SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_TrvaFAMAMG_TR16310c0_g5_i9
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
ATP-binding_cassette_sub-family_A_ABCA1_[Heliothis_virescens]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0005215 F transporter activity
GO:0005319 F lipid transporter activity
GO:0005524 F ATP binding
GO:0005615 C extracellular space
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0006810 P transport
GO:0006869 P lipid transport
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0016887 F ATP hydrolysis activity
GO:0042493 P response to xenobiotic stimulus
GO:0042626 F ATPase-coupled transmembrane transporter activity
GO:0044267 P cellular protein metabolic process
GO:0051384 P response to glucocorticoid
GO:0055085 P transmembrane transport
GO:0097208 C alveolar lamellar body
GO:0097232 C lamellar body membrane
GO:0097233 C alveolar lamellar body membrane
Transcript
Level
FPKM:0.89 TPM:0.88
ORF EntryO_TrvaFAMAMG19041_complete:A_TrvaFAMAMG_TR16310c0_g5_i9
Sequence
(Nucleotide)
CTGACTTAATACTAGACTAGACGGGACGAACCTGAAGTCCACGCGAACTAGAAAAGCTAG
TTACTTTATATGCAAGTGAACTGATAAACAGAGTTTAAAAATATCGACAACCGATATCGC
CAATTCAATATCGAACTATCGATATATCGACCACAAAAATATTAGTAATAAATATCGATA
TTTCGAAATTTTATCAACAGTCCTATCAGTCATTTGCTGGTTTGATTGACGTTTGGTTGG
ATCTATCCTGTGATCTATCCATTAATCTATCCCTAAATTTGTGGATAAATTTATGGAATA
AAAATCTTAAATTGTGCTTAATTCTAAGTTTAAGAATCCAATAAGCTTATGAGGATTAAA
TTTTACGTGAGATTATGGTTTCTGTGTTTGTAAAGTGAGAAAGAAAGTGTTATAAAATAA
TGTTTTCAAAATAATACTTCTAAATTCTAATGTGTGAGTCAACAATAAATAGTCTAATTT
ACGGAATGTAAATATATTGTTATACGAGTTACTGTAGGCCCAGAGTTATGCTGCAGTTGG
AATTTTTGAGGATAATTTATAAATAGACAATACAAAATGTTGGCATTTCAAAAATTACAA
CTCCTTATTTGGAAAAATATCCTTTTACAATACAGACGGAAATGGCAAACATTATTTGAA
ATAGCTACGCCTCTTATGTTTTGTTTATTCTTGATAATTTTGAGATATGTTGTAGCTCCA
AAAGCAATACCTGCAAAAACATATCCGTCCTTCGATGTGACTTATTTTAACAGATCAAGG
GGGAATTTGTCTTCAACTGAAATGGTGATAGCATATTCACCGAAAAGTAAATTAACCACT
AAAGTTGTTAATAAAATCTTAACAGAATTTACTCAAGATTCATTCGAATATTATGCATTA
CTTTTCATGTTAGATTTTGATAATGATAATAAGTATATAAAAGGATATAAAAATGCAAAT
GAAATGGAAACTGCATTAATGCAGCCTAATGCTCTGAATGACAACTTGCTTGGTATACAA
TTTGAGGATGATATAGCTAATGCTACATCTTGGCCAGATGATGTAAAAGTAACATTAAGA
TTTCCAGCTATTATGAGAACAACATCTGATCACCAAATGCAGTTAAGTTGGCAAACTAAT
TTACTGTTTCCTTTATTCCCACATTCTGGACCAAGAGAGCCCGATGATCAGTATGGCGGA
ACATCACCAGGCTATTTTTCGGAGATCTTTTTATTTATACAACATGCACTCTCAAAAATT
ATCATAAACGAAAAAACAGGCAAAACTATTGATACTAAAATATTAATGCAACGTTTACCT
CAACTGGAATCTAGAGAGGATCCATTACTCTTTATTTTGGAAAGATTTGTTTCCATAGCT
ATTATGTTGGGCTTTGTTTACACTTTTGTAAATACCGTCAGAGCTGTTACGACCGAGAAA
GAGCTACAACTTAAGGAAACTATGGCAATAATGGGCTTACCATCATGGCTCCACTGGCTA
GCTTGGTTTATTAAACAGTTTTCATTTTTATCTGTTACTGTCATCATAATGGTAATATTG
TACAAGATTCCACTAGCGGAAACTAAAACAGGAGAATGGTTTTCTGTATTCACTTTTACG
CCATGGTCAATGATTTTGTTCTTCTTGATTTTATTCATTATAGCATCATTGACTTTTTCA
TTTATGATCAGCGTTTTTTTCACCAGAGCGAACACGGCTGCGTCGTTCATGGCTCTGATG
TGGTTCGCAACGTTCTCTGTGTTCATGTTCACTCAGATGATAAGCGAGAGTATCTCAGCC
CCCGTCAAAATAGCGTTATGCTTGTTCTCGAACACCGCGATTGGATACGCTTTTCAAATG
ATCATCATCGCTGAAGGAACTGCAATGGGTTTACAATGGGAGAATTTCTTTTCTCCTATA
TCGTACCATGAAAACTTCCAACCGGCCCACGTGGCATCGATGTTGATACTCGACTCAGTG
TTGTACATGGCGATTGCCGTTTACGTGGAGAACATACGACCCGGAATGTATGGAGTACCT
TTGCCTTGGTACTATCCCTTCACTTGGACCTACTGGAAACCTAATAGAATCCATGATGAA
GCTGATAGACTCCTTACAAACAATTTTGATTACAACGATGCCTTACTATCTGTAGTTCAC
GACGAAGAACCGAAAGGAGTTCCCATTGGAGTTAATATTCAAAACCTAACAAAAAAATAT
AAGGGACGTAAAAAAGTAGTTGATAACTTGAATCTTCGATTATACGAAAATGAAATTATG
GTGCTGTTGGGTCATAATGGAGCTGGAAAAACTACAACTATTTCTATGTTAACAGGTATG
GTGCCACCAACATCGGGTTCTGTAAAAATAAATGGTTATGATATTGTAACTGAAACAGAA
CAAGCCAGACATTCCCTTGGAATTTGTCCTCAGCATAATGTACTATTTCCTGACTTGACG
GTGGCGGAACATTTAATTTTTTATTCTAAGCTCAAAGGAATTCCTGAATCACAAATACAG
GGAGAAATCTATCATTTTGTTAAACTTCTGGAATTAGAAGATAAGAGACACTGCGCGGCG
TCGAGCCTGTCGGGCGGACAGAAGCGCCGGCTGTCGGCGGGCTGCGCGCTGTGCGGCAAG
TCGCGCGTGGTGCTGCTGGACGAGCCCACGTCTGGGCTGGACCCGGCGGCGCGTCGTGCG
CTGTGGGACTTGTTGCAGCGCGAGAAGCGCGGGCGCACAGTGCTGCTGACCACTCACTTC
ATGGACGAGGCGGACGTGCTCGCCGACCGCGTGGCCGTGCTCGCGGCGGGTCGGCTCGCG
TGTGTGGGCTCGCCTTACTTCCTCAAGCGCCACTACGGACTCGGGTACAAGCTCGCGCTC
GTCAAGGATGCCAACTGCCAAGTCGATCTAGTCACTGAATTCTTCAAGACGTACATTCCC
GATATAAAAGAGAACACAAATATAGGATCAGAACTAACATACATCTTGCCTCACGAACAT
GTTAGTAAATTTCCCGATATGTTCAAAGATTTGGAAGACAAAAAAGACATTTTGAAAATA
TCTAGTTATGGTTTGTCATTGGCCAGCCTCGAAGAAGTTTTTATGAAGTAATATCTACAT
TTAATTTTCTTTATACTTTAATTTGGTTGTAATATTCTAAAACTGAATGCTTATCCAGTT
AATATTTACTTGCTGTTTTTTCAGAGCCGGTGCTGAGTCTAATACAGAAAACGAAGGCAT
TAAAAATGAGAATCATGTCGTACCTTATAGTGACGATGTTAATGTATCCATTGAAGATCA
TAATTCCAGACACCTCGATTCACTGGAAAAAGTTCGCGGCTTTAAACTACTCAATAATCA
CATAAAAGCTATGTTTTTAAAATTAGCATACAACACGATGAGGAATAAACTAATTGCGTT
CATACAGTTTGTAAGCCCGGTGATTAACATAATACTTTCAGTATTAATATCGAGATCTTG
GAAGTTTCTTTCTCAACTACCCCCTCTAACACTAAGCTTGGAAAGTGGATTCAAAGCTAC
CCAGACTCTACTATCGGAAGGTGCTAATGTAACGGACGATAACTTCGAATCCAAAGCCAT
CAAGGCATACAAAAATTTCTTTAAACAATCTACTTACCCTGACATGAGTTTGACTGATAT
TGGGACCATGGACATGGGAAAGTTTTATTTGAAATTGAGCGAGACAGACCTCTCTCGAGT
AAAATACGAAACGTTGATTGGTGCTACATTTGACCGTAGCAAAATAACTGGGTGGTTCAG
TAATTACGGATACCACGACTCTGCTATCTCGCTCGCACTAGTGAATGACGCCATACTGCG
CTCTCTTTCACCGGGAAGTTCATTGACAATCGTTAATTATCCACTGCCTTACTCCATAGA
AAACTTGGTGGAAGTAATGGCTACCGGAAGTAGTATGGGATTCCAGTTTGCCTTCAATAT
AGGATTTTGTATGGCTTTTGTAACTTCGTTTCTTGTACTATTTTCTGTTAAAGAGCGTCG
CAGCGGCGCCAAGCTCCTGCAGCGCGTGTCGGGCGTGCGACCCGCCGTCATGTGGAGCAG
CGCCCTCGTGTGGGACTGGCTGTGGCTGCTTCTCATATACTTGTGTATTGTCTTTACCCT
CGCATGTTTTCACGAGAAAACACTGTCCACGCCTCAAGAATTGGGTCGCGTGTTAGTTGT
CCTCATGGTTTTTTCACTTGCAATAATACCAATCCACTATGTGGCATCTTTCTTCTTTGA
TGCTGCGGCGACAGGGTTTTCAAAAATGTGTTTCGTGAACGTATTTAGTGGTTGTATGCC
ATTTTTGATAACCGAAGTGTTGAGATTACCTCAAGTGGGTAATCCTTTTTACGCACATCT
TTTTGATTGGATATTTTCACCTCTACCAATTTATTGTATTAGCCGGAGTTTCAGAGACAT
GAGTGTGTCGTCATTTTCACTGTTGGCCTGCGATGGCCTTTGCGACCAATTACGTATTGA
GAATTGTACACGACACACAATATGTAACCAGCTCAACCTAACCGTGTGTTGTATTGAAGA
CAATCCCTTCATGAAATGGAGTGAACCAGGAATTGGAAGATACTTGTTTACAATGTTCGC
TGTTGGTACAATTACATTCACGGGACTACTCATAAAAGAATATGAGCTACATAAAAAGGT
TAAGTGTCTAGTCTCTCAAGATGAGAAGTCACTAATTAAAACGTCTACAGATGAACGAGT
AGAGGATGAGGACGTATCAGCAGAACGAGATCGCGTGACGTCACTGTCGAGCAGCGAGGT
GTCGGCCCACAGCCTCGTGTGTCGCGAACTGAGCAAGCGGTACCGCCGCCTCGTCGCCGT
CGACAGACTCACATTCGCAGTACGCGGCGGAGAGTGCTTCGGACTGCTCGGAGTCAACGG
AGCCGGCAAGACCAGCACCTTCCGCATGCTGACCGGCGACGCACGAGTCACTCACGGCGA
CGCGCTCGTGCACGGACACTCGGTGCGGACCCAAGTACGGGACGTGCACCGCCTCATCGG
TGAGTACACTAGCACAGTCCGCATGCTGACCGGCGACGCACGAGTCACTCACGGCGACGC
GCTCGTGCACGGACACTCGGTGCGGACCCAAGTACGGGACGTGCACCGCCTCATCGGTTA
TTGTCCCCAATTTGATGCACTTTTCGATAATTTGACTGGACGGGAGACATTACAAATCTT
TTGTCTGCTCCGTGGTATTCCCACGTCGATAGGAGCAACTCATGGTATTCATCTCGCTAA
ACAGCTTGGATTCATTCAACACTATGACAAAAAGGTACGACAATGTAGTGGTGGAACAAA
AAGAAAAATCAGTACGGCTGTTGCGTTACTCGGTGACTACCCCGTTATATTCTTGGATGA
GCCTACAACAGGAATGGACCCGGCATCGAAGCGTCTAGTGTGGCGCGGCATCAGCAGCGC
GGTGAGCGGCGGGCGCAGCGTGGTGCTGACGTCACACAGCATGGAGGAGTGCGAGGCGCT
CTGCTCGCGACTCACCGTCATGGTCAACGGCACGCTGCACTGTCTCGGCTCGCTGCAACA
TCTCAAAACTAAATTCTCACAGGGTTACACTATTGTGATTAAATGTAGATCTGGATCTAA
TAGGGATAACGACGTAGCAAACATCAACCAATTCATGAAAGAAAATTTCATTGAAGCTAA
ACTTATTGAGACGTACCTGGGTATGAGTACGTTCCACGTGTCGGCGGCGGGGTTGCCGTG
GTGGCGCGTATTCAGTACACTTGAGACGGCGCGGAACTCTCTGCCTATCGATGACTACTC
GGTTGCACAAACTACACTCGAACAAGTCTTCCTCGCATTCACAAACCAACAACGGACACT
AGATTAAGTTGATCGTTTGTAGTATTCTCGATTATTTAATGTTCTTACAATTTTAATACT
TTGTCGATTTAATCTCTCGTCTCGTATTTGTCTCACAAGTAATGAACATCTTACATTGTT
AGATTCAATTTATATTGACTATGGTGTTGTTTGGATTAAAAACTCTAGTTTAAGTCTTAG
GGTTCCGTAGTCCAAACTAAGAACTCATATTAAGGTTTCTGTGTCCGTCCGTTCCTCTGT
ATGGCGGGGATTTCTTGTTAAAGACTAGCAAAGGTAGAAAGATGAGATTTTTTGTAAAAT
TTGTGTACTTTTTTCACTAATTATACAGTGAAATGTAGTGTACAAATAGAAAAGATACCA
GAACCTATCGTGAGGGTGGGGTATCATTAGGATTTTGTTTGGAAAGGACGGTTTTAATTT
AAAAACCTTATAAAGTTACTTACATATTGTTGTTGTTATTGCTTATAATTGATAAATATA
AAAATGTGTGCCGTTGTATAACTACGGAACCCTACATGCGTAGCCTGATACGCGCCTAAC
TCCTTTTTAAAAATCATCTTCACACAATCTATATCACTTTAGTTTTGATAAGGTAAATGA
GAAACTTAATTATTGTAAACTGAATTTATTATGATATAGAAAGTATTCAAAATTACCTAT
CTATTTAACAGAACTCTACACACGTTATTTGACATTTTGTAATAATGGCCTTTGCAATAA
TTATAATCCTTATAAGATAAAAGATAGTGCACATTTATAATGAACACATTTGATCGTCAA
ATGAGTAATATATGTTAAGATAAAAATCATATGTAGTAATATATGATTTTTTTAATACCG
TCAGTTGGTCTACTGCGTGGTAAGAAAAAACATAGAGGCATTAATTATTATTATTGCTCG
ACCCATTTTAAACGAGGTATAAAACATTTTCTGAGACGATAGAATCTTTTACATTGTCTT
AGACCTATTCAGGTACGAGAGAAGCCATTAACACTCACAAACTAAATCACAAAATGACGA
ATTAGAAGTTCAAGAAGAGATATTTTATTTTAATTAATTATGATTGGTAGAATTGGTATA
AACAAACCGCAGTACTTGTCTACTGTTTCCTATAGATTAATAATTGACTGTAATTACTTC
AATTGCCACAGTTCAATTGATGCCGTTTGTGTCGTCAAACATCTGGCTCTCTTTATAATT
GAAAGCTGACTGTAATGAAGCCTAAAGCAAAAAAACTAAGTAGTACCTACAACAGACTGT
AACTCACCATGTATGTTCACATTAACTTTTTTGTAATAATTAAACGTTATGAAGGGATAC
TTTCTGATGTTATATTCTTTTACCAAGCTTGTTTGTTTATTGTGTAGAAGAATCATTACC
TACGTATTATATTAATGTTAAATGTCATCTTGCCATGTCTGTTTATAAATACGACTACAC
TCATATTGTTGTGATACTTTGTTATAAGGAAAACATGTTTGTAAACTAGATGTGTAGTAT
TGTGTACCTAAAGTTTAAAATAAATATACAATGTTTCAAATACTAAAAAAAAAAAAAAAA
ATACTAAAAAAAATAATTACCAACAAACAAAAATCAACCTTAGTTCTCA
(7489 bp)

- SilkBase 1999-2023 -