SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR16339c1_g1_i2
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		endonuclease-reverse_transcriptase_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003824 F catalytic activity
GO:0003964 F RNA-directed DNA polymerase activity
GO:0004518 F nuclease activity
GO:0004519 F endonuclease activity
GO:0006310 P DNA recombination
GO:0008152 P metabolic process
GO:0009036 F type II site-specific deoxyribonuclease activity
GO:0016740 F transferase activity
GO:0016779 F nucleotidyltransferase activity
GO:0016787 F hydrolase activity
GO:0032197 P transposition, RNA-mediated
GO:0032199 P reverse transcription involved in RNA-mediated transposition
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0090305 P nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis
Transcript
Level		FPKM:11.02 TPM:10.80
ORF EntryO_TrvaFAMAMG19308_complete:A_TrvaFAMAMG_TR16339c1_g1_i2
Sequence
(Nucleotide)
GATTGGTAATTATCATACACATCAGATAACTCCGGACAAACAGATCGATCTGCGTAAGTA
CATTATGGAATATTTATAAATTGTTTTAAACTATTACGTCTAAGATTAATTGAACGCAAC
TACAAACTACCTCCAGTACAAAAAAACCAGCAATTCTGGTAAGAGCTTTGTAATTTTTTT
CTTTGTAACGTTTTACAACGGAATTACTAATGGTTTTTCGATATTCGATCACTAACTTAG
GGATAAAGTCTCGGGGATGGTTAGTCTACAAATAAACAATTTAAAAAAACATTAATTAGT
AGCAGTGCTTATTGAATAATAATAATAGCCTATTTATTAGAGAAAAAGAACATAAACTAA
GAACAAAAATAAATTACAAGTTTTATATAATGTCTCTTAACTCTACATGCCCTCTGACAT
AGGCCTCCTCCAACTGCTTCCATTGCGTTCTGTCTGCAGCCACCCTAGTCCAGTATGGTC
CCAAAGTCAGGCGTAATTCGTCTTCCCATCGTCTAGTTGGTCGACCTTGTCTTCTTACGC
CGTCTCTCGGATACCACACCGTAATCTGCTTACTCCATTTGTTTTTATTGCAGCGAAGCA
TATGTCCTGTCCACATCCATTTCTGGTGGTCGATGAGAGTAAGAATGTCAGCAATTTTGG
TTATTCTCCTAATTTCCAAGTGCGGTTTTTTTTCGCTAAGTTTTACTCCCAGCATACTCC
TCTCCATAGCTCGTTGACAGCGTTGAAGTTGTTTTCTGTGAGATTCCGTCAAGGACCAAG
TCTCACATCCGTATGTTAGGCAGGGCAAGATGCAGGTATTAAAGGTTTTTCTCTTTATAT
GTATATTTATATCTTTATTTTTTAGTATCTCTTTGAGGGACCAGAATTTTCTCCAACCAC
AGGCTATTCTTTTATTTATTTCTTTTGACATCATGTTCTTTGGAGAGATAATCTGTCCCA
AATATACATATTCTGACACATATTCAAGTTGTCTTCCATCTATCTGAATGTTTTCCTCTG
TATTATTAGTTATTAGTTTTGTTTTCGATGCATTTATTGCCAAGCTAAAGTCTTTACTCT
GGTTTGCTAGAGATTGTATCATTTTCTGAAGTTTCTCAGGGCTTTCCTCAAATAGAACTA
TATCATCAGCAAATCTTAAGTGGTTCAAACGTTTACCATTAATGTTCAATCCTACGTTGC
TGAAGTCCAAGTTTCTGAAAATATTTTCTAATACTGCATTGAAAAGTTTGGGAGACAGAG
GGTCTCCTTGTCTAACACCTCTTTTTATTTGGAAGGGCTTCCCCTTTGATTCTAATTTTA
TGTAGCTTCTGCTTTTCTCATATAATATTTTTATTGCATCTATATATATTTTATTTACTC
CCTGTTGATTAAAGCTTTCCCAGATATAGTTATGGTTGAGACTGTCAAATGCTTTAGTGA
AGTCTATGAATGCTATATAAATTTTTTTTTGGTATTCAGAATATTTTTCCAAAATTTGTT
TTATGGTGTGAATATGGTCTATTGTGCTATAGTTTTTTCTGAATCCCGCCTGTTCTATTG
GCTGATTTTCATCTAGGGTTTTTGTTATTCTTTCCAGTAATATCTTTGCAAAAATTTTGT
AAATATTTGAGATTAGGCTTATAGGTCTATAGTTTCCTATATCCTCTGTTGGCCCTTTTT
TGTGTAATAGTATAATACAAGATTCACACCACTGTTCTGGAATAGCTCCTGTGAAAAGAA
TATCATTAAATAATTTCGCCAAAATTGGACTGAGTTCCTCTACTGTGCCCTTTAGGATTT
CACAAGGAAAGTTGTCTGGGCCTGGAGCCGTCTCTAGTTTTTGTGAATTGATTGCATTTC
TTACTTCTGCTGTGATTATAGGTGGTACAGTTTCTGTGTTGTTTAGGTTTAAGGAATTTC
TCTGCTCATTTACTTTAGTTTCAGAATAGAGTTTCTTGAAGTAATCCGTTGCAATTCTTT
CTAGGTCAATGCGATTTGTGATTGTGCTACTTTCATTTCTTTTAAGGTTTGTAATCCATT
CTTTTCCTTGCTCCTTTAAATATTTAAATGCTTTCTTTGTTCCACCAGTTCTTTGAATTT
CTGATTCAAGTTTTTTCATTCTTTTTGCTTTTCTATCCTTTTTCATAGACTTTCTTATGA
GTTTGCTGAGTTTTGATATTCTTTTTAAGTTTTCTTTACTTCTGTTTTCCGAAATGGCTT
TCATCCTGGCTTCTAAAAGTTTCATTGTATCATCACTATATTTTTCCTTATTTTTTGTTA
TTCTATTAGTTAATTTCAATTTTTCCAAAGTAGTTTCCAGTTCATTATATTTTTCAGAGA
CACTAATGTTTTCCTGCATTGTTTTCATTAATGGTTTTAGTACTGATGAGTCCATGTTGT
TTACATCATATTTTGTTGACCTTATTTTATCACCTATATTGTTTCTTGACATTTTGGGTT
GTTGTAAGAGCAAGCAGCAGCGTACCATACGGTGGTTTGTGTTGAAATTTAACTTCTGTA
TGACATGTGTATCACTAAAGTATTTCCTTTTGTTTGTTAGAATAAAGTCAATTTCATTCT
TGTATTTTCCGTCTGGAGATATCCAAGTCCACTTGTTCTTAGGATTTTTTTTGAAGATTG
AGTTTAGATGCACTAGATTGTTTTCCATTATGTAGTTTATCAATTTTTGACCATTACTAC
TTCGTTTTCCTTGGCAGTATTTACCCAAAACATTCTCTTCTCCTAATTCTCTACTTCCTA
CTTGAGCGTTAAAATCACCCATGATGATTATATTATTGTTCTGGTATCTTTGTGTAATTT
CTGATAGTTTATCATAAAAAAGTTCAATATCTTCTTTCTTACCTTGTTCTGTGGGTGCAT
AGGCTTGCACTATTGTCCAGGGTTTCTTATAATCTATCAGTTGAAGATTGAGTATTGCAA
GCCTGTCTGAAATACCTATAATTTCAATTATTTGATATTTCAAGGATTTGTTTATAAGAA
ATCCTACACCTCTTTGGCCAGCTATCTCTCCCTTATGGTATAAAATGAAGTTTTGATGTT
CCTCTATTTTTTCACCGATTCTTCTCATTTCACTTATTCCCAAGATGTCTAGGTTGATGT
TAGTGAGTGCATTTTCAAGTTCAAGCAAACTTTCTTGTGTTCTCAGGGTTCTGGTATTGA
GTGTTGCAATATGGATGACTGATTTTCTTTTTGTTGGAGGGTTTTGGTCTAGTCGTCCCG
CGGTGACCAGCCGTGTTGGGAGACATGTAGTTGTTTTGTGCAAATTGTTTAGTTGTGATA
TGTTAGTATTTCCGGTTATTGGTATTTTTGAGTTACATTTTGTTTGAGTTTTTATCCGAA
ACTGATTGTGTCCGTCCTCGCATGTAATGAAATGCATTTTTTCCTTGAATTTTTGGGGCA
TAAATTTTGTGACCTTGGTTGTCGGGGCTTGGTGTTTCCGACCTTTTTCTTTTGTCACTA
TCTTTGTATTTGTTTTTGTTATGTACCTGTTGTTTCTCTCTCTTTGCAGACAGTGCTTCC
TTTGTCAGGTCGTGTGTAATATAAGTATTTGGTTTCATTTTTTTCTTGCATTTTAAAATT
TCTATTTTTTTTTGAAGAGTTGTTGTAGCCAAGAGAATTGGTCTTGTTTTAATGCTGTTT
TCAATTCTTTTTCCCAAACGGTGTACTTTGTTGATATCTCCATTCTCTAATTTGACATCT
ATTGCTTCCAATGTTGTAACTACTAGATTTGATAATACCTCGTAGCTTTCTTGTTCTGAC
TCAGGAATGCCGTGAAGAAGCAAGTTGTTTTTTCTGTTCTGAATTTCAAGAATTTTTATT
TTATTGTTTAATTGTAAGATTTCACTATTTATTTTTACATTATCTTGTAATAATGGTTGA
AGTTTTTCGTCGACTTTTTGCAGAACTGCAGCAGTGATGTTTTCAGTTAATGTACAAGTT
TG
(3962 bp)

- SilkBase 1999-2023 -