SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR11950c1_g1_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_solute_carrier_family_12_member_6_isoform_X2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0001525 P angiogenesis
GO:0005215 F transporter activity
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0005887 C integral component of plasma membrane
GO:0006810 P transport
GO:0006811 P ion transport
GO:0006813 P potassium ion transport
GO:0007268 P chemical synaptic transmission
GO:0010107 P potassium ion import across plasma membrane
GO:0015079 F potassium ion transmembrane transporter activity
GO:0015293 F symporter activity
GO:0015377 F cation:chloride symporter activity
GO:0015379 F potassium:chloride symporter activity
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0016323 C basolateral plasma membrane
GO:0019901 F protein kinase binding
GO:0022820 F potassium:chloride symporter activity
GO:0035826 P obsolete rubidium ion transport
GO:0035827 F obsolete rubidium ion transmembrane transporter activity
GO:0055085 P transmembrane transport
GO:0071476 P cellular hypotonic response
GO:0071477 P cellular hypotonic salinity response
GO:0071805 P potassium ion transmembrane transport
GO:1902476 P chloride transmembrane transport
Transcript
Level		FPKM:1.89 TPM:1.85
ORF EntryO_TrvaFAMAMG14986_complete:A_TrvaFAMAMG_TR11950c1_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
GGTGAATTCTCCGCGCCCCTTACAAACCAGAGGTCGTGGGGGTGGTAGTGGCGAAACACC
ACGAGCGGCGTCGCGACGTGCCGTGGCTCGACCCACGTACCATTTTATGATCACCGTGAA
ATTATTGCACCGAATTAATCTTCTAAAAATAACTATGACGTGTTATCGTGCTTAATTATG
AGAAGGTGAATAAAGTGAGCGACTAATAAAAGTGAATGTGAGGTGCAGTGAAATTCCATA
TTGTTATTATCATTTTTTGTTATTGCTATACATATTATTTCAGACAGTATAAAGATACGA
TGTTAAAGTTAAAAACAGTGTAGTGAGTACCACAATATTTGTTATTAAAAAACAGTTATG
TGAAGTGTCACTAAAAATTGGGAAAATGCATGACTACGGAGAAACTCCTTTGATGACCCC
AGATGGATACAGCTCTGTGTCTCAAGGTGATCCGGACGAACATGGCCTCTCCACGGACAA
GAATAAGGGCTGCGATACCAACCTTTATCTCTATCATGAAGAAATCGAGGACCGGCCCCG
AGCAGCCACATTCCTCAGTTCCCTGGCGGACTACGCCAACACCATCCCAACGGCATCTGC
CGCCGACCCTGATGCTCCGAAACCCGCCCCACCAGCCCGCATGGGAACTCTCATCGGTGT
CTACTTACCCTGCATCCAGAATATCTTCGGTGTCATCCTTTTCATTCGACTGACCTGGGT
TGTGGGGACCGCTGGAGCTATACAAGGATTCCTTATTGTTCTGACCTGCTGCTGTACGAC
GATGTTAACCGCAATATCGATGTCTGCGATCGCAACGAACGGCGTGGTGCCGGCGGGCGG
GTCGTATTTCATGATCGGTCGATCTCTGGGGCCGGAGTGCGGCGGTGCGGTCGGGATGCT
GTTCTACACGGGCACTACGCTGGCTGCAGCTATGTACATCGTTGGAGCTGTCGAAATTGT
TCTGACCTACATGGCACCATGGATATCGATTTTCGGCGACTTCACCAAGGACCCCGAGGC
GATGTACAACAACTTCCGCGTGTACGGCACCTGTTTGCTGCTCATCATGGGAATGGTTGT
CTTCGTCGGCGTGAAGTTCGTCAACAAGTTCGCTACAGTTGCCCTGGCCTGCGTGATTCT
GTCCATCACCGCGGTGTATGCTGGAATCTTCGTAAATTTCTATGGAAACGATAATTTACA
GATGTGTGTACTGGGTCGTCGTTTGCTCAAGGATATCCACATTACCAACTGTACGAAGGA
TCCAAAAGGCGAACTGCATGCACTCTTTTGCCCCAACACGACCTGCGATCCTTACTATCA
AGCTCACAACGTGTCTATCGTACAAGGGATCAAGGGTCTAGCCAGTGGAGTATTCTTCGA
CAACCTTCAAGACTCGTTTATCCAGGACGGTCAGTACATCGCGTACGGCAAGGAACTTGA
TGACATCGAGAAGATGGACTCACGAACTTACAACCAGATTACTGCGGACATAACTACTAC
GTTCACTATTTTGATCGGAATATTCTTCCCATCTGTGACAGGTATAATGGCGGGTTCGAA
TCGGTCCGGAGACTTGGCCGACGCTCAAAAGAGTATTCCCATCGGAACGATTTGTGCGAT
CCTCACTACATCGACTGTGTACTTGTCTTGTGTGCTGTTGTTCGCTGGAACTGTCGATAA
CTTGCTGCTTAGGGACAAATTTGGCCAATCGATTGGCGGTAAGTTGGTGGTAGCGAACAT
GGCTTGGCCCAACCAGTGGGTGATTCTCATTGGTTCGTTCTTATCAACCCTGGGAGCTGG
ATTACAATCTCTGACGGGAGCCCCGCGGTTACTGCAAGCTATTGCGAAGGACGAGATTAT
ACCATTTTTGGCTCCTTTTGCTGTGTCTTCTAAACGTGGTGAACCTACTCGGGCGTTGCT
ATTAACAATGGCGATCTGTCAATGCGGCATCCTGCTCGGTAACGTCGACATCTTAGCTCC
GTTACTATCGATGTTCTTCCTGATGTGCTACGGGTTCGTAAACCTCGCCTGCGCTCTGCA
GACGTTACTTAAGACCCCGAACTGGCGTCCACGGTTCAAGTATTATCATTGGTCTCTGTC
TCTGGCCGGTCTGACTCTGTGCATCTCTATAATGTTCATGACGTCATGGTTCTACGCTCT
CATCGCCATCGGAATGGCGGGACTCATCTACAAGTACATCGAATACCGCGGTGCTGAAAA
GGAATGGGGTGACGGTCTCCGCGGTCTGGCTCTGTCCGCCGCGCGCTACTCTCTACTGCG
TCTGGAGGAAGGACCGCCGCACACCAAGAACTGGCGCCCGCAAGTATTGGTGCTCGCCAA
ACTCAACAACGAACTGATGCCCACTTACCGCAAGATGCTCGCCTTCTCTAACCAACTTAA
AGCTGGTAAAGGTCTGACCGTATGCGTATCTGTACTGGGTGGTGACTTTACAAAGCGCGC
TGGAGAGGCGTCCACCGCGCGACAGAACCTACGCAAGTCAATGGACGATGAGAAGGTCAA
GGGATTCGTTGATGTGCTGGTCTCGCCGAACGTTCCTGATGGATTGAGTCATTTGGTCCA
AACGACAGGTCTGGGAGGATTGAAGCCGAACACAGTGATAGTAGGATGGCCATACGGATG
GAGACGGTCCGAGGAACCGGAAGTACGTCACCGCGCCTTCCTGCACACCGTTCGCTCCGT
GGCCGCCGCTCGCATGGCGCTCCTCGTGCCAAAGGGAATCAACTTCTACCCGGACTCTAC
CGAGAAGGTATCAGGCAACATCGACATCTGGTGGATAGTCCACGACGGCGGCATGCTGAT
GCTACTCCCGTTCCTCCTGAAGCAGCACCGAACCTGGAAGAACTGCAAGATGCGCATCTT
CACCGTCGCGCAGATGGAGGACAACTCTATACAGATGAAGAAGGACCTCAAGATGTTCCT
GTACCAGCTGCGGATTGAGGCCGAAGTTGAAGTAGTGGAGATGACTGACAGCGACATATC
GGCTTACACATACGAACGGACTCTGATGATGGAACAACGGAACCAGATGCTGCGGGAACT
GCGTCTCAACAAACGAGAAACTATGGGAATGGTACAGGCCATAGTGGATCACCACCACGC
GGACGTCAAGACGGCGAGTAAGGTTCGTTTCGCGGAACCCAACGCGCCGCCCGCATACAG
CGAGGTTCCTTCGCCACCACTCGCAGAAAACGAGGAAAAGGAACGAGACGATAAGTCGCA
GAGCGAGGAGCCCCCCTCGTCCCCCGCGCCGCCGCCCTCCGCCGCCGACGACAAGCAGGA
GCGCGCGCCCAATGGAGACGCCGGCACTCCCGCCAACAACATGTCCGACATCACGCCTGA
TGAGGGCACAGTCCGTCGCATGCACACGGCGGTGAAGCTGAACGAGGTGATAGTGGCGCG
GTCGCACGACTCGCAGCTCGTCATACTCAACCTGCCCGGACCGCCGCGAGACACCAGCCT
TGAGAGGGAATCCAACTACATGGAGTTCCTGGAGGTGCTGACGGAGGGGCTGGAGAAGGT
GCTGATGGTGCGCGGCGGCGGACGCGAGGTCATCACCATCTACTCGTGAACACGACGCGG
TCACGTGACAACACGCTACAACACACTTGTGATTCTCTTTTACTATTACTACGTACTACG
GACCCGCTGCGGTCATTATCGACCGGCCTACGGTGTGTCCATCCTCGGCTCCGGTAACGA
ATATCTAACTACTTATTTCGTTTTCATGTGCAGTTTAAATTGGTTAACTGTTTTGTTGAC
TGCTACAACAGTAATTTCGAAGGCCTACTGTGCCTGGTTGCCTTTTTGGGTGATTGTAAG
GCAGGGTTGGTCTACGATTGACGTGAGTCGAGTCGCTCAACTCGGCTCTACAGACGATGG
ATGTGACGCGTCACGTGGTGCGTGCTCGCGGTGCGTGCTCGCTGTGCGCCGCTCGACGAG
AGCGTCCCACGTTTCTTAGCTTAGTTAACTATGGTTCTAGGATACGTTTTGTTGAATTTG
CTGTTTAGACAAATATTATTTTGAAATTTATTGACTGTTGTGTAGATATTTAAATATATA
TACGAGTCTGAGGAGCCTTATCTGTCGTTCGTTAGCTCTAAGTTCGTTTCTTTATAAGTT
AGGAATAGTTCGGAGTTGATTTAGACGTCTGATCGAGCCTTGACACGGTTCGCTTCTGAC
TGCACGTGTCTTGTGTGAAAGTGATCGTTTTCATATTTTGTTAGTTTACGTTGTTCGTAG
ATTGTTTGTGATATTGCACAGTGGTGACTATTGTTATATTTTTGACTTTGTAAAACGTAT
TTTGTAAATATTCTGTTGTAAGATTAACATCTGCTCAACTTAAAACTTATCGCGCGGACG
CGTCTTGTTAACGTTACCTTTACATTCAATATTCGTCTTTACAATATATTGTAGCTCGAT
TTAACGAAATTCAAATCAATTCTAGTCAGTTTTTCGATGTTAGTTATATAATATCTAGTA
TCTACATAATAAATGTAATACCAAAAAAACATTATTGAATAATTAGAGGATCTTTAACTT
CGAATGTTTCTTTATAACTCCCCCAGGGTTTTTTGATGAGTAGATAATTAGATAATAATT
CAATCCTCTCAGTATTTGCAAATTTAATTATAATCATTATTAAAACTAAATAATCAAGAT
TTATTAATATAATTAGAAATGAAAAATACATTCTAGATTTAGGTGAAGTTTTAATGTAAG
ATTCTTAAGAATTTTCTCCATTTGCGATTGACTTAGTGTTTAAAAGTTATGCGCACATTC
GCATAGTTTCTACTCGTAAGATTACATTCTACGATCACTTGGAACTATTATGTTTTACAC
GACGATAAGCTGTGGACACAATAATTTAATAAATTTAACGTTTTGCTGCCATTCAAAGAA
AAACAATATCTACAACAAGAAGTAAAATATCAAGTACGCAAGAATAATTGACGGTGACTC
AACATGCAAAAATCAAAAAGTACTTTTAATATATTGTATTTTCCTGTTCAGCGTTTTTGA
ATGGATAAGATTATTCAAATTAGATACTTCTTATCAAGTAATTCTGTAAGATACAGTATT
GTAATATTTAACCATGACTTTGCATTAAAAGGCAATTAAGAACAAAGTGATGAAACATCT
ACTTAAGCCATATAGGTAAGTATTATGTACTTTACTTCAACTAAAGATAAAATTTTAATA
TCTCTAAAATTTTTTGCTTTCACTACATAAAATTCCAATATAATTAATATTCATATTATA
GAATTTTGGATAATTACAAATTAGACAGAAATGTCGTACATATAAGTAGTCTCGTGAATA
AAGTAATTCTTACATAGTAGTTTTACATTATCCCGTCATTGTTCTACTATTTATTAGAAA
ATATATTAGATCTAAATTTGAATTTCGAAGTGTGATGTTACCATGTTCGAATGCTCAGCG
AGTAGTTGTATCTAGATATAGGATCTACCTAGCTCTGTTACAGATACTGTAACCATAGCG
TCCTTGACCCTAGAGAAAAAAACTATTGGATTTTAAATAATTGTAGATACTTTGAGTCAA
TCACGAAGCTTGGCAACATTATGATCACTTAATATAAGTATTATAATTCTAAATTATACT
AAAATGTTACTAAATTAAATGATTTTACGTTCAATATTTACTTTATCACTTAGTGCTATC
ACTTGGTGATGTAAAAACAGTGTTTCAAATAGTGATCACATATCTTCCTTTCGACATAGA
TGAAAGTATTTTGTGTATTATTCTTATAATATTTATTGTCATATTCTATTTATGCCTATT
AATAGGTAATGGAGTATTATTTATTTTTTTCTAAACAAGTGTAGGTATTATTTATTGAAC
TATACAAAAGATATATCGTATTATAATATTATATTTTTTGCAACTAAACCAACTTCAAAT
TTCTTTAAACTTCAGAGCTTTGTCGTTACAAATCTTAATTTCATCGAATTTATAAATAAA
AAAAACTTCTAAAATATTTCGTTTAAATTAAACGAGTATTTATTGAGAATTTGGAAAATT
GATAAGGTTCATTAAATATAAACAAATGGAGAAATAATGCATTGTGCCAAATAGCAACGA
CTGTCAGAGGCACTTGTACCTTACGTACAGCAATAAACTGTTATTCTATCTATAAATTCA
GTAATATTTTAACTGCATAAAAATTAACTATGAAGCAATTCGATTCGTGACCTTACATAC
CTAATAGGTAACTAATATCTAGTATCTATCTAATAAAATATCTGTAATAGGCACGCAATA
ACTTAGATGTACCTAATCTAATGCACTCTACTTATTTGAGTAAAATAGATATTTGAATAA
ATCGTGTTCGTAACTTCTTGAACAACTTAGACTTACCTTAATTGTTAACCCCAATAATAA
TTATATTCAATATTAATAAATACTAATCTTGTTATCACATGTGAAATAACTGTAAAGGCA
TATTGTACCTGCAACCTACACTATTCCAACAGATTCTAAGACATAAAGTCTGCCTTACAT
GTTATCAAAAATATTCAATCATTAGTAGGGGGATGTATTGTGTCAAGTAATTATTAATAA
TTATATATTAAATAATAAAAATTATCTACTTATAGATTTTAGGCTGTGAATCAGCGTAAA
CACATTCTTAAAAATTTAAAAATTATTATTCAAGCTAGAGTTGCTGTGATACACGATTAT
GGCTATAAATTATAGATTAGTCGTTTCTGGCTACAGCTCAAACGACGGTCTGTTTCCCGT
CTACTTAAATACCTACGTCTTGTTATTGTGTCTTTTCATTGAAACTTACTGTATTACAAT
ATTCGCCCACCTACAAAAGGAGCCTTTGGTCCGCTCAATATCAAATCCAACAATAAGATA
AAACCTACGGTGGGTGCTTCGAATAATAAATAAACGAATATTGGTAATGTAGTTACTATT
TCACTTATAAAGTTATATTTAATCAAGGCTGTCAATATTTTGAAATCTTTTGGAAATCTA
TTAAATTTTATAAAACCTCTTCAACGGCCAGAAATGTATTCGTTAGGGTTTCTGTGTAAC
ACTTGTTTCGACTTCAATTTCAGGATACTAACGATTTAAAAAGTTTTGATGTTCCACGTG
AGCAATAACTTATTCTATTAGATAGAGATCGCTGAGCGGTGTGAATAGTTCTTTCAAGTT
TGAACATTTTGATCTGGGTCGAGTTTTTTCATAGAAAATGTATTTCGAATAATTAAAAAA
ATAATTAATAAATTTAAAACATTCAAATAATACATAATTCTAGTGAATTAGTCAATGAGT
AATTATTATCTGTAAGAAAATGTTATGAGTATAATGAAATAAAATAATAAAATAAAAAAA
AAAAAAAAATAAATAAAAAAATAAATAAATAATAAAAAAAAAAAATAAAAAAT
(7433 bp)

- SilkBase 1999-2023 -