SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR22961c1_g1_i5
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_protein_muscleblind_isoform_X5_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000381 P regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome
GO:0001654 P eye development
GO:0001751 P compound eye photoreceptor cell differentiation
GO:0003676 F nucleic acid binding
GO:0003677 F DNA binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0006915 P apoptotic process
GO:0007275 P multicellular organism development
GO:0007422 P peripheral nervous system development
GO:0007476 P imaginal disc-derived wing morphogenesis
GO:0007517 P muscle organ development
GO:0007525 P somatic muscle development
GO:0007601 P visual perception
GO:0009790 P embryo development
GO:0010468 P regulation of gene expression
GO:0030018 C Z disc
GO:0031673 C H zone
GO:0042052 P rhabdomere development
GO:0045924 P regulation of female receptivity
GO:0046716 P muscle cell cellular homeostasis
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0048471 C perinuclear region of cytoplasm
GO:0050896 P response to stimulus
Transcript
Level		FPKM:1.21 TPM:1.18
ORF EntryO_TrvaFAMAMG25871_complete:A_TrvaFAMAMG_TR22961c1_g1_i5
Sequence
(Nucleotide)
GTTAAACTGTGTATAAAATGATTTCCATTAAAGGATCTAAATGATTACAAAGCATACTTA
ATAAAATTAAACATAATACATGCCTATTGCACAAAAATCTAAATATTGTGTATTTTATGA
GGTCATACAGCCCCAAATATTTTGTAAGCGATAAACGTTCCCACATTACAAAGTCACGTC
ACTCGGCCGCGCGTAGTCAGCTGCTGCTTAGCTTGCCGTTTCGTGTCGCGCTTCTTGTCC
GCTTTTAATGTTTTCGGTTTTATTTAGTTATTTCTGTGATGCAAACCTATTTCTTAACTA
AAATTAACACTATTATTTAATTGTGACAAAAACTGTGCAAAATTACCGTGATATCGGCCT
CCGGACAGCGAATTGAACAAGATTTCATCCTGGAGTCATATATCATTGTAAAAGGAGCTC
CCATTTGAAGTTGAGCCCCGCACCGCACCGGCTTGCTCGCTGACCGCCGAGCCGCTAATC
TAGCTTTTTTCGCGCCCCACCGTCGCCAGCCCAGTTCCACACCGGCAGCCGCAATGCTCG
CGCACCAAGCACAGCTCGCCCTCTACTAAAATCATCAGTCGATACCGATAAACCGCGTGT
GATAACAATAATTTAATACTTGCCTAAATAAGCTTGCAACGTCGGTGTCTTAATTCTAAC
TTAATTGTAAGATTAATCAATTAGTAAGTAACTATCATCGTTTCCGCGCGTCTCCCGCTG
CGGAATATATTTACGCGTGTGCAGTAGTGAGTGATAGTGAGGGTGCGCGAGTGCCGTCAG
TGGCCAAGAGTACAGTCAGCGTCAAGGCAGTGTGAGAAGTGTAAGCAAAGAGCGCGGCGT
CGCGCTCGCCCCTTGTCCCTGCCTATGCGCCGCACTCGCACTGCGTAATTGTGCGCGCGA
CTACCGCCTCCTTTGAACACATAGCCAACGATGGCCACCATGGTGAACATGAATAGCTTA
CTCAACGGAAAGGACTCCCGCTGGTTACAACTTGAAGTATGCCGAGAATTCCAGCGGAAT
AAGTGCTCGCGACCTGACACCGAGTGCAAGTTTGCGCATCCTCCGGCTACTGTCGAGGTT
CAGAATGGAAGAGTCACCGCCTGCTACGACAGTATCAAGGGTCGGTGTAACCGTGAAAAA
CCACCTTGCAAATACTTCCATCCGCCGCAGCACCTCAAGGATCAGCTGTTAATCAACGGC
CGGAATCACCTAGCATTGAAGAACGCATTAATGCAGCAAATGGGTCTGACACCCGGGCAA
GTGTTGCCCGGTCAGGTGCCCGCCGTGGCGACGTCACCGTATCTGTCAGGAGTACCTGGC
GTGGGGTCGACGTACGCTCAGTACTATGCACCTCAGCTGGTGCCCGCGATGCTGGGCCAC
GACCCTGCAGCAGCAGCCGCCTCTCCGCTCGGCGTCATGCAGCAACCTGTGCTGCAACAG
AAATTGCCTCGCACTGATCGCCTCGAGATGGACATGAAGAGCGTCGGTTCCTTCTATTAT
GATAACTTTGCGTTCCCCGGTGTGATGCCGTACAAGCGGCCAGCTGCCGACAAGGCCGGC
GTGCCAGTGTATCAACCGGCGACAACTTACCAGCAACTGATGCAGCTCCAGCAGCCGTTC
GTGCCCGTGTCATTTACTGGACACCCTCCCGGTGTGCCAAGATTTTAATCGGCAAGGATG
TTCAAGACCTACCTGCAGATTCGTTCATATTCGTGAAGGTGAGATTACATTCTGCCTACA
ACCCTGTTGATGTCACAAACGATTGGCTGTTTATGAACAAATTTAAAGCATGAAATTATA
AAAACTAAATTAACCATGACGACCGATACGGTCTAAAAATTATAAATTGTATTTAACCGT
ACTATCCTTATCCAAATACCTATATTATTGTGCATGATTTGATGTTGTAATATAGATTTA
GATTTCACTATTACGAATATACTTAGATGTTTTTAGTGTTGTCTCTCTCTATATTATACT
GGAAATGTAGATTAACCTAGTTTCGATTTAATGTCTATTATATTATGTATTTTTCTCTTT
CATGTATTTTGTATTGTAGTTGTCAAGTGTAGTTGTAATACTTACAAATGTATCTTTGTG
TCCGTCTCTTCTCTTTGTGTAACTTATAGTAATGTTTTGATATAGTTTTAGTATTGATTA
TAAATTATCTATTTATTTATAGAAATAACAAATATCTAAATACTCTGTTATGAAGTATCT
ACGTAACAATGACTTTTATTTAATTTCATTTTAATGCCAACAGTAGTAACATACCTATTA
TTTCATTACGTATATGCTGAAAATGAGTAAATTGGGTTTACAGTAGTGATGTGTGTAATA
CGTCGGAGCGATGGTCGATTATTACAAAACAAATTTATTGCAAGTTGACCTATTAAAATA
TATCTATTTGTAAAATTTGCACAAAGAAATGTGAGAAAAAGTTGAGGTCAAGTAAACGTA
ACAATTAAGATAGTATGTGGCCGTAATCGTCCATCGCTGCGAGTGTGTGTCGCGGAGAGT
AAGCGCGTGTGTGTGTGCACGTTGCAGGGTGCGGGCTGCAGGTGGTGGGGTGCCGCGTGG
TGGTGTGTCGCGACGCCGCCGCCGGCACGTGTCGCCGCGCCCTCTGTCGCTACTACCACA
TACCCGTTCAGTTGCCACCGGCTCTACGTCCTCCCTAACAACCACGCGCCCTTCCCTCCC
CCACGTATACCTACCCACACTCACACACCCACCCCTTCCTAGTATGATCCTCTTCCCCTT
CATCGTCGCCCGCGCCCTGCGTTACCCATATCGATCTCGCCCCTGGCACACTCGGGAAAG
GCAGGTTTGGCCGACTGTTACTGTCGCTTCGGCGGCAGAGGTGGTGATATTATTGTGGAT
ATCGGTTAGTTTAGATGGTGGGGTCGAGCCGTCGCGGACGTTGCTGCCGCGGCTCGCTCT
CGCCCGGAATGAGCGTAAGTCTTCGGGAAAGAGTGTGTACATAAAGTAGCGGGATGTGAT
TCTCAGGCACGGTCATGCGATTGTGATATGAATAGATTTCGGAAAACCGGAGCCGTATGA
AATTATTTGTCGAGATCGTCGAGCGGTAGTTAGTGAGGTTTCAAATATTTTATGACTAAT
GTATAATTTTTTAAGAAACGATATGAGTTCCTGTAATAAACCGGGTCTTCGTTGCCCGGA
TACTTTGTTGTATATAAGCGATGTGATTTGACCGGTGATGAGAGGAGACGTCAAGAAGTA
CGTCTCTCGGCGACTCCTCGATCAGTGTCAATCTAATACATCACCCCAGTCCCTGTAAGA
GCATTTTTTGTGAGATTTATTTTACTTTTTTACGTATGTTATAAAATTACGTTTTTCTAG
AGGACAAGTTTACACTAGTTTAGATTTAAGTGAATCAGTAACGAAACACCAATAGAGTAG
CCGCTTCTCTCCTTCGGCTCGACAATTTGTCGCCGGAGCACAAGTCACAACGATGTGTGT
AAACGCGGACCTTGTGTTGTACAGTAGTGAACGCCGTCGACCTATATTCCATAACTATAT
CCCACGATCACGTACTATACTGTACAACCAGAAATTACGTTATGACGTCGTTCTCGACGA
CACGAGTCGTCACTGTGAAGTTTGATTACGACACAGTATCGAGCGGCGCATCGGCCTCGG
TTAACCCGCGCGCCTACCGCCTCGTCCCGTTCGCACTTTAGAGTCGATCGCGATACTCGT
AGAGTAATAGGAATCATGAATTCGAAATACAATGAAAGTCATCAGACAATATTGAAACGA
AAAAGGCATACTTCCAAGCTATTTTAGAATAAAAAGTCGGCTTATATTCCGGATAGATTT
TGCTAGAATACCGTTTTATTTACTTAAAATCAGAATCTGTCTATCGATGCACAAATTGTT
ACCGATGATCGAGTTCGATCGATGGTGCATTGTGTAATAGCTACGTTATTTTCACTATAA
ACAGTATTAAGGTTTTTATGAAATTTATCTGGTGGTACGTACGTTAGAGGTGGTATGCGT
ATAGAGAGAGGCGGAGTGCGTGCGCTAGTCGACGTCCTCTGACTAGCATTCGGTTCACTG
GTCGCTAATAGTCATGGCCTGAAGTCGGTTGACGGTCACTAGCAGGCAGTCACCGATTGC
TAGTAGTCAGTCACAGATTGTTGGTAGTCGATTGGTCGATTACTAGTACTCGGTTGCAGG
ATACTAGTAATCGATGGTCAGTTGCTAGTCATCAGTTTCTGGCTGATAATAATAGTCGAT
TTTGTATCATTAGCACGCACGCGCTCCGGGGGCATGGAAGCCTGATGCCTAATATTATTC
CTAGTCCATATCCTTTTGTTGATCAGTCATGCGATTAATGTTAGATTTAAAATAATAATA
ATTTGATTTATTCCTCCCATTTAGTGGATATTTTGATAATGATATATTAATAATGAAATA
TTTAAGATACATAATACATATTTGATTCTAAATCCTGATAAAGTGACACTACTTTAGTAA
TTTAGTCGGAGGGATACTTGTGCCGTGATTATATTTTTAGGTATATATTATGAAATAATT
CCTAGCGTCGGAATTAAAGAAGTGATTAATGTGTAAGCGTGTTATGTATATTTATTGTCG
TAACGTAAGTGGAATGCCATATCGATAAAAGGTGAATATTGGATGCGGAGTCAAACTCGT
GAGTAGCGTTTGTTTATGTTGATTGGTTGTTGTTGTATCCCGTGCTAGTGGCTAAGATGA
ACAGTTCGCTTTTATCAATACGGCACTATGGCTCTATCTATAAGTTGGCATTTTTATTTT
AAACTTTTTTGTTAAAATTTATCGTTTCTTTGAATATTATTTGATTATTTGTTACCTATA
ATTTTACAATCAAAATTTTATGATCTGACGCATTTATTGTAAGACAATCGATTACTTTTA
TAATTAATTAATTAGTGTGATAATAATAATTATGGTATGAAATTGCCGAAATGAAAGATG
AACATCGAAAGTATCCTTCCTGTTTAGAAGGGACTATTCTGGCCCAAGGTTTCTAGTGGA
TTTTATATTTTTCTTTTGTTGTATTTTTAATGTTGCGTGTGTCTTACACATAATATATTT
CATTTTTGTGATATTTTTAACTATAAAGTACTGTTATTGTAAATCCAAATGGAATAATGA
TGACCTAATTTAATATTCAAGAATTTATTTGTAAATCACAAAAAAAAATGTAAAACTGTA
AATATTATGACAAAAAAATGAACTGCAACACAATAATAATTTACTATTATAATAATCTCT
CATCAAATAAATTGTAAGTGTTTGAGTACCTAAATAATGGTATCGTAATATGTAGCATAT
GTATCTACAGACTACTTAAATGTAAACCGGTCCAGTGAACAAATTATGATTAATATTGTG
ATTTTTTTTTATTCACGAACAATCACAGAATAATACATGACATTGTAATATTATTTATGA
AATTACTATGTGATGTGATCTTCGGATCAATTTTGAGTACATTATAGATAATAAACAACT
GAATATGTAAAAAAAAAAA
(5539 bp)

- SilkBase 1999-2023 -