SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR15944c0_g1_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		daxx_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003723 F RNA binding
GO:0003746 F translation elongation factor activity
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0006412 P translation
GO:0006414 P translational elongation
GO:0006452 P translational frameshifting
GO:0043022 F ribosome binding
GO:0045901 P positive regulation of translational elongation
GO:0045905 P positive regulation of translational termination
Transcript
Level		FPKM:89.09 TPM:87.29
ORF EntryO_TrvaFAMAMG18291_complete:A_TrvaFAMAMG_TR15944c0_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
TGCAGCTATAGCTAAGTTTTCGGTAAAAAATGAGTAAAAGTTAAAAAAGATCAGTTGAAA
ACAATCAAGTTTATTGTAAATAGTCGTTAATGTTTAATTTCTAATATAATTTAATAAATT
CTATGGTAATTACAAAGAAGGGCGTGATCAATAAACAGACAAAATGTTTGAAGATTTAGC
CGATTTCGACGACGTCAGTGACATGATTGTCATACCACCAAAGAAGGGAATAAAGAATCA
CGCCCTCGATTCACTGAGTATGATCGTCTTAGATGATGAAACAGGACAATCAAGTACCAA
AAAAGAAGTAAAGTTTGATAAAGCATTTTTAGATAACAAAAATTTAGTCAAATTTATAGA
AAAATGTTTCGCCCTCGAAAATTCCGAGGGGATGATGCGGATTATCAATAGAACTCTGTT
AGGGCTGTACAAAAACACATGTCCAGAATATAAAACATCACATAGATTCCAAAATATACT
GGACAATGCATTTTTGAAGTTAAAGTTGGATCCGAAACACAAGTTTTCGCATATAAAGGG
TTTGTGCGATGCATTGAAATTGCACAGAATTAAGAAGAGAGCTAGGCTTTATACACTCGC
CACAAATTTAAATCAAGACAAGGATAATACTACCACAGAAAAAAGACCGGAAGGTGAAAT
TCCAACAAAGAAGTCCAAAGAAGATGTTATAAATCTTGATTCTGAACACGAAAACGTTAT
TGAAATTCAAGATGAAGATGACATAATTTGTGTGGATAACAATTCAAAATCAAAGAAAAC
AAATAAGACTGAGTCTAGTACAAATGAATCTATAGATGTTGATGAATCAGATAGTTTGGA
AGAAGATATTATGACTATAAAAGAAGAAAGTACGACGACCGAACTACTAGTGCCCGTCAA
TAAAAGTTCACGTGACATTGAAACTAGAATTAAAGAAATTGAAATCACTATCTCTAATTA
TAAAGCGAAAATTGTTAAGTTGGAGGAGCAAGAAGTTTGTGATGATTCCCATTATTCACC
GTACATTCAGAGTGAAAAATTAAAACTAAAAATCGTGGATTTATACAAAGAACTCTGCAG
CCTCACCGGTGATGAGCCCATCAAGAGACGCGAAGTTCGACTGCAAGTATCAAAAGATCA
CGCGCCCGCGCCCGTGGAAAAACTAGAACAATTCCTCAACGATAACATAGGGCCTAACGG
AGAACCACCATTCCCAGATTTCCATGACGTAATGACATGCGTGGCCGAGGCAAATGCTAC
GGAGTGCTTAGGATGGAATGCAGTCAAAGTTATGAGCGAAGCTAATGCGTTGTTTATTCA
ATGCGGTCGCGCCTTACAAAAGCGTCGTCAACAACGCGAATGGCGCGATTTGCTCAGCCG
AGTGAAAACTGAAGGTATTCAAGATCCCGCCGAAGATGATCCCAAGCTGCTGGCCAGACT
TGAGGAGAATCGTCGAATAGCTTCCAAGAAAGGACGCGATCTTATGGATAGGTTCGTGAA
CATTGATTGTGATGTACCTAGTCTTAACTTGCATGTAGACATTAATGATTCCCATGATTT
GATTGAAAATGATTGCTCTGATGATGAAAATGATAATGAATCGAATGATCAAGAGAAAGA
ACAAGAAAGCAGTAGCGATAAAGATGATGACGTACAAATCATTGATGAAGTCCAAATAAA
AACAGAGAAAGATATTAAAACAGAAAAAGAGGACAGTCCTGTTAATACAAAATTCAGTAA
CTGTGAAAATAAAAATGTACCTGATGTTGAAGTGAAGATTGAACCAATAGATTTGTCTGT
GTTTATGAAAGATGATGACGTCACATCCGTTATATTCGATATTGAAGATCCGTTTTTGGT
GATCGACATTTCGTCTGATAGTGAAGATGACAGCCCAGACAATGATGATAAATTATGAAA
TATTGTAGCATTTTATTGTATGCGTATTTATTCAGCTCGTAACATTGAAATAGCCAAGTT
CCGCAAAAACTATGTTAGTAAATTCAATGAAATATGCACTAAATTGGAGAAAGTTTTGGA
TATCATTTCAGTAAATTTTAATGACAATAGTGAATTTTGGGGCAAAGTAATCATTCATAA
TAGACAGTAACCATGGTTTAGTATTTTTATGTGAAAGATATTTTCGAGCAAAACGACGTA
AGGAAAACTACTATTGTTTTGCCAGTTTAGTATAACTTGTGTATTGTGTGAAGCAATAAT
AAGTTCAATAGATATTCTCATACATTCGTGTTGTATCAGTTTAAAAGATATGCAGTGTTT
TGATTGTACTGTGGTCATTTATAATTATTTACCTGTGATAAACCACTGCCTTAGAAGTCA
CGATTGCAATTAAAATGTTTTAAATATTTCTAATGTTAAAATGGATTTTAGTAGAACATC
ACTATTTTAAAAGTTTATTTGAACTGCTTGTTACAATTATTCATATTAGATTGTAGTGTA
TTTATGATTGCGGTATTTAAATAAAGTTTTCGCATTTTAATTGTGATTTCATTTAAGACG
ATATTACAAATACTTCCAATAAGTTTCTGACGAAGACTAATAACTTAATGTTTAGTATAA
TTTGATACGTATTTGGGGGGAGGGTAGAAAACAAAAATACAAAAGTAAAGAATCACAACT
CACATTTTTTAGTTCTGTACAGATTTAATTCGATAGACTGTTTAAATAATTATGACTGAT
TAACATATGCATATTCGGCAATAATTGCATTTCAAATTCGGTATTTAATAGAGACAAAGT
TTAAGAGTGAGTTTAGACACGAATTTTCATTATATACCAACTTACGTATATACAGATATT
AATAAAATGCAACATTTCATTCTGAACTAGCCCCAATATAAAAATAAATCTTAATTCTTT
AAACAAAAACTTGTTTGTAGTGTTGAAAGTCTCTTAGTCACAAGGTCGGTTTTGGCCTCG
CGCTTTTTATACAATATTAAAGTGGATAACAATTCTAGTTTTGATCCGATTATTTCTTGA
GACCATGTGTATAAGAGAGCTACTATAATAGTATTAGTGCACCAAACAATGAAGTCTAAA
TTAATCTAAAACTTGGACCAAAGCACAAGTAGCACAACACAAACGGGTACACCTTAAGTT
TACAAAAGAAAAATTAGTTTTTACTAAAGTATCTTTTATTTTACACTTCCCGATGTCTAC
ATGTCTCATACCTTAGGCTTTTTTTTATATAAAATAAAAACCTGATTACAAGCTGCAAAT
ATAAAACTTCAACAATAACGATTATGCAAATTCGTTGAAAAAACGTACGCGCGGTAATTT
TAGCAGCAGTTTATTTAAATAATGCAGTGTACGAATTTTGAATGCTTAAAAAAATATCTC
TATAGGGCCTTACCTTACATTCTTACATTAAAAATTTCGTATAATCATATCGTCTTTGAC
AATTTGATGAATGAAACTAAATCGACAAATCCGCTGACATCAGTGAAAGATAAATCTAAC
TAGCCTTCGCTGGCAACACTTGCGACTAAAGGGCACTACATTAAATCGATTAGGCAACAA
TAAGCCACTTGAGTTTGTAACAATTCATGTTTTCAAACGCACAGAGCAAGGAAAGGCCAA
AATGAGCAAAATCTATTTTATAAAATGATAATTTCCCTTCTACAAAATGCATATCAGTCT
TCGCTGAAAGATTACCTTCAGGAGACGTGATTGTCGTCAGTCTTGATTGATTCAGCACGA
GTTTGGTCTAATTCACCGGTTCGTGACACCACGGAATGCAAATAACTAAGGTAGTACGTA
GTTCAAGATGGAAAGTGTTACTCATGAAGGGATCACGACTCTTCCGAGAGGCGGCTTCAG
TCGCCTCACAGAATCATTATTTAGGACTATTCAATCACACACCACATTCAAGAATTTTAT
TTATTTTTTTGCATTTTTTGTTTTTTTTTAAGTATTTTTATGTAGCTTTAAAATATGGTA
CTAACTTCAAGTTTGCGTCCATCTTTTCGGTACAATTATACCAAAGTGGTATTAATCTTA
ACCTAAAGTCTGTTAATAGGAATGATTATGACCTTAAAATGCATAATGCAGTGTATTTGT
AGGATGACATCCGAGGTTTTTCATACACTATCTCTAAGTACCATTCACTTCTATCATTGA
GTATTTACGTTGTTCCAAAACAGGAGAAGCAAATTTTAGTAACCAAATTTGGTTCAGCAG
TTTTATAATAAGAAATTTTGAATATATTTCTCCCTGTAACCAACCCATAGTTAATGATCT
CGAATAAATCGTCTCAATCAATAGAAATAAAAGTATACACTCCACAAAGCATTTCAGTTT
TCTACATACCTAACAACAGACCAAGTGTTAAAATGTTGACCGAGTAAACTGCATGTGGAC
GCCATAAGCGAAAAGAGAACGAACAAAACAAAAACAAATATGAAGTTTTGGTCCGACGAG
TCGCGGCCGCCGCGGGTGACCGCCATCGCTGATCGCACCAACTCATTATAACATTACTTT
ATTGGTGCAGGCCATTCATATAGTTATAGTTCTTAATCACCAACAATAAATAAGCTCTTA
ATTTGACAACTTTTATTAAAAATCATAAGACACTTATTTACACAGTACAAACTGTTCGGG
GTGTTGAAAATTGCAATGATTAATTTCATGGTAAATGCGAAAGAATATTTACTTGTAGTA
ATTAAAGATACTTTTAATAACTTCATTTGGCTAACAATATCTGTACAACTGCGAAAGACC
GCCAATTTCACCAGGAAATATATTAATATTTGATAGACAGCTTGGGTCCCAGTAGTCGAC
ATAGATTGCAGTTATGTCAGCGATCGAAGGCACACCGCGGTGTCCGCGAACCGTCTATGT
ATTTTAAGTTAAATTTATACATAATATTATGTTTTACATTTATGTAAGTTGTTGATTGTA
AAAAAATTAAAAGTTTGTTAACCCTATAAATGCTGAGTTGGTTTATTTGTCGAGAGCTGT
GTTTGCTTTGACGGCGATGACGCACTCCTCACCGCAGGATTTCAGCACGGTGCACAACAA
TTCCTTGCCACTGTCGAAGTCGGAACGCAACTGTGTACCGAGATCGCCGTCCGGTATTTT
GAGGTCCTCGCGAAGGTCACCGTTATCAGCCATGAGCGTCAGGTAGCCGTCATCCGATAT
GTCAGTCAGTTGGTAGTCTTCGCGCTTTACGTGGGGAACATCCATGTTGTGTGTAGAGGG
ACAGATATCTTCGTACTTTTTGCCGTTGAAGATATCAATTCCAACCAAGTGAACTTTAGC
GTGACCGTGCTTTCCAGTTTTGGATGTGGACATTTCAACAATCTTGCAGGGACGTCCCTT
CAGCATAACGAATCCGTTTTTACGTAGGGCCGAACATTGCATGGGAAATGTGGCGGAGGC
TCCGGAGTCTCCGGTCTCGAAATGTGTGTCCTCGATGTCACCCATTGTTGTGTTTTGAAT
TTAACAACGGTCAGGAATGATATGTGACCGACGGGTTCTTCAACCGAAAGGTCAATTTGC
GCCTGCGTAGCACCGACAACACTCACTTCCTGTCGCGGGGTTCACAAAATGCGTGTGTCC
TCG
(5583 bp)

- SilkBase 1999-2023 -