SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR17669c2_g2_i2
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_intraflagellar_transport_protein_80_homolog_isoform_X2_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0001649 P osteoblast differentiation
GO:0002062 P chondrocyte differentiation
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005813 C centrosome
GO:0005856 C cytoskeleton
GO:0005929 C cilium
GO:0007224 P smoothened signaling pathway
GO:0030992 C intraciliary transport particle B
GO:0035058 P non-motile cilium assembly
GO:0042384 P cilium assembly
GO:0042995 C cell projection
GO:0045880 P positive regulation of smoothened signaling pathway
GO:0050680 P negative regulation of epithelial cell proliferation
GO:0060271 P cilium assembly
GO:0060349 P bone morphogenesis
GO:0072372 C cilium
GO:0097542 C ciliary tip
GO:2000051 P negative regulation of non-canonical Wnt signaling pathway
Transcript
Level		FPKM:1.75 TPM:1.71
ORF EntryO_TrvaFAMAMG21206_complete:A_TrvaFAMAMG_TR17669c2_g2_i2
Sequence
(Nucleotide)
GCGATGGCTCACGTCATTTAAATAACTGACAAAATTATATAATAATATTCGGTTGTCAAA
TTTATTTAGAAAAAATTAAAAAAAAAACGTGAACCAAACTCAACATTACCTCTTGAAAAT
ATTGTACTAAAAACTATGTACTTTTTAAAGTGGGATAATAATCTATTTTATGAGCTTGCA
GTCAACTTGATTAAATAATATCTTATACATAACAACGTTTTTAAATGTAATTTAAATACA
AAACAGACATCACACAACGTTCGATTTTAAAACTTATAAAGAGACATTGGAAATAATATC
GCATTAAGCGTATATCACATTCATTCAGAACATTAAAAATAATAACTCTATCTAATCATC
TCTTGTTAGTATCCTTAATGAAAAATAGACCTAACTTAAAAATAAAACTTCTCGACTTCT
CACAAACTTGATCATATCATGTTTACCAATTTATTCAATTTTACCAAATAAAGAGCCCGG
AACTAAATTTAAATTGTTAGAAGATTCGTCTGAATTATTGAAGTAAATTTAAATAAGGTA
GTGCTTTTAATTTATTAGCCAAATTGTTCCGTAAAAATAAATCATTAATTTTTTTTTTTT
AAATTATATCCTTAGTTTAAAAAAAAACTTTCCTATTGCATATTTTGAATGTCCGCATTA
ATTAGTGAATACATAATTAAATTAAAAATACGCCGTATACAAAATTACAATTTGGTAAGT
TCTACACAAAATTATAATGCTTCTAAATTGTACCATCACTAGGCTACACAACATATGTAC
TACACAGTACACAACAATACATAATACACTACACAACACATTTGACTATCAATCAAGATC
AAAACCGACTATACTATCTAAATGGTAATCGAATATTTTAAAATCATACGTATACAGTTT
GTACAGCCTCCGTATCAAAGGTAGGTCGAGCTGCGAGTAATATTTGTGTAGTTTCTGTGC
TGTTCCCGAAGTACTGGATAATCTTGGAAAGTGTACTTGGGTTACGTTGATCGTGTGGAG
AGCTAAGAGCACATCGTCTAGGAGAGTCTCGTATTTACCAATCAGCGTGTATTTGATGTG
ACACGGATGACACAAGTCTGTTATCGGCTGCCAGTGTTCATTATTGACAACATCAGCCAA
TTCCTCAGACTTGTTCGTGAGGAACATCGCGAACTCCTTGAAGGTCACGTCGTTTCCGAA
CTCGAGGGACTGGTTCGATGGGTTCTCGCGAAACGTTTTTATGATACGACGGCCGACGTG
TTCTTGAAAATATTGACTAGGCGAATCTCCTTCCAGCTTATTTCTGTACGCAGACAACAG
CCTCTCAAAAGGATTCCTAACAAAGATCATCTTGTGGTAATTGTTCAGTATGTTGTCCCG
TTCCTCTCTATTGACCATGCCCAGGTCCTTGAACATGCCGGGCAGATGTGGTATATGGCC
CGGGATGGACAGTACATCAGTACTGTTCCATTTCCCGGCTAATATCAGCAGGAGTCTCTT
CCAGTTGGTGCAGGCAACCTTCGGAACGTAACAATACAGTAGTTTTCTTTCATCATCCAC
CAGTATATGCCTCAACTGATCTGGATTCAGGTCGTCCAGACTGTAGCTGTATGGGATTCG
TCTGCAGGCCTCTTGAACTAACTCTTGCCGCGCCAAGTTCAAGGACTGGGTCAACTCCAA
CGAATGTCCATTTATCTCGTTATCGTACACACTACCGTTCGAAAACATCACACACAACAA
AAACAAAATAAAACTCTTCTCGTAAGACATTTTCGCACAAAAAGTTTATATTCCGAAACG
TATACTTTCAAAACTTCTTCGCTTGTAATGTAGGGCACGTGTTCATTTACATTATTGTAA
GGTAAATTTACACTTTTAATTTATATTTCACGTTATTGGACGCTCACTTTGTGTTATAAA
AGTTGTACAAATACAAAAATGTTTTCGTAAAAAATCAATCAACCGTGACACGTCCACCAC
GTACAACATGAACAAAATTACTGAATGAAATTTTAAAGCTTTGAACGTAGTGAACGAGAT
TTAGAATGAAGAATTGAATGTAATCTTCGAATGAACGTAAAGGGATTGCGGGTCGTTGGC
CAAGAGCTGCCGAAACTTTTGATTTTTCTATATTATTATCTAACGATTTAATTTTTATTT
ATTAATTTACCAAGCGATATTATTCCATACAATAGCACAAAGCAGCAAAGGTTTAATTTC
GATCAATATTTTAATCACATCCATAGTGGTCTGATAACAAGTAGTGGAAGGAGTCGGGCT
GTTATTAATTTAGTTTTAGTTAATAATAAATTTAATCTGTGTACTGTAAAGGTTTTTGTA
ATAGAAGTTATTGATACACATATTGAATAATTAATAATTTATATGATATATTTGTTTCAT
TTTATAAAAAACATTACTTATTGTAAAAATAATATTATAATGTAAATTTTTGGTATCACT
GCTCAGGAACAGTTTGAAGGTCCTTAGGTCTGTTGCTAAGTTTAGGTAAGTCGATCCGAT
GAATTATTATCATGCGCTTAGCTTTTCTGGTATATTACTTCTTAAATGTTGTATATAGAA
AACTTGATGGTATTGGTGTATTAGAGCAAAGGCTTCTTCAGCTACTGACAATTGATGGTT
TTGCCAAGCTAGAACTGCAAGGCAGGCCCATAATGTTTCATCTTCGACTGTACGACAGAG
CTGCAAAGCAGCCTGCCACATACCCGCGGCTACATGTTTCAGTAATTTTTCTTGGAATGC
AGCGATAGAAACGTGAAAAATAGAACCATTACCCCTACATAAACGTGCAATACCATCTCC
CACACTCAGAATACTGGGATTGCGTCCCAAATCCGTAACTTCCTTGCTTATAGTTGTGAG
AGCTAGCCAGTCTGGTTGAGAAGCTCTGGGGCAACACCAAGCTACAATAGCATTAGCCCG
TAACCCAACCAGCAATTCCGTTTCTGAGCTCCATACTACACTCAATACTTGAGCTCCTAA
TTTCACAAACTTGGGTTTATTTTCTTTGACCGGAACAACGTATAGATCTTTGTTATAGTC
CAACAGAGCCAGTTGCCTGTCGTTTATAGGTCCAGTCTCACTCAAAGCTATGGTTGATAC
TGTCATTTTATGGGTCAGTTTCGTAACAGCATTGTCTGTTGAGCTTCGAACTATGAGACC
AGTCGGAAGGTCGAAAACATGAATCAATTTCCGTTCGTCGCTCTGATCTATAACAGCCAA
TGTATCAGGTCCTAAGGAAACAGACGATTTACCGAAAGCCTCTGGTCTGCCACCGCATCG
AGGACTCGCTAACAACCGCCCCATATAACTATACACTGATATACCAGCTCTTTCTACAAT
GCATAGGCATCTTTCTGAAAGTAAAATCATACTTATAGTGCCTTCTTTTAGATCGAAAGT
GACCGGTGTATTCCAAGAAGTTAGTTTGTGTATAAAACATTGCTTTACTGTCGCTGTAAC
TAAATGGTTGAATCCCAATGCTATCTGTATAACTCTATCTGGATAATCTAATTGATCGTT
TTGTTCAGACATTATGTCTTTGATAGCTATCACCTTTCTACCAATCTGGGTGCATGAGTA
ATTTTTCCACGTGTATTCTCTGTCAATAATATGTGCGAATAGAACTTGGCCATTAGCACA
AGCAGCAGCCACCTGAGTTCCATCCATAGACCAAGCAACGTCATAGATACTACCAGTTGA
TGGACGATCCAAGCAATGAGACCAACCATTAGCATTGCACAAACGAATCAAGTTAAAACT
ACCAACTACAAACATATCTCCAGCTGGTGACCAACTAACGCTCGTAATTGGTTGATCATG
CTTCACGCTCACTGATATGTGCTGACCGAAAGTATCCCAAATCTATTGGAAAGACCGAAT
AAGTAACTGTCAGTATTATTATACAGGGTGTCCCAGAAAGTAGTGATAAGCGGAGGTCCA
GAATTAGAGCATCTCCTACGGTACCCGAATCACGCCCATGTATGTATTTCTGAAATTTTG
AAATGTTGTACCCCAACAACTTTAAATTTAAAGTATAACACTTTTTTTTTTTGGCAACTG
AATCTTCATTAGTAGTGATTTTATGTTTAATATAAATAACTTCATAATTTTCAATTAAAA
TAATGAAAATATTACTGTAAAGTGAAGAAT
(4170 bp)

- SilkBase 1999-2023 -