SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR17484c0_g1_i6
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_protein_PTHB1_isoform_X2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005815 C microtubule organizing center
GO:0005856 C cytoskeleton
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0005929 C cilium
GO:0016020 C membrane
GO:0034464 C BBSome
GO:0042995 C cell projection
GO:0060170 C ciliary membrane
Transcript
Level		FPKM:5.43 TPM:5.32
ORF EntryO_TrvaFAMAMG20872_complete:A_TrvaFAMAMG_TR17484c0_g1_i6
Sequence
(Nucleotide)
TTTGTTACGTTGCTATAGTAACCTTTCCATACAAATATAATTTAAAAATACGTAGAGTTA
ACTTTGTGTAATGCACAATGTAACAGTAAAGACATATTTTAATTTCTAAAGTGAAAATGT
CTATTTTCAAAGTTAAACATTGGTGGTCAACCGATAACTTGAAAAATAAGGAGACAGTGT
GCGGAACTCAAAATGCCAATTGCCTTAAAGCTGAAAGATTTAACTCTCACAGTGATAGTG
ACTGTATATTATTAGCAGAGGAATCTATACTAAAAGTTTTCAAACCTAACATAGAGCATG
AAAACTCGCACACAATCATAGAGAGTGAACTTGAAGAAGTTATATTACAAATTGAGACGG
GAAAATTTATAAGCGGGATCGTAGACAGGCAAATAATAGTACTACATCCAAAAAGCTACT
CAATCTACCAGTTGCTCAGACAAGAGTGCGATATAAACGCAGGCGAACAAAATAAGCTTG
AGCCATTGGTTAAACACGCATTTACTAGAAAAGCCGATAGTTTGACATGTGGTTCTTTTG
GGAATATTAAAAACCGAGATTTTATATGCATCCAAGGACTTGACGGGAGCTTAAGCTTCT
TTGATCAGGATACATTTTTATTTCTTTGCATTTTCAACGATGTTATTATTCCAGCACCGA
TTTCTTACATTTCAAACTCTGATTCTTTTGTCCTTTGTAAATCAACTTGGGTTTTAGAAA
TCTACAGTTACCAACAGTTAAGAGAATTCAGCGAGTTAAGTGTACGACAGAATAAAAAAA
ATATACCTCAATGGACGTACAGTGCTGGTGAAGAGATCACACAAGTACAAGTTATTCAGA
CTAGCAGTAATTTTTCCAGCGTTGTAGCAATGGGAGAGCGACATCTTTGTTGTTTTCAAG
ACAATGGATTGATGAAGTTCATCATCAAATGTGATTATATGCCAATATGTTTTAATGCCT
ATCTAATTGGCTGGTATTATGAACCAACTGCACGGATGTTGGTAATGGTAACATCAGACG
ATGGTAAATTATTTATTTACGAAAGCACCACATTGTTATGGTCGTGTGATTTGCTTCATC
CAGTTATCTCAATAGCTCGATGTTTCCTTAAAAATCTACCTGGGGGAATAGTTACTTTAT
CAAACACAGGAATTGTGACGGTCAGCTATTTAGGAACAGAACCTGATTTGAACAGCAATG
CTCCCGCTATGATAAACGAACCAATTGATCCAGAACAGATTCAGAACGAGCTGGAGGAAG
TTGAAAGTGAATTACAGAGAGTTTTTGATACGAAAACTGAAATAGACAGTCGGTTTTCAT
CAGTAGAACAAACGATAAACATAAAAGCAGATGTCGGGAAACCAGTGCAGAATTTATTTC
AAGAATTCACAAAAGGCGATGAAGCTCTGCATTTGCTAATGTGTCCTGTTATCATTATGA
TAACGTGTGACGATCCAAAAAATATACAGAATGTTCAGATAACATATAATTGTTGTTTCC
CATTCACTTGTTCTGAATCTGCAGTTTCTCTCGACGAAATTAATGGCACAGAAATTATAG
AGTCACAAATCTTTTTGACCAGCCCTTGTGACATTTCTGATACACGAGTTACAATTATGT
TTACTATTACGGACTCTGCAGGAAAAATTGTGGTAGTTTCGCACAATGTTATGTTACCCA
TAAGCCTGTACTGCACACCAGTTGAAACGACAATGGAAAACCAGTTTAAGTTAAGAATAA
CTACCAATAAACCTTTGGTAGAATTTTCTCGAATGATTACAGACTTTAGTTCTGAAGATT
TGTCTAAACGTGGTGATACAATAACGTTTGAGTATAGATCAACAAAGAAAACTGTGACTC
TTCAAATAGTCAATGACCAATACATTATTGGTGCTAATGATTTCACGGAGATCACAAGTA
TGTTAGATTGTTTTCTGGTCAAATTACAAGATTATCATCTGAGGATGGATATGAAAGACT
TTCGTTTTGATTTGAAATCTGAGAAAGAGTTTAAAAAGCAGCTTTTACACAGGTTTCTTA
AAAGCATTGAAGTACACGCAAAAGAACGTATTAAACTGAAAGGTTTTGAGGATGAACTAA
ATATTCTGCAAAAGCAGTTTACTTTAATACAAAAGAAACTACTCGTACAGTATGGGTCAT
TACCTCCAGGCGATTGTGAACTTCTTGAATTTTTGATGAAAGATACACATCAACGGTTAA
TCAACATAGTACAACAAATTATCAAGTGCAAAGACACCGTTTGCGATCTTGGTAGCACTT
TGTGCACAATCGGTAAATTGATCTTATGTATATTGAAACAAGTGACGAACGACACTTTAA
AAATGAAGTTAATTGAAGAGATGATGTCCGTCAATTCTTTGTATGAAGATTACCAGGAAT
GGGAAGAAGCAGCTGTACAGGGAGTATTTTACATTCTTAATAACATATTCAAAAATTCAG
AGAAAGACAAAGAAAAATTGGCGCCAGTAACAGAACAAGGCATGTTGTCTCAAATAAATG
TGAAAAGGTGTTTGAAACAAACCAGAATGGTTTTAGAAAGAATGTTCAATGAGGCAGAAG
ACGAGATTCAACAAGATGTAAAACGTATCGAACAATTTGTAGAAGTAATTTAGAACAAAA
TAGATTTTATTTAGAGTTATTTAAATAATAACCAAAGTACAAATACTTAATTTTTGACTT
TTCCATGTTCTCAAAAATAATAAAATTATTTTTAGTTCGATAAAAA
(2746 bp)

- SilkBase 1999-2023 -