SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR17468c0_g1_i3
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_autophagy-related_protein_16-1_isoform_X2_[Papilio_polytes]
Ontology
GO:0000045 P autophagosome assembly
GO:0000421 C autophagosome membrane
GO:0005515 F protein binding
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005776 C autophagosome
GO:0005829 C cytosol
GO:0005930 C axoneme
GO:0006810 P transport
GO:0006914 P autophagy
GO:0015031 P protein transport
GO:0016020 C membrane
GO:0016236 P macroautophagy
GO:0019787 F ubiquitin-like protein transferase activity
GO:0034045 C phagophore assembly site membrane
GO:0039689 P negative stranded viral RNA replication
GO:0042802 F identical protein binding
GO:0051260 P protein homooligomerization
Transcript
Level		FPKM:1.51 TPM:1.48
ORF EntryO_TrvaFAMAMG20779_complete:A_TrvaFAMAMG_TR17468c0_g1_i3
Sequence
(Nucleotide)
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAATAATACATTTATTTTGTATCGAATATATTTCGC
AGAATAGAAAATATGACTAATACACTTAATAGCGTCGAACGGGGTTTTGTGAGTGGCCGT
ACCTTAAATTCCACCATATAAAAATATTAAAATAAAATAGTTAAATCTCAAAACCCAGTT
CGCTACATCTATCGACAATGCCTTAAGTTTACATACAACAGTCAAAAGTTTTTATCACTT
CAAATCTTTTGTTTTGCATTCACATTTCACGTGATGCATCTACTCTTTAATGATAATTGT
CTTCATAAAGATTTCATATTTACACTTTATATACAATTCAAAATTATGAAATTATAAGTC
TTAGTGTAAAGCAGACAACTTAGAACTGTACGCATTAACATTTTTGGTCAACACGAGCTG
TATTGCTTATTAGCTAATGAAGGCACGTATTCTCATCAAACTAATCAATTAAACCAAAAC
CGATTGTGAAAGTACTATAACGATATACAACATCCGACTTCTTAACAAACTAAATAGTTA
ATTTTATTTAAAACATCAGTTGTAAAATGAACGTATTTCTAAATGGGTAGGTAATATTTT
TATCGAACGACATTAAATACTAATTTTAATGTAAATCATATCGCAAACCTATTTAAGATA
ATTTGAAGTAAACAAACAGGTCTTGAGCTATTTATTTTATTGATTTCAAACTGTTATCGT
TGAATCACAGCAATAAATTTGCTTAAATATGCTAAACAGCGTTTCGGTACCGTTCGCATT
TCTACAAATTCAACAAATTCATTATCTTGCTAAACATGCCTATTTCTTAGCAAGATGTTG
TTAATTCACTTTATTTATTCCCATTTATAAAAATATAATATAACCATAACCGTATAACTG
TTAAATGCAAACAGACCCAGCACAATTTATCACAATCATAAAATAGCGAAAATTTCTTAC
AGTTCGATAGTGACTAGTATTAAACAATGAAAAAAATAGTTTTAAATCAATACGAGTAGT
GTAGCCGTTATAATTATTTTGCCGGACGGTCGACGCTGACAATGAATATTTAACTTATAA
TAATGCTATGATAGTATGACACATTTACTGGCAAGAATCAACGTGGGCGTAGAGAGACAA
GGACATAATTCAACTCCCCGTGCAAATCCAACTGAAAAGAATCTTTATCGGGGCCGAAGG
TTAATGAAGCGTAATTTAAGAGTGGCGCCGACGGTATTTTTTTAGCTCATGAACACGTTG
CAGTAGTTTAATGTAATTAAGCGGCCTGCATATGTAATTATACGTGAAAATAGTATCGTG
CCTCGAGTTCGTTGAACCATCGTATAAAAAATGTGGTAAAAACAGACTACCGAGAAGTGG
CCCGGTGCGGCTGTCAAAACACACGTCACAGGATTATGGATGTGTCGCCCGAGGCAGGGA
AAAGCTCCGTAGGGTTACCTTATATTAGACTATACATGTTAATTCGAGTATTGCCGTTAC
TAAAAAGTGTAGCACACGACACAAACAAGAATTAATCTCTGGCATGTTATGAAAATTATT
AATGATGTACGTAAATTGATTCGTTTTTACGCAATTCGCATTCTTGATAAGGTATGAGTG
ATATGACAGCCCTGTGGTCCAGCTCGGGTTTTATCGGCTCAAAAGTTTATTGATCGCGAG
GCAGTCGGTGGTCATTGTTTGCTAATGAGAGTCAAGCACAGGTGGTCTTATCCTGCGTGC
TCGAGGAAAACGAATATAATGTCTTATCAACTATAAATTATATTCTAAGATATTCGATCG
AATAGGATTTTCTATAACAGTTTTTCAGGCGAAATTAATCCTTAAGAGCTACAGTGTCAC
TTATTTCATCAATCGATTGTCAAATAAGATCAGACTTGAGAATTTTTAATAGAAGTAATC
AATAAGAACCTTTTCCAGTAAATGTCTGGCGTCGATCATAGGTAATATTTTGCATTTTTG
CCTCGTATTTAAAGCGTAGGTAAAAAGCGCGTAACAAAGTATTGCTAATGAACAAGACGC
CAACTTTGTGCGACTTTTGACTGCTTTGAAAATATTTTCTAATACAGAATCATATTAAAT
ATTTATATTTATACAATATTTTTTCGTGTATAAAATTTAATTTCATATTATCATTCGAAA
TCCTTTCTGTACTAGATATATAGTATAGCTGCATTATTTAAAATTTTCTTAGTAACTAAA
AGTGAGTAAAATTTTAGTATCTAGATACTAAGGTGCACTTAGACGCATGTTTAAGACTAC
ATTATCAAATAATCGCAATTCACACAAGAATAGGAATGGCTTATTATGCGTATTGAAGGA
AGACACTTACGCTAGGTTGATCTCAATGTTATGTACTTATAATATTCGTAATTACGTGTT
TGTATGAAACATTCAGTAAACAGTCGTGATACGGACCATTAATTTCACACTAAAGAGGTC
ATTCACATCTTAATGTTAAATGTTATTAGTCTATTGTTGTATTTTTTTTCATGAAACTAC
ATTCCAACAGCAGATTTTTTCTTAGAAATTTGAATATCGCATAAACAACGAATAGCACCA
ATTACATAGTCGCGAAAATGTTTCATATTATGAAAATACAACAAATATTTTATAGAAATC
ATTATAATTTTAGAGACATCGCATATGCCATTATCCAAAATTCAAGTTTTATAAAGTAAA
TAAGATTCAATATTATTTATACACTTCTAATTAGACAAATCCATTGTTTATACGTCAGTG
AAATTGATGTATTTGCTTATTGTATGTTGAGCGCGGTGAAACAATTTTCGCTATAGGCCG
AATGTTAAAGGTTACAAGAAGTCACGACACCAGTTTGCGTGCGAATTCTCAAAGGTCTCA
ATATTCAATTTATAACAATAATTTCTCTCAACATTTGGATAGTCTCGAATATTATTTTAA
GTTTACTTTAAATTGAAAATAGCAATAGGTATTTGAAAATAATTGTTACGTGAAACGATG
GAATATGTCCGTGGTGAAGCCACGTATCAAATCGAACACTTCTCCGCTTTCCTCCGTCGT
AATCTTTTCTGGTTTCGCCTGTTCATCTGGTGGCGGAGGCCTGGGTGCCTCCCATGCTTG
TCACAAGTCCCCCCATATGAGCGCTCGTTTTCCTCGATCCACTGAAGCCAGAAGTCCAGA
CTGAGGATGCCATGAAACAGATGTTACCGCCGTCGTGTGATCCTTCAAAGTAGTTTCGAG
TTTTCCCGAATACGTGTTCCATACAAAGACCGCGCCGTCCGCTGCTCCTACCGCCAACAA
CCGTCCTCCCGGACCGAACGCCGCCCGCGACCAATCACAGCCCACTTTGAACGATTCGTG
ACTGAAAGATCGCACGATGTTGTTCAACCTCAGATCTATGAGTTGTATTGTATCATCTCT
TACGCATGCTAATAGATAATTACTATCTCTACTTAAATCGAGTGAAGTGACCTTTCCCTG
CAGCATGATGTGATTCGCTGACATCTCTGTCCTTATGTCCCAGAATCGGATCCGTTTGTC
GAAATGACCCGAAATTATCGTAGAGCCCGCGCCGTCAGATGTAACGAGATCATTACAGGA
AGATCCTGCAAATTTGGTTTCTGTGCACATTCTACTTCTAAGGTCCCATATTTTCAACGT
TCTGTCATGACTTCCTGTTATCACTTTTGTCGGTTCCCCGAGGAATTTAGCTGCCATCAC
TTTCCCACTATGACCGGTCAATGTATGCCTTAATCTCTGATCAGCGACTGTCCACACTCG
GCTCGCGAAATCATTAGAAGCTCCCACAATGTACGCGCCCGTCGAATCGAAGTCCACCGA
CATGACGCCCTGATTCGAACCCACTAATGAACCTTTACTCTCTACTACACTTTTTGAAAC
ATCCCACAGTTTGACTTTTCTATCGGCGCCTCCGGTCGCCACGAGCCGATCAGTAGGACT
CCACTTCACCGCGTAAACTTCGCCGTCATGTGCGTCAAATCGTATAGCAACTTTTGAAGG
TAACGACGTCGCGTAGTACGGTAACGAGTCCATGATCTTGTCGTCAGTACTGCCTCCGGA
ACCGCCGCTACTCCGACTGCCGCCTTCCCTCGCCGCCTCCTCCAACTCTTTCCGTAGCTT
ATCACTTTTCTTTCCGAAACTAACTCTACCGAATGTGTTGAAGAAAAACGCGGTAGGGTT
GCTTGACTTTAAATAATGTTCATTTTCTTCGTTCATTTTATCGGCATCTTTTGCTTTGTA
TTTTATAAGTCTCTCAACTAATGATCGATTTTCATCCTGTGCTTTTCTCAACTTTTCTTC
TATTGAAGCAAATGCAATCTGCAAGGCCTGGTGTTCATCTCTTAAAACTTGGTTTAATCC
TTGTAACTCTGACATATTTGTTTCATACATTTGAATTTCAGCTCGTAATGAAGCAATTAA
TGCTGTGTTTTCTGAAATTATCACATCCTTGGCTTGAAGCTGCTTTTCTAAGTCATGTAC
TTTTTCATTGAGACTCATAATTTGCTGGGCATTTTCCCCTTTCCGCCGATGCAGTGACGT
CAACTCTTCTTGTTGTATAAGAATTTTCTGTTCCAATGCTTGTATTCTCTCATTGCTCGC
ATTGCTGGCTGCACTGGGTGACGCATCACTTGTACTTGAGAATCTAATTCTTTCATTAAC
TAGCGTTAACTGTAGATTTTCATTCTTTAAAGTATTGACGTTATCAAAGAGCCTGCTTTG
AAAACTGATTATATCTTGAAATGCTGATGTTTCATATTTATTTCTATTTTGCAACTGACT
TATAATGTTACTTCTCCACTCACGGTCTTCCATTATTCCATGTAGAATTGTTTCCAATAT
TGAAACAGAATGAATTAGAACAAAAATTAAATATCAAAACAAACAGATGGCATACTGTTG
AAAAGATATTTCTTTAATAAGATTATTTATTTTTTGAGTATACTAGTTATGACTTTCGTT
TACTATTAAAGGTATTTATCAACCATACGATTTCACAATTTTAATGATAATTGAATAAGA
TATTACAACTTGTTCATTTATTTTGGTCTCACGAAACTGAAA
(5082 bp)

- SilkBase 1999-2023 -