SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_TrvaFAMAMG_TR13540c0_g1_i5
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_stress-induced-phosphoprotein_1-like_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0005575 C cellular_component
GO:0005634 C nucleus
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0006986 P response to unfolded protein
GO:0009408 P response to heat
GO:0009611 P response to wounding
GO:0034605 P cellular response to heat
GO:0051131 P chaperone-mediated protein complex assembly
GO:0051879 F Hsp90 protein binding
GO:0070417 P cellular response to cold
GO:0070678 F preprotein binding
Transcript
Level
FPKM:1.42 TPM:1.39
ORF EntryO_TrvaFAMAMG16270_complete:A_TrvaFAMAMG_TR13540c0_g1_i5
Sequence
(Nucleotide)
TGACCTACACAACCGAGAGGTAAACAACCTTCGGGAATATTTCCTTAAGTCAATTTTATA
TATTTTTAAGCGTATTGGGAGTACTTTTTGTTCACGCAGAAATACACATAAAAACGAGAT
AAATCCTTGCCCAAAAGCGTAAATCAACATGAGTGAAACTGAAACTAAGAAACCGGCAAC
AGTAGAAGAGTTAAAAAACAAAGGAAATGAATGTGTCAAAGATGGAAAATACATTGAATC
AGTCTTACATTACACACAAGCTATCAAAATGGATCCAAATAATTATGTATTGTACAGCAA
CAGGTCATTTGCTTTTTTAAAATTAGACCAACATTATCTGTCGTTGCAAGATGCTAATGA
AACCGTGCGGCTGCAACCTCATTGGGCTAAGGGTTATTTTCGTAGAGCTGAAGTTGAAGC
CGCAAGTGGTTTGTATGATGAGGCAATCTTCTCATACACACATGCATTACAACTTGATCC
ACAGAATCAAAAGTTAATAGAATCCATTAGAAATTTGTCAGAAATACAGGAAAAGAAAAT
AAAAGATCATCAAAACATTGTGTGGATTTGTTCATGTGTTGGTTTAGTAATTGGAATTTT
GGTTGTTGTACTGGATTATAGTTTCACATCGAATCCTACATTAACTAATCCATTTAGCAT
GGTAGCATTTTCTATGGCGTTATCAGGAATTGGGTTTGCAGTTGGTAAAACTACAATTAT
GATCTCTTCCTCAAATGCTGGCAAATCTCTACAACCTCCAAATGATTTAGGATTCGGTGA
TAGTTCACAAGAAAAAGAAGATGTAATACCAGAAAGAAAAAATAAATACAGCAAAGCGCA
GGCACGGCAACGATATAAACAAGGAAAATTGTAGTGTTAAGTATTATGAGGTAAAACAAT
GTTTATATTGAGAATTTTGATATTTGTTGCTAAATTATAAAAATTGAGGATAAATACTTA
ACGTTGATGTTGTGATTGTTTAAAACTTTTATATCACATACTTGTATACGTCCTAGTCTT
TTTTTAACTAGTTTTGGTGAAGGATTTAACGATATAAGAAAGATTAGGTTTTAATTTTCA
TTGTGTAGGTTTATAAAAGACAAAATAAGTCAATTTACTTTTGCTGTAAGCATTACGTCA
CTTTGGCCTCTATGGTGAAAACTTATATTTATTAGATAAAACATTGAAAAATTGAGTTAT
AGACGCTACATAATAATACAAGTGTGCCTTTAAAATAAATGTTTCAGTACTAATAAGTGA
ATTCTATGTTCCATATAGGTACATATTATGTAACTCCTTAAGATATATATGGAATCTGGA
TATAATCATATGTGTTCTTAGCCACAAAAAAAGCAAATATACATAGACAATATTTTTTTA
AGTTCGAATGTTAAAATTAATGAAGTTGGACTAATGGGAGTGTAGGTGAACGGATTTGAT
TAGTGTGGAATTCAGATGTTTTTCCAAATGTATTGTAATATTAAGGACCATAGTAAATTA
AATTTCTATTCAAAACCACCAGCAAAAAACCTTTTAATATTTTGTACAGACATTTCAATT
TTGAAATATAACTTTTTGAAGTGTGTGAAAAGAAGTTTGGATTGTAACGACGCAGTCTGT
TGCGGTAGGAATAGGGAATCCAATCCCGGGATTCCGGGTTTTCATATCTTTGTTTTGAAA
CGTTCATTTTAAGCCTTCTGTCATGGTTTCTCGTTACCTTAATATTATGTAAAGTGGCAC
AATTAAATATCCTAACTCCGCTTCAAATCTTTGCTGCAATATTCAAGAGCGCGGAGTCAC
ACTTTGCTAATGTATTTATTATAAACACCATAAAACTAGAGGATATGTACCGAAATAATT
AAAATGGATCGGTTGGTGAAATACCAAATTTGATCATAAAAGTACTGTAATTTTGAAATA
ATTATACAAACAAGTGCGAAATGTTTTAAAACCAATTTAGATTCATATTTGAAATTTGGT
GAATTTTTTTTCTAATTTTTAATCATATTTATTAATCCCGGGATTACTCGACTTGAATCC
CGGGTTCGCAAAAGTACCCCAGGATTGGATTCCCTATCTAGGAAGAAAGTCGGTTGACAT
CTGCACGCGAGATCAGTGTCTATGAAGCTTGCATTGCCTAAAACCTAAAATAATCAAATA
GCCTGTCTGTAAAATTTAAGTGATTGTATTAAATTTTTGTATTGCAAATGTTTATTACAA
TGAAATAATAAAAATGCTCAATTTTTATTAGAATCTTATGTGCGGTTTGATTTTATTTTA
ATTCAATTATGATTAACGTAAAATAAATTGATATAAATTAAATGTTTTAGCTGATTCATT
TATGTACTGGACAATTCTTGTGTGAGTAACCCATACCAATATTTGTTAAAATAAAAGCCA
ATAGAAATTAGGGGGAAATACTTTATTGATCCTAGTGTAAAATGTATTTCGAAAATTGCG
ATAATACAGTATATCTCTCGAATAAAACTCTTGGTCTCATACTTACACTTAAAATAAGTT
TAACATTGTATGGATAAGAAGGATAAGAAAAAAAAAAACTGTACAATATTTGATACCTAT
TATATTGACTACTCCCTGATATTTATGTATTTGTGCGTTTTAGAACTGCCTCGTTCTCTG
CAGTCGAAAATGCCGATCACAAGACAATCAACTTGTCAATATTCGATAGTTTTATTATTT
TAGACACTAATATTTATATTTTGTACAATTATTTTTTGATTAAAGACAGTTCTATTTCGT
CACAATATAAAGGTACTATAACAAAAAAACACCGAGAAAATATTTTAACATCAAAATAAT
GGCAACTTTACACATTGTAGACGGTCAAAGTAGAAGCTAAGTTCCATTCTTAGAATGACA
CTTAACCATTTACTATAAACATAAGGTAACAACAAGCGAGACGCATTATAATATAATGTA
TTGAGTTGCACTTTAGTGTTCAACTAAGTTATTGTTCTTTTAAAATAAAATAAAAAATAT
TAATCACTGTCCGATATTGCCTTCTTTCGACGTTTGGCTTGTTTCGGCTTCACAATCTCT
TCTTCCTGTAACCAAAGAAAAAATAATTTCATTGTGTGTTATAGTTTTCAAACAATAAAG
AGCTAAGCTTCAAATTTATACGAAATAAAGATAATTCGCAGGATTTTGCGGCAAATATTT
CTGCTATGTACAATGAGAATAAATATTTATAATTTTAATGAAATTGCATCAAAACTTGAA
TGCTGGTTAAATATTTACCTCACTATCCTCATTTGAAGAATGCAAGTTCGTGTTGATTGG
CATTGAATTTGAAACTAATTTCCTAGCACGTCTAGAAATGGGTAATTCGTCTTCCCACGC
CAAACAAAATAATTCACTATATTGTCTCTGAAATTAACAGTGAAAATAAAAATAATTATA
AAATAAATAAAAATATTTTGGTCCTAATTGCAATCAAGAAAATTAAAATATAGATATATT
AATAAGTTAGTAA
(3493 bp)

- SilkBase 1999-2023 -