SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_TrvaFAMAMG_TR11881c0_g1_i2
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_vacuolar_protein_sorting-associated_protein_26B-like_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005768 C endosome
GO:0005829 C cytosol
GO:0006810 P transport
GO:0006886 P intracellular protein transport
GO:0007224 P smoothened signaling pathway
GO:0008565 F obsolete protein transporter activity
GO:0015031 P protein transport
GO:0016020 C membrane
GO:0016055 P Wnt signaling pathway
GO:0019233 P sensory perception of pain
GO:0030111 P regulation of Wnt signaling pathway
GO:0030510 P regulation of BMP signaling pathway
GO:0030904 C retromer complex
GO:0030906 C retromer, cargo-selective complex
GO:0042147 P retrograde transport, endosome to Golgi
Transcript
Level
FPKM:16.06 TPM:15.73
ORF EntryO_TrvaFAMAMG14851_complete:A_TrvaFAMAMG_TR11881c0_g1_i2
Sequence
(Nucleotide)
CGACATTATACCAGTCGCCATCTTTGCTTCAAATCCTACAATCGCCCTGCCGATTCGCGG
GCGTTTCATCGCCGTTTTTTCAATGTTTTGCTCAATTTTACCACTATTATTCCAAAACAG
AGCCACATAAAAATAGTTCTAAAGTTCGCGTGAATTAAATTTGTGAAAATGAGCTTTTTC
GGTTTCGGTCAAACGGCGGACATCGAAATAGTTTTTGATGATGCTGACAAACGAAAAGTA
GCCGAAGTGAAAACGGACGATGGTAAAAAAGAAAAGTTATTGTTGTATTACGACGGTGAA
ACCGTGTCCGGGAAAGTGAATGTGACATTGCGGAAACCGGGATCAAAACTCGAACACCAG
GGCATCAAGGTCGAACTTATAGGTCAGATCGAATTATTTTACGACAGAGGTAATCATCAC
GAGTTCATATCTCTGGTCAAAGAGCTGGCACGTCCCGGTGACTTACTGCAGCACACGTCG
TATCCCTTCGAGTTCGCTAACGTAGAAAAGCCATACGAAGTTTATACGGGTGCTAATGTC
AGACTGCGGTATTTCCTGCGAGCCACGATCGTCCGGCGCCTCACAGACATCACCAAGGAG
GTGGATATCGCCGTCCACACGCTATGCAGCTACCCGGACGTCCTCAACTCCATTAAAATG
GAGGTTGGCATAGAGGACTGCCTGCACATAGAGTTTGAATACAACAAATCAAAATATCAC
CTGAAAGACGTCATAGTCGGCAAAATATACTTCTTACTGGTTCGTATCAAGATCAAGCAC
ATGGAGATATCGATAATTAAACGAGAAACAACAGGATCTGGTCCTAATACATTCACCGAG
AATGAGACTGTTGCCAAATATGAGATTATGGATGGTGCACCAGTTAGAGGCGAAAGTATC
CCTATCAGGGTGTTTTTGGCAGGTTATGACCTCACTCCTACTATGAGAGACATCAATAAC
AAGTTTTCAGTAAGATATTACCTTAACTTAGTTTTGATGGACACAGAGGACCGTCGGTAT
TTCAAACAGCAGGAAGTGACACTTTGGAGGAAGAGCGACAAGTCGAGGTTACCGTTACAT
CCTCACCATCCGCAGACAGTGTCATACCAAGGCCACCAGACGGTGAGAAAACAAAGTGTG
TCTAGTGATGACAATTCAGCACGAGCTACACCGTCACATCCTGAGAATCCAATGCAAAGA
TCAATATCACCATCTATGCCGGAAAAACAGAATGGACCCCTACAAATGGAGAGAGAAAAA
CCTGAAGCAATCACAGATAAGTTGGCAAATACACATATAAACGAAAATAACACCAATAAT
GGCAATAGTGAGGAAATATCTGAACCAGAACCTGAAAAATCACCTCTGGTTGAGAAACCA
CCAATTTCCGAGAAACCTCCAGTTGCGGAGAAACCTCAGATTTCTGAGAAACCAACTCTA
AAACAACCTGAAACGGAAGCAAGTCCAAGTCAATAGCCCAAATGTATGTGCTCTGTCAAT
TTGACGGGCAATGACCATTTGAGTTATATGTTTTCATATCTGAAGACTATTGATTGATAT
AGTTATATTTATTCTGCCATTCAAATTCTGAAAGATTCTGAGTGTATCAACTGTGCACTG
TTTAATTTGGTAAAGTAAATAATTTATCAGTTATGTTTTAAATGAATTTAGTTTTTCACA
AAAATGTACCAAACCACAAATCTTTGTTTTGTTTCAAATTTGAAAACCCAAATTTGACCT
GTTTGTGGATTTGATCATTTTTGTTTCTAATATCAATTACTTATTTCTATTTTTTAAGTA
TTAAATTTGAAAATAGCATCAAAAATATTACATTTTTTTATAAAAAAATATTATTTAATT
CATCATTGTTCTGCCCATTCAAGAATGGGAAAAATTAAATTATAACGAATGTTACACTAC
CAAATTGCATAGGACATTGTGTTGATCCACACAGTAGTGTTTCATAATATGAATAGTAGC
AATATAATGACAGTTCTCAGCTCATGCACACAGAGCTTAAATTTTGCAGCTTTTTAATGT
AATTTATCACCAAACATTACTCATAGACTCCAGAATAAAAAAATACTAGTTCTAAGATCC
TGATATATTGATGAAACATTCATTTTAAAACTTAGTTGCAGACATCATGCCTTAAAACAA
CTCAATATCAAACACAAGTTTGTCAAAACATTTCAGTAATAAAACATTACAAATTGTACG
TAAAATTGGAAAACATAGGTAATGTCAGCTTGCCTCTAAGGCTGTTGAATTTTTTAATTA
AAGAAATATTAATTTTTATGTAATTTAATGTATATTTATACACATAGAACACAGAAAAGC
AATAATAAGTGTGTATAGCTTTATTGCGTTAAGTATATAATTATAGTTTAGAGGAAATTC
ATTAAAAAAATATAATATATAAATATACAAAGTGTGATTTGTTGATAGGTCTTAGGTGGT
AATTTTTGATCATTCTAAATATGTTGTAATTTTTCTTAAGTAAATCATTTTTGCATTGGA
GCTAGAGAATAATAAATCTAGGAATAAAACCAAATCAAAATCTATTTAAGCCACATAAAG
AAGTTACTAAAAATATACATTTCTAGTTTCCATTAGCCTAGGTTATTTAGAAAAAAAGGA
ATGGTTACTCAAAAAAAAAACATGGAAAACATCCAAAAAAAATTCAAAAAACAAGGTATC
AAAATTACAAGCTATTTGACATCTATTGGTTATCATAGGGCAGGCAAGAGGTCTAATAGC
CGATTCTAAAACATTTTCTTACATTTCTCAAGCTTTCTATCATTGCCATTCTAAAATCTA
ATAATTTTCTTTTTCTAAAATTGAAAAAAAATTAAACACATGCTTTGGTATTCTTTGTCA
TACAATGATTTTTCCCTCTACACAGCTTGCCTTCATACATCAACATTCTAGAAAAAACAT
ATTAATAACGTTATCTATATACATTTGTATATCATAGGAATGTGTAACAGAACTAATCAT
TTAGCGAGCTTTGTGTGTCATTTGTTTGGTTCGTTGATAATAAAGATATTATGAGCTATT
ATAAATGAGTATGAATCGACATAATAATGGGTCTAGAATATATTTAATTGGATGTTGTAC
AGAATTGATTCAAGATACTATTATACTAAGAAATGATTGTTAAGACAAATCTTGAATATC
TTGATGTCTTTCATTTCAATTTCTACTTTTCCGTTACACACGTTTTTATTTGGACGTAAT
TTAACAAAATCGGTCCAAACCACTTACGTCGTATACATGTGGGTAGGCCAAAAAAAAATG
GATTTACTACATAAAAGAGTAGAGATACAAAATTATGTCAGATGGAGTATTGTATTTTAC
ATTACATACTAAATTTTGGCCCGAATTTTGGTTGGAACAAATTTGCCAAATACTTCCAAT
TCTTTAAGTAACAACTTGTTTTTGCAATAGTATTTTTGAATCGTTTCTCCGCAACTATCA
ATTCGAGACCACATCAATTTATTTCAATTGAAAAGCATCGATCGGAACTGGTGATAACAC
TAATTGTTTGATAATTATTTGTATAGACGAGAAAATATTTTTTCTTTATCAAAGAAAATA
CTGAATCGTAAGACTATTTGTATTTATAAATTATAATAAAACGCATGTATTTATTTACAA
TGTTTACTGGATGTGGATATGCTGTTTAGATTTTTTTATAGTCTTTCAATTGTTATCACT
ACAGACTTCCCTATTTTTACTTGGGACAAACGTTTAATTTGAAATGAAAATAATAATTGT
AGTTAGTTTTACCCAAGTTCTATAGTATAGTCAACGATTATAATTATATTATTTTGTCTT
GAAGAAAACAAAACTACTACCAATAGAGGTTTTGTCCCTTTCAACTATAAATGACTATAA
TTCTATCGTAGCCTGCGTTTGAAAAGTTTTACAATTAATTTATTTAACAATACTTTGCGT
ATTGCGTTTTAATTAGTTTTTAATAGGTGTAATTAATATCTATTTTAATTTATTATGTAC
ATTCCGTACAGTTTTTATCTTATCACACATTTAATAATTGAGGATATTTTCAGATTTTTC
GGCTATTCAACAACCATTAGCTGATTTCAAAAGTCCAAAAAGTTTTTCTGAAGTTCTTAA
ATTTTCTTTATATCTCTTCCTAACTGCGTGCATTTATAAGCACATAATTTTAATCTGATG
ACGAATTTAAACATCATGCATCAGTTATGTTGCTCTCAACTCTAATAAAAATCTATACAT
AGTAATGTGTACGCGCAGTATTATCGTTGCAAATGATAACACACATGCTCGATAACAGAG
ACTACGTATGTCTGTTTAAATTTGATCAATTTATTGTCATACGCCTTTGCGCCTGGTGCA
AAGTAAAATGTCGGATCGTGGTGAGAAAAATGGTAAATGTATTTTATCAATTATTGTTAC
TTTTACAAAAGTAAAATGAAATAAACATGAAATTTTTGAAAATAAATCTATGTAAATGGT
GTTAAATAGTGAAAAATAAAATGAAATATGCATTACTTATATGAAATCAATACCACGACT
AATAAACCGAGTATCGTATGAAAGTTGAACGGAATGGGAACCTGAATCAATATTTATCAT
GACGTGATATTTGTAAATGTTTCGAATGATATCGACATTATTTACAATTGATATTCCATT
AGATCATTCATAATGATGAATGTCGACAACAATGGCTTTAGCGACTCAATACGACGATCA
ATTCGATTTTCCAAGCCATTATAGACTACGAGCTTTCCACATTCAGTTATGTATAATATG
CTGTCCATATTAATAAATATGTTATATTAGTATAACATTGTAAACAATAACATTGTTTGG
TTTTAGTGTCTTATTATTGTATAAAAAGATATGTTTTTTTATGAGATTAAGAAGCGCATG
TCTATTATATCATATTGTTAATAAAGTATATGTATAAATTGCTAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAACATGGAAAACATC
(5000 bp)

- SilkBase 1999-2023 -