SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_TrvaFAMAMG_TR13562c0_g2_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_LOW_QUALITY_PROTEIN:_supporter_of_activation_of_yellow_protein_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000791 C euchromatin
GO:0000792 C heterochromatin
GO:0003682 F chromatin binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0005694 C chromosome
GO:0005700 C polytene chromosome
GO:0005701 C polytene chromosome chromocenter
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0006351 P transcription, DNA-templated
GO:0006355 P regulation of transcription, DNA-templated
GO:0007480 P imaginal disc-derived leg morphogenesis
GO:0008270 F zinc ion binding
GO:0016458 P obsolete gene silencing
GO:0031936 P obsolete negative regulation of chromatin silencing
GO:0045892 P negative regulation of transcription, DNA-templated
GO:0045893 P positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0046427 P positive regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0070604 C RSC-type complex
Transcript
Level
FPKM:1.71 TPM:1.67
ORF EntryO_TrvaFAMAMG16377_3prime_partial:A_TrvaFAMAMG_TR13562c0_g2_i1
Sequence
(Nucleotide)
CCCGCCGCCGCCCCGCCCGCCGCGCCGCCCGGCTCCCGCGCGCCGCACGACTTGCACACG
GCGCACTCTACGCAGTGCCACCGACCAGTAGGCACTTCAGGCAGGCCGACGCAGTAGGAA
TGGAAGCCTCTGTCGCATAGATCGCAGAAGAGCATCTTGTCGTCGTCGGCGGGTCGCGCG
CACTGCCCGCACGTCTTGCACTCGGCGCACTGCCACGCGTACTCGCGACACTTGCGGATC
GTGTCCGCACCCAGCTCCACGCAGCCCGGGTGGAGTTTAGCATTGCAAGTAGCGCAGACA
AGGAACCGTTCGTGCGTGTGTTTCCTGTTCCCTTCGAGCCGCAGCTTGCAGGTGCGACAC
GTGTCTTCAGCTTCCGCCGACTCACTTTCCTTTTCTTTTTCCTTCTCCTTCTCCGCTTGA
CTGCTGCGTTTTACTTTACTCACTCTCTTACGCTTAGCCTGTTGTGTGTGTGAATCAGAG
TTGACACTGGAGTCGGAGGCTGAGCCCGAGTCTTGTTCCGACTCGGAGCTACAGTCCGGA
GTGACGGCGGGCGGAGGCGCTGCCAACACTGTGTTCAGCGGGAAGTACCTGAGCTGTTCG
GGCGTGTAGATCCTGTACGCGTGCTGGTACTGTCCGGGCAGCAGGGCGTGCGGGTAGAAG
CCGGGCGGCGGGCGCACGTGGATGGCGGGTCGGTGCGCGGGCGCTCGTCGCCTGTGCACG
GTCATGCTCTGCAGGTCGACGCACGCGACGCTGCGTGTTGCGTTGATGCGCGCGTTCCAC
TCGCTCGCAGACGCTATGGCAGCCGCCGCCATGTCCTGTCTTAATTTTTCTGGATCTATT
TTAGGTATATCCGGTTTGTGATCAGAAGATTTTTCAGATTTAAATTCCATTTTAATGGAT
TTTTCCTCCATCTTAATTTCAGTGGCAACTTCTTGAGGTTCAGTAAGTTGCCTTTGACGT
TGATGCGTCCGATATTCCTCATATTTGTGTGGGTAGTCTGATAACATGATATCTAGAACT
TCACTTGCATCCACTGCTGTGATACCTAAGTCACAGAGAGCTTCAGTGACCAATCCCTTA
GCTAGTACAAAATCCTTTTCGTCGCCTACGATTGGTCTCCGCTTGAGTTCCGGATATCTT
CGTTTAAAGCTCTTCACGCCAAGGAACATTGCCACCTGTTCTTGTATCATCATTACCTGT
GGTTCACCTTCACCGCGTCCTAGTGGAGGCCACATGTACTCCTTCACATCAGCTGCTGTC
CACTGCTTATTACTGTCAAACAAGTCTGCAAATTTCGATTTTTTAAATTTGCTACTCTCG
TTTGTTAAACTTTTCACAGAGCTTTGTGAATCTTCATCAATGAGATGCGACGGTTTAGCA
GGGGTAGCATTGTCATCCATCATGCAGGTTTCTTCTTCAAAAAGTTGCACTGTGGTCGTC
GCGGGGCCGCAAACACGACCATAAATACCCATGGTCTCCTTCATGTAGACGGCACCGCGA
CCTCCGCCCCGGCCTCGAGGCCGCGAGCGTGGCGTGCGACCGCGCGGCGTGCGGCCCCCG
CGCGAGCCTCGGCCCCGGCCCGGCGTGCTCTCCCGCAGCGGGATGTCGTCGAGGGGAACC
GGCTCCAGCACCACCTTGGGCTCAGGCTCCGGCGTCCCGCGCCGTCGACTCGACAGCGGG
GTGGCACAGCCTCCCGGCATGCGGTCCAGAGCCTCGGTGAGTCGAGGGAGCTTCACTCGT
GAGCTGGTTGGGTCTATGTCCTCGGGAGGATCTTCAGGGGGTGAGGGCGGCGGTGGCTCG
ACCTCAGATCGCCGACCGCCCCGCCCGCGACCTCGCCCTCCTCGTGGTTTCGCTACTATC
GCAGGCCTCTCTCTCGTCAACCGAAGCGATCGTTGCGGTCGTTCTTCTAGCGCCGTTACC
GGGAGGATGACCGGTTTGGCCCCCTCTGAAGTGGGCAGTTTTCGCGGCCGCCCTCGTTTT
TTCGGTTGCGGTGTAAATTCTTCTGGTCTTATTATACTAGTCTCATTCATGAGATCCTCT
GATATTTTAGAAGTGTCGACTTCTAGAGGATCTTGTGACATGTCATCGGCACCCATGCTG
TTATCTCGAAAATCTGAATTTTCGTTGATTATCATCTCCTGAACTTTGGGATGACAGTTT
TCACTTACTGATTCAGTTGCGTCCAAACTTCCCGTTGATGGTTCGGAAACTACATCGGCA
TTCGTTATTGCAGATTGGATTGCATTATTACTATCAAGTAAAGATATTGACTTCATTTGC
TTTGCTTGTAAATTTGAAAGGATATTATGTAATTTAGAATTTCCATTTTTAGAACAATTT
TCATTATTGAGTATTGAGTGATTGACAGATCTTGTAGGCTGTTTAATATCTAAACCTTTT
GTCGGAGAAGTCGACGTTGGTTTGGAAGCAACAGGTGTTATGGTTAAAGATTTGTTGCTT
GTCAAAAGCTGTTCTAACTTTAGTCGTTTAGTATCTAATATAGACATTTCAGCATTTTTC
ACTTCTGGGGGACTTGATTCTGATGTAGAAGGTCTTTTCACTGTATTTCTTTTTACAACA
GGTGTCTTATCAACACTTTCAACGACTCTTGAACTTCGTAATCTTTTGCCTGCTGCCAAA
GGTGGTGATTCAAGGTTATGCTGTTTTCTCTTGCTATTTACAGTATATCTTTTAGGACTT
TCTTTTTCATTAATTGCTTCTTGAACATTTTCTATAAAATTCTTTTGAGGAGAATCAGGT
CTCTTTGTCTCTTCAGTGATTATTTTTGCTGAAGGACCTTGATCAGTCTTATTTATTTTC
AAAATTATTCTTGGTGAATCTTGACCAGAACTTTGAGTTCCTACTTTATCTGAGATGCTT
ATTTCTAGTGGCTTACTTATGTGTTCAGCAGATTTCTCGCATAAACCTTGATTTACAATA
AATTTTTCTTCAGTCAACTTTTTACTATCATTAATATTACTATGAGTTGAAACTATTTTC
TTTTTATCACTATAATTAATACTGTCACTTTCATTTCCTTTATTAGTTACTGGAGGAGTA
TTACAATTGATGAGTTCTTTATTGAATGTGGAACATTCTTGTTTATCCACAGAAACACAA
TTTACAGTAGGTTTACACATTTCTGTTGTACCAATTTGCTCTTTTGTATTTTCTAATAAT
TTTTTCAACAGTGTGCAATTTTGTAAAGAGGATTTTTGTTTAAGGCTTGCGCTGGTACCT
ACTGGAGAGTCTGTGTATGGTGAAATTGTGTTAAAATGTTTTGGAGTTTGAGTTTCGCTT
AATTTCAAATGATGTTTAAGTTCCGGATGATTTTGTTTCATTACAACTTGAGCTGGAGAT
GATGCTGTTGCATGAGTATAATTTACAGTTTTGTCATGAGTTGTATAGTTTAACAATAAA
TTCTCAGTTTTTGATTGAATACTAGCACTATTTAAAAAGCCATCTTGCATACTTTTCGGT
AGGCAATTTTGCATTCCAACATTTCTGTGTTCATCAATTTTTTCTTTACAAATAACATCA
GTCTTTGAATTATCCAACTTAAGCAACTCTTGATTAGCAGTAACCACTGGTACAGTGTCA
TTACCAGATCTACTCTCTGATGATTCTGTGATGTGTTTAGTGGGAGAGTGATGAGCATTA
ATATTATTGCACAAATTATGTTCTTCATTACAATTCTCTTTAGAAATGGTCTCAGAAACT
GCTTTCATATTTATTTTCATAACTATTGGTGGATTTTTGCTAGACATCTCATTTTCATCG
TTAGCTAGATGTGTATCATTGAAATCATGTTTGGATACAGATTTAATATTTAACTTAGTA
ACTACAGGTATAATAAAATCTTTTGAATTCGAACTTTTCAAGTTCTCTTTCTTTGATGTA
TTTAATTCTTCTGGTTTCACCAATGGTTTTATATTTAGCCTGGTTATTGTTGGAATGGTT
TGTTCATTACTTGCATGTGATCTGGAGTTGTCACCAACTTCTGCTGGTTTAACTATTGGT
TTTATATTTAGCTTTGTAACAATAGGTATATGATCAGCATTATCATCACTTGAGTTTCCT
GTTTCTGATGATTGATTTTCTGAATCTTTTGAAATATCTTCATCCAAGGGTTTAACAATA
GGCTTAATATTAATTTTAGTAACAACAGGTACACTATCTTTATTTGTATCAGCATTTAAT
CCATCACAGTCTTTGTTTTCTAAAAGGTTTTCTTCTGGGTTTTTTATTGGTTTTATATTT
AACTTGGTAATTTTAGGTACATTTTCAACATTAGATTCTAGATCATTATCTTTAGATTTC
AACAGAGGTTTTATATTTAATTTTGATATTACAGGAACTTTTTCTTCATTAACTTCAGAT
GTATCTCCAGTATCATGTTTCACTAAAGGTTTAATATTTAACTTAGTTACAACAGGAATC
TGTTCTGTGTCACTTGAAAGAGATTTTTTGGATGTTTTTGAACTACTTTCAACATCCTGT
TTTGTGATAGGTTTAATAGTAATTTTAGGCACGTATGGACTATCTTTACTGTCAGAACTC
TCACAATAACCCTCTGAAGCACATCTGGATTTTTCATTTTCCTTTATTAGCCCATCAGGT
GGTTTCAAAGGTTTAATTGTTAATTTTGGGCTAGTTGGTTGGTTGTCAGTTTTTGTAAAA
GTCTTAATCGTTAATTTGGGTATTTTTTCAACTTTCTTATCTGATTGACTACTAATAACT
ATTTTCAAATTGGATTCTTGGTCTTCACTTTCAGCATTCTGTACACTTTTTATTGTAAAT
TTGGGTACATTTTGATCTGTATAAAATTTGCCTTCACTTTCTGTACCTACTTTGCCCATT
CGTATGGTAAGTTTTGGTACGTCTGCTGAACCATGATCAGATGCTGATGCCTGGTCTGAG
GTGCTTGTTGTCTCATCATTTTCAGAGCATTCAGATTCTGATATTTCACTGCTACTTGAT
TTTCTATGTAAGTCATTAATTTTCTCAGGAGGTTTAAGAATAGGCTTAATATTTAGTCTT
GTAATGGAAGGGAAATTCTCTGTTTTGTCATCTTTACTGGGAGAACTAAACTTAATGTTG
TCAGTCTGTGGTTTCTGAATTGGTTTAATGTTCAGTTTTGTCACAGATACCACCTGTTGC
TCTGTTTCTTCACGTTTAGTACATTTTGAGATTTCTTCATTTTCATGTGGAGGCTTAAGT
ACAGGTTTGATATTCAATTTTGTTATTGATGAAACATGTTGCTGATGATCATCATTCACA
GATGATTGTTCATCTGGCTTGATTGGTTTTATTGTAAGTTTAGGAATAGGTGATTTTGCT
TCCTCAGATGATTTGTTTCCCAATTTGATAGTTAATTTGGGAACTTGTTTGCTTGACTCT
GAGTCAGGCTTTGAATCTAGTTGACTTTCTGATTCTTTTAATTTTGAGGTTTCTGGTAAA
GAACTTAAATTCAATTTTAATGGTGGTATTCTCTTTTCACTTTCTTCAGATTTATTACAA
CTGCTATTTTCAATTGATACCTTAATCTCTTTACTTGAGGTTGAAGCCACTTCCTGCATT
GTTTCATCATTTTTACTTGAGCTAGCAACTGTCTGTGGTTGTTCCTCAAGAACAGTAGCG
GCAGGTGAACTTTCTTTATCATTTTTATCACTCTCTGGAACTTCTGGTACTGTTAACGAT
AGGTAATCTGGAGAAACTCCATATTTTGGTTCAGTAGTTATATTAGTTTCTACAACCATA
CTCTCTTGTGAATTACTATTTTTAAATTTTGATGTTTCACAAGAATCAGCTGTGCACTCT
TTTACACTAGCCTGTGTACACTCTTCCGTACTATTTTCAGTTATTGATTGAGTAGAAGCA
CTCTGAACTTCTGTACTTTCTTTTGGCGTTTGTGAACTTTCTGAATTACATGGTGTTTCT
TGAGTCACTTGATTTACTAATAATCTTTCAGATGTTGTTGGTTGACACTCTACCTTCTCT
ACTTTTAAAGGTTGACTGTCAATATTAATCTTATTGTCTTTTAAAACAGGTCTATGCCTT
ATGAGTTTAATTTTCTTAGAACTCGCAGGGCTATCAGTTTTGTTGATACTAATCTCATTT
GTATTACTAACCTCATCTTGCCTCACATCTTGTAGAGAATGATTAGAATCTGAGGAACTA
GTCACATCCTTGGGTACATTTTCACTTGCACTTACAGTAGTATTAATATTTACAGATTTC
AAGTCTACACTGGAAGATACAGTACAGTCCGAGCGCCGGTCACTGGGTGCAGGCCTCACG
AGCCGGCGTCTCAGAGGTATTTTAGTGGATATTTCTACAATTTTGTCATCACTAACACTA
CAATCACTTGATGTTGATTCTGCAGATTCTATTCTTATTCTGTCCTGAACCTCACTAGAC
GTAACACATTTTACTGTCCTATCCTCTTTATCACTTTCACTGACAGTTTCTGATACACTT
TGCATATGCAACGCACTGCTGGAAGGAATATTTGATAATGTTTGTGAACTGGATGGCTCA
AGTTCCACTTGTGACACTACACACTGTTGTTGAGTTTTAGCACAGTTTAAAGCCTTTTCA
GCTGGTATTGTTACACTATCTTGACTAACATTTTCACTATTTACACTTGCAACATTTGAT
TCATTACTGTTCTCTTGTTCAGTACTTGAGCTATTTACAGTCGAATTCTCTGTATTAACA
TCCAGCAGAGGAGAAACATCTGGGATTGGTGTTAAAGATGGTGTACTTTCTGCTGTTAAA
TACTCTTGACTGAGTCCAGAGTCTTCCCCGGAGGCGATTTCATGTGCAATTAGAGGAGAA
TCATTTGGCATAGGTATTCGCTTCGGTGCGCCTGGCCCATCAACGATTTCATCGATCATG
TCAAGTATTGCTTCGGTACTTGTGTTGACGTCTTGTGTCGACGGCGATGGTACGCTGTCG
CCGTCGAAATTGTCCTCCGACATCGCGGGGGTTTGACACGATGTGCGGCTCTCCGTTGTT
TCTTGTTGATATAAACTAGTGTGTGCATCACCGTGCTCAGGCTGCTGGCCGACATCCCTT
TCCCGCGCCGATGTACGGCGGGAAGCGACTGTCGCGGAGCCTGCATCGTCTTCCGAGCCC
TCCATTATCTACTGCTTTGCGACACTGTCATATACAAGTATTTTAATTTCATATTCACGA
CGTTTTTATCTCGTTTGAGAATGTGAGAGGTCTTGGAAATTATTCATTCGCGTAAACCGG
CAAACAAAAAGCTTGTATACGCCATTTTTAAAACCAAAGACATGGCAGGTCGAGATGTAT
GAGCCAATAAAAAAT
(7335 bp)

- SilkBase 1999-2023 -