SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR17649c2_g1_i5
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_UPF0505_protein_C16orf62_isoform_X1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005515 F protein binding
GO:0005768 C endosome
GO:0005769 C early endosome
GO:0006810 P transport
GO:0006893 P Golgi to plasma membrane transport
GO:0015031 P protein transport
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
Transcript
Level		FPKM:3.03 TPM:2.97
ORF EntryO_TrvaFAMAMG21084_complete:A_TrvaFAMAMG_TR17649c2_g1_i5
Sequence
(Nucleotide)
TTTTTTTTATAATTTTATATGATTTATTAAATAAATTATAATAGATGGTTGTACATTATT
CTTTAATCTTAGGTGTAAAATTGCATCGTTCCTTAGATAAATAACTGCTTTTCATATAAG
TCTCGGGCATGTAGGTAGGTACTATTAAACTAGGACTAGAAAACTACAATAAATTGAAAT
ACAAAATAATAGGTACAGAATCATGCAAATCAAGCTTGTGTAAAAGTTTTGTCTAATTCA
AGTAAGTTAAAACGAATAGTTCTAAAGTTTATCTTTTTAAATCTAGACAATTACAATAAT
ATGGAATGTGTTAACATATTTTTTTTTAAATAATCAAATATAAACAATGTGTTTTAGTTT
CAGATCTTAAGCGCTTTGAACACCTTGTTCTAACTTTTCGTATAATTGCCGGTTCACTGG
ATCTTTCGAAGCACGCAACGTCGACAAAATGCTTTTTGCAAATTTATTGTTAGGATCTTG
TATTTTCTTTGCTAGCATCCATAGGTTGACTGCTAAACTGAACATTGAAGGTTGTTCTAA
ATCAGCTCGTTTTATCACGCGCCAAAACAACTCCAGTGTTAGGCTATACTGTTTTTTGGT
TTCCTTATTATCGCCGAGAACTTTCAACACGACGAGTAGTTCCTGACATATATTGGATGC
GTAGTCGTCCAAAACAGAAATGAATTCTTCGTCGCAACCATACAACTTGTCGTTTGAGAG
AACAGAGTCGATGTGATATACGTAGTTTTCTTGCGTCATTTCGCTAAGAAGATCCAGAAT
GTGTAGGAGTGTGTTGTGGTAGTGTAGGTCCGTCTTACGCCAGTGTATCCTTTCCATTGT
TTTGATGAGACCACTCAGTACGTACGCTTTGCAGTTGTTATCTACGTTATCTGGTAAAAC
CACCAGCGTCGACACAAAATCACTCAAAATTCCATCAACTTTAACATTAGTCAGCTTCTT
CTGCCCGTCTTCTAAGATGTACTCAGGAATATCTGGTATCAAACCTATGAGGGCCTTAAA
ATTGGCTTCAGCTTGTCCAATGCAATTATTGAGAAGAGCCACTTGTCCAGATAGTAAGTA
TAAATGTGCTTTCATAATATTGCAGTGTAGTGAAGGAACTGTTATGAAACAATAAGCCGC
ACACGCTCTCTGCAACCACTTGCTCTGCGCGTCGTTCGCTCGAGTCGCTAGAGTATTTAC
TTTCTGTACAAGCGTTACGAGTACTGCATCCAGTTTGATGAATGATGATCTACATTCGAC
GTAAAAATTTAACTGTTGTTCAAAGTCTTCCTGGAACGTCACAGCCTGAACAAACTTGTT
TATGAGTTCACTGCATACTTTTATTTCGTCATCCACAGTTATGGCGTTTATGGAGTCATG
GAGAATACAGCACAGGCACATGAGAGACGTAATAACAATATGATCGTCGATGTATACAGA
GTTATATCGAGGAAAAAATGTCGACAACACAGTCTTCGCCATTAGAGTACGTGCATTTGT
TGTTTGAACTAGTTCTATGAGCGGCATGAATGCGTCCATAAGAAAACATTCCTCAATGTG
AGGAATAGATCTAAGCATTCTTTTTATAACGAGTTGCAAGTTACCAGAGAATTCATCAGC
CGGCTTACCACACTTAATTAAGTACCGTATCGTACCTCTCAATATTATATTCACGTGTTG
TGTCGATAAATGTGTACATGCAAACTGCAACCACGATTCTAATACTTGCAAAAAATGTGC
AGTGGATCGAATACTGCTTGCTATTTTCCACCAGGTCTGAATCAAAGTTTCTGAATTGAT
TTGTCGATGGTTTCCAACTGCACACAGATGCTCCCCAAGTGAAGACAATACTTCATGTGC
CAAAACCATATTTTCAGCGGATCCCACAATCATATCTAGTATAGCAGGCGACCTTTTGAT
TATGATATTAGAATCGAATGCTGACACAATTCCACAGAGGAGCAACTCATTGTTTTCTAT
TCTTTGACATTGTTGAAGCATTTGATCCAGCAGGGTTTCTTTGCATCTGTTAGTATTTAA
AGTTCCAAAAAAGAGCCAATCAACAGCTGGTATGTAAATGTTCAAGTATTTATCTAAAGT
CAATAGTTGTCCTTCATATCTTTTTTTCATAGCCACATGATATACCTGTTGATATTCTTC
AGTAAATTCTTTTAAATTTTCATAAAAGTATTCAGCACAGTCATTTCCTAGAAGTTTTGA
AGCCACTTTGCAGAGGTAAACCCTCAAATAAATGGCAACTAAAGGATTTCCTATACCTCT
TATCATGGCAGTAAGTCTCACTATTGTCGGTTTTATTTCATCTTTTGAAATAAATGAATA
ACATTTTAACAGAGTCATTTCCATGTAAAGTCGTGGTAGGAGCTCTCTGATTGATGCCAT
TTTGTACAACCAATTTTGACAGGTTTCTTTGGCAGATTCTGGCACTTCCTTGGGATCTAT
ATCATGTATTGGTTTCACTGGTTTGTTTCCAAAACTTTTCTCCCAAAGGCGATCAAACAC
CAAGTTTCCAAAAGTATCTAATATATCTGTGATGAGGATGAACTTGCTTGGATAAAACTG
CATTACACTAACATCTGACAGTAATTTGGAACATTGAATTACTATTTTAAATGCTTTTAC
TCTTTGTTCTGATTGCCAAGCCTTTTTTATTTCATCACTCAGCATATTTATTTTACCAAC
AAACTCCTGTTGGCTCAAGCCCATAGTTTTCCTAATTGAATCTTCATCAAAATCATCCAG
TTGTTCGAGCCTATTTTTAACTTTTTCATTCAAATTTGAAACCTGTCTTATAAGAGTTTT
CTCACCCCCGGGCAGAAAACTACTAACTATTGTCAGCTTTTCACCAGTTGTGTATTTATT
TAATATGAAAGTTCTTTTTGTATTCCATGTTTTTACATAGTTTACACCAACATCCTCTAC
TTCAGACACTATATCTTCATCCAAAGCCATTTGTTCAAATTTAAGCAGTGGATCTATCTC
TTCAAATCCAGCACTCCACTTATTCAAATCATCAATAAAACCCTTGTCTACATTTTTTTT
AAAAAGAACATGATTGGTTTTCAAAGGATGATGGGAGACCTCGAATTTCGGAAGTTTTTT
TATTTTACGACTAATTTGTTTTGATTTCCATTTAAACGTAGGCATATTTCTCAACAATTT
AATTCAATGAAAACCAGAGTTACTTAATCAGTTTCAATAATAATATTGTGAACACAATTG
TGAATAATATCTGTAATTAAATATTAGAAATTTGTGTTGCAG
(3282 bp)

- SilkBase 1999-2023 -