SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR17702c0_g1_i2
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_tectonin_beta-propeller_repeat-containing_protein_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000421 C autophagosome membrane
GO:0003674 F molecular_function
GO:0005575 C cellular_component
GO:0005765 C lysosomal membrane
GO:0007031 P peroxisome organization
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0030246 F carbohydrate binding
GO:0032266 F phosphatidylinositol-3-phosphate binding
GO:0097352 P autophagosome maturation
Transcript
Level		FPKM:4.20 TPM:4.11
ORF EntryO_TrvaFAMAMG21472_complete:A_TrvaFAMAMG_TR17702c0_g1_i2
Sequence
(Nucleotide)
GGAAAATGAAAAAGTTACGAATCACATTCCGAATTTTTTATTAATAACAATAATTGTTCT
GTATTGCATTGTATTTGTTTAAAAATTTGGGCCTTCTTATAATTCAATTTATAATGAATG
TATAACAATAAAACTAGTGAAATTTTTGAAATGGAACTTTACCTAAAGATTAGCCTGAAG
ACCCAAAACCATTGCTGAAATACTACATACATACACTACAATACTACTAAGAAAACAAAC
TCGTACTTTTCCAGATGTAACAAAAAAGTTAGTTTCCGATTAGTTTCATGAAAAATGAGT
GCTAACTCGCTATTGTTTTCATTAAATAATGAAGGTAAAGTTTACGCGTTGTCAACAAAT
GGATCGTGTTGGCGTGAATTTATGTACTTGGGCTTGGAATTCAAAGCTTTATCTGCGGTT
CCTCATTTCCTTTGGGCTGTTGGCGGAGACAGACAGATATATCTTCATGTGCATGGCTTG
GAGATACCAATTCGTGTAAAAGAAGAATCTTATGAGAATGAGAGATGGCTACCGATGGAG
GGTTTCAGTGGACGATTGTTACCAACAGATCGTTATCACTTCTCATCTCAAGATGGTACA
AAAGACAGATCCATTGAACATATAAGACTACCATCAATGGCTTGGCAGTGGGAAGGACCA
TGGCAATTGGAATTGACGTTAGATGGGCAACCATTAGATCATGATGGTTGGACATATGCT
GTAGATTTTCCGGCTCAGTTTGGTCCATCTAAACAATGGAAATCATGTGTAAGAAGAAGG
AAATGGATAAGGTACAGAAAATTTAGTGCTATGAATTCATGGTGTGCAATAGCTCCTTTA
CACAAAGATCCTACTCAAGAACCATTTATTGATGTAAGTATAGGAGGTAACCAAATGCCG
TATGCTTCACCAGGATCATTAGTTGTATGGTCTATTACTGCTCAAGGTCGAGTTATGTTT
AGAAATGGTGTAAGTACAACCTCACCTGAGGGTTTGAAGTGGATAAACGTAAGTATTCCA
CCAAACTGTGATATTAAACAAATATCAGTAGGGCCAACTGGATTAGTTTGGGGTTTACTT
TGGACTGGACGCACTCTTGTAAGAAAAGGAATAACAAAAGATTGTCCTTCAGGAGATTCA
TGGTTAGAAGTGAAACCGCCACAAGATACAAAACTTACTTGTATAGCAGTAGGATTTAAT
GTTGTATGGGCTATAAGCTCTGATTCAAGAGTATGGTTTCGAAAAGGCATTGATGGATCA
AATTCTGGAACTTCTGAGTCTGCTGCTATGGGAAGTGGATGGTTAGAAATCACTGGAAAC
ATGATTCATGTTTCAGTTGGTATGAATGATCAAGTTTTTGCAATTGGAGAATTTGATAAA
TGTGTTTACTGGAGAAGTGGGACTACTGCAGCAGAATCAACAGGAAAGCAATGGAAAAAA
ATTCAAGCAAACATGCAGCTAAGTCGTACTTCTAGCTCAGCAAGTGTGATCTCATCATCT
TCAAACACTAAACATCATAGTCTAAATACATTGAATGAGAGTGAACCAGAAAAAAAAACT
AATAAACATTTAAGGAATTCTTGGGAAGAATCTCATTCTGCTCCAATAGAACATACACTC
CCAGTTAAACCACAAAGACAATCAAGACCACGCAGCCAGATAAATACAGGAAACATTGAT
ATGACTGGTAAGAGTTATGAAACTACCTTAAAAAATCCTAGAGCTTGGAGCCCTGTGAGA
AGTGTTGGTTCAGTAGTGGGTATGGAAGCTCAACCAGATAGTGACAGTAGTGTGTTTGAC
ATAGACTCTGGGATGTTTTTTGATGATGAAATAAGTCAAACTGCCTGGGGATCCTGTGAG
ACAACATGGTCATATGTTGAAGCTGGAGCTTGTCTAGTTGATGTTGTGCAGGTACCACAT
TGGTTTACAGATTCTCATAAAACACAGAATTTTGATATCACAGCTGAATGGAGGCTAAAT
ATTTTAGATCATTTAAAGAATAGAAACAAATACCAAAGCTTAGATTTATCAAGTTATGGA
ATTGCTGTGGAAGAGAAGGGTTGGACACGAAGTTGTGAAGCCAGGTTAGTTCAAGCCAAC
AATAATACTGAAGAATGCATTATTTCATTGTATTGGCATGATCTGGAAAATACTGGAACA
CTCTCAGTTTTCCAACCAGATGGGACTATTAAATTCATTTTAAACCTTGCCGAAGTAACT
AGTGTATTTGTAGCATCAGAACCTGGTTGCCCAAGAATAGTTCTTGCTGTACCACGACAA
AATGAAAGTTCAATTAAAGTACAATTCATGACAGAAGTTGAACAAGAAGAATGGGTGAAA
ATGTTACTTGATATAACTTCACAAATCAACAGTGTGACTGGAAAACCGTCACCAAATTCA
GTCTGGGCCATTACCAATGCAGGTGACATACTTAATTGGGATCCTTTACCTGCTAAGTTA
AGTAATGAAAAGGATGGAATGTACAAAAAGGAGTTTACAGTTTTTGGAAAAGATATTTTA
TCTGGTTATTCAACTAGTCTACATAATAACTTTCCATCTGGAAGTATTTTAAAGATTGTA
GGTTGTTTATTTGATGACGTAAAAAGATTTTATATAGATTTCACCGGGCCTGAAGTAAAA
AAACAAAAACATAAAATTGAAACTGAGGTTTCTGAAATTCCTTTTCATTTTAATGTCAGG
TTTGATGAAAAAGTTGTAGTTTGCAACACCAAAATATTTGGTAATTGGGGAAATGAAGAA
CGACATGAACTACCGTTGGTTGTGGGACAGGAATTCTGTATAGAAATATATTGCCATGCA
CAGGCATTTAGTATTATAGTTAATGGAAAAAGTTTCTGTATTTACGAACACAGACTCAAT
CCAGAGAATATCATCAGCGTTACAATACAAGGTCCCATGAAGCTTTTCAACTTGGAATAT
TACACTACAAGTGTAATTATAGGTGCCGATGAAATGTTTTGGCGTTTGATGGGTGGACAT
TTACGTCGTGTCGAGTGTTGTGAAGCTGACGTTGTATGGGGAATATCACATGATCACAGA
GCTTGGGTGTATACAGGGGGATGGGGAGGAGGAATATTCCAAGGAATTTCGAGTAATACT
GGTATACACACAATGACAGACACACATACTTATTGCGTGTATGAAAATCAACGTTGGAAT
CCTCTTACTGGTTATACTTCTACTGGCTTACCGACTGATCGTTACATGTGGAGTGATGTA
ACGGGAAAACACAAAAGAACTAGAGAACACACAAAATTGCTCAATCGACATTGGCACTGG
ATATCTGAATGGATGGTGGATTACAATACTCCTGGAGGTGTAGACAATGAAGGTTGGCAG
TATGCAACTGACTTTCCAGCACCATATCATGGGAAGAAATTGTTCACAGACTGTGTAAGG
AGACGAAGATGGTATAGAAAAGCACAAATAAATACAGAAGGCCCTTGGAGTCGCGCCGGT
AATACTGCTTTATTGGATATTTCACTATGGGCAAATGGCGATGAAGTGTATGTTTGGGCA
ATCACAGTAGCTGGAGACGCTATTTACAGAACGGGAGTAACACCGGCAACTCCTGCGGGT
ACTTCTTGGGAACATATTGACAGCCCTCAAGTACTTATAGCTATTAGTATTTATAACAAC
ATAGTCTGGACTATTGGAAGGAAGGGCGAATTATACTATAGAGAAGGTATTGATCCAGAT
AATCCAGGAGGAAAAACCTGGAAATTAATAGAACCACCAAAGAGTCATTTATACAGTCAC
AAAACTACTACTGCTAAATTAGTGTCATTGGCGACAGCAGTGGCTTGGGTTATATTATCA
AACGGTGCTGTTGCTGTGAGAACACAAATATCTAAAGAACACCCAGGCGGTAAAGAATGG
AAATACCTAACAGATTCTGATATAAGCTTGAAACATATATCAAGTGCTCACAAAGACGTG
TGGGCTGTAAGTTCGGACGGGACCCTGCAGCGGCGGCTCGGCGTCACCGCGGAGAACCCC
ACCGGCTCCTCGTGGCAACGCGTGCTCAGCGCCGCCGCCCTCTACACCACCGCCCGGGGA
GGCGCGCTCTCTTAAATACGTGCAGGTGTTTGTTTCTACGCTTGCTATTTGAGACTATAT
TACGGTAAACTTGGTTAAACAAACACAAAACCTAACTTACCTACACAATTACTAAACGGG
TTCTTACCACGATTTGTTTTAAAGGAGCGATCCTGGTATTTCAGCTCTGTTGCCAGCGCC
ATGATCACGGTAAAACTGATTACTGCGGGTATGTTAATAAAAATCGTGGTAAGAACCCGT
TTACTAATTGTGTAAGTGATGTAGATAACCGCGAGTGTTTAATGAAAGTTACAAAATAGG
CATTTATTTTTAAGAAAATACTATAAAACATTCCATTCGGTGATGAAAAGTCATACCACC
ATATAAAAACAATTTATTTTTTACTTTTCGAATATTTTTTTCCCTTTTTTTGTATTTAGG
GTATATTTGTGATATTATTAGAATACTTATAATTATTTATTATTTCAGAAAGCATTAAAA
TTCAAATTTATTTCGTAATCTCTAATTATTTATTTGGCAATACTTAAATATAATTTATTT
TAATACAGCCCGTGATCTTGTAACCTGTATCAACTTCTATATAACAAGATTGTTTTTTGA
ATAAAAGCCATGGGCAGGACCAGCTTAATCTTCAACTTAATGCAATTATATTCACTTACA
TAACAGATATCATGTATAAGAAATTGAACTTTAAAGCCATTATTCAGTTGATGAATGATA
ACGTGAGCGCACATCTGACTTTATATAGTTGTAAAGAATCCAGTCACAACCGAACGAATC
TTAATATTATCGAAAGTGGCAACTATGATGCAATTTATTATTTCAATTGGTTATAAGAGT
TATTAAATCATTATTTTATTTAATGGTGAATCACTAAAAAAATAAGATGTTTCAGTCTAA
ACTACAGTATTATGAAAGCCAAGATTTTATGAGAATTGGAACAGTTTTTTTAATTGTTTT
AGTGAATGATAATTATTATTATCGTTGTTTAAAATGTAGAAAGTAGTCCTTAAGCACAAT
TATTTTAAAGTGAATCAAATTTTCAAACACCTCAGTATAGCAATTAGAGGCTTATGCTAT
GAAAAAATGTGATTATATTTTTATGATTTACTGCCATGATATGACTTTATAACTATTGTA
ATTTAATATGTAAAATTCAACTTTCTAATATAATTTTAATAAACTAATATGAATATGTGC
ACAATGTCCAAACTGTAACTGTCCTACTCTGAAGCTTATGTACTTTTTCTTAATGATACA
GATCGAAAACAAATTAAGTATTATAAAACTAGTAGTAAAAATAAAGCTGCTTTAGTAAAT
GAAACTTGATAATTCCAACCTGCCGCCTAGTTTCAGTCCGAAACTTATAAGTGTTGTTTG
AACAACAAAATCCATATTTTGTTACATGAAGTTTCTCCTCAATGTTGTACGTTGAGTCAT
TCAAAAAGCCCACCTTCAGACCCGTGTCATAAAAGTTTTGGCAGAAACCGCAACTAGAGG
TATATATTTTTGGCCGAAATTAATACCTTTGGTCGATCACTTTAGACTTGACTTTCCCCA
GAAGTTATAATTTACAGTGAATTATTTACACATTGTAACAGATATTCGTTCCAAATTATA
ATAAATCTTAATTAATTGTATTTACTATTTTTACCAATGATGCTCATTTATTTAAAGAAT
AATGTTTTTAGTGATATTAAAAGACATACCTATATATTTCTAGTCATTTGTAATTTTAAC
TGTATTTAAAAAAAAAAGTAAGGTCAAGAATCAAGATTCGCTTTTGCTTGAATTGTATAA
TTTCTATAAAATATACGAGATATGAAGAAAAAAAAAAAAA
(5920 bp)

- SilkBase 1999-2023 -