SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_TrvaFAMAMG_TR2260c0_g1_i2
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_mushroom_body_large-type_Kenyon_cell-specific_protein_1_isoform_X2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003677 F DNA binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0006351 P transcription, DNA-templated
GO:0006355 P regulation of transcription, DNA-templated
GO:0007613 P memory
GO:0042803 F protein homodimerization activity
GO:0043565 F sequence-specific DNA binding
GO:0045893 P positive regulation of transcription, DNA-templated
Transcript
Level
FPKM:3.73 TPM:3.66
ORF EntryO_TrvaFAMAMG1365_complete:A_TrvaFAMAMG_TR2260c0_g1_i2
Sequence
(Nucleotide)
GCACGATCTATGCAGCCGCGTGCAAAATTAATAAACCAAAAGATGACAGTTCAAATTCGA
ATTCTGAATGTACGAATTTAGAAGTGAAATGGTCGGGAGCGCGCGTGCGAACGAGACAGG
TATATATCTCTGCGCGTCTGCCAATCGTGACGTCGGCCGGTGCATAGCGAAATAATAATG
AAAAGTGGCATTTAGTAATTTTGTTGTGTTTACGCGCTGTGCTAGTTCGTATCGTTGATG
GCGGTTTCTTTTTTCTAATCGGGTGACGTCTTCTCTGTGGCGCCCTCTGGACTGTTGTCG
TCGTAGTACACACACGATCGTAAATATTGTAATTCATGGATATGTCATAACAACGGCTGT
AACCTCGTGCATTGATTAAAGGATGTGTGCGATGCGTTTTTGGCGCGTTTAAGCAGCAGC
GAACTCGTAGCGCAGGAAATTGAACTAGCGACGTTTTTTTCCAAACTTTACCTACGGGCG
TTGTTCAGTTGCGCGCGAGCTGTGCCCGTAGGCGGCTCGCGTCCCGAAACGAAAACCGAC
GAAAAACCACCGAGTGCGTCCCGAACACCACCGACCGAGTGCCGAACTTGTGTGAAACGA
CGGTCCATTTTCAAATCCGCGTTCGATGACCTTATAAAGTGAAACTTTTTTCTTTCACTT
TGCTCAATATTGTGATAGAACAGTGCCTAGTGAGTACAAAACTAGATTGTGATAGTGCAA
ACTAATTATAAAATAGTTAATAAAGTGTATTTAAGACGATATTTTATAGAAACATTTTAA
ATGGATACTGTTCTAAGTGGGCAGATACGGCGAGTGTAGTGTGCGTGGTGAAATGGCGGA
GTGTTCCTTCGCTCGTTGCCAGCAGGAACGTCGAGCTATACGCAAGGAGCTGCAGCGTTG
GACCAAAAACATGGTCTATATATTGGGTCTAGAACGGGTGGCAGAAGAGTTGATGGGTAG
AAGAAAATGGAAACTATACCAGGACGCGTTACTACCAAAGCGAAACGACCAGGACCATTC
CGACGACTCCATGCCTTCAAACGATCCACCACCCTCATTAAAAATAAAAACTATAGAAGA
AATCAACGCTCCCGAAGACGAGAGGCCCAGGGTAGAGAACGATGGAAGCCAGGAGGTGAA
GAGACCAGAGACAATCCTGGAGAGTCTTATAAAGCGGCCGGCCACGCAGCCGAAGGTGGA
AATGATAGAGGAACCTTCGGATTGGAAGCCGCCGGATAAATGCTACTTCTGCGTGGACGG
GGAGCCTGGTGGAACCACGGAGACAGCGCAGCCTGGTGGAGCTACCAGTCCAGCATCGGA
GTCGGACAGCAGTTCGGTGTCGGGCGCGAAGAGTCCGACAGCCGCCCCACCTCTGTTACA
ACATCTGCTCCAACTGCAGGCGCAGAGCCCACAAACTATAGCTCAATTCCAGCAGATGTT
GGCTGCGTTGGCTGCCCTGGGCACGGGGCTGGTGCCACCTCCTCTAACTCAAGCCTGGAT
GATGCAGAGGTTCGCGCACCAACGGCAACAGGCTGACAGGTTATCAGAGAGCGACAAGAC
AGCAGCTCCATCGTCTCCGAGTCCAGCTGAACAGCCTTTGGACCTGAGCGCCAAGTCTAC
TTCCAGCACCAGTGGAACTCCACCTCCAGACCCTAAGTTCTTGGATAACCGATTGCGACG
ATCGGCGTTAGATAGTGCATCAAATAGTACAGGCCGGCGCACGTACACGGAAGATGAATT
ACAGTCCGCTCTACGTGACATCCAGTCCGGGCGACTCGGGACCCGGCGGGCGGCTGTGCT
CTACGGCATCCCGCGGTCTACGCTACGCAACAAAGTCAATAAGTTCGGTCTCCTCGCCGA
CAATCACGACTCGGACCAGGACAGCGACCAGGACCGCGCTGAATCTCCTCCCTCGGTCAT
CCTCAAGATACCGACGTTCCCGCCGCCTGATGACAAGAGCTCGTCCCCTGCTACACCTAT
CAGCACCCCGATCACGCCCATCACACCGCTCGTACCGCAGCTTCAGCCATCGCTAAACCC
GACCTCAAATCTGTTGTTGTCGCCATCCGTGTTCGCGGACCCACCTGCCGGCTCGCAACA
CATCTTCACGTCCTTGAATGACGTCATAGCGAAGAGCATCAGTCAGAAGTTCCAGCAGCC
ACTCGACGCTCGTGCGCACCAACCTGATCTATCGTTTATGAGAGCGCCTGACGCTCGCCA
CGTGTCCGTCATCAAGAGTCAAAATGACAATCAAAGAAACTACTCCATGCCGAGTAATTC
TAAAGTGCCGACGAACAACAACGGACAGCCTGCTGCTGGCGGCAAGGGCACGCGACCCAA
GAGAGGTAAATACAGGAACTACGATCGCGACAGTCTCGTCGAAGCTGTGAAAGCAGTGCA
ACGAGGCGAGATGTCCGTGCACCGCGCCGGGTCTTACTACGGCGTGCCTCATTCAACATT
AGAGTACAAAGTTAAAGAAAGGCATTTGATGCGGCCTAGGAAACGCGAACCGAAGCCTCC
ACAGGACACAAAACCGCAGCCACCGAAACCTCCTCCGCCCAAACCTCCAGGCAAGCCGTT
TTCCAACGGTCTCAACGGGCCTGACACGCCAGCGTACCCGACGGGCTATCCATTCTGGGC
TGGCCCCGGCTTCGCGCCACCGCCGACACCCGACCTGTACGCGTCCCACATGATGCGGCG
TCTCCGCGAGGAAGCTCCTCCGCCGGCGAACGGCTCGTTCTTAGAAGGCATCATTCGCTC
GAGCCTGGAGCGTCCCGGCGCGGCGCTGATGCAGCGGCTGGCGAGCGAGTCTCCGAGCCT
GGTGCGGCGGCTGGCGGCGGACGCGGAGGAGCCGGCGGCTCGGCGCGCGCGGCTCGACAG
CTCCGACCACGCGCTGGCGGCCGACATGCGCGAGGCCGTGCAGCGGCTCCGCGCCGACAA
GCTGCGGCCGCGCAACGGCACCCCCGCCCCCAGCCCGCCGCCCGCGCCCCCCGACCGTGT
CTAACCTCCTTCCCCGCGCCCGCACACACCGGTCCGGTCTCTCGTAGACGATTCTGTATC
CGCGTATTACCAAATATCACAATAGTTACCTAAGTCCCGACCGGCTCAACAGCTTTACTG
ATGCGATATCACAATGTAGTGTAGCGGCATGGGGCCCGCGCGCCGGCTGGCGGCCAGTGA
CTGCGGCTCTTAGGAACATGGGATAGGCGAAGCGACAGGAAATGTGGACCGAAATCACTA
CAACTAACTTTATAATGAAATAGTACAATAATTAAAACAATAAGATGGAAATCGTATGAG
ACAGGAACCGAGCACTGCGCGTCACGTCCGGCCTCCGACCCGAACCGGAATCTCACGATT
TTGACATTGTCCTAAAAGAAAAGACAACCAAAAGTTAACGTTATTAAAATTTTAAACTAT
TTAAATGTCGTTTAAGTAAAAAAACATTGTAACAAATTAATTATAATGCTAGCTACGAGT
GTAAATGTTATCGTTTTTTAAGTGAACTATTAAGTAAATATTTGTGCGGTGTTTTTATAA
TTAGATAGGTAATATATTGAATGGGATTAGCGCTGGGCTCGATCGACAGCGCGAGGACTT
ATGTGCAATTATTATTTTGTATAAAATAATAGTAATGTGTAAACTGTGTCTAAGCTAACA
CGTGGATTTCCATTATACTGAATGTGATATTTAGGTATTACGAGAGCGGCTTGTTCGAGC
GACCACGCCCTATATACACCTACGTACGTTAAATACATCTAGTGAACATATATATTTTAT
GTAATATTATTGTATCTTAAGATATAAAGAATATATTCTTATTTTTCATGGTCCAAGTTT
TAAAATGTTTTATCGACTATACATACAAAAATAAACAAAATAATCATTATTATATTCTCT
TTAAATCATTATACATATTATACTACATTTGGAAATTCTAAAAATTTTTACTTGAAACTT
TTCGGTGTTCAAAACTATATATTAATACTAAAAAATACGATATGAAAATGTATACGCTCG
CCCAAATTAAATTTAGGTAAAAAAATATTCAAAATTAATCTAATACAATTGTATTTGTGT
AAGTTAATGTGTATGTGTGCGCCTCATGGAAATTACGATATCTTTGTATTATCTAAAATT
ATACATAATTATATTATATGTATACAAAATTATATAAAATTCGTGCATTTTTCTCCATGA
GCTGTTTTTAAAGATTTTGGACTCGACAATTCGACAAAACTTTAAAAAAAACAATAGGAA
TATCCATATTAATACATACATATCCGTTGTGCCGAGATGTCGAATTCAAATTCGGAATTG
ACAAAAAAAAAATACTTATAGAAATTTTTATATTCAAAATTTTAAACTAGTCGATAGAAT
ACTATTCGCATTTTATTTCCGTAGGTATAGTACGAGTTTTGAATTTAGACACTTTTCTAT
TTAAATCTTACTTTCAGACAAATCATATCGTAAAACTTCTTAAGAATATCTTTCATACAA
TCAATTCATCATTACTTAGATCACCATTTTGAAAAACATCAATTTCTTTATTCGCCTAAT
ACGATTTGGTTTTCATCTCATCACACACCAATTAATTATTTTATTTCATAGGTATGTACA
GCCTATAAGTAAATTAATAAAAAAAACTGTTAATTGCACTCTCTATAGAAATCATATTTT
CTGTACAAAAGTATCAAAATTAATATTTACGTCGAATTTTCAAACTCGTGCTAACCCTAC
TGTCTTTTCGATGTATTTTTAGCGTATTAAAAAATCGAATGCATTTACAAAAAAAAACAT
TTCGTTCAAATTTCGAATTGAACAACTTTTTTTAATACGTACGGATCCTGTGTGTTATGC
CAGACAATGTTGCTAGCTTAAAAAAAACATTATTTTAAATAAGTTTGTAAATAATAGGAT
GGGACAATTTGCAAAGAGTATTTAGTTAACAGACATTCCGCTTAGAATGTTATTAGATTT
TTTTATTATTACATAAATAATATTACATTATTTTTTAAATCGGGAACAAATTACGTTGTT
TAATCTTATTTTTAAAGTTAGTTATTTTTAAGTCGCTTTTTAACACTTTAACATTAGTTT
TATTGTGAAATGTTATGATGTTGTAAATGCCGGGTTTCCAAAGGCCCGGCGCTGGAGAGA
ACCGCGACTGATATGTAGTAGAAAAACAAAACAAATTTTAGACAATTATTAGTAAATCGT
TCGAAGCTTGGCATCTTAAATTAGCCCCTAGTAGAATCTTAGGATGCTTCATAAGAGAGA
ACTGCCTTCAATTTCAACATTGTCAAAAGGTCTTACTTTGAAAATTAATAATAGTTAAAA
TTGAGTTGCAATTTAGTGAATCAATTATCCAATATTTCAAATCTGGTAACACCAAAGCCA
TTTTTTTCTATCGATTTATTAATAAAATGTCGTAGAGTGGCAACACTCTCCCGGTCTGTA
CAAATGGTATACGCCGCCTTAAATGTTATAGCGATCTATTTTAGAAGGCAGAGTTTTCAA
AAGACAATCTTCCTCCTTAAATACCTCATTTCAATAGTGTTTTTTAAAGGTATTAAAATT
GGCTGTATGTGTTTTGAGAACTGCGTCTTATGGTATAAAGCAGTCGCTGTGTAGTGAATC
GTTTTATTGTATATTTCTATAAGTTTTTTCCACATAGTTTAAGTATTTTTAATTACATAC
TAGTGTAATTTTTCAATTAAATTAGATAGTCGGTAGCGATCCTTTAATTTTTGTTAATTT
TTTTCTTAAATGTATTTCTTCTAAGTATTAGATTAGTCTTGAACGGTCCTCGACTGCTCC
AGGAACAAAAGACAGTGAACTTTGAAAGAAAATTGCATTTTACTAAACAAAAGTAAAACT
TGAAAAAGTTTTCGTGAAACGAAACGTAACTCGAACCTCCATTGTTTATGGTACTTTTTT
GAAAATGGAACACAATGATTACATGTCCCAACATAAAAGACATTGCCAGATATTTTTAAG
CATTTTAAAAAGTTTTAGAGGTTTCCAAACTATGTGTAATAACTACACGATATAATTTTA
ATTTGTTTGTACTCCTACGAGTACTGCTTTGTTAATCAAGTTTGGAAACAACATTTAATA
CTTAGCTATCATTAAATTGTGTATATTAATTTTTAAACTAATTATTATCTTATTATTGAA
GTTAAAATGGAGATGATTGATTGTATTTCTTCGGAAATGACCTTTTTATGGTCAATCAAA
TAAATATGTACAACTGGAAGCATTTAAATATTAGAAAATATAAAAAATATAATGTTTATC
GATGTTGTTCGTCTAGAAACATATATTTATATACAAAACGCTTTAGGGAGTTAACATCAC
ATCGCTGGATGGCGTTTCCGGTCAAAAATGTTGTCTATGATGTTTGATTTTTTTTTTAAT
TCAGGAAGAGGACCAATGTATCATAGAACGTTAATGTATGCTCACGTTTTTTTATCATTT
AAATATTATAACAGCGGAATAGTTGAGATCAAACTATAAATATTGTTATTTAATTATTGA
GTACAAGTTTTTTAAATGATTTTTTTTTTCAATATTTTACCCTCTACTCGCCTTATATCT
TTTGTTATTTTGTTCCTTTAGTTATATTTTTATTGATTAAATATCATTTAGCCAAACGGC
TTGTTGATGATTTAAAAATTTATATACTTATAAATCTACTATTTTCCAAGCCTAATCGAT
GTATTCGTGAACTTTATTTTATTGGCAAATAAAATTGGCAAAGTATATTGTATTCGATGT
CTAGTCAAAATATTAAAAAGGGAGGTTACAATTCGACTGAAATTTTTTGATAGCAAAACA
AAAGTGAAAAAAAAAACTTGAAAAGTAACGTCCAAGAGTGCTAAGTCGCCTGGCGACGAG
TTGATTCAAATATAAATTTGGAAATGTAGACTATACCTGTTTGTAATGTATACTCTATGG
AGTCGGACGCGGCATAGGGTTGCCAGAACATAATGTTTATCTTCTCGTACTGTGTCCTTA
TGTATAGGTGTTTATATCTTACGTTAAATGGCAGGTGTGTGAGAATGTGACTATTTAAAA
AAACCTGTATACAATAAATTTCTTTCATTTGTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAA
TAGGAATATCCATATTAATACATACATATCCGTTGTGCCGAGATGTCGAATTCAAATTCG
GAATTGACAAAAAAAAAATACTTATAGAAATTTTTATATTCAAAATTTTAAACTAGTCGA
TAGAATACTATTCGCATTTTATTTCCGTAGGTATAGTACGAGTTTTGAATTTAGACACTT
TTCTATTTAAATCTTACTTTCAGACAAATCATATCGTAAAACTTCTTAAGAATATCTTTC
ATACAATCAATTCATCATTACTTAGATCACCATTTTGAAAAACATCAATTTCTTTATTCG
CCTAATACGATTTGGTTTTCATCTCATCACACACCAATTAATTATTTTATTTCATAGGTA
TGTACAGCCTATAAGTAAATTAATAAAAAAAACTGTTAATTGCACTCTCTATAGAAATCA
TATTTTCTGTACAAAAGTATCAAAATTAATATTTACGTCGAATTTTCAAACTCGTGCTAA
CCCTACTGTCTTTTCGATGTATTTTTAGCGTATTAAAAAATCGAATGCATTTACAAAAAA
AA
(7682 bp)

- SilkBase 1999-2023 -