SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR18230c0_g1_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_glutamine--fructose-6-phosphate_aminotransferase_[isomerizing]_1-like_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0004360 F glutamine-fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing) activity
GO:0005975 P carbohydrate metabolic process
GO:0006002 P fructose 6-phosphate metabolic process
GO:0006042 P glucosamine biosynthetic process
GO:0006047 P UDP-N-acetylglucosamine metabolic process
GO:0006048 P UDP-N-acetylglucosamine biosynthetic process
GO:0006541 P glutamine metabolic process
GO:0009744 P response to sucrose
GO:0016597 F amino acid binding
GO:0016740 F transferase activity
GO:0030246 F carbohydrate binding
GO:0032868 P response to insulin
GO:0032869 P cellular response to insulin stimulus
GO:0032922 P circadian regulation of gene expression
GO:0045719 P negative regulation of glycogen biosynthetic process
GO:0048511 P rhythmic process
GO:0051289 P protein homotetramerization
GO:1901137 P carbohydrate derivative biosynthetic process
Transcript
Level		FPKM:17.73 TPM:17.37
ORF EntryO_TrvaFAMAMG21988_complete:A_TrvaFAMAMG_TR18230c0_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
GTCTTCAACTGATCAGATTGTGTACGGTTAGCCGCTGATATTTATTTTACGTTTTTAAAA
CAAGCTTGATAACGAAACACGATGACGTGTGACTGGCCGTAAGTGAAAGTAAGTTGTAGT
GGAAGGAGCGTTGCGTTTAGGCCTTCAATATTAGTTGTGTATTCGTGCAGTTTCAGTCTC
TCGCGGTCCGTGTTCACAATCGCACAATCCCTGCGTTTACTTTACGATGTGTGGAATATT
TGCTTACATAAATCATTTAACACCCAAGACCCGGCGTGAAATTTTAGATTTGCTCGTAAC
TGGACTTAAACGTTTAGAATACCGTGGGTACGATTCAGCCGGTGTTGCAGTGGATGCTGC
CGACCAGAAAGACATTGCTGTTGTTAAACGAAGCGGTAAAGTAGCCGCGTTAGAAGAATT
ACTACAGGAACGTAGTGCGGAACTGTTGGTTGAAGAATGTTTGGAATCCCACTGTGGAAT
AGCTCACACTCGTTGGGCAACTCACGGAGAACCAAGTGCCGTTAATTCCCATCCTCAACG
GTCTGGAGATGATAATGCCTTTGTCGTCATTCACAATGGAATCATCACCAACTACAAAGA
AGTTAAAACTTTCCTTGAAAACAAGGGGTACATATTTGAATCACAAACAGATACTGAAGC
TATTGCCAAGCTGATTCATCATATATACCATCAACACAAAGAAAACAGCTTCCAAGAATT
AGTTGAGCAGGTAATACAACAACTTGAAGGAGCTTTTGCTTTATGTTTTAAATCTCGATT
CTTTCCAAATGAATGTGTTGCAACTCGCCGTGGAAGCCCCTTATTGGTTGGGATTAAGAC
TCCCCGTAGGCTATCCAGTGATCATGTCCCAATCATGTACACTAACAACAAAGCTACTAG
AGGTGTGGTAGCTGGTGTGCCCAGAGTCAACAGCCATGCTCACTTTGAACCAGAGGAAGA
GAGGGATGTAGAATACTTCTTTGCTTCTGATGCATCTGCTGTAATTGAACATACCAACAG
GGTCCTATATTTTGAAGATGATGATGTTGCTCACATTAAGGATGGTGTTCTGAGTATCCA
TCGTATGTCCAGTAGCAGTAATGATCCTCATGAAAGAGAAATCTTTACTTTGAAACTGGA
GCTTCAACAAATAATGAAAGGAAACTATGAATATTTCATGCAGAAGGAAATCTTTGAACA
GCCTGAATCTATTGTAAACACCATGAGAGGTAGACTTAATTTTGCAAATGGTACTGTCAC
ATTGGGAGGAATCAAAGATTACATCCCAGAAATCAAGAGATGCAGAAGGCTCATGTTAAT
AGGATGTGGTACTAGTTACCACAGTGCTGTAGCAACCAGACAGCTATTAGAAGAATTAAC
AGAGTTACCAGTGATGGTGGAGCTGGCTTCTGACTTTTTAGACAGAAACACCCCTGTATT
TAGGGATGATGTATGTTTCTTCATCTCTCAGTCAGGCGAAACTGCTGACACACTTATGGC
CCTGCGATACTGTAAACGTCATGGTGCCCTTATTGTTGGTATAACAAATACTGTTGGTAG
CTCCATATGTCGTGAATCACACTGTGGTGTTCACATCAATGCCGGTCCTGAAATAGGTGT
GGCTTCTACTAAGGCATACACTTCTCAATTTGTTTCATTAGTTATGTTTGCACTAGTAAT
TAGTGAAGATAGAATTTCACTTCAAAAACGAAGAGCTGATATTATAGAAGGACTACATGA
ATTAGATACTAAAATTCGCCAAGTTCTAGCTTTAGATGAGGAAGTAAAGGGCTTAGCTCA
AGATCTTTACCGCCAGAGATCACTGTTAATCATGGGTAGAGGTTATAACTTTGCAACTTG
TCTAGAAGGTGCATTAAAGGTCAAAGAGTTGACATACATGCACAGTGAAGGAATAATGGC
AGGTGAACTAAAACATGGTCCTCTAGCCCTGATAGATGATTCAATGCCTGTCATGATGAT
TGTGATGCGTGATCCAGTCTATATAAAGTGTATGAATGCTCTGCAACAAGTGACAGCACG
CCAAGGTCGTCCTATCGTTGTTTGTGAGGAGGGAGACACGGAAACAATGTCACTGGCTTC
CAGGAGTCTCCAAGTGCCGAAAACCGTTGATTGTTTACAAGGTGTCTTGACAGTTATCCC
TATGCAACTTCTTGCCTATCACATCGCTGTTTTGCGTGGATGCAATGTTGACTGTCCGCG
CAATCTCGCAAAATCTGTCACAGTTGAATAAAATACACTTTTTGTAGTGTCATGATCATG
GAAAATGCGAAATAATGGTGATTTCATGACCTTTTTATAATGATACCTGTAGCTATAGGT
ATGGCACTTAAATTACTATTCCTACAAGAGGTACTACTTGGAGACTGAAATTTCCAATTC
CTTGTTCAATCCTTTAAAATTCATCATTTCCCAGGAATAGTTCTTATTTTTCATTCCTGT
TGTGTATCTATCTATAATATTTTAAGAAGATTTATTTACACATTTAAAATACTATTTTCT
GTCTTTAGCAACATTCCTATAAATATCTTCTACTAATTTATTTATATTCCCAGCTTTACA
TTCCATTATCAATTCTGCGCTCGGTATGAAGTTGGTGTTTTCAAGGTCAAACCTCTCATT
TTTGTGTAACCTGTTCACATTAATGTTAATAAAGTCTGATCACATTATGAAACAAAACTT
TAGATATTTTAACAGGGAAAAACCTAAAATGATGATGCTAATTTCTGAAATTTACAAATA
AGGGCTAGTTCATTTGTGTATAATAATTATTATCCATAATAATACTATCGTTATCGTAAT
GGAAACGAAAAAAGTACCTTGTTCAAATATACCGACTGATCTGATAAGTAGTTTGCGGAA
AATGTTTATCTATATCACTTTAATAACGGCGACGTAAAATTAAAATCTTCGCAGAAATCA
CAAAATTCATTGTAATCAGTGTTACCGGATTGGTATTACATATTTGAAAAACAATGTATA
AAACTACAGACATCACAATGAAGAGATTGAATCGATTGTAGGCAAGAGATTGTAATATAT
TTTTAGATTTTTATAAAAATCTAGATGGTAATCTAACTGACTTCTGTATTGTAAATTTAT
AATAATTTTATTACGAATAAGCTATCGATACAAATATGTATTGTGTGCTAGGTATAAACT
GTACGATAAGGTTTATATTTTTTATACTTAAAAATCTAAACATGACAAAACCTTCAGCAT
AAGTAGTAGAAATTAAAAACCAACATTCTCAAGAATCTGTGAACGATTATTCTTAATGAA
TTAAGTATATGTACCTTCATAAACAATTTACAACGCTGTTTATTAATCTTTTACAATGTT
TTTGTATTTTTTTCCAATAACCATTCAAGAAAGTTACCTAAATAATAATAACTTGTTTGG
TAATATTTGTCTTACACCTCTTAATGCGTTTATTTATTAATTAACCGCTACGACTCGCTG
AAGTTTTATTCCAGATTAAATCTTTATTTACAGTTTATTTTGTAGTTAAGTACTTATTAA
GGCTGTTGTATAAAACGTCCTTTATCCCAAATGAGAAGCACAAGTAAACTCTGATGGTGT
AATTTTTGTTATATGCTATAAATTATCAGAATATACTTGGTAATTCTCGAAAAAATTTGG
TTGTTTTTAAAACTGGTTATTGTAATGATAGAAACCAATGTTAATTAATAGTGATTAAGT
TGTTATTTTAATGACGAAATGATAGCATCGTTATTGTCATTTTGTCACATCGCATCGGCA
ATATTATTTAAATTCGACACACATATGCTACGTAAGTTTGAGATTGATATCATCTGTATC
GAATTTATTATAAAAATTCATTTTATCTTAAAATGTACTTAGTCTATGAAAAAAATGGTT
TCTATGTTAACCACGAAATTAAACAATTAAAAATGTCATGATCTTCATAATTTTCAGATT
CAAATCGATTCTGAAGAGACGCGCTGATACGCAGAATATTAAACTTATTCTCACAAATGA
ATAATGAAGTTAGATTTTTAAAACATATATCTTTAATGTATTTGCAAATATATCTATTAC
ATACTTAATTTCATTATTAACATTCGTACATTTAATTAGTACGAAGAAATCGTTAAATTA
CCACTTAATCTTAATTATTATGTACGTCCAAGATACATGGATAATTATAATGAATTGCTT
GTTACTAGATTATCATTCTTAATCTAAGACCTTAGCTTAACACTAGTCAAAATTTAATTA
ACTTTACGTTGGTGAATAATTAATTATATACTTATTTTGATCAGTAAGTATAACGGTCAA
CGTCAGAAAATAAACCTATTTGACGATACCTAATTATTGAAGGTATGTCAATTTCAAAAG
ATGGTAATTACATAATTATTGAATTTTTAAAATAGTTCCTATACTTGAAATAGTTTATAG
TACACATCGGCTACTGGATATTTTTTAAATGACACGTATTTTTTTTTATATTAAATTTCT
TACTAAAAATAATAAAAAAAAAGAGTAGATGAACCTTGTGCCAGCTGAAGTGGGGTGAAT
GACCTGTCGAAATACAACTTAGAACCACTTTTATTTTTGGAATCGGTTAATTTTCCAATG
TCATATGGTGTATGTACGTTCTATCATTGCAAACTTTTTACTTCAACTGACATAAGGTTA
CTTACTGTTCCACCCTGTATAGAAAATCTGGCGAGAATTATAATAAATTGTGATAATTTA
AACTCTAGATAATTTGTTTTAAAGTACTACTTATTATTTTAAATGTCTTAGGATTAACTT
TAGTGGATAGATAATATTATTTTATATTCTTCTTTTTTTTACGCTAATAGCATTTTGGTG
TATATGTGCAAATATCAACACTAAAAATATAATATTATGATAAGATTCATTTAAGTCTTC
TATTATATTGGAATGGCTTGAAATTTGCACAAATACCTGTCAGTACTTAGTAAGTACCTT
ACATAAAAATAGATATGCAATCAAAAAGGATCTGTAAAACAGAATTGTGGCAATGGTTAA
GTTTTATTATAGTTATTTTTCATATTTTATATCTTTAATATATATTATAGAGCTTTTATT
ATAAAAAAAA
(5110 bp)

- SilkBase 1999-2023 -