTGTTGGGTGATGATGGAGACAATTCCTCTAT
GCTATGCATATCTCGTAGTGGGTAATAAGGATGATTCTGATTCGGCGGCTCCGAGTAACG
TTGCGAAAGATTCAAACCAACTCTGATCAATTTCCGACGCTGTACTGGTGGTAACAAGGC
AGCCTCTTTTAAAGCATCAACAGGATCAGCGTAATATGGACTACCAGTGTTGTCTTTATC
TGAGTCATCAAATGTTTGTTGTTTAACGTCATCCTCTAGTTTCACAGTCTCCATACTTTC
TGTGTTATGATTTTCTCGACTCTTGAGCACGGCTTCCATTTCTTCAGTAAACTTTTTGTT
CATATTTAATGGAATATTTAGCTTATCTGGTCTTTTAGGTATAATCTCTCCTTTACTGTT
GGTAGTCGCAATGATCTCATTGGAGCCTTTGAAACTTTTCTTAAGAGATCCATCAGATAG
CGTTTTCTTTTCCGATAGATTATCGTCTGAATTAATTATATGCACATTTTCTTTTTCTAG
GATTGATTGAGTACTTTTAGCAGCGTTTAATTTAGGTAGTGTATCAGGTAATAAATCAGG
TCGCTTGCTCTTCATTATACCATTGTTCATATTGTTTTCAATGTCGAGTTTTTGTGGTTT
AAAAGTAGAACAATTGTTACTTTCCGGTCCCCAAATGTCTTCGTAATCAGACACTTTATC
CATTAGTGAACTTCTGTAATATATTCCTGGAGATTCAAGGATGTCTGATTCCTGGTAGTG
TTTGGATTCTTTTCGTAGGGAGTGTTTACTCCTCCTTGATCTGCCTGATGGTGTTGTACT
TGTTGTGTTCGTTGTTGGGGACAAAAGTTTATCTCTTTCTTTTCCTATTATAGGGGATGT
TATAGATTGATTTGATTCTGGTGACAAAACATTTTTCGTAGATATAGGTGAGCTCCTTGA
CACAGGAGAAAAAAGTTCGCTTTTATTCTGACTAACGGGAGAAAAGACACTGCTTTTTGA
AGATATAGTATCATTGGAAAGCGGAGAATTTATTTGGCTAGTCGGAGAAAATATTCCGCT
CGTAACGGAATTTGTTCCATTTGGAGAAACAAGTTGGTTAGGAGCAAAACTATTGTTCGA
TGTCGTTAGACTGTTTACAACAGGGTCAACAAATTCTGAGGTATTCAGTTGGGATTGTGG
TTCCGATAGTGATCCAGTTTCTGCGTTTTGTTCAGCTTGCCTTTTGAAGCTTCCTTGTGA
ACTAGTAGTTATACTGACGCATTCTCCTTCAGGTGACATACGATGCATCATATTCTGACT
AGCTCCATTACATTCAGCAACATATTTTGCGTCTTCTACTACAGTGAATCCATTATGGAA
GTTATTGCGATTGTTAACCATATTAGATGCAAGCGTTAGTTGCAGTTTCTCATTTTGTAT
GCTTTCATTGACTGGGTTATGTGTATTGTTAACGCTAAATGTGACTGTTGTTGTGACTGT
TATATTTCCATTCTGTGATACTTTATTAATGGGACTAAATGTTGATGTTTCGGATTTGGG
AGATATAGACGTCTTTGCTAAAGGAGGTTTAGCCCAACGTGGAGGAGGAGGTGGGGGAGT
AGTTTTAATATTAATGATCTGAGTAGGTGAAGTTCGTGTGTTTGTGGTGGGAAATGAATG
AGGCTGTGTTATATGAGCTGTACTCGAGATTAGGTTTAAAGTATTTGGTGGGGTGGGTCT
CGGAGCTCTCACAAATGCACTGGTTGGTTTGGCGGGTGGTGAAGGCGCGACGCGTCCTTT
GAAAGTACTTAAATTTTGGTTTTGACTCGGTGGGGAACCAGATGTGTCTATTGGAGACAT
TTTTAAAACTACATTTTGTTCTTTATCGGGACTTTTTAGTATGTGTTCACGTGAATTTGT
TCTTGTACTGGCATTAAAACTACTTAGACTCGATCCGGTATCAGATGGAGTAATTGCCAT
CGGTACAACTCCATTTGAAAGCTGACATGGTGACAGTATATTTTGAGGGTTACTCTTAGA
GTTTGCCATCGGGTACCCCCAGAACTCTTGACCAAGCAACGCCAGGGAACTTAGATGTTG
TCGACTCTTAGCATCTCGAAGAGCTCGAGGAAGTTGCAACTGTACTGGTAACTCATCACA
ACACTGCGAATAATGAGCAATAAGCTCAGGTATGTTATCGAAACGGTTATGAGAAGTTTC
TAGACTTATGCGACCTCCACACGCTTGAATCAGATAATGTTCGATGTAAGGACCCTTATC
GGCGGGAAGACGGACACTTATCGCCATTGTGTCAGGCTGACTTGACTGACGAACCACGAA
GTTCCCTTCTTCCTTCCCTTGCAGAAGATGAAACGCTCCCGCCCTCTGTATGCCGGGAAG
GAACCAGACCGGGTGGGTCCTTATGAGCCGCTCTAATACTCCAATATCGCATGGTGGCTG
CTCTTCTGAACAGGATCCTGATGACGTCACAGACGAGCAGTCTCCTCGGGCACCCTCGCC
GTCTGATGACAGGGTTTCTCGACTCTGACTCAAACTATCTCCCAAACTATCATCTCCGTC
AACAGGCCTGAACAGATGTGCATTCTTAATAGGAGCATCTCTCGACCGCTTCCTATCCTG
ATTCTCCTTCATAGCTTGGCTCTGGAGTCTCTCGAAGAACTCTCGAGGCTTCAATGGCGG
TGGCTCATCATCCGGAGGGGGTGGAGGAGGAGGGGGTAGCCTCGTACGAGGTGAACTTCG
TAAGAGGCACCTCTCATCGTCTTCTGTTGAACGCTCGTCATGTTCTGAGTCTGTGCTACG
GCTGTCGCGACGTCTCACGCCTTGGAGATGCGGTTCCAAGAAGGTTGCATTTCTTTTACT
CCAGTTTCCGATCTCAGCGTAACGTCGGCCTTTTGTACTTCCGCTCCTTCTTACTTCATT
TCCTTTGAACGTCTGCACAGAGTTCCCATTAGGAGTTAATATTCCGTTCGGCGAGCCGTT
ATTGTTCCGTTCCCTGTTTCTCGGAAACGTTCCTGTACCGGAACGAAACGTTGCCAGTTG
AGGAGTTTGTTCTTCGGGAGGGAATTGTTGAAGTGGCAAAGTCACATTACCACTCCAACT
CTTGCGATTGACAGAGAAAGTTTTGAATGTTCCGTTGCCGTTCGGCGATACGCCACAAAA
ACTACTCCTGTTATGGCTGTTCTTAATGAACGCTCCGTTTTGTAGCTGAGGCTTGATCGG
CACAAGTGGAGATGCCTGGTCAATGGACATCTTACTTTAATAGATGCTACATACGATCTA
TCTACATTTTTGTTTGAAACTAAAACAAAACAATCCAACTGATAGTCACTGATAAAATAC
ACTACGAATCATACAGCAAAATAAAATACGCAAGATGGAAACAATTACCGAACGTTCTTC
GCAAACTTTTCACTATTCACAGATCGACGACTATATCAAATTTTCGCGTGAAATTTGATA
TGTGTACTAATATAAAAGCGAGTGTGTGCAGAGATACACGCGGCGCGGTTACCCG
(7255 bp)

- SilkBase 1999-2023 -