SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_TrvaFAMAMG_TR17053c0_g1_i5
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
Protein_smoothened_[Papilio_machaon]
Ontology
GO:0005581 C collagen trimer
GO:0005634 C nucleus
GO:0005730 C nucleolus
GO:0005847 C mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex
GO:0006378 P mRNA polyadenylation
GO:0006379 P mRNA cleavage
GO:0006397 P mRNA processing
GO:0044822 F RNA binding
Transcript
Level
FPKM:1.07 TPM:1.05
ORF EntryO_TrvaFAMAMG19906_complete:A_TrvaFAMAMG_TR17053c0_g1_i5
Sequence
(Nucleotide)
TTGGTAGCGTTTTCTTGAGGTTAAATGTAATGAATTTAGTCTTGTTGTTTGTTTATTTAC
ATAGAAAGTTAATAAGAGTATTTAAAATTAAGTCAATTTTGTGCTGCTGTGAAGAAAAAA
AATATGATGTTATAGTACGTGGCTTTTTAAGGTATCCAAGTGTTAAAAATGGATTTTGGA
CATCCTCACCAGAACATGGCTATGCCCCCGCCGGGCATGGGTATGATGGGTCCACCTATG
GGTCCTCCGCCTGGGCGGAACATACGCCATAACTTTAGACCTTTCCACCATCAGATGCGG
TTTCCACCTCAAGGACCACTTAACATGACTCAAGATGATTTCGATGGTAAACGTTTGCGT
AAATCAGTTATGCGTAAAACTGTAGATTACAATGCGGCTATAATTAAAGCTTTAGAATGT
CGTGTTTGGCAACGAGACTGGCGTGATAGGCACGCGCTTCAACCCGACGCTATGTACACC
CCTGATCTTTTACCTCCCCCTTCATATCCAGATAACCCAATCAATGCAGTCACAACACGT
TTTGTTAAAACTGCTACTAATAAAATGAGGTGTCCAATTTTTGCCGTGGCGTGGACCCCT
GAAGGTAGAAGATTAATAACAGGTGCCTCTTCGGGAGAATTTACATTATGGAATGGATTG
ACATTTAATTTTGAAACTATACTTCAAGCACATGATTCTCCGGTGAGGTCAATGGTTTGG
TCTCATGGGGAAGGTTGGATGGTTACCGGTGATCATTCAGGGTTTATAAAATATTGGCAG
AGTAATATGAATAATGTTAAAATGTATCAAGCTCACAAGGAAGCTGTTAGAGGAATTAGT
TTTAGTCCTAGTGATTCAAAAATAGTGACATGTTCTGATGATGGTACACTTAGAATATTT
GATTTCTATAGATGTCATGAAGAACGGATATTGAGAGGTCATGGAGCTGATGTTAAATGT
GTACAATGGCATCCAACTAAAGCACTAATTGTGTCAGGTAGTAAAGACAACCAACAACCG
ATTAAATTATGGGATCCAAAATCAGGATCAGTTTTGTCAACACTACATGCTCATAAATCT
ACTGTAATGGACTTAAAGTGGAATGATAATGGTAACTGGCTTATAACAGCATCTCGTGAT
CATTTACTGAAATTATTTGACATTCGTAAATTAGGTTCTGAACTGCAAATTTTCAGAGGA
CACAAAAAAGAAGCTTCCAGTGTTGCATGGCACCCTCATCATGAAGGGTTATTTTGTTCT
GGGGGTTCTGACGGGGCCATTTTGTTTTGGAATGTTGGTACTGATAAAGAAGTTGGTTGT
ATTGAAGGAGCACATGAATCTATTGTTTGGACCATGGCATGGCATCCTCTTGGTCATATA
TTGTGTTCAGGTTCTAATGACCACACATCAAAGTTTTGGACTAGGAATCGACCAGGTGAT
CTTATGAGAGACAAATATAACTTGAATACACTGCCACCTGGAGTACAAGATGAACAAGAT
TTGGAAGAACCCTCAGCCATTCCTGGCATGGGTCCAGAAGACAAAGTAGAAATATTTTCC
TCTGATACTGATAAAGTTATCCCAGGTTTAGATTTGGATACCACATTTATTCCTATGGAA
TTTGAAAAGAAAGTCAAAAAAGTTCCATACAGTAAGCCTATTCCCAGAAACTTCCAAGCA
CAATGGAATCATGCTCCTAGTTCTGAAGAAGCGACTACAGAGATTTTGACACAAGCCCTG
GCTGATTCAATGCCAGGTTCAGTTCCACTGGAAAATATCTCTCCATCAGCAATATTTATT
TATGGAAAATTAATTACTGTGGAACCTGGATCAAAACTTGAGAAAGCCATAACTGAAGGT
CATGTAGCACTCAGAAAGTTCATTGCTAGTGGTGAATTAGAAGAATTACATGATGTTATG
CCTTACTTAGAAGATGATGCAGATGATGATAACTTTCAACCCTTTGAATACCCTGATGCA
GAAACAGATAAAGAAAATGGAGAAGAAGGTGAACAAAACAAAGAAGATTTTGAAAATCCA
GAAGATTATTATGAGGATGATAAAATGGATACAAATGATGAAACTCAAACACTAGAAGAA
AATAAAAGTTATAATAATGGACCTGATATTTCCAATATGCCACCAACTAATATTCCACCA
CCGATGAACATGATGAGACCACCACCCTTGAATAACATGGGACCAATGAGAAATCCAATG
AGACCTCCAATGGGCCCTATGCATATTCCACCACCACATATGGCAGGTATGCCTCCTATG
AGTAATATGCCACCACCCATAGGTAGTATGCCACCAATGGGCAACATGCCACCAATGGGT
AATATGCCACCAATGAGTAATATGCCACCACCAATGGGTAACTTGCCTCCTATGAGTAAT
ATGTCTCAAATGGGCAACAGGCCACCAATGGGTAACATGCCTCCAAGGAATAACATGCCC
CCAATGAACAACATGCCTTCCATGAATACCATGCCTCCAATGAATAACATGTCTCCAATG
GGTAACATGCCACCTCGACCTCCCTTTAATGACAACGGGTACAATAAACCTCAGTATGAT
TCCAACTATGACAATCAACAATACTCTCATAATGATGATGAATATAATGAGGACGAATCT
TATGAACAAAATTATGATGGAGAAAACAATCGTAACGATGATGAGGATGGAGATGATGGG
TATTCAAGAAACCAGGGATGGGATAGTGGGTTCCGAGGCAGAGGTCGGGGCCGAGGTCGC
GCTATCAACAATGGTTTCGGTGTACGTGGTAATTGGCGCAACAATAATGGTTCCAGAGGA
TCGCCGCGAGGTCGTCGCGGTGTCCCGACTCACAATAGGAATTTTAGACGAGGCAGTAAA
CCTGTTTCTTAGTGTTAATATTTGTTTATTTTTGCTACATACTAAATCAGATATTTTTTC
GCTCCTGTGAGTGAATTGATGATGTTGTGTATGTTACAAAGACAATATTACAGTGACTGA
AAATGGTTGTACATAATTCTTACTTACAGCTTGTAATTTTAATTGCGTAAGATGAAAACT
TCAATAAATCTATGTTACAATTTTGTTTTACAATTTACATCTACAGGTCAACATATTTTT
GGGCGCAATCGGTGAGTTTATCTTTTCTACTGAGTTAATTAAAAATTTTCTACTAGTTTA
AATTATGATTTTTGTAAAAGCAGGTAATCAGAATTGGGAATTAATAAGAAGATCAGATTT
GAAGATTACCTGTGCGTCATGAAAGAACGGAGTTTGTACTCTTCATACGACAGCTGCAAC
TTTATAGTAAGAAACCGATGGTGCTTGTGTGGGCGTGGGCGTGGCTGCTCTTGGTGTCAA
CATGTACTGGGAGTCATTTTGATTCTGGAAACCACAAAAATTCTTTGGGTGATCTAACCG
AAAATGCGACGCGCCTTGAACCTATCAAGGGTACACTGATTTACAGATTAATTAAACCAG
ATGAAAGTACGCAATGGATTCCAGAGAGAGAAACGAAAATGGATAGTTGCGTGATGAAAG
CTCGCTGTGAACCACTTTCGATCCCGACATGCCTCGGATCTACACTACCGTACAATGGCA
CAAGTGTACACTTGACATTTTACAACAATCAACGACAAATACAAAATCAACTGGAGTATT
ATAAAAATTTAATCAATGTGCCAAATTGTTGGGCTGTTATTCAGCCGTTACTTTGTGCAA
CTTTTATGCCAAAATGTGAGAAAATATTAGATCATGATATGGTGTATCTACCCTCGTATG
AGATGTGCAAAATAACAATGGAACCATGCGCCATCCTCTACAACACATCGTACTTTCCTT
CTTTCCTCAAATGCAACAGAACAATGTTTCCACCGCGGTGCGACAATGTCATGAGAGAGA
TTAAATTTAACACTACCGGGAAATGTTTACCACCGCTAATACATACAGATAAGTCTATGC
GTGTATATGAAGGTATAACTGGTTGTGGGTTGCCTTGTCGTGATCCATTGTATAGCGATG
ACGAGCATCAACAAATACACAAACTTGTGGCGTGGGGCGCCGGCATTTGTCTGGCTCTCA
ATCTGCTGACTGTGGCAACATTTCTCATAGATTGGAGGAGTGCTAATAAATATCCCGCTT
TAGTCATTTTCTATATCAATGTTTGCTTTGCTGTTGCATCGATGGGTTGGCTCATTCAAT
TCGGCGTGGGTTCAAGAGACGACATTGTTTGTTCGAAGGATGGTACAAGGCGACAAGGCG
AGCCGTCCGCAGAAGAAAATCTATTTTGCGTCGTTGTATTCGTTTTGGTATACTATTTCA
TGATGGCGGCTTGTGTATGGTTCGTGATATTCACCTACGCGTGGCATATGTGCAGTTTTC
GTGCATTGGGTAAAATACAAGATCGTATTGATAAGAAAGCGGCATATTTTCATTTAGTGG
CATGGTCTCTTCCATTAATATTGACAATAACGACAATGGCGTTTGGTGAAGTAGACGGCA
GCAGTGTGACGGGCGTGTGCTTCGTCGGCTACGTGAATCATCCGATGCGGGCCGCTTTGT
TGCTGGCCCCTCTTGCTATTGTACTGGCTTTGGGCGGCTATTTCTTACTAAGGGGTGTTT
TTTCCTTGGTCGTGGTTCGTGTTTCGAGTAAGGATGTAATATCGCCTCGAGCTTCGAACA
AGATCCGTCACACAATAACCCGGTGCTCGATCACGGCCGCTTTGGTCGCCGTCTTTATAT
GCGTAACGTTCGCCTGTCATATCTACGAGTTTAGGAATGCTGATCTTTGGAAAGAATCGT
TTAAGAGGAATATTATTTGTCGACTGGAAGCCGGACTAGAGAGACAAAAGGAATGTTTGA
AGGGTTCTCGTCCATCAATATCAGTATTACAGTTGCGGTTGTTGTGTTGTTTCGGTGCTG
GAGCTCTCATGTCTTCGTGGACGTGGACTCGAGCTGCCCTCGCCGCCTGGAGGAGATATC
TAGCCAGAAAGTGTGGATGTTCCGTGGATGAGGAAGTGACCCGTCGCGCCCAGAAACACG
AGTTGATCCGTCGCGCGTACAGACGTCGCGCAGAGTTCGCGGCGCGAGGACGACTCTCCA
TATCGTTGGGCGGCTCCAGGCAGGACCCCGTCGGACTCTGTCTCGATAACACGTCGCCTA
TTGACTATCCTGATGATGGGAAACATGAAAGTGGTGAGCTGTCTTCGTCGTGGGCGGCCA
ACCTGCCTCGCTTCGTGCGTCGTCGCGACGCGCTGGTGCTGCCCGCGCACACGCACCACT
CCCTGAGCTCGACGCCGGACCGACGCAACTCGCAGGACTCACAGATCAGCATCAGCCTCC
GACACGTGTCCGTTGAGTCTCGTCGGAACTCGCTCGATAGTCAACTGTCGGTTAAAATCG
CCGAAGTAAAGACGAAAGTTGGTAGACGCCGTAATAAACACACGAAAGCTAAACGTAAAA
GGGCTGCTGGACCTCGCAAGGAGAGCACGCCTTCGATAGAGAGCCAAATAAGCCGCTATT
GGTTACAAGCAGTCGCAGCTAATAATGATCGATCTCGCGAAGAAGTCAAGTTCAGTTTCG
AATGACATTTACGATATTAGTTTTTCTACGAATCTCAAGTTCAGGTTTGAACTGGATATA
CCTATATTTAAACAATTATTTTTATAATTTTATTGACTTTAAATAAGACTGATTAGAAGA
GTCTTGGCAGCTGACAATTCCATGACAATGTGAATGCAACCATTTATGATGTTTTCATCT
TATTTGTGCCATACTTCAGAGTTGTATAGACCATACAGTTATATGTGGCATATAACACTG
TTTAATGCATTTGTACAAAGCATTTTTGTATTATATTTTTTTATCTAGTAGTTTGGTAAG
CAATGACAAATGTAAAATAAGGTTGTGATATGTGTTGTAACAGAGGTGAAGTGAAATATT
TGTTACTCCGATATTTTACTTTTGATGCCTCATCTTCAAACAGCTAATCATCAAGTCTGC
ACTAGCTTTAAATTTTATGATAATTTTAGTCTCTTTTGGAATAAATATTTTGATACAGTA
AAAAAAAAA
(6069 bp)

- SilkBase 1999-2023 -