SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR14934c0_g2_i3
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		Ef1alpha-like_factor_isoform_1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0000184 P nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
GO:0002184 P cytoplasmic translational termination
GO:0003747 F translation release factor activity
GO:0003924 F GTPase activity
GO:0005525 F GTP binding
GO:0005829 C cytosol
GO:0006412 P translation
GO:0006479 P protein methylation
GO:0018444 C translation release factor complex
GO:0044822 F RNA binding
Transcript
Level		FPKM:17.10 TPM:16.76
ORF EntryO_TrvaFAMAMG17704_complete:A_TrvaFAMAMG_TR14934c0_g2_i3
Sequence
(Nucleotide)
TTCAAATTTAACATTTATTAAATACATTTTTGGCAATTTGCCATGAACTTCCGGTCCAAG
ATAAAGACACACGCGGATCTAGTGGGAAAAGAACCTAAATAATTATTTTAAACCGGGAAA
GAAGACCAAATTATTTATTATAAAGTCTGCAACAATAATGTCCAATAACGGTGCTCCGGA
TTCATGGGAAAATGAAGCGGAAATTATAGGTGAAAAAGGTGCAAAGGATTCTAATGATGT
GTCTTCAAAATTTTCCACGTTGAATGTAAATGCCATGGAATTCGTGCCTACTTTTCCTAA
GCCTTCTCAGGCTAGCGATAGTACCGATTCCCCTACCTCCCCCCAGAAATCAGAAAGCGG
TTCTTCAAATTCAGCCGGGAGTCCCGTCTTAAACGGATGTGGTGATGGAGGTGCTGAGAG
CAGTGACGGGGGTGCGGCCTCTGCATCTCCACGTGTTGAGGAGCCGCCACCCACAGCAGC
AACAGTTCCACCTGACGTCTCTCCAACTGCCGAAAGTTGGGAAGTTGAGGCAGATGACGC
ACTACTCACACCAGAAGATAATAATGAGCCCGAAGAAGAAGAATTGGAACCACAAGTAGG
AAATGCAAACCCTAATGAGGATGGTGAAATGACAAAAAAGATCCCAAAAAAGAAACCGCC
ACGAGTGGAAGACACAAGAAGCAAAAAGGAACATGTAAATGTAGTATTTATAGGACATGT
AGATGCTGGAAAGTCTACAATTGGTGGACAAATTATGTCACTTACTGGAATGGTAGACAA
GAGAACATTAGAGAAATATGAAAGAGAAGCTAGGGAAAAATCAAGAGAATCATGGTACTT
ATCATGGGCCTTGGACACAAATCAAGAAGAACGTGACAAAGGCAAAACGGTAGAGGTTGG
AAGAGCATATTTTGAGACTGAAAAGAAGCATTTTACAATTCTTGATGCTCCTGGGCATAA
AAGTTTTGTACCCAATATGATTGGTGGGGCAGCACAAGCTGATCTTGCTGTTTTGGTCAT
TTCTGCACGTAAAGGTGAATTTGAAACTGGTTTTGACAGAGGGGGCCAAACACGTGAACA
TGCAATGTTAGCAAAAACAGCTGGTGTAAAACATTTAGTAGCACTTGTCAATAAGATGGA
TGACCCTACAGTCAATTGGGATGAAAAAAGGTATAATGAATGCAGAGACAAAATATTACC
TTACTTAAAAAAATTGGGTTTTAATACAGCAAAGGATCTATCATTTCTGCCTGTTTCTGG
ACAAACTGGACAAGGATTACTAGAAAAACTAACTGAAGAGGTTTGTCCATGGTACCGTGG
TCCATCCTTCATTCAGCTCATTGATGAACTTCCATCCTTGAACCGCAAGGTTGATGGTCC
ATTCATCATGCCTGTTGTTGACAAATATAAAGACATGGGAACCGTCCTAATGGGGAAAGT
TGAAGCTGGAACTACACGTAAATCCAGCACACTATTTTTGATGCCTAACAGGGTGCAAGT
GACAGTTGATCAACTATGGTCAGATGATATTGAAGTGACGTCTATTGGTCCTGGGGAAAA
TGTTAAAGTGAAGCTTAAAGGAATTGAAGAAGAAGATGTGTCACCTGGCTTCGTTCTCTG
TGATGTCACTGAACCCATCACAACAGGAAGAGTTTTTGATGCCCAAGTTGTAATTTTAGA
GCATAAATCTATCATCTGTGCTGGATACTCTGCTGTTATGCATATACATTGTGCTGCTGA
AGAAATAACTGTTAAGGCTTTGATTTGCTTGGTTGACAAGAAAACTGGAGAAAAATCAAA
AACGAGACCACGCTTTGTAAAACAAGACCAAGTTGCTATCATGAGGATAGAATGTGCAGG
AATAATTTGTTTAGAACCATTTAAGAAATTTGCTCAAATGGGCAGGTTCACATTAAGAGA
CGAAAATAAAACCATTGCAATCGGCAAAGTTTTGAAGGTGGTTGAATAGAAACGGGGTCA
GCGTTATAATTTATCTAGGTTAGGCCTTTTCACAACTTAATGTATGGAAGTGTATGATAA
AACAACTAAAATGAACCTCATAATTCATACACTTCCCACTGATTTTTTATATAATATTCC
ATTGTCTTATTTACTACATGCAGTTAAAAAAAATTGAATATTATATCACGATGTTTTTTA
CTAAATTCCTATAGTTACAAAATATATAATACTATGTATGTTCTTAATAAAAATTACAAA
AGTATTTAATAGACGTTTTTTGTTTTTAGCTTATTTAGCAACATAAAGTTGACAAAAGGC
ACTAACTCTAGTGTAACGAAAAATAATTACTAAAACAGAATTTGTAGTTCTGATATCAAC
ATATTATTATGGTCCACTTTTATTTAGAGTGAACTCTAACTACTATCTGTTGATGCCATG
CCTCTTATAATATTTGAAGATCACTCAAATTAGTCTAATTGATACTTATATAAGCATATG
ATTGATAGTAATTACGATATATTTTTACATATTATCGTTTAATTATAAAGTGCTGTTTTA
TTTTAAAATATTGTTCTTTGTCACATTTATTTCAGCTTATTATTTTAGTTTACGTTCAAC
TTCACTTAAATATATTGACGTTCTAGTTAATAATAATTAAAACACTTAATTGTGTACTTG
TTATGTTAAATATATATTTTGCAATATTTTATTGTACCTTATAGATTTATAATTTATACG
TTTTAAAACCAGAATTAAAAGGGGTAAAAAAAATGCGAAGTTTGTTTAGATTAAATTTTA
TTGAATTTAACCACTTTGTATTCTTGAACTCAAGGCATTTGATGATTTCTGTTATAATTT
TGTAACGCTTCAGTTTATGGTGGTATATACACAGTACTTAGAACACTAAAAACGATGTGC
GTTTAATTTAATACTACCTTCTCTATGATATTAACAATGTTCATAAATGTATATTATGAA
TTTTATATATTGTCAGCTTTTTAACAATACAATAAAATTTATACATAGAGGTTATTGTAT
ACTATTTTTTATTTATTCCAATTTTGGAGGTGTGCATGTCTGAAGTTTTTTTCTGTAGCT
GCTTAAATTTGCTTAAACGATTACGTTTAGAAAAAAATCATACTATTGTTTCCAAGAAAA
TTGCAAAGCAAACGTTCAACGAATTATAATAATAGGGAGTTTTTCATGCCTTTCTAAAGC
TTCATAATTTATGATATACATAAATTGGATACAACGTTTGTTACAATCACAACATCCGAT
ATTTTAAGCGCATCACCGGGTGTCCTTATGAATTACGATAAAAGAATTTGATATTGCTAG
TTTTTTGGTACCTAATAATTCTCTAGATTATTGATGATAAGTTTGCTTATTAAATTTGAC
ATCGACTAATTAATATTCATCACTAAGTGAGAAATTTTAAGTACTTATAGCAAAGTTTAT
CTTAAATAGACCCCAGTTCTTACTTGATGACTGATTTTATTAAATTACTCTCTCAATATC
CCAATCGTTTAAAGGCTTGTTTGGCCAAGGTATATTTTTACAAATTCTGTTATTCTTCGA
AGGGAGATTATATAATATTATTTTATTTATTTATGTAATATATTTTCTTTATAAGTTATG
GGGCGTCAGCTTGTGCATATTGAGTTTATACATTAAGTACATAAATAATAAAATATTTTG
ATATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGCGAAGTTTGTTTA
(3703 bp)

- SilkBase 1999-2023 -