SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR17697c1_g3_i3
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_voltage-dependent_calcium_channel_subunit_alpha-2/delta-3_isoform_X3_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003747 F translation release factor activity
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005739 C mitochondrion
GO:0006412 P translation
GO:0006415 P translational termination
GO:0016149 F translation release factor activity, codon specific
GO:0043022 F ribosome binding
GO:0070126 P mitochondrial translational termination
Transcript
Level		FPKM:0.38 TPM:0.37
ORF EntryO_TrvaFAMAMG21409_complete:A_TrvaFAMAMG_TR17697c1_g3_i3
Sequence
(Nucleotide)
ACCCAAAAATCTAATAATTGTTACATAAAATAAATAATAACTTTGAAAATATCGAAATAA
AATGTCGATTCCGAAATTACTTTTTATTAGATCATTATTAAAATACGAGAGGCAGTTAAT
CAATTTTCGTAGGAATTATTCACAGAATGGTGTAAATCTTTCTGATCCGGCTATTCAAAC
ATACTTAAAACATTTAATGTTAGAACATGAAAATCTACACACAAAAACAAAGCGATCGTC
GGAGGAATCAAGAAGGTTACAGGAAATCAAACCAATCGTGAATGTATTAGAACAGAGAAT
ATCCTTGTACGACAGTATTGAATCCCTCAAAGATTTGAATAAAAAAGAAACCGAAGACAG
TGAAATGAAAAAGATGATAAAAGAAGAAGCAGCAATTTACTTGAAACGATTAAAAGAAAT
TGATAACGATCTGGAATCAATTTTACTGGAACCAACAATAACTGATGGTGGAGTATTATT
AGAGGTGGCAGCAGGCGCAGGAGGCCAGGAAGCCATGTTATTTGCTAAAGAACTCTTTCA
AATGTACGAATCTTACTCAAAAAACAAAGGTTGGGAAGTTGACATAGCATCATTTGACTT
GACCGAGTTAGGTGGTGTTCGTAAAGCATCCATGCTCATACAAGGCTTCGGAGTACCTGA
ACTAATGAGGATGGAAGGCGGAGTACATCGTGTTCAAAGAATTCCAACCACTGAGAAAGG
TGGACGAATTCATACTAGCACAGTATCTGTGGCTGTCTTACCACAGCCTTCAGAAATAGA
ACTAGACATATCTGAGAGAGATTTAGTAATAGAAACAAAGAGGGCCAGTGGTGCTGGCGG
TCAGCATGTGAACACTACAGACAGTGCCGTGAGAATCATTCATACTCCAACAGGTACAGT
GGTAGAGTGCCAAGAGGGACGATCACAAATAAAAAACAAACAAATTGCGATACAAAAACT
GAGGACTCTGCTACTGGAGAAACAAATACAGGAACAATCATCAAAACTTCAAAATGAAAG
GAAGTCACAGATGGGCTCCGGCAACAGAAATGAAAAAATAAGAACATACAACTACCCTCA
AGATAGAATAACTGAACACAGAGATGGAGGTGGAACATTTCATAATCTAAAAGGGTTCAT
GGAAGGAGGAGAACAATTAGAAAAACTGCAGGAGTCACTTTTGAAAATGGAAAGACAAAA
AGTTGTTTTGGAAGAGATTGAGGAATTCTTAAAGAAGTATAAAACTGAGAGTAACTGATA
TTGATTGTAATAGATGCTGTTGACTATTTTTATTGTTGTTTAGTTTCCACCTATAATCAT
TTGAGATTTATTTGTGTTACTGAATTTCAACAATGGAAAATTGAAAAATTGTGAGTAATA
TTCTATTGTTACATGAGATAGTAAATTAATAAAACTAATATGAATAGAGACAATATTTAT
TTTGTACCAAACAAACAATCACAATTTAAGAAAAGGGTACATCTAAATTACACATACACA
AAGAAATAAAATGCCAAAAGATTCAGAACATTTAATTCTAGATAACAGGAACAGAAATTT
TCAAACTATATTACTAACAATAGACAGTAATTGTTTAATTTTAATAAAAGATTTTCACCA
TGTTTTTGTAGGTTATGTATCTATAAAACAAAATTAGAACTATTGATTGCACTCTAGCAA
ACCTATATATGACTAAAGAGCCTAATTTTTATTTAAAACTTACTGCAAAGTATAACATGA
ATAAAATTTAATATTATAAGTTAATAGAGCAGTTTAGAAGTAACATTGTAAAATAGAACG
CTATCTGTTAGATTGTAAATAAACTATTACTTTTATCTCCATCCAATAAAATTATAAGGA
CGGTAGTTTCAAGAATGAAACAATCCTTTCCATTCTATATTTAAATATTTGATTTAAAAA
GCATTTGTTTTACAAAAGCTACTCATATAATCTTATTTTACTTACGAATAATGAAACTTA
ACAAGTAAATAAAATTTAAAGTTAATGTTTGATATGAATGTTTTATTCTTTTCATAATGG
GGATTTATCGTGGCACCGCTGTGGCGTAAATCTACGATTGAACCCAAATCATTTATAATT
AAAAAGACAACAATTAAAATTGATATGTGGTTATGACATGTATGTACATTTTAACTATTA
AAATTTAAATTATTTTAATTTTATTGCCATTCTTGGGCTTACAAGCTCAATGCTTGTCTT
GTGTGGTAAGAGAAGATTTAATAATATTTGTAGAGTGTATTGTCAATATTTAAAACTAAT
TATTATTGTACTTTACGTAAATAAATAGCAGTCGTATTATAAATTACTTTTTCCCGCGTT
TTTCTATTGAGTCTATACCGTCACCACGATGGTGACCAATGTTAGGTATCACATGTTAAT
TATGTACCTACCTATATACTTTTTTATTTTAAAGATTAATTAAGAAAAAACTTTAATTGA
TAAAAATTTCAAGTCGCCAATATTTGCCAAGAAATATTAAAATTAGGAAATTGTGTAGCT
ACCTTTAATATTTCTTTTATACAAAATGATATGTTATAAAAATGCTAAATATTATCCACA
ATAAATTGGAGCGATGTAGGGCTCCTCTTCCACACATGTCTATGTTGCTCTCCTCTGTAT
GATTTCTGATGCACGACGTAGGCTGTTTCCTATAAAGCGGGTGCATGTGTTTCAGACACG
GCAACGATTCATTGTACTGGACTTCCGTAGCTTCTATAAACGTCGTCGACACTTCTTCCT
TAGGGCAGCTCGCGTCCACCACTATCATCAGCATATTTGTGTAGTTCACCAATTGAACAT
AATACGGTCTTTCGCAATCTCTGACCGGCTTGTTCAATTTAGCGTCCAAATTGTTGTAGT
CAAGTTGGTAGAGGAACATTTCTCTGTCGCAAGGTGTTGGTCTTGTTCTGTTAATTAATA
CCAGTTTCTCAAAATCCCTCTCCAAGGTTCGCATGTTAGTTGGCTTGGACATGTAAGCGT
CATCATTTTCTTCGTCGTTCTCATAGCTTTGATACGCCACATCATCGAACGAGTAACTGG
AAGCTTGCCCAAATGCCGTAGTAATCGAGTTGTAAAACCATACACTCGAAGTGATCAACC
ATGACATAATGATCCTCAAATTTTCTAAAGGAGTCATTAATGTGGAAGCAGGATTCGTGG
TTTTCTTTTCTCGGAAACAAACAGCTTGGTAGTCAACAATATGAACAGTCTTGTAAATCT
CATCTTCGATCAGCCTCATCATTATATCGGGTCGAATTCTTCCAAAGAATTGTCCTAGTT
GATTTGAGTCCTCGCTGACGATGATCCAGCCGTTGTTGTCGACGAGGTAACAGTCCCATA
CGTCAGAGAGACATGTCACACATTCCTTGTTATGTTCACACGACGATGTTATATTTTCAA
ACCATTCTGTAAGGCGTTCGTGTTTGAACTGAAAGCCGACGACAGCTGCTGGTGCTTTCT
TGTGACCATCGCCGTGAAACACAGCGTGAGAAGCCGTCACTACAGCTGAACTGGCGTTCA
ATGGAAACTTGTCTGTGTTTAGCTCAACACTGTACACGTAGCTCAGCGGATCCACGTAAT
GCTGTTCAACAGCTCTTCGATACCACACTTCATCTATCGAACGAGGCCATTGCTTGCCGA
ATTCCATCCTGAAGTTTATGTCACACGATTCTTCGGTAAATTTAATGTTTTAGGAATTAA
ATGCCACATAAATCCACTAGTTACATGCAACACATTCACCTGTTCTCGGGGAAAAAATTG
TCCCCACGGCAAACTAATTTTCTAAGAGATTTTATCTCAGTTAATTCTCTACTGATATCA
CAACCCCAAATCAATGAAAAGACATCTACCTAAGCGCCATTCCCGTTATTTTCATCGATT
TTAATCTAGCTTCTAATTCCATGCATCATTGGAACAGTACAAAACATTTAGGTCACACTT
CCCAAAAATAAATAACGTCAGTTTCCACCACAATCCATGCACCACTAGAGATCTCAACTA
ACAAATTTAAGTCCTAGGTTTTACCTACCCTCTTGCTACAAAGGACTGGAATTTGATTAC
GCAGTTTACGCTTTTTCCCTTTGTATGGTAGTTTTTCGAAAATAAAAAATCTATTAAATA
CTGATTCCTACAAAGAATTCTATCCACGCCATACAGTGAGCGTAAATGTGAGCACTCGAT
CACAGTTTTTCTAATATATCTATCAACTATGAAGCTTTACTATGTCACCTATCGTCATGT
TCCCTCGGCGGATGTGTTTGCCATCGAGTCAATCCACTGTGAGTTGATAGAAATGCCACG
ATGTATCCAAAACGCTGAATGAACTCAGACGCTTTTTCATCTGAAGCTGAATCTGAAATG
CTCTTATTGAACCATGCTGTATTTCTGGCGTCATATACTAGAGCTTGCATCAAGCCATGA
TCACAGTAATATTCATTCCTGGGAGTACTATTGGTCACTTTATTGCGATCTTTAGTTTCA
GGAGTTCCACTATGTCTTTCGTGTCCCTGTTTATTCTTGTGATGTTCTGGAGGTCTTGGC
TTCGCAGGCCATCTCCATCCTGGCTTAGCGACTCTTTCCAAAAAGTAAAGCAGCTCTTCT
TCAGGCGACGAAAATGTGCGATCGTAGTGCCGACAGTAAAGCCAGTCAGGATGAACGCTC
CATTTATCAGACAAGTACTGACGAGCCGAAATGTTTTTGGATGTGAGAGACAAACGATGG
ATATCATCGGTTGGAGGAGGGGTGATCCGATGACGACCGTAGTTCTCCGGAATCGTGACC
ACTAGAGTGAACGGTGAATCGCTGATGCCCGTCCAGAAGTAGTGTTTCTTCGCACGAGAC
ACTCTTTTCATGTCGTCCAAGTGATATTTCACATTCATCACCTTATTGCCTGTCTTTTGA
TCAATAATTTCTTTACGGAGCGCTGTTAACTCTTTGCTGAAATTTCTTGGTCCTCTATCG
TCGTCAAACAATTCAACTTCAATCATGTCGACGCTGTTGTAACTCGGTTTTAATATTTGT
TGAAACACTGGACGCAGATCAGGGTGTAATAAAATATATCCATTGTTGGTGACGATGAAA
GCGTAGCCGTTAACTCCAATCTTGTATGGTGTCATAAGAGCTTGGATTTCTGATAATGGA
ACGTCTGTGCCAGCTACTCCCAACAATTTAGCAATACGCATCTATAAAATTTTGCAATGA
ATTTTAATATCCAGCATAAATAGACATCTCAATTAAATAAATTTACTAAGTTTTAATATC
AATATTTTATGGTTAATATTAAGTTATGTACTATATTAAAATTATTATTAAAAATATAAC
TATAGTCTACTCGATATGATATACTTATTCTACTTTATATTTCATAGTCAAGACATTCAA
AGTTATTGTCGTGTTATAATAATATAAAAAACATACAAATCCACTAGCTACGCAAACGAT
TGGCTGTATTGCCACTTTGTTGCTACAAATTTTCAAATATTTCGTATAAATTGTATTTAT
AAAAACTAGCAATCTTACATTTAGCATCTAAGCCCCGTTAGGAAGTTCCACAGTAGAACT
ATTTTGTATTAGTAGGTAAAATATCATCACACTTTGTCATAGGTTCTAGCAAATCTACGT
GGATGTTGTATAAAGATACAAAACTACTCATCATGTATAGAATATTCTAGAAACCCACTA
CTTTATAGACATTAAAGTACCATTTGTAAATCCGGTTCGTATCTGTCAACATTGGGATGT
TAGAATATGTTAAATCCATTCAGCAAGAATATGTTACAGTATAGAATTTGTATGCGTAGC
TGATGTTCTTGTTTTATCTAACACAGAATCTTATGAGTAATAGTAGAGTTGAGTGCATCC
ATCGCCGTTCACTCGTCACCAGCTTTCATCGTAAACATGTTGAATAATGTGTGAACATCG
CCTACCTCTTTGGGTCCGTTCTCCTCTA
(5968 bp)

- SilkBase 1999-2023 -