SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_TrvaFAMAMG_TR21691c1_g1_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_RNA-directed_DNA_polymerase_from_mobile_element_jockey-like_isoform_X1_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0003964 F RNA-directed DNA polymerase activity
GO:0005575 C cellular_component
GO:0006278 P RNA-dependent DNA biosynthetic process
GO:0006313 P transposition, DNA-mediated
GO:0016740 F transferase activity
GO:0016779 F nucleotidyltransferase activity
Transcript
Level
FPKM:1.34 TPM:1.32
ORF EntryO_TrvaFAMAMG25053_complete:A_TrvaFAMAMG_TR21691c1_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
TCAAGATGTTCGTATATATTGTGTTTAGGCACAGGTACATGGAGATGATATATTTGGTCT
CGACTGACTGTTTACAACTGTAATAACAGTTTATAGCTCCCTTACATATTATATAATTTT
CATTTATTTCTATGGCAGATCTAATATCTTTATTTGATGATATCGATCGTACTTCTGCCT
TTCGGTCAGTCGTAACCTCGCCCGAGGATGTTCGTTTGCATGTGTCCGACAAAATGTTTA
AAATCTTTCACACAAACATTCGAAGCGTCAACTGTAACTTTGATAGTTTGATCACACTCC
TCAGCAGAATTGACTCACAATGTGATGTACTCCTTTTGACTGAGTGTTGGCTACAAAAAG
TTGTAGCAATTCCAAACATCAGTGGATACAACTCCTATATGTCTGGATACACTAACCAGA
ATGATGGTTTAATACTGTATGTTAGGTCCGACATTACTCACAGTGTTGAGGAAACTGTTG
GTTGTGATGCGAATTGTCTGATAGTTAAGTCCAGTTTGGATCTGGCCATTATAGCGATCT
ATCGTTCGCCATCTATTAAAAATATTGACATGTTTCTGGATAGACTGGACCTGATCTTGG
AAGCCCTCTCTGCTTACCGTACTGTGGTTTTAATTGGAGATCTGAATATCGATATAATTA
ACAATAGCCCTAATTCTGACAGCTATCTTGAACTATTGGCTCATCATGGCTTACTAGCAG
TTCATACATTTCCTACCCGGGTTAACACCTGTTTAGATCACGTAATGCTGAGAACGGATA
GAAATTCGACTACTTTTGTGCTAAATTCTTTTATATCCGACCATGCCCCAACAATTTTTT
GCTCTGACATAGAAATCGAACGTTGTAAAAAAGTTTTCACTAAGACGTTTGTGGATATTA
AGTCAACAGTTAATGACTTATCTAAAATTGATTTCACATGCATAACTACGTCTCTCGATG
CCAATTTTGCAGCTAATAAACTAGTTTCTTTAATTAGTGATACTGTAGATGCAAACACAA
AACAAGTTAGCATCCCAAGTCGGAAGAGATGCCTGAAGCCATGGATGACACCTGGCTTAT
TGCGATGTGCTAGAAACAAAGATAACTTACATAGAAAAGCCTTGTTGTCTCCTGATAATA
TAGTACTTCAGCTTACATACACTAGGTATCGTAATTTCTACTTCAATCTTTTAAAAAAAA
TTAAATCTGATTTTGACACAAAAGAACTTGAGAACAATAAAAATAATACAAAGGGTATGT
GGAAGACTATTAAGAATATAACAAATTTAAACAGTTCCAATAATCCTGCAATCGAATTAT
TGAATTTAAGTGATAATGAGCGTGTGTCCACTGACATCGTTAACAACTTCTTTGCCACCA
TTGGAGCCAATCTTGCCAATAAAATAGGTATTCAAGATTCGATTGCCTCATTAACTGAAC
CTCCTAGTGTGCCGTTGTCATCCATGGCTTTGCTACCGACCGATGAGACGGAAGTTGTGA
ATATTATCAATAGCTTAAAGAGTAAATGTGCTGTTGGAAGTGATAAAATACCTGTCGAAG
TGTTGAAACTGGCTCAACATATCTTGGTCCCACCTATTGTAGTTGTCTGTAATTTGTGCA
TGGAGGCGGGTGTCTTCCCAGATATTTTCAAAAAAGCTGTCGTTGTTCCGATTTATAAGG
GTGGGGACAGACACAGTGTTAACAACTATCGACCTATATCTATTCTTACATCTCTTTCTA
AGATTTTGGAGAAGATACTAAACATTCGTTTAATTAATTACATTGACACTAACTGCATAC
TCGCTAAAAATCAGTTTGGGTTTAGAAAGGGCCTCTCTACTGAAGATGCTGTACTCGATC
TCTCCCATAAAATTGTAAAGCTTTTAGATAATAAGGCTAAAGTAATTGGAATATTTTTAG
ACTTAGCTAAAGCCTTTGACACTGTGTCTGTTCCAATACTTTTGAGTAAGATGGAATATC
TTGGCCTCAGGGGTGTGGTGTTGGATATTTTCAGGTCCTATTTGTTTAATCGTAGACAAT
GTGTCAAAATCGGAAGCACTTATAGTAACGATTTAGTACCCTCTTTCGGTGTGCCTCAGG
GTAGCGTACTTGGCCCTACCCTATTCCTCCTCTACATTAACAACTTATGTGCACTAAACT
TGGAAAATTGTAGTCTTATCTCTTATGCGGACGATACTGTTCTGATTGTTCATGACTCTA
GTTGGGAATTGGTTCGTCAAAGGGCAGAGACTTCCTTGGGCAGAGTTTTGTCATGGCTTA
ATAGCAATCTTTTGTCCCTAAATGTCAACAAGACAAAATTTATTACCTTTGCACCCCGAA
AGCATTCACAGCCACCGATTCAAAACTTCAATGTTAAGGCCCACAACATAATATTATGTA
CAGTGCAAGGTCAACAGTGTGATTGTCCGTCTATTGTTCGCACTGATGACATCAAGTACC
TAGGTGTTACTATAGACAGCACGTTTACGTGGCACGCTCATATAAACTGCTTGGTAAATC
GCTTGAGAAAATTAATTCCGATATTTAAAAAACTAAGAGCTTGTGCTGATTTAAAGACTT
TAATTATGGTATTCAACGCACTGGCACAGTCACTGATCCGGTACTGTATAGTGGCGTGGG
GTGGAGCTGACACTACTTCTATGCTCCGATTGGAACGTGCTCAAAGGGGGATATTAAAGA
TCTTGATGAAGAAACCCCGTAGATACTGTACCACGACGCTATACAGTGACTGTGGCGTGC
TGACAGTGAGAAAGATGTATATTTACCAATCTTTGATAAGAAAACACACATCTCTGCCAC
TTCTCCAGTCTAAGACTAGCAGACGCCGAATGGCACCTTGCTTGATGGAGCGGTGTCGTA
CTCGACTGGCGAGGCGTCAGTATTATATCGCTGCTGATCGGCTGTACAACAGAATTAATC
AATGCAAACCCATCTACGAACTGTCTTTACATCATTGTAGAGATGTCATCAAACAATGGC
TACCTACTCTCACATCCAACCAAACTGAGGATTTATTAAAGTGATCCACCTTTTGTGGAA
GCACAGATATTGTATCAACACATACACTCGCACACACACACACACACACACACACACACA
CACAC
(3125 bp)

- SilkBase 1999-2023 -