SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR13638c0_g2_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_probable_E3_ubiquitin-protein_ligase_HERC4_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0004842 F ubiquitin-protein transferase activity
GO:0005634 C nucleus
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005829 C cytosol
GO:0007283 P spermatogenesis
GO:0016567 P protein ubiquitination
GO:0016874 F ligase activity
GO:0030154 P cell differentiation
GO:0042787 P ubiquitin-dependent protein catabolic process
GO:0061630 F ubiquitin protein ligase activity
Transcript
Level		FPKM:6.34 TPM:6.21
ORF EntryO_TrvaFAMAMG16799_complete:A_TrvaFAMAMG_TR13638c0_g2_i1
Sequence
(Nucleotide)
GCGAAATTGAAAGATTGTTCTCGATTTTTAAAAATGTATTCCTACTCATATTTTCTGTAT
CGCAAATAAAATTGAAACTGTTAAATTTATAGGATTAAACTAATAATCAGGAAAACTGAT
AAAAATTGTTATCTTTATAGACTGAATGACAAAGCACAGGTCATAATTAAACTTTAAAAA
AATTGTAAAATTACAACAAAATGTTTTGTTGGGGCAATGCAACTCATCATGAACTCTGCA
TCGATGGATCACAAACAATCGACTTGGTCATAAAGCCCACTCTATCAAAATGGAAGGAAA
GTGACCACATGCAAGCTGTAGCTGCAGGAGAATTTCACAGTCTGTACTTGACAAATAGTG
GCCACCTGTATTCATGTGGAAACAATGAAGTTGGACAGCTTGGTAGACAAACTAAGTCAG
ATAGTGGGGAAACTCCAGCTTTAGTGGAAACATTTAAAGATTGCACAATATCAACAATAG
CATGTGGCCTTCAGCATTCCTTAGCAATAGATGAGTGGGGACAACCATTTAGTTGGGGAT
CAGATAGTATGGGACAGCTGGGCAATAATTTAGGTGCTCATGCACAAGACAAACCCAAGT
TTGTCAAAGGATTGGCAACAAAAAATATAATACAAGTAGCCTGTGGAGCTTATCATTCTG
TGGCTTTAACCAACGGTGGTGATCTTTACTCATGGGGTGCAAATAGTTATGGTCAGTGTG
GTTTGGGTACTATATCAAGCAAGGAAATGTCACCTCAACAAATTACATCATTAATTGGTG
TACCTATTGCTTTAATAGCATGTGGCAATAATCATACATTTGTTTTATCAAAATCTGGGG
CCGTTTTCGGATGGGGGAAAAATACTCATGGACAGCTTGGAATTCAAGATGTTGAAAGCA
AATGCTATCCCACTCATTTAAAGACCCTTAGAAATGTGAAGGTGTGTCACATAGCATGCG
GTGAAGACTTCACTGTGTTCTTGACTTTAGACGGCGGCGTGTTTACTTGCGGAACCGGCG
AATACGGACAAACCGGCCACGGTACAACGAGAGACGAACTTGTACCTAGAAAAATAGTTG
AGCTGATGGGCAGCACAGTAACTCAGATAGCGTGCGGTCGTCGTCACCTGCTGTGCCGCG
TGGGGGAGCGCGTGCTGGCGTGCGGGTACGGCGCTCGCGGACAACTGGGCTGTCCGCACA
TGGCCTTCGCGCTGGTACCTACTCCTGTACCGTTCACACCTACTGACGAGTCGCCTCCAA
AGAAGAAAGCAAAGGTGGAGAGTTCGTCGACTTTCGGTCGTTCGGGCAACGTGGGCACTT
CTAAACGAAATTTTTCACCTGACACCTTCAAGGGTCCAATCAGAGTGTTCGCGGGCGGCG
ATCACAGCTTCGTGGTACTGAAGGGAGACAAATCTGGTCCCGTCGACTTCAGGACGCCGG
ACCATAGGAAACAAATACTGACCCTCGCTCTGCCCAAGTTGGCAGCGTGTCAAGTCTTCA
AAGACAAAGATTTTGTTAATCAGGATTTAATGGCGTATTTAGAGACGGTGTTCGGTTCGT
TGGCGTGTGTGAATGCATCGTTTTTATTACCTAACAATGGTCACTACGGTTGTAATACTA
AAGTGCCGGGAGTCGATTTGAGCAAAGCAGAAGAAGCTTTCGCTTTGATCAGCCGGTTTG
AGAATACTTCTATCAAGGAACTAATATTCAGTCATTTGACAGATAACATAATAAAGAAAA
TGAAAACCTCGCCTCCTGACGCCGAAGCTCTGAGGATGTTTTTAATATTGCCGCTTTATC
ATGAAATGAGAAATCCTAGACGTCACGCTAAGTTACAGGGTCCTTTTGCCGAAGCTTTCA
ACAATTTATCAACTCATCCTCAGAGAATAGTTAATATGTGGTGGGAAGCGCAGACTACAG
AATACTTTGAGATGCTCGTAGATATATTCAAAAGTGTGGTTGTGTACGAACTTATGCAGC
CTGTAGTTAGGACTTCTAAGAAAGTGCAATTCAAACACAGCACAGTACAGATATTGAACA
CGTTAGCTTTGTTGAACAAAATTAACTTTACTAATCCGAAGAAACCTAAAATACCGGCGG
AGTGTTTCTACATTGAGGATTTGAGTGACCATGTTGATATAGCTTCCGATTACATTAACT
GGTTATCAGATCAAACGTCGACACAGACTCACATGTGCAACTATGCATTCCTATTCGACG
TTCAATGCAAGTCCTTACTACTGAAAATAGATCAACAACTTCAAATGCAAATAGCAGTAA
GCCGAGCCACCACACAAATATTTACGAGATTGTTCATGGATCCCACTTACGAATATCAAA
GAGATCAGTTCTTAAACTTGACTGTGTCGAGGAACCATATAGTCAGAGATACGATGTTGC
AAATCAGTAATCATGATACTTCGCAATTGAAGAAGCCTCTCAGAGTTGAATTTATAGGTG
AAGAAGCAGAAGACGCCGGTGGGGTTAAAAAAGAATTTTTCATGTTATTATTGAAGGAAA
TATTCGATCCCGTGTATGGAATGTTTAAACAATCTGAAGAAACGAATATGATCTGGTTCT
CTAATAACCCCTTTGAAGATGACGTAATGTATTACGTTATTGGTGCGATTTATGGACTCG
CAATATACAATTCCATTATAATATACGTTCCTTTCCCGTTAGTTTTGTATAAGAAAATTC
TCGGTGAATCAGTAATGATGGACGACCTGTCTGATTTATATCCGACATTAGCTAATAGTT
TGAAAAGCTTGTTGGAATATCCCGATGAAGATGTAGAAGAGGTATTCGGATTATGTTTCG
CGGTGAACACAGAAGTATTCGATCAAATACAAGTGAATCCATTGAAAGAGAATGGTGAAA
ATATACCCGTCACTCACGAGAACAAAGCCGAATATGTTGAACTATACGTTAATTTCTTGC
TCAATAAATCTGTTGAAAATCAATTCAAAGCATTCAATCAAGGATTTCAAAAGGTGTGTG
GAGGTAGAATAATAAAATTGTTCAGATCTCATGAACTAATGTCTGTTGTTATTGGAAACG
AAGAGTACGACTGGGAAATGTTTCAAAACAATTGCGAATATAAAAATGGATACTCTGAAT
CTGATCAGCAGATTAAATGGTTCTGGGAAGCTTTCCACGAGTTATCGATTGAAGACAAGA
AGAAGTTTCTACTGTTCTTAACGGGCAGCGACCGCGTTCCTATACAGGGAATGAGAGATA
TTAAAATAAGAATCCAGCCAGTAGCAGATGACAGGTACTTCCCCGTAGCTCACACTTGCT
TCAATCTGCTAGATCTGCCGCGTTATAAAACTAAGGAACGACTCAAATATTACTTATTAC
AAGCTATACAACAAACGCAGGGTTTCTCATTAGTGTGATTTTTTAACTAGTCTTAGCAAA
AATCGTTGGTTAAAGTATTCGAAACGGTATCTTGAAAATGCAAAGGTTTAATTTAAAAAA
ATCGTCCAAAATTTTTGATTACGTCATAATTTTCATGGTTCCGTTTCGAAAACTATTGTT
GGGATTATTGATGTTGTTTTGTTTATCTATTTGTGATGAAAATTCTTTGAGAATTTTTGC
TACGAAACACGGGTTCGTTATTTAAAATTGTTTCTAGTGAATTAAGTTCATACACGACAA
AGTGTGGCTTAAGGAGGCACTATTGTTCTCAGCACGAGTGATAAAACTATGTAAAATAAA
TAAATATTTAACAAGCGTAACGTCAAATTTGTACTGATTTTTTAAATTGTTTTATCTGAG
TATGCTACAATTAAATTATGCTACGAATAAAGTTTTAAAATTTGTTTAAAAATAATTTAC
ATAATGAATGATAATAATTATATTTAAATTACTATTTTAATTTTCAGTAATTTCGAATAA
TATGGTTATTTATGACAGAATCGTTTCATAATTTATAAAACCTGTGATACAAATCCATGC
CTAATATTTATTGGTTAAAATCGAGTCTGATTGTAATAATAAATAGTAATGTGCGATCAA
AATAAGAACAAAAATTGCTTTTAATACTTGAGATTTTAGCAAAATGATAATTTTATTTAA
TTTGTTTTTTTTTTTCATTTTGAATTCGCTTCAAACAACATTATACTGTTGATAAATTAT
AATCTATAGCAAAGTTCATAGTGACAAATATAATTGAATCAATATATTGTAAAAATATGT
ATTTGTAAAATATCACTATAATTGTATTTCTACGTGGTGTTACAATAAAGAATTTTCTAT
CTATCTATCTATCTATATTTGTGTAAGAATAATGGAAGATATTTGGAGGAGGCTTATGTT
CAACAGTGGCTACGGGCTCTCTCAAACCACATTTGATGACAAAACGGTAAATAACGACAC
CTATTATAAATATTCTTTGTTGGATTTAGTTTATAAATAGGATGTGACAAAAATTACCGT
GTCTTGTGGTGCCATCTATAGGTGACATTTGACAGCCATTGACAAGTAGATGAAAATCAC
CGTACGTTTATAAAGCACACGTGTGAACTAGGTCTATGAAATATAAAACTACTAAAAATT
ATTCTAAATTCATTTTTTAACGGCTAAATGTAACCATTTAGAAACCAATTAATGACTTGA
TTCTTATTTTGATCGTTAAAATCGTGGTTTTGTTATAATAAATTGTACATAATAAATAGC
TGTACGTAGCTTGGCTAGATCGAGTGTTGTTTTAAGGCATTTACTTGTTTACCTCGGCCT
AGTTGTATCTATGGCGCAGTATGTACATTATGTATGTAATGTATAAAAAATAAAATATTT
TCGTATTGAAAAAAA
(4815 bp)

- SilkBase 1999-2023 -