SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_TrvaFAMAMG_TR11417c0_g1_i2
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_zinc_finger_protein_665_isoform_X2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003676 F nucleic acid binding
GO:0003677 F DNA binding
GO:0003700 F DNA-binding transcription factor activity
GO:0005622 C intracellular anatomical structure
GO:0005634 C nucleus
GO:0006351 P transcription, DNA-templated
GO:0006355 P regulation of transcription, DNA-templated
GO:0046872 F metal ion binding
Transcript
Level		FPKM:7.83 TPM:7.68
ORF EntryO_TrvaFAMAMG14139_complete:A_TrvaFAMAMG_TR11417c0_g1_i2
Sequence
(Nucleotide)
TTTTTTTTTCTTGTCTAGAAATTTATTTTACTAATTTTATTATACACAACTATACAAATC
TTAAAATTACATCATTTTCATGGACACGATGGAACTTGTTACACTTATCACGCTTCGTAT
TTATTAATTTAATTATTGCTTTCGTCTATCAATTCACATGACTAAAGTGCAACACATACA
TTCATTCAGAAAATAATTCAGTAACGGATATGCTCTAATAAATCACATCTGATTTTCATA
TAAGTACCTTACATTTTAAATTATTTACAAGTAAACTTTACAGTAAACAAACTATATTAC
AGCATTACATCAGTTTTCAAAAACGCTCAGTCCATTATTTTTAAAGCCCTTATGATAATA
ATCATAAAAAACTACAAAATTTGGAAATTATTATCATTTACATGTGACTTTGAAACCTCT
AAATGGGCTCTGTTTAGTTTGACGTAATGTTTTTTTTTTATATTCCTGATTTATTTACAC
TGGTAGTTAAAATCTTAAAAACGGGTTCTTTTTAGAACTGCGACATTTTTAATTGACTCA
GCATCTGGACGAGTCGTCGGCCCACGTCAATTGATCACTACTCATAAACCCAACAGTTTC
TGTATTACGACATTATGATACACCCTCATCTCATCTGCATAAAGTGGTGTGACACTTTAT
GCAGATGAGATCGATACAGCAAGACGTCGCACTTCGCAGTATTAAAACTTAACACGTTTT
TAACATATTGACTAGCAATTGTAAATATGCTTTGTAGCATTGAGACTGTCAGTCTATGTC
TGGTAAAGAATTAAAAATCATAATCATAAATTTATGTAAATACAATTCGACAGTTCAATA
GTTATTGCCTTGATTAAAACATAATAATTCGTGTACACAAAACCAACTTAGTTTGTGCTT
TAAATGAACCAGCTCAGTCGTTGTTTAACTTTTCAGTTCCCTATACTGACAGTTGTGGTT
CCCTGTGGGGTTACGACTACTTCGACACTAGGCTGTGTTGTTGTTTGTTCATTCGTCTGT
GATGTCTGAAGGTTTTGATTCTGTCTGTCTAGGTGTATTGTTGAAGGTAAAGGCGCGGTT
TGACCATATTTATCGTGAATCCCTCTATGCCTCTTGAGCGCAAATCGATCGGCAAACGCA
GCAGTACAAATATCACATTTGTATGGTTTCTCTCCTGAATGTACTTTCGCATGATTCTTC
AAGTGAGCAGCTTGACTAAATGCTGACCCACATGTTTCACATTTGTATGGTTTCTCTCCA
GTGTGTATACGTCGATGATTCCAAAGTGTCGCGTGTCGAGCGAAACCTTTATCGCAAACC
TCACAAACATAGGGTTTCTCTCCAGAATGAGTTCTTTCGTGATTCTTAAGATGAGGAGAT
TGTGAAAACTGCATTCCACAAGTTTTACATCTGTAAGGTTTCTCTCCAGTATGTATTCTT
GAGTGATTTTTAAGATATACAGCCTTTGCAAATGCAATACCACATATTCCACATTTAAAG
TTCTTTTCACCAGAATGCAATTTTTTATGTGACCACAGTGATGAATATCTTGAAAACGAG
CCCCCACAAATGTTACAGTGAAACGGTTTATCAGCACTAGGTTGATTTAATTTACTTTTG
TTTCCTCCAACAAATATTATACCGGAACCATTACAATTTTGACATTTCGTAACAGAAGAT
AGGTTTCTTTTCTTCACAGGATGATGTCCGGGCAATGGTTTTTGTTGCTGCTGTTGTTGT
TGAGACGGTTGCGTGGTTTGTGTCGCCGAGAGAGGATCCGACTGGGTTGTATTACTATTC
ACACCACCCACTTCAAACTTCACTGTTTCTTCCCCAACAAATATTTGTGTTGGCATCATT
TGATTAGGTCTATGGTCAACTGAATCTTGTGCTATACATGTTTCACATCTAATTAATTTA
GGTCCCTTTCGTTTAGGATTGTTCTGTATCGCTCCACCACATGATATGCATTTCTGGATT
TTGTCCAATAACGGTTTAGTCTCTTGTATTTGTACATGGTGTTGTTGTGTTTGTTGCTCA
TTATGTTCAGATGACAATATTTGTATATGTGAGGGCATTGCCACTTCATTTCCTGCATTC
ACACCGGCCGCTACTACTGTTATGTTGTCTGTATCCTGAGCATGGATCCTTTTATGAGCG
GTTAATAGCGTCAGGTGACCAAACATAAGACCACAGACATCACATTTGAAACTTATGTTG
GATATGGTATTTTGTAATCCATTGGGAGCTATTTGCATTTGATTAACAAGGGCATAATTA
TATGAAAATGGTTGTGCTATATAACATGTTTTGTCATCACTTGTAGTCAACTGAGTTATG
TTAACACCTCCGGTTTGACTAGTGTTAGCAGTTCCAATTTTTCCAATCATGTTGACATTT
GTAGTATAGCAAAATGTTGGAAATTCCTGTTGTGTCTGAGACTGGTGTGTATTCTTTTGT
TGTACATTTTCAATATTTTTCCCCTGTGACTTTTGAGCATGCTCTTGGTACTGTAGTGTG
GACACTGTACCGGCTTGAACGTTGTTTGTGGTAAACATTTTGAAGGCTTTAGGATCCCTC
TATATCATTATTTATCCCAACTCTAAATTAATATCACAGACGAAGTTAAATTTATTTACT
GGCAGAATAACAGCTCCAAACACGTTCAGATATTTTATTTCTATCTCACTTTCCTGTCTA
ATTCTCCATCTCACACAAGAAACGAAATGGCGATGACATGGAAG
(2744 bp)

- SilkBase 1999-2023 -