SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR13616c0_g1_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_ubiquitin-conjugating_enzyme_E2-24_kDa_isoform_X1_[Papilio_polytes]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0000209 P protein polyubiquitination
GO:0004842 F ubiquitin-protein transferase activity
GO:0005524 F ATP binding
GO:0005575 C cellular_component
GO:0016567 P protein ubiquitination
GO:0016740 F transferase activity
GO:0019915 P lipid storage
Transcript
Level		FPKM:9.03 TPM:8.85
ORF EntryO_TrvaFAMAMG16710_complete:A_TrvaFAMAMG_TR13616c0_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
TTTTTTTTTTTTTTAATAGAAAATGTCGGAAAGTGGTTGTGCATTCTGTAAATTTTTGTA
ATTTTTCCTAGCGTTTGTCATATTTAGTTATTAAGAAGCTAAAATAGTTTAAATGTATTA
TATTAGGAAAAATACTTGTTAGTTAATAAATTGTTTGTTCTGAATGAAAAGTTACAGTGG
TATTGACAAGCTAGTGTGCAGCGTGAAGAGTTGTTTGTGTTGGTGCAGCTGACGACTTAT
GAACAAATATTTGAAATGTGGTAACCGTAACTACAACTACTAGAGAATAGTGGAAATAGA
AAAACACAAGTCCATTGAAAAAGGCAGTGGAACGGGCCGTGGTCGTGGAGTTTCTGACAG
CAAATCGGACACAAAGGAGAACAAGCCAAATCATAAGATGTCAAAGGCTCTCGGCACTTC
GGCCAAGAGGATCCAGAAGGAATTGGCAGAGATCACACTAGACCCACCTCCAAACTGCAG
TGCTGGGCCAAAGGGGGATAATCTGTATGAATGGGTGTCCACCATACTCGGGCCGCCTGG
ATCAGTATACGAAGGAGGTGTTTTCTTCCTTGATATTCACTTTTCACCAGAATACCCTTT
TAAGCCACCAAAGGTGACATTCCGAACTAGGATATACCACTGTAACATCAACAGTCAAGG
AGTGATATGTTTAGATATCTTGAAAGACAACTGGTCGCCCGCCCTAACTATATCTAAAGT
TCTACTCTCAATATGTTCACTATTGACTGACTGCAATCCAGCGGATCCACTAGTAGGCAG
TATCGCAACCCAGTACATACAGAATAGAGAGGAGCACGACCGCATCGCTCGCCTGTGGAC
GAAGCGTTACGCGACATGATTGCATTACACAACACACGTTAGCCATGGGACGGACACACA
TACTCAACAACATTCTCTGATGGCTGGCGTATATTTGGCGAACAGAGCAATAGAGAATCT
TTTGAATGCTAAGACATTATCATCTTTGATTACGTTTAAATAAGATTGAAAATAGAACAG
ACAGAGAAAGGCAGTGTGGTAATGGTCGCCTTGTCCGGAAGGGGCGGATTTGCGGCAAAA
AAATTGCGTCAATCGAAAATCAGAAACACTACATGAAACAAACGAGCCTAGTGCAAGCAA
TTTATACGCGTATTTTAGAGTGCTACTTGTTGAGGAGATGACACATTGCCGCGCAAATCC
TCTCGCAGTGAATTCGCTTCTCCTGGATAAGGACTACCAATGACATTCGTCATTCTATGT
CTCCACAACAACAGGAATTTTCAATGTTATTCACATGTCATCAAGAATGATAATGATTTT
GGTAATGAAAATGCGCTACATGGCTCGTCGCCAAATATGCCTCAGCCCTAAATCCATCCT
ATTTACCTATGTGTATACTTATGTTATTGTTTCAAGCACTCTGCTAGCCACAGATTACAT
AAAATAATTCAATTTGAAAAATATTTAATCTTGAATGTTTCATTAACTGAGTCTAATTGA
TAAATGTAATGCAATTTACCTGAAGTTATTGGGGTTAAAATGAAGTTCAATTTCAGATTT
GATGCATTTTCAATGTAATTTAAATATACTGATTTTGTGATATCAATATTGTGGCCGTGC
AGAGTGTGTTAACGGCTTATATGTAAATTTAGTTGCGATTAATGTGATGTCACGCTTGAG
ACGAGAGTCTGAATTGTATAATTTTAGTTTAACAAATGATTTTTCTGTTAATTGTAAACT
GTATTATAAGAATGCAGACAATGTAAACGTAGGTTTAAACCAGTGAATTGAGTCAATTTG
CCGCTGAACGCGATGATCTCAAGAGCTCATCAACTGTTACTACTTATTTGTAAGTACGTC
ATAATATTGCGATTGATATTATTTTAGAATCGGAATAAATCGCATACTCCTATAAATTGT
TTTTAATTTTTTCAGGGTAATTAATGTGTTGAATAATTTTGGGAAAGCCTTTTTTTTTTC
TTATTTCCACAGGACAAAGTAAATGATGTAAAATATGTAGTAGGAAAATAAAGGACACGC
AACGAGTGATATTTAAGTTGCCAAAATAATTTCGGTTTTGCGATTTTTAGTAGCCTATTA
ATTCTAGTTTCTATATAAATCTAATTTAATCAACCTTCAGAGTGAAGTTTTTAATCGAAA
TGAATCTTAGATTTTTTATGACTTAACTTTTACGATTTTACAATGAACTATATTTTATAA
AGAATAAATTGCAAGTGTAAGATACCTTAACTTATCTTATGAAGTATGCTATGAGTTTAA
ATTGCAACCACATATCACTCCAGGTTTGATTGCAATATTTGTTACAAATGCTGTATTTGT
GCCAAAACTCAGGCACTCCAAGCCTCCGCTCCAATTTCCTGATTACAGAATATTCCTTTT
ATTATGTAAACATTTTAGATGTAAGCTATTTTATTATCTAGGTAATGTACGTCTTAATCT
AGCTGATAGTGTTAGATGTTGATTGTAGCGAAGTGTATGTATGTCGCGAATGATTTTGGT
GATGTGGCTCGACTAATAGTAAAATGATTTTTTTTATATGAATTTCGGTGATTGTTTAGT
GAATGTGATCTGGTGCTGTGAGATTCAGACGCTTGCGACATACAGTACGTATGGGAGGAA
TACTATGTTAAGTGGACTATGTGATTAAATTATTTTGTACTGAGTCTAGTGCAGGAGTAG
CAATATTGCTGCGGTTGTCGCGACTGATGTTCCTCGGATACTATGTGCATATTAATAATC
CCTTGTAACCATCCTTTGTTACATTTTAATGATAGTGAAATAAAAATTGTGTGTAACTAG
AAAAAAAA
(2828 bp)

- SilkBase 1999-2023 -