SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_TrvaFAMAMG_TR16283c0_g2_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_RNA-directed_DNA_polymerase_from_mobile_element_jockey-like_[Plutella_xylostella]
Ontology
GO:0003964 F RNA-directed DNA polymerase activity
GO:0006278 P RNA-dependent DNA biosynthetic process
GO:0008152 P metabolic process
GO:0016740 F transferase activity
GO:0016779 F nucleotidyltransferase activity
Transcript
Level
FPKM:1.71 TPM:1.67
ORF EntryO_TrvaFAMAMG18846_5prime_partial:A_TrvaFAMAMG_TR16283c0_g2_i1
Sequence
(Nucleotide)
AATCAATGAATTTCTCTGTGGTGTTGATTGGCTATCTATAATGAATGAACCCTGTCTCGA
CGAGGTTATTAATCAATTTTATATGATTATAAACAGTTGCATATCACAATTCATTCCTAC
CATTGTGACTTACAAAAAACAGCAATATCCAAATTGGTACAGTAAGGCTTTAATTAGAAT
TATTCGTGAAAAGTCTAAAGCTCATTTTAAATGGAAAAAATTCGGGAATCTTCGCGATTA
CGATGAGTTTAAACTATTGCGAAGTAGGCAACATCGCGTTCAGAAGGAATGTTTTGAAAA
CTATATTGATGTTACAGAAAATCTTATAAAATCTGATCCCAAAAAATTTTGGTCGTATAT
AAAATCCAAAAGAGGTGGATCTAATTATCCTAAACGGGTAACGCTAGGTAACCATGAGTA
CACAGAGGGGATGAATATTACCAACGCGTTCAACGATTTCTTTCGCAGTTCTTTTGGTAC
ACCTCTTATGGATTATGATTTGCCTGGGTCATCTCATAGTCCTTGTCACTCCTTGTCAAT
GTTACAGTTTCCAGAAACTAAAGTAGAAAAAGTTTTATCTTTGCTTAACACAAAGAAAGG
TCCTGGTAGCGACCAGATCCCACCTTTCTTTTGGGCTAACTGTGTAAAAGCCTTGAAAAC
TCCTATTACTATTATTTTTAATAGATCTTTGCATGAAGGTAATTTTCCTAGTCTCTGGAA
GCAAGCACATATAGTTCCGATCCACAAAAAAGGCTCTAGGGCTAAAGTAGAAAATTATAG
AGGTATATCCATTTTAAATACGTTGGGGAAAGTATTCGAAAAACTTGTTTACGATGAAAT
CTACCCGGTGATTTGTCAGGGTATACCGACAACACAACACGGTTTCTTACGTAAGCGATC
TTCGATTACCAACCTTACATGTTTTTCAGAATTTGTATGTCAGAATATGGACCAGGGTGG
GCAGGTAGATGTAGTTTACACTGACTTTGAAAAAGCGTTTGATAGGGTGGACCACGTCAT
TTTACTTCATAAACTAAACATGCTCGGTATTCACGGAGATCTACTTCGCTGGGTTGAATC
CTACTTGTCGAATCGCTCACAAGCCGTTGTAATGGGCGGATATAGGTCTAACTTTATTAG
CATTCCAACGGGTGTACCTCAAGGTTCTCATTTGGGACCTTTATTTTATAATGCATATAT
ATTTGATATTGTTGATTGTTTTTCTTTTACTAACCACTTAATGTATGCAGATGATAAAAA
AATATTTTGTAAAATACGTTGTTTGCAGGATTGTGTGAACTTCCAAAGCGACCTTAATAA
TCTGTTCCTTTACTATACAAAAAAATAGAATAACGGTAAATACTACTAAGTGCCAAGTGA
TTAGTTTCACTCGCAAGATAAAACCATTGAACTACACATATAACTTTAACTCTGTTGTAA
TACCTAGATCAGAATGTGTGCGTGATCTTGGTGTATTATTGGATAATAGGTTGCTTATGG
ATGATCATATTGATACTGTAACAAATAAAGCTTATAAAAATTTAGGCTTTGTTTTGAGAG
TTTGTAAACCGTTTAAAGATCCTTTTACGCTTAAATCAGTATATTGTGCATACGTTCGCA
GTATACTCGAATATGCGAGCTCGATTTGGTCTCCCCAATATATCATTTACAAGCAAAGAC
TAGAGAAAATCCAAAAAAAGTTTATTGATCATATGAACTATAGATATAGGAAAAACTCAT
CCACCTATGTAGACGGTTGCGCGGAGTATGAACTCTTAACACTTGAAGAAAGACGTATTA
TGTTAGACATGCTTCTGTTGTATGACATTATACATAGTAATGTTGATTGCATTGATCTGG
TTGGTAGCTTATTCTATTGCGCCCCGACGAGACGTACTCGCAGGACACAATTGTTTCATG
TACCGTTGCGACACACAAAATATGCAAAAAATTCTGCGCTTACACGTATTACTAGAACGT
ATAGCGATCACTTTGAACATATTGACTTGTTTTACAACTCTAAATTACAACTGAAGCGGT
TGTTGGTGCAGACAATCATTTCGATGCGATAGTCACTGATTTTGTATTCTCTTTTTATTA
TAATTTTTAGGTACTGTTAATATTATCTTTTTATGTATATTGAATTATGTGAGCATGTAT
GTAAATTTGTACACTTTGCGTTAGGTTAGTTATAGGAAGGACTGTAATTGGTCTTATTAT
TTGTTACTATTAGTTATAAGTATTTTTGTAACACTGTTGTCTTTCTTAATAAATAAATAA
ATAAATAAATAACAGCGAATCAGCGACAGCTGTTGAAAGACTTCAAGCACACGCATTACT
GTATTTTTATAGTCAAACTCTCTTGTTATACATCTGCATTGATATAATTCAAATAAAATC
ACGTTACAAGACGACTCAATACAAAAAGGACCGAGATGAATACAAATACCTATGTACACG
TTTTGCATAATTGCATGTATTCAAACAATAATTAGATTGCAATTAAAATGGCGTGCCAAG
TTTCTATTATTTTCATTTAATTCTAACAGAACGACAACGCACTTGTACACACATGAAAAC
AAACTCATCAATTACTATTACGAAACAAATTGAGGACAAGGTCTTATTTAGGAACTGAAC
AAGTTGCGACCAATGGGTATATTAAAATTCTTTCAAACGAGTTTGTACTTTGAAACAAGT
GACTGTGCAAGTGGCAAAAGTATACAGCCTAAATATTACTACTGATTTATTAAACACTTA
TTATATTTTAATTCATTAATTAACTTCTCCATATTCATTTATTTGCTCATTTTTTACATT
ATATCTTTAAATTAACTTTATTATTATAATATCCACATTTTCGTATTAATTTCCATAGGT
TATGTTTCTAACACATACATAGTTTAAAAAATTGTCAAAGTAACTGTACCTACTACCAAC
CTGAAGCTTGAGAAAAAGTTCAATTCACAATTCAAATCAATTCACACTTCAATGTGAACA
CGTGACATAAGTTCAGTAATGTAAATCAAACACAAATCGAAGATACTCTCAGGACAAAAA
AGCGATAAAATTGACAATGCAATGGAATGTTTCGGTGATGCCGTCAACAGACTAAATATA
GTTTGGAGAGGTACGATCGAGCAAGTGTGTCCACTACTGGATCAACAAGAGGACGGACTT
TGCAATTGGCCTGGCTATATATAAGTGCCCGGCTTTCCGCTGCAAAATGCGCAAAAGGAA
AACTCTTTTAAAAATGACCTTTGACAATTGCGAAAAAATGAAGAACAGACATT
(3293 bp)

- SilkBase 1999-2023 -