SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR11771c5_g1_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_tripartite_motif-containing_protein_2-like_isoform_X2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0004842 F ubiquitin-protein transferase activity
GO:0005622 C intracellular anatomical structure
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0008270 F zinc ion binding
GO:0016567 P protein ubiquitination
GO:0016874 F ligase activity
GO:0043523 P regulation of neuron apoptotic process
GO:0046872 F metal ion binding
Transcript
Level		FPKM:9.01 TPM:8.82
ORF EntryO_TrvaFAMAMG14601_complete:A_TrvaFAMAMG_TR11771c5_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
CTTCTCCATAAGAATTTCCGTCTAGCCCCCTTTCGATAACGCGCGATAAGGAACTTCGTT
CCAATATTTTGATTGATTAGTAGTATAAACTTTGTGAATGAGAAATGACTTATGCAGTAA
ATAAAGATCGACATATTCTGAAGACTACGTTCGTCATTTTCGTAATCGTCGAGTTACATA
AAGAATTCGGTCAAACTAACATCTATACAAAAGAACGAACACAATCACACAACATCACTA
CACGATTATTCAAATACAAATCATACACTCAATAGCCGTATCTAACTTTAACAATCTTTA
CCTATTCAAGGTGAGAAAAACATTGTTATAATAATAATGACGCAATTATAACGTTGGTCC
AACGAAACTATTCAATATTTTGAAATTGTTTAAATAGTCTCGTGTAGAACGCGTCAACAT
TACACATTACCCAAGATCACTTCAGTTTTGCATTTACTAACTGAAAATTATTACATATGG
AAATATCAACGAAAAAACACCGAAATTATTCTTTTCATTTCATATTCATAACAATCATAG
AACATTTTAGTTTTTATTAATTATTTCAAAAATAAAATAAAGATGCAGTTTATAATTGTT
AATTTAGAGCCGTCACGATTTTAGCAACGGCAACTACGTGAATCAGTCATAACAGATTTT
ACATTAGCAACGATTAGTATTCTGCAGTTATTAAATAATTAACTGTTTGATAGATTTATA
AAGACGTGTCAATAATAAAATATTTTAGTGATCATAATTCCGAAATGAATGTTGAAAACA
ATATTCTTTAAATTTTTCTTTTATTAGGTTAGGATATAAGCCTGGTTCGATATTTTTGAG
AGGAAATAAGAGCTCATAATCTGCTAAATTTACACACTACATAATGAATTAACCTTATAT
TATATGTTTGAATTTAATTGTGCGTTATCCATCCAACTGCATCATACGCAAGGCCAAATC
GTTTGGACAGTCAATAAAGTGACGAGTACTAAATCATCGCCGTCTATATAAACATTTGAT
TGAGTAGATAAACCTTGGGTCAGGGTAGCTTTGTAAGAACTTTATGAGTAACTCATCTCA
ATTTCAATGAAGTTTTTATGAAAACCGCATCTTAAAACACAAGGCCATGAATAAATTTTC
CAACAAGTCAATATTTCTCAACGTTAAGCTTTTAAAGATGGACAAATCACGATGTTCTAG
AACGTTCTATTTTTCAATAATTCAGTAAACCTTGACAACATTATATGAAACGTATATGAA
ACAACAGATTTGTGCATTAAATAATTCATGATATGAAGTTTTCTCAGACATTCATGTATT
CAAACTTCAGGGTACTATGGACATGTTACAAATTGTGTTTTCATGGAATTTTTATCACGT
TGAACCTTGGGTATAAAATATTAATAATGCATGAAAATAACTATTCCCATCTCTTTATCA
CTTGTCAGAATAACAATTTATTTATGTCAAAACATTTTAGTAAAAAATATTTTCGAAATA
TACGATACTGACACCGTCAGTGACTATCAGGCACTCTTTCATTTTACAAACTACGACTAT
ATCTACAGGGTGCGCCTTACTCCATTTATATCGACATACTAAATTAATAAACGTGGGATA
ACAAAGAAAAAAACGAGTAATTATTTCAATGGAATTTTTTCATTTTCAGAGAATTTGATA
TTAATATTTCTTAATCCATACGAACCGCTATTAAGAGATTAGAAATTCTAGATTATGCCA
CATTTATTACATTTATACACAACTGAAAGAGAGTTAATTTCATGAAACTCTGAACTCAAC
AATTAAGGCAACGCAAATTACAGTACAAATATAATATAGTATCAAGTGTTGTACTTAAAT
TTAAGTGTAATGTTTGATATAGGTGCAGGGTTTGGAGCCAAACAAGGGATTCAAAGAAGT
CATCTTAACAAAAAGATCCAAATAAGAGAATGTAATCTGATTTTTTAGAATTCTTGATTA
CAGGTGACTAATAAAATTCAGTTAAATTAACTCGCATTGGATCAAAGATATAATACGTGA
CATCATCCATATTGAGTTACATTATTCGATGAATGCTGATACAGAATTTAAGGTGAAATG
ATTACAAGGTATCATGTCAGTTATGACATGTTTAACAATAAATATGGCCAATTTTGTATT
ATGCTTTCGATCCATATTTCATGCACATATTTGAAGAACTAAACTTTTTAATAAATAGGT
ATATTTGAGTTGCCTTACATAAGAAAAAATATTATTAATTATTAGATAATAATTCCAGGC
CTTTTCATATAGATTTCGCATTAATACTATAAATCAAGTACACTTCCGATGAGATTCAAA
TTACGTAAGCATTAAGCACTATCAAAAAACCCGATAACTAACTAATAAAATGCAGTCAAC
AATTCTAAAATTATTTAAAAATACAAGAAAAACAACAAGGAAACGCTTATATCATCTTGT
AAGCTGTTTCATCTGCGTTTAGTCTTATTAAGATATGTAAATTAATGATAAACTATGTGG
AGATTAAAATTCGGTGTAACTAAGCGTTTTGTGGTACATTTAATTATGTAATTAGATTTA
ATTAGATATCAATCTTAAACTAGAACGCGTGGGTACAAGAAGCTTAAGATATATTTTAAT
GAAATCATTATATTAAAGTCAACAGAAAACTATGGGAGTTTATTAAATTTTTATCGTCTC
ATGGTATTTCACAGATCTTTAACTATTCGTTTTTTAATTACTCAAAAAAACATTCCAATC
TAAAGTTTGTTTTTTCTTTAAATTCTATCTGAGTTCAACAAAATCAACAAGTTCTTCACG
TGAACTTAAAAAGATTTGACTAAAAATATTAGATAGGTAAAATAAACTACAGTATAGTTT
AATTTTTTTGATTTGTCATAGTTGCTGATTTTTATACATTAATGATATTATCATAGCCAA
TCTATTTCATTATGTCTAAATTTCTAACAAAATGGAAGCTTTTTCTTGTGATATGGTGTC
TCAGTTTGATTGAGCAAATTGACATGAACAATGGTATCATTTATTTATAGGAATCAATTT
GTAAAGCAAATGGATGGACTGATGTATCTATAGTAACTTTATTTATTCAAACTATTTTAA
AGAGTTAAGATTTATTTATCATAAATTATTATCAATGATGTTTTCGTGAACGATTTCTTA
ACTTAAATATTGTCGTTATTCAACAATAAATGTGATGTTCAAAGATCTAAGACAGGAAAT
GCTTTGTCCTTGAGACTAGCTTTTAGACGAATCGCCTTTTAGGATAATCGATTTTATGCT
ATTTATTATATCGATTAAAACGTTTGATATCACACCGAAATCGATGTCATAGGATTCTCA
GTCTTAACATAGAGATTTTAAGAACTGAAATCACGTGTATTCGCCGCATTTAATCCTTAA
AGTTATCAAGTTCAAATAAGCTACGTAAACTATTATGGCTTGCACGGATTAATAAGATAA
ACGAGCCAACTTAAAATAATACAAAAATCAGTCGCGTTTCAAACTACTACTATCGACAGT
TAACTAAAACAATACACAATTTAATAAGAAATAAATACTGTATAATACTGTAAATATATA
AAGCGAACTTAATTTACTAACACCCATTTTTAGGCACAAATTCCTGACATTAATTCAATT
TTATTCGAGATAGTTCGGTTAGGCATCTTACGAAATGACACATTTTTAAAACAAGGAATT
TAGTTTTAAATTCAAGTAGCCTTGTGCCTGTTTACTAACAAAGATGGGGGAGATAATAAC
ATTCAAATTTGTTTTACTCGATTCCCTATATCACAAATTTGAAAGTTTGATCGAGCGCTC
ATAAGACATTTACAATTTTAAACAAAACAAAATCACCATTAGGGACGATAGGAAAAAAAT
AAGATTTTTATTCACATCACAGAATCAATCGACTCACTTATGATTTTTCGATCAGATGAC
TCGATTTGCTTATGATTAAGAAACCATTTCTTGCATAGACAATCATCACAAGTTGAATAA
TATTATTTAAGTACGCCGTATAAATCTTAACCTCAGTGACCAGTCGACTAAAGACTTTGG
TGCATAAGTATCGCTTAGTACATAAGCGTTCATATGGCCGACGTGTCTCGTTGCGATTAT
AGACTAGCATAAAATTCGTTAACGATGACCATCTTACCTGTGAGATTCGATTCATCTTAT
GTGATGTTCATCTCTCACCAGTAAGTGTGCAGTCTCAAACAGTCCCCCGCCAGGTCAGCG
AGCAGCACCTTCTTGTCGGGCAGCAGCGTGATGCCGGCCACCCGCCTCGGCCGCCTGTCC
GCCAGCTCGCACGCCGCCAGCGTGTTGGCGCCCTCCGGCGACCCCTCCGCGTCCAGCACG
ACGAGCGCCGGGCGGCCGCGCACGGAGCGAGCGCACACGATGTGCTTGCCGGTGCTCGTG
ACGTCTAGAGCTATGCCGCCGTATACTCCGCGACCTTTGGGTACAGGAGCCAATGTGTTT
TTGAGATTTCCTTCAGAATCATAGATTCGCACTGCCACATCGGCTATGATAATCAGATCT
TCCGAGAGCGCCAAGCCACCAACCAAACCCAAATCACCATTGCCAATCTCTCTCTCAATG
TTTCCATATCGATCGAACACGAACACGGTCCTGGCTCCGTTGTCTGCGACGGCGAGGCGA
CGCGTGACGACGTCGGCCGCCACGCACACCGGCTCCACGAGACGATCCGAGCGAATCGTA
CGTAACGTCGTGCCTTCGGTGTTCACCTCTGTGATAGTACGAGTTCTCCAATTAACGGCG
GCCACACCTTCTGCGGTTACAGCTATACCGGTACAACTGCGTCCTGCCAATCCTTCATTC
ACAATATGTGTTTTAAAGGCGAACGTCTCATCGTCCAATACTTTAACTCTTGAATTACCG
GCATCCAGTACATAAATTTCTCTGCGTTTAGGACACCTGGCAAGAGCAACAGGTTGACTG
AGTTGATCCTTCCCGTTGCCACGTGTCCCCCACACGTGCAGCGGTGTCGCCTGTGACGTC
ACGGCGGCCCGCAGCGGCGAGTCACGCACCGCGCGCGAGAACACTAACACACGGACCGAC
ACTGAACCCGCGCTCCATGGACGCATTGAGATCCTATAAAGTCCCGAATCCAGATCAGTG
ACGGTACACGGCAGAGGAGCATCATCAAGTGTAGCGGCCGCCGTGACGGGATCTCCTCCA
GTACTACGAGCTTCACCGTGATAGTCCACCGTACGAAGTACTACCACCACTTCCAAACCA
GACACACATGACGATTCTAGTTGTAGTGAACACAATCCTGGGAACGTAGTACTCGTTCTG
ACGCGACCAAGTACTCCAAGAGATTCAACGAATCGTTGTTGAGCATCGTTGTGAGCAAAA
TCAACAGCTAAGAATGCGTTTTCTCTTGGTTCAGCCAACGCAGCCGCATCACCTAATCTA
GCACCCAACGCCGCCGCTCTACTGCTCACTTCACGAACTTCTACTTGTTGCTGTAACCCT
GAACATTCTGCTTCCACTTTAGATTTCTCTGCATCAATCAGCTTTAACTGTTCCTCGAGT
AGTTTGCGTTTATGACTAGCAGCTGCAGCTGCAGCAGATTTCAGTTCATTGTGTCTCTTC
TCAAGCGCCGCCCTCAACTCTGCAAAATGTCTATCGATAGCTTCATCTGCTGCTGTAGCT
GCTGCTTCTAATCTTCTCAATTCGCCTGCTACAGCTTCCCTAGCTGACCCTAATTTGCTC
AAGCACTCGTTCGCTCTGTACAGCAGTATTTCAGACATCCTTTTCAGGGCTATTGAGAAC
GGTACAATTGTATGATCACAAGGCGTATCGCTGTGAGGTCCGTCGGCGCAATGACGGCAG
AAAACGCAATCGCAGGTCTCGCAGAAAAGTAATTCTCTGCCTGGATGTGAACTACATTGC
GGTATAACTTCTCTACGCTGTCGTGCCATAAGATCGAGGAGTTGATTAACAAGAAACGAC
GGTGGGAGAGCAGGAACTCCTCCTCGCGGTATAGTTATCAGTTCACGACAAATAGGACAT
CGGAAACTGCCCGCATCTCGTGTCTGTGAAGCCGCTATGCGTGTGAGACAATGTAGGCAG
ACTGTGTGCGAACATGGCAAAAGCTTCGGGGTATGTTCGCCTCCGTCGTATGTGCATAAA
CATGTGCCGCACGTGAGGAAACTCTCATTAAAATCCTCGTAGTTGATGGAGACGGTCTCG
ACGAGCGTGGAACTCATGCTCGCCATCCCGACGCCCAGCCGCGAGCTGTTATATCATACA
AGTTAACGTTTTACAAAACGTTGTTAAAACAAAATGCACCAAACATGTTAGAAGTTAATA
AGAAAAACAATACAATATTTATTCTGAAATATATTCACAAGATTCATAACATTAGTTCAG
TTGGTATAATAAATTACTATGTTGTTAAGGATGAGGAAAAACCAATACAATATAATGATG
ACTTAATGAGGAAGGAATTGAAACAAACAAAAAAAGCTAAGCTCAGTTCAATCTGTGCAG
ACTTATTGTTGGAACAGAATAGTTTCAATATAACTTGTTGAATCACTCTTCATTGAAGTA
GATACTTGTTTATTGGCTCTATATGTATTAGCTCTAAGTTCATTGGAATTGCATTTGTTG
TAATTCACAATATTTATTATAGTAGTTTTAAGCTATTATTGATAACAATATTCAAAATGT
TGTTTTAATATAATAGCATCTAAA
(6744 bp)

- SilkBase 1999-2023 -