SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_TrvaFAMAMG_TR13014c0_g1_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
heparanase-like_protein_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003674 F molecular_function
GO:0005575 C cellular_component
GO:0005576 C extracellular region
GO:0005634 C nucleus
GO:0005764 C lysosome
GO:0005765 C lysosomal membrane
GO:0005975 P carbohydrate metabolic process
GO:0007155 P cell adhesion
GO:0008150 P biological_process
GO:0016020 C membrane
GO:0016787 F hydrolase activity
GO:0016798 F hydrolase activity, acting on glycosyl bonds
GO:0030200 P heparan sulfate proteoglycan catabolic process
GO:0030305 F heparanase activity
Transcript
Level
FPKM:5.67 TPM:5.56
ORF EntryO_TrvaFAMAMG15772_complete:A_TrvaFAMAMG_TR13014c0_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
ACAAGTGCTCATTTCACGGCTTTTTGAATCTCGTCAAGGTTGCCGAAGTGAATTTTGGTC
TATGTAAATAAATAAAGGTATGTTCAAAACGAACAAAACTTGTGCCAAGTGACTTAAACA
GTATCGTGTTGCAGTATTAGTTAGTTATTGTTCCATGTTCCTTTTTCAATAATGTCGAAT
AAGCGGTTAGCAGTCACATGTGCTATAGCATTTTGCTGTAACGTGGCTTTATTGGTGCTA
TTTGTAAAATACAACGGGGGTATAAGATACACTCTCACCATCGATGAAGATCAGCAACAT
GTAAACGAACTTCCGGAAACTTTTCTCAGCTTTGGAATCGACACTTCTGAAATTGAAAAC
TACAACAAAATCAACTATTCAGACGCAAGATTGAGAAGCTTAGCGGAGGCATTATCACCT
GCGCGACTTCGTCTCGGTGGCACGAGTTCTGACCGTCTCATATTCAGCAAAGAAAACCTC
CCAATATCATGCGAAAAATGTAGTGAGAAATCTTATTCGAAATCTGTTTGTAAAACCGTC
GAAAGATACTGCAAACACAAGTTTTTACCATTTTTCGTAATGACCGGAGAAGAGTGGAAT
CAGATTAATGATTTCTGCAGAAAGACTAATCTAACATTGCTGTTCTCATTAAATGCAATA
CTCCGTGATGAACACGGAATGTGGAATGAGAAAAATGCTAAGGGACTCATTGAATATTCT
AACCACAAACATTATGAAGTTGATTGGCAGCTAGGAAATGAACCAAATTCATTTAATCAT
AATTTTAACCAGAGTGTGTCACCAGCAGAGTTAGCGCATGACTTTGAAAAATTACGCAAA
ATACTTAATCATAATGGTTACAACAATGCACTTCTAGTCGGTCCTGACACAACTAGACCA
CAACCACACCGTCCAGAATGCCTTAACTATATGGTAGAATTTTTAGGAAATGGATCTCAC
CATATAAATGTCAGGTCATGGCATCAGTATTACCTGAACAGTCAAACAGCTAAATTGGAA
GATTTTTGGAATCCTGCAACTTTTGATTTACTGAGACAACAAATTGAAACAATGAAAAAT
TACACCAAAAAGTACAAACATATTCCAATGTGGTTGAGTGAAACTAGCAGTTCGTATGGT
GGAGGAGCACCAGGATTATCTAATACCTACGCAGGCAGCCCACTTTGGGTTGATAAGTTG
GGTTTATCAGCAAAGTATAATATAACAACTGTTATAAGACAGAGCTTCATTGGTGGAAAT
TACAGCTTAATCGATGAAAATCTAAAGCCATTACCAGATTGGTGGATCAGTGTTCTCTAT
AAAAAATTGGTTGGCAACAAAGTTTTACATTTGAAAAGTAACTGTTCCAGGATGCAAAGA
TTGTATATTCATTGTGCTAACAGAAAATACACAAATGACACTTCGGCCATTACACTTTAT
GGTATCAATCTTCAAATGGCTAAAGCTCGGTTTGTTCTTAATGGCTCAGCTTTGCATGGG
GATGATTTAGTTATTGATGAGTTTATCATCAGCCCTCCATCAAACAATAGACAATCTAAA
ACAATACTACTGAATGGCTGGCCACTCTATTATGAATCAGACTTAGAAAATTTAGAACCT
TGCAAACATAGATATGGCCGCTATTTATCACTACCTCCTTATTCTATTGGTTTTTGGGTG
ATTAAGAAAACATCAATTAAGGTATGTGGATAATTGACTAAGATGAAGAGATTGCCAAAG
AATCAATCAAATTTCGATGGAATTATTCAGATATTTCAAATAGGAATTCATTTCAGTCTG
GTACTTTGGAATTCATAAATCATTTTCTTTTTCAGTATTTAAAACAATCTCTTCTCTCTA
ATCTCATTTGCACGGCTAATAATTTCTCCTACTTAATATAAATGTTTTTGGTTTTTATAC
TATAGTTTATTTACTTTCATTTATTTTGTTTTTGTTAGAAGTATATTTGTTTGGTTATTT
TTATTATTATTTTTGCTGAATCAACAGCATAGTGTACTTATTTGATTCCTGAATATTAAT
AAGATTTTTTTGTGAATTTATTTTTTCTTATACTGATTTTAGAATGAAAGAACAGTTCAT
TCCTGAAGTTATTGTAGTTTGCACTTGCATGTATGTAATTGTTGTGATAAATTGATTGTT
TAAAAGAGGATGGCAATTGTACTGTTTGTCTCCTCAGTACACTGACCTTGGCCCTGACTA
ATAAAGAGCTATTGCTGTTATTGCAGTGAATTGTATGATTTTAATGAATTGAGTGTAGAA
GGAATGACAAAAACATCACTAGTATGATTGTTATACACACTCAAATGATTCTCAAATTAA
TTATAATGAAACACTGACTTGAATACAAAATGAACATTTATTTTTGTCTGTTTGATGTGA
GATTTTTTTTGTTTAATGAGAATTCTGAATGTGTCTTTGTTGCCTTTGCAAACTTGTTCT
ATCTATTCTATGGCTATTGCGAATAATCTCTGGCTGGTTCCACAAAATTGTTTCAACTAT
ATGACTAGATTAGAATGTGGTTTAAGTTACATGAATGGAGAAAAGAATATTCACATGGTA
CAGGTATGGCAGGTAATACTGCAGTAAATACTAATTATCTCATATTTTCGAATAATGTTT
TTTAGAATGTTTTTTGGTTTATTGTATTCTAGATTTTAAGTTGATCTTACTTGTTTACAA
TGATAAAAATGTCCGTGTTAGCAATGAAGATAAGTCTTATCTTGATAATCTCAATGCAAT
TTTGTCTGACATGATGTGGTAGACAAAAAATGTGGTATTTCCACCACTGTATTTTTGAAT
ACAATTTATTACTATTAAAATGGATTTCAAAGAACAAACCTTATAAGCACAAATTATAGA
ATATAATATACTTAAATATTTACTTATTGTTGTGGCATCTGATTGAAATATTTATTGCAT
GAATTTACAATTATTATAGGTTGAGGTAAAGTGCAATTGTGCCATAAGTATAAGAAGTGA
AAAAATGTAGTTGAATAACTATATTGTTAGTAAAATGTGCCTTGATGTCACTGCCAGTGT
TTGCTGTAACTGTTGTCATATATTTTCATATAAAATGTTTTTTATTATAAAGATATTTAA
CAATTTATTTGATGTTGTCATGTCCCAGTTGAGGATTTATGGATATTATAATGTAGGAAT
TTCGTGGTGTGGATATCTCAATTTCTGCTTACTTCAAGCAATTGTACTGCTTTAAAGTGT
TTCAAACTTCAAAACTAAATATGGAAACATTTACTTAAAACTAAAAACCAAAGATGCGTT
AAGTTGAATTTGAGAAAATAACAGAAGATTATTATGTAATCGATTTGCAAACTGATTTAA
CTTTTCATATTAAACAATATGAATTGAATAGTTTGAAATACAATTTTGATAACATAACCT
AATACATTAAATTAAATTCTCAACTCAGAAATTAAAAATGAGAAAGAAATCAGTGTATCA
ATGACATTTAACAGTATGGTATGAAGGACCAAACTGTGTTTTTGTAGCTTCGGTACTAAT
TTGTACTCATACCAAGCATTGTTGACTTTAAGGTGCCTATATGTAAGACTGATTAGATAT
ACCATAGACATTTATTTTTGAATTGCCTGGATCAACCATTTGTTAAAATATTGAAACAAA
TTTACTTTTCTTTATATTACGAGTAATGAGCAAGCAATTACTTAACGCCTAACTATATTT
GCATAAAGAATTTAATGAATTGGCATAACTTGTAACTAGAATTAAGAAAGTTATTAAGAA
AAACTTTCGATGTATTTGTACTAAATTTAATATTTTTTCATATACATGTTTTTCTATACA
TTATATAAAGTTTTTCTATGTATTATTTTTTAGAAATAGATATCTTCTGTTCTAGAAATT
ACATTAAAGGGTTGTTATAAGTTACTGTTATGGTAAAGTTTATTTACTAGGAATGATGAT
ACATTTCCTCCATTTTTTAGATAACAAAAGAAATTTGGAGAATATGAACTTTAATACATT
TACATTTAAGAATGCACTTATTGTACTGACTGTTGTAGGAAAGTATAATAATAATTAATT
ACTTGAAATATTTCAATAGTCCTTCAAACTATAAAAAAAAGCGAATTTTGCATTCTTCAC
ATATTCAAGGACATTTTGTGTTAATAATATTCTGTAAGAAACTAACAACATTCTCAATGT
GAAGTAATTTCTGTACAAAAAAAAATTTATTACTACTATAGTACAGTACTATCTTCAGTA
AGTACAAAATGTGTATCTCCAATTAATGTTTATTTAAAGAATAAGCTGTGCTTTGTTGTG
CTGATCTTGTGCCTTTTATTTGTGGTATAGCCATGCCAGTGAAATCTTTATATTTATAAG
TTAAGGAAATAAAGTTATTGCATTATAAAAAAAAAA
(4416 bp)

- SilkBase 1999-2023 -