SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR20128c0_g3_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_uncharacterized_protein_LOC101746073_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000272 P polysaccharide catabolic process
GO:0004553 F hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds
GO:0004568 F chitinase activity
GO:0005575 C cellular_component
GO:0005576 C extracellular region
GO:0005975 P carbohydrate metabolic process
GO:0006030 P chitin metabolic process
GO:0006032 P chitin catabolic process
GO:0008061 F chitin binding
GO:0008152 P metabolic process
GO:0016787 F hydrolase activity
GO:0016798 F hydrolase activity, acting on glycosyl bonds
Transcript
Level		FPKM:1.36 TPM:1.33
ORF EntryO_TrvaFAMAMG23746_internal:A_TrvaFAMAMG_TR20128c0_g3_i1
Sequence
(Nucleotide)
GTACTCTGGAGTTGTAGATTTAACATAGTTCCTTACGGTACTAGATGCTGACGAGTATGA
AGTATCTACAGCAGGGGGTAAGTAATCTCTGGTTGTGGAAACTGTCGAGTAGGTGCGAGG
TTTATACGTTGTAGTAACGATAGGAGCGACTGTTGACACGACTGGAGGCAAGTACTCCTC
TGCTTTGTACGCTACTTGAATTTCTGGACTTTCATAGGCAGCTTGCTTATAGTTGGTTGT
GACTTTAGTGCCTGGGAAAGATGAGAAATGTATGGATTCAACATTTTTCTGTGCTTGGGC
AGATGAGAAAGTTTTCTGGATGTCGTATTGTTGCGAAAATTCGGCTGGTTTGTAATCATA
CTCATCTTTAACTTGTTGATAATTGACGCTTTGCTGTACAATAGGTGTTGAAATTGACGA
GACTTCTATTTGCTGCTGATATTCTGACTTTGGAGGGATGTATTCAGGAGCCTTATAAGT
TTCTATTTTCTTCGGCGTATCATATTCAGAGTAGTGATTTTCATATACCAAAGTCGACGG
TGTTGTCGAAAGGAACACTACATCTTTACCAGCTGCGAAATCATTTTTTGTATTTATTAA
ATTGAAAGACTGTTGAGATACTAAACTGGCATCAGAATAAGATTGAGCTGTGTTTGAAGT
TTCGATGTTCCTTTGAATTTCAGGTTGATTGTATGAGAATCCTAAATCGATTTGCGATTT
TTGTTGCACGTAAGAATTTTGATCCTCAAATTGTACAGGCTGATTTACAACATGACTGAC
TTGGTGTTGCTCAACAATTGGTTGGTATGTTTGTGTAAAAACTGTAGCAGTAGGCTTCAC
GTAAGTTATAGGAGTAGCCTTTTGTGTGTATTTAAGGATGGGGTTCTCATAAGTAGTCAC
ATCTGGTTGCTTGAAAGTATATTTTATGATTGGCGCTGGTGTTGTCGACACAGTTACAAA
TTTCTGTGGTTCCACTTTGTGGAATGTTTGGTGTCTGTACGTTTGAGGCCTGTATGTGGA
CACTACTGGGGCAGGGGTCGAATAAGTGACAGTTGGTATCGTTTCCTCGAATTTGACAGC
AGGTTTCTCGTAATTGTAACCAGACTCTGAATTTTCTGAGTAAGTATGTATTTGACTGTG
ATCTACTTGATGCAAAGTTTGATGGCTTGACACTTGGGGTTGATATGTTGATACAACAGG
TGCTACTGCAAGAGCTGGCTGTGCTGTTGTGTAAACTTTTGGTGCTTCGTAACTAACTGT
TTTGGAGATCTCGTAACCAACATCGACTGCTGGAGTGTAAGCTTGATTACTTTCTACTTT
ATGAATAGTTTGTTGACTAAACGATTGACTAGGTCTACTGGTATACTTGAGGATAGGATT
TTCATACACAGTGACAGGTGCTCGGTAAGTAACTTGTGCTACTGGTTGAGGAGTTGATAC
GGGAACTGGATAACTTTTTAGTTTGTGGATCGTTTGCTGACTGTAAGTTTGAGGCTTGTA
TGTAGACACAACTGCAGGGGCTGGTGTAGAATATTGCACATCTCCAAAATGAACAGAAGG
TTTTTCGTAATTGTAACCGTTACTATTAACAGAATAAGAGTTAACTGAAGCCTTTTGTGC
AACGATATTTACTCTATCTGTATCGACTTTGTGCAATGTTTGGTGGCTAAATGTTTGGGG
TTGATAAGACACTGTTGGTTGGACTGCTATTGTTGGTTGTACTGTCGAGTATTGTACTAC
TTGAGGTTGTTGATAATGAATGTTAGTCTCAATTGATGGGAAGTGAACAGTTTGATGGCT
GAACGCTTGAGGTCTATAAGTTGATGAAGCAAAAGTAGTGACCGGAGCACCAGTTGTGTA
CGCTACCAACTTCTTGAATGGTTCCTCAGTTACTGGGACAGGCGTAGTGTATTGGAATCC
AACAGGTTCTAATTTATGTACCGTGTGTTGTATAGCTTCAAATTGTTCCGATTGAGGCAC
AGAAACAATAGCTGGAGATGCAGTTGTAAAACTCAAACCATCTTCAAACTTGACACTTGG
TTTGGAGTAATCGTAACCTGATGTTGTTTTAGTAGCAGAAGATTTGACATAGCCACTGTT
GCGATTGGAAGATGCTTGCTTGACGTTAAAGTTTTGGTAGTTGGATCCTTGACTATGTTC
AACGAATTGGACGTTAGAGGCAACTTGCTTCACAGGAATAACTGTAGGTTGTACGTAAGT
AACCGCCGGCTGTGTGTAGCCAAATATCTGTTTGATACTGGTTCTGGGTGCCTCTGGTAC
GAAAGTGGTTTTATATGTTACAACTGGTAAGGATGTTGTCACTTCAATTGGAGTAGTGGT
AGTCGGTACCCCTGAAGAAGTAGGGTTTGTTACAAAGCTGTATCCGTCCAAATTGTGCTC
ATCAGTACCTACATGGTTAATAGATACAGCTGGTTGGGAAACTTGTACAATTTGTGGATG
TAAAGTTTGATGGCCAAATGAAGTTTGTCCACTGAAGCCCTGGTAATTGCTTTGACCATT
ATAAGATGCATCAACTAGTGTCGTTTTCCCAACAAGTCCTACATTAACCGCTCCAGCAGT
CAAAGTATGCGACGCTCCAGTGTACGCTTTGGAGTCACTCAAATAATTTCCATTGGCCTG
ACTATAGCTTCCGTGATAAGTGGCTGAACCACTCTTGGTTGTTCCTGAACTAAAGTCACC
GACATTTCCAGTTCTGTAAACTCCTTCTTCATATTTACCAGCGTTATAGTGATTGTATGA
TCCTGAATAGTCCGCCCTGTAAGATCCTGAATGATCTACTTTATATTCTCCACTGGTACT
GGAGTAATCGTAGCCAGCACCTGTGCCGTAAGAGCCAGCTTTGTAACCGAAATAACCTGA
ATTATATTGGTTTTTTCCTTCAACGTAATCCCCAGAATTGTCATGTACATATTGTCCGCT
AGAGTCTTCTACATAAGATGCTCCTGCGTTAGCGCTTCCTGTGTATAGTCCTTTAGTTTG
TTCTGAGTATCCGCTGCCGAAAATGGATGCTGAATACTGTCCATTGTCAATGTATTTAGA
GTCGTCGTGAACGTAAGGAGCGACGGGTGACCCAACATGTTTATAGGGCTCCGCATAGTC
TCCAGAAGGATCATGAACATAAGCACCAGATTCGTCTTCATATGAAGCACTTTGGTACTG
TGAGTTTTGACCAGCATATAAAGTTGAATGGGTTTGCTGATTAGCATAAGCTGATTGTCC
TACATTCAAGCTTGCTGCATTACCGTGCTTTACAAAGCTTTGGTGTTGTGCTTCTGATTT
AGTTGGCAGTCTATAATCATCTAGGATAAGTGATCCGCTAGTATATTTGCCTTCATCTGT
GTATGTCGATGGTTGAACCAAACCTGCGTTAACTAAGCTACCCACAGACGCATCACCGGT
TGCATACGCCAACCCATTACTGTTGGATGAACCAAAGCCAGCTTTATTTCCTGTAGCGTA
CTCTTGAGATGCAATGAAGTTAGAGTCCAATGCGTCGGCTTTTGTGAGGAATCCATCTTG
AATTCCTACCAAATTGTTGAGGGAAGCACCAGATACTAGACTTTGGTGCGCAGCGATGTT
GACCGAGTCCGCTGTTTGACCGCGGAATCCTGCAGCTCCTGTAAGAATAGCCGCAGAGAA
TCCATGAGCCTCCGCTTCGTATCTGGCGATGTTTCCACAAGCAGGTACCAACCATGGCCA
GTCGCATTTAAGCTTGTCAGCGTCGAAGCCAAGTCCGAAGGGACAACGGAACTCATAGGC
CGTCAGCGGAGCTTTGCCGTGGTCCAGACACGCGAAGAACCAGCGACAATTTTCAGGGTC
TGCGTAGTAACCTTCCCTCTCAGGACATATGAACCTGGTGTGTGGTACGGGCGCTATCTC
CGAGGATCCTGGACAGGCGTGCGAGTCGGGCAGGCTGCCGGGCCACACGCACACCTCGTA
GCGGGAGTCGAACGCGAGACCGGCTGGACAATCGAACTCGAATACAGTAAATTCCGGTGA
AAGCTGGTCGAACTTCACGCATCTGTAGAATCGGGCGCAAGAACGAGGATGCACGAAGTA
ACCTTGGCGGGAACAGGAGAACTCTGTACGGGTGTCCTCACGAATAGAGTGTATGACACC
ATCGGAATCCACAACTTGTGTGATACGGTACGGGGACACTTGTAATGCGTCCAGGGCGCG
GTGACTGGGAGCTGATAAAATCTCCTGCTCTAGAGATCTTAAAACAACAGCTCTTGGCGC
TCTGCTCTGCTGGTTCAGTACTTTGGACAAGGAAGCCTTGAGTGTTGGTCCACACGGTGT
CTCCACGTCACGGTCAGCTCGGTTCAGTGCGAGTCCGGCCAATCCTCTTACACGGGCGTA
CTTCCCTTTCACGTCAACTGATGAAGCGTCCTCGAATGACATCCAGGTTTTGCCTTTAAA
AGCGTAAGGCGCTGACAAATCCTGGTCCCTTTCCAAAGTCCATCGTCCCTTCCGAAGCTG
TCTGCAGAGCTCGGCCTGGTCTATTTCCTTGGGCTCGTCCTCCTCAGCAGGACTGCCGGG
AGTACTGAGGGTCTCATTGACGAGGGTAAACTGACGCACGGTTGCTGGAAGACTGACCAC
GATCTTGGAGGCTGGTACTCCTAAACCGATGACTAGGTCTACTACTGAATCGGTATTCAT
CATGTCCCACAACCCACTCAAACGACTAGGATGGTACGTCATCTTCTTCACAAGCCCCAG
AGCATGTGTCTCCACCATCAGCAAATCCGCCTTCTTCACCAAACTCCTCAAGTCATAATA
CTTCGCTAACAGCTCAGGGTGTGCAGGTAAAGCTAAG
(4837 bp)

- SilkBase 1999-2023 -